|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4451 | hla0410 | NP1576A | Hbo2874 | VNG2068 | HQ3102A | HVO_1916 | Hbo1788 | Hut2020 | Hmu3123 |
2789 | hla0410 | 4391 | 2858 | 2192 | 2411 | 2352 | 2397 | 2477 | 2298 | 2302 |
2788 | NP1576A | 2858 | 4479 | 2218 | 2410 | 2284 | 2374 | 2461 | 2330 | 2289 |
2982 | Hbo2874 | 2192 | 2218 | 4459 | 2734 | 2479 | 2596 | 2611 | 2577 | 2644 |
3407 | VNG2068 | 2411 | 2410 | 2734 | 4601 | 2957 | 2985 | 3123 | 2814 | 2882 |
3551 | HQ3102A | 2352 | 2284 | 2479 | 2957 | 4454 | 3333 | 3572 | 2855 | 2930 |
3666 | HVO_1916 | 2397 | 2374 | 2596 | 2985 | 3333 | 4535 | 3614 | 2981 | 3018 |
3799 | Hbo1788 | 2477 | 2461 | 2611 | 3123 | 3572 | 3614 | 4466 | 2993 | 3076 |
3342 | Hut2020 | 2298 | 2330 | 2577 | 2814 | 2855 | 2981 | 2993 | 4508 | 3064 |
3361 | Hmu3123 | 2302 | 2289 | 2644 | 2882 | 2930 | 3018 | 3076 | 3064 | 4530 |
668 symbols consensus --------------AAAASNLIPIVAAIIGIGVVAQLLADRLQVPSVIFLIAAGIALGPE #oth 111111111111244334452242113.323.242.22132122.113.1132.232.13 hla0410 ::::::::::::::---V:S:L:VI:::LVS:L:V::V:HH:KI:::::YLLI:VV:::: NP1576A ::::::::::::::--M:ADAL::::G:LVA:IA:::::R:::::::L::::I:L:V:ES Hbo2874 ::::::::::::::V::T:E::V::VT:L:L::A::VI::::R::::M:::L::::V::: VNG2068 MLARQRARRDTTGGC:MS:GI::V::T::AL::LS:VV::K::::::L:::L:::VV::: HQ3102A :::::::::::::M:G:GG:::AV:::::::::I::I:S::F:::::V:::T:::I:::: HVO_1916 ::::::::::::VA::GGA::::L::::::::::S:V:S::F:::::V::::S::L:::: Hbo1788 ::::::::::::::M::G::::Y:::::::::::S:I:S::F:::::L:::TS::I:::: Hut2020 ::::::::::::VS:GG:DVIVLL::M:FAL::G:::::A::RL::I::Y::::L:I::L Hmu3123 ::::::::::::::-M::TE::LL::G:TA:::L:::::::::I:TI::Y:G::LL:::I consensus V---------LG--VVTPDSFG--DG-LSAIVGLSVAIIVFEGAFHLRIERLREAPAATL #oth 21221111111221224132..11321.431..11.11...1...2.34211.1114233 hla0410 ::::::::::::::L::L:T::::N:::EI:::I:::::::::::A:::::I:G:STVS: NP1576A G:::::::::A:::I::L:T:::::::::VV:::C:SV:::D:::D::T:::::SSV::A Hbo2874 G::::::::::::::I::AV::::::::P::::::::::::::::::NF:::::::RE:F VNG2068 :::::::::::::::::LS:::GI:T::AG:::::::V:::::::::KL:K:::::G:W: HQ3102A ::::::::::::::::G:::::::SA:::::::::::::::::::::::QK:::::T::: HVO_1916 :::::::::::::::IS:::::::NA::Q::::::::::::::::::::DK::::::::F Hbo1788 :::::::::::N::::H:::::::S:::::::::::::::::::::::::K::::::::I Hut2020 SGFV:::::::PSRLFSLET::::A:P::::::::::::::::::::HLD:::::::::F Hmu3123 SGYLADSLPF::GRIID:A::::::A::P:::::::::::::::::::V::I::::::A: consensus RLVTVGAGIALIGTAAAVRFALG-APWPVSFLIGALLVATGPTVITPILEVVPVRDRVAA #oth 111.21.423131.132223232124.631111.1..2......11..141.21.21.32 hla0410 ::::IS:LVMFL::::::::FE:::N:EI:L::::::::::::::::::N::R:::H::: NP1576A :::::::VLT:L:::::M:VFAD:::::TAL:V:::::::::::::::::::H::EH:SS Hbo2874 ::::I::V:S:::::TV:::::D::S:S:A::::S::I::::::::::MN:::::N:::T VNG2068 :::::::A:::F:::IV::VL:::TG:D:A::::S::::::::::::::S::::::::G: