Home |  Text search
1 genomes BUD4557 5 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi
- - -

Hbo2857

Hbo3609

Hbo3610

Hbo3615

Hbo3617

- - - - -

Pairwise sequence scores
Consensus score3474 Hbo2857 Hbo3609 Hbo3615 Hbo3610 Hbo3617
1351Hbo2857 2823 1029 1057 981 891
2482Hbo3609 1029 3512 2469 1523 1328
2696Hbo3615 1057 2469 3824 1543 1557
2167Hbo3610 981 1523 1543 3491 2019
2136Hbo3617 891 1328 1557 2019 3089

570 symbols
consensus       --------------------------------M---FRLVLI-FLAVGMIASGAVAPVAA
#oth            111111111111111111111111111111121333221212311211223322342211
Hbo2857         ::::::::::::::::::::::::::::::::-:::------:-----:VL:VM::::::
Hbo3609         :::::::::::::::::::::::::::::::::NKK::::::V::::::::G:::L::::
Hbo3615         MPTVGTGSKFLSLHRFADSVLTCGVIDDEMKA:KDT::::::L::M::::TA::AM::::
Hbo3610         :::::::::::::::::::::::::::::::M:DRIQT:T:VT:::::LV::V:LPAA::
Hbo3617         ::::::::::::::::::::::::::::::::-:::------:-----------------

consensus       ---------------------------------DHRDNN-VDVDTEDGEIEHDGDDAEIE
#oth            111111111111111111111111111111111224424222221212221221122221
Hbo2857         :::::::::::::::::::::::::::::::::S::SS::F::E:S:ERV:L::::FD::
Hbo3609         :::::::::::::::::::::::::::::::::S:GG:DK::::::::::::::::::V:
Hbo3615         :::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::E:::I:::::::::S::E::::
Hbo3610         GTVGITSTASVSNPSGADLVGDHETVVDTADDE:NEESGD:E:E::::::::::::::V:
Hbo3617         :::::::::::::::::::::::::::::::::------:--------------------

consensus       ------DDEEDLDFESNEDDDTADIESDDLEIEQDDDDLEVEDDEADLDFESDDGGDDVE
#oth            11111122332212232313133132233312.1122222..122321211222211111
Hbo2857         FRSDGRVEI:GD::DIEL:G:RI:L::::V:V:INGNEI:::GRSGS:TLDVEYN:N:L:
Hbo3609         :::::::::N:::A:T:::E::::::::GN:::::N:::::::EDN::::::E::::::D
Hbo3615         ::::::::DD:::::::A:::E::V:FE::DL:::G:::::::::D:FE:::R::::::D
Hbo3610         :::::::E::::::::::::::V::D:GEQ:::::::S:D:::::::::::::E--:E::
Hbo3617         ::::::-----------------------:D:::N:E:VA::::::E::::N:E--:E::

consensus       VESDDHEIEQDDDEAEVEDDENDLDFESDDDGDRVDVETEEAEIEQRGDRLEVETDEDEH
#oth            1211121..2311341..12132..1.11221.2111.22121..12.223.111.2222
Hbo2857         :D:::F:::RKNG:YD::S:NEN::I:::--::::EI:GD:FD::FD::TI:IQ::DFDV
Hbo3609         ::T::Q:::KH:GV:::::::::::::AEE:D:E:::::G::::::S:N:::::D:T:G:
Hbo3615         ::T:::::::R:::V::::E:::::::A:::::::::::G::::::D:::::::D:T:G:
Hbo3610         A:::G:D::::::GT::::H:AG:::::E:G::EL:::::D:D:::::ESA::::::V:Y
Hbo3617         AK:G:::::::::DL::::H:DG:::::::G::V::::F:DN::::::ESV::::::V:Y

consensus       ER---DFEDDADDLEVENDDVDIERDGDEAEIESDDHEIENDGGRLEVEKAGFGFE-NID
#oth            121112211222.111.211312.22122212.212313.21124112.32132211211
Hbo2857         :I:::---:ADG:I:::TN:F:F:Y::STLDL::::FDV:F::D:I:::GDDGD::FTL:
Hbo3609         DL::::Y:AED:::D::H:EAE::KH::D::V:::NV:Y::EN:D:DF:SEDA:DI:D::
Hbo3615         DL::::Y:AEG:::D::H:ETE::KR::::DV:LS:L:F:::::-:DI:FD:S:GI:D::
Hbo3610         ::GGNK:::::::::F::::::V:::HG:V:::T:E::::H::KE::::::::H:::::G
Hbo3617         ::GGNK:::::S:::F::::::V:::HG:V:::T:E::::H::KK::::::::H::::LG

consensus       LDQD---------DVDVEADDTEVEQDGDDAEVEDE-NDLDFESDGDRHDFE--------
#oth            223111111111111.112.23.1.121.11...21212..1.1.1.1211.11221111
Hbo2857         T:DNGNVVFDGGR:::I:L::I:::R:N:R::::TD:-:::::::D::V:V:::::::::
Hbo3609         ::N:::::::::::::IDT::Q:I::::::L:::N:R:N::L:::::D:E::::::::::
Hbo3615         ::G:::::::::::I:::T:ER:I::R:::L::::DD::::L:::::D:E::::::::::
Hbo3610         -E:::::::::::E::::::G:::::E:::::::::::G::::N::::L:::DAAETVDL
Hbo3617         -K:::::::::::E::::::G:::::E:::::::::::G::::N::::L:::DATGTVDL

consensus       --ADDEHDIEHDGGDA-------DVEGDDFEFENDRNRIDFENDAHDIEQDDDDLEV-DT
#oth            122113311.22.221112211111.32131111.2223111213212122213321113
Hbo2857         ::-G:DFE::R::DR::::::::E::S::L::DS:DG:VE::F:GSG----------:--
Hbo3609         :::::::E:::T:S:::::::::::::EE::::::::G:::R:::T:V::E::E::::::
Hbo3615         :::::::::::R:::::::::::::::EE::::::::G:::R:::T:::L::::F:::::
Hbo3610         EAT:EAV:V:F:::EIEQDGDAL:A:AG:TDL:S:DEMT:L:T:E::::::G:::::E:D
Hbo3617         EVT:EMA:::F:::EIEQIEDALE::I::ID::::G::LE::TED::::::::SVD:E:H

consensus       DDGIDFESDDE--DVEFETDDHDIEQRGDDVDVEDHDDDFEFENDDNELEFETDDHDIEQ
#oth            21.1.1.22221121.1.1.111..1211111..212..21..1.3222.1.2.2.1..1
Hbo2857         --:::I:IR:G::R::V::::::::HD::SLE::T--:::D::S::DRT:::D::::::H
Hbo3609         :::V:::::N:::ET:::D:::::::::::::::N:E::V:::::E::::::N:::::::
Hbo3615         :::::::N:G:::E::::D::R::::D:N::::::::::::::::GD:T:L::::::::H
Hbo3610         E:::::::EGSGD:::::::E::::::D:::::::::::T:::::R:G::::::K:::::
Hbo3617         E:::::::E:GGD:::::::E:E:::HD::LE::::E::V::::::E:V:::::E:E:::

consensus       SGDALDVEKDGGLDLESDGETVDLERDDHND-EVGAFLDDLTRDEIIELGTETGADDLDD
#oth            312411..3211112...113212123224331222211122222222122222111222
Hbo2857         D:GD::::H:D-::F:::-------------:----------------------------
Hbo3609         :::R::::::::V:::::::::::::SE:SHA:T:QY:::ISTSQVNN:ISQSD:::YEE
Hbo3615         :::N::::::::::::::::SI:::::::D:T::E:::::::::::::::::::::::::
Hbo3610         EDEV::::DED::EV:::::N::V:QE:N:E:--------------------------::
Hbo3617         R:::VE::TH:-:E:::::::::::::E:E:I::::::::::::::::::::::::::::

consensus       LADMDLEDLD--E-NMLERMLS-DG-----
#oth            111222221233232211221231222222
Hbo2857         ----------::-:--------:--:::::
Hbo3609         :::EEI::::RETL:L::SY::A:::::::
Hbo3615         :::::::::NDN:V:::::::TD:DSEGSP
Hbo3610         ----------::-:--------:--:::::
Hbo3617         ::::::DE::ND:IE:::::::H::EANGE