HQ3102A K:::I::::::::::IT:::L:S:TS:N:A::V:::::::::::V:::::::::::::E: HVO_1916 :::::::I:SFVA:GVV:HY::::::::::::V::::::::::::A::::::::::::G: Hbo1788 ::I::::::::::::::IHYL:::S::S:::::::::::::::::A:::::::A::::E: Hut2020 ::::L::::::V:::V::KL:F:T:T:GL::::::::::::::::A:::Q:::::::::: Hmu3123 :V:::::L:::L:::I:::::::::S:AL:LT:::::T::::::V::::DI::::::::: consensus ALETEGIVNDVTAAILAVVIFEAILLGATGPDALLQLFAERLGVGVLVGVIVAGVVYYLL #oth 2.11..11...1...3.2.3.2434445753543365.34.1.5.233.43213433142 hla0410 :::::::::::::::V::::::TL::DDL:VP:T:FS:V::::::::A::LATV:I:::: NP1576A L::S:::F:::::::A:::::DVFVT:DG:LA:GVAG::A:F:L::G::LAI::I::TVI Hbo2874 T:::::V::::::::::F:M::FV::ETQ:FPT:IRE:GM:::G:I:::SV:::I:W::: VNG2068 ::::::V::::::::::I:V:RVVENPQRSV:VV::D:VT:::T:::::LV::A::W:I: HQ3102A :::::::::::::::::I::::::TA:V:Q:G::::::T::::I:L:I:A:::TLLV:G: HVO_1916 ::D::::::::::::V:::::::::E:VSS::::VT::::::::::V::A::::SL::A: Hbo1788 ::::::::::::::::::::::::IE:::E:G::MT::::::::::V::TL::AAMF:A: Hut2020 :::::::::::::::T:::V::VVV:SGNP:VE::SA::::::Q:::::::::::::::: Hmu3123 T::::::::::S:::::::F::-:VNP:DDFEG::HG::G:::I:LFF::V::::L:::V consensus RYVDLSPGNAPQNARLLVLAGALVAYGAADAVATEAGIAAVATAGILLGNADIPYEEEIE #oth 333113212111111121.111212113.25324...1..1..2.23...2221212113 hla0410 D-S::V:ERDV:ASQF::::A:VG:FA::E:::A::::::A::S::::::L::NNR:::: NP1576A N-A:IT::::::AS:F:F::A:VGS::::E:F:P::::::A:::::V:::LPL:HR::MA Hbo2874 :H:S::VE::::::::I::VAS::M::I:EI::P:::::::::G:FT::::E:::RGD:: VNG2068 :RI:::K:::::::::V:::::::::::::TLYS:::::::::::V::::::L:::K::: HQ3102A Q:I:::::::::::::::::::::::::::FI::::::::::::::I:::I::::::::S HVO_1916 ::::::::::::::::::::::::S:A:::Y:::::::::::::::::::::V::::::S Hbo1788 ::::::::::::::::::::::::::::::FI::::::::::::::::::::V::::D:S Hut2020 ::I:::::D::R::::::::::I:S:AG:NYLSG:::V::A:::::V:::L::::::D:T Hmu3123 :::::A::D::R::::::::::::::AS:NS::S:::V:::::::F:::::::::::D:: consensus AFKGDITLIVLSFVFIALAALLEFETLLALGLGGLAVVVAVALVIRPLLVFISTVG-DRF #oth 3.2213..2.1.....3..111334513621221132233122.2..22343214223.2 hla0410 R:AENT::V:::::::S::::INV:AIA:::::AV:L:LVIM::L:::GAL:A:A:VE:: NP1576A E:GR:A::V:::::::S::::IDID:IA:::VA:VG::L::T::V:::AIAVA:YDIE:: Hbo2874 R:::::::L:I:::::T::S::SLRDI:S::I::VV::IV::G::::A::ILC::::::L VNG2068 :::::V::V:::::::G:::::S:Q:::D::VA::::A:L::::::::A::A::AR:S:Y HQ3102A :::::::::::::::::::::::::I:RMI::P::GITAI::::L:::::::::R::::: HVO_1916 ::::::::L:::::::::::::D:QN::N::V::::::A::::::::F:::V:AR::::: Hbo1788 ::::::::::::::::::::::::::::R::::::G:::V::::L::::::L:AQ::::: Hut2020 :::::V::L:::::::T:::I::L:V:FDVLVP::I:A::::A::::::MYV:::::G:: Hmu3123 D:::::::::::::::T:::::::S::RTV::A:V::::II:::L::::I:::::::::: consensus TRGERLFMSFVGPRGIIPASVATLFAIELQSE--------------GLPQAA---NILVG #oth .55.2412131...........1...22.3541111111111111123522111154.2. hla0410 ::P::::LAS:::::::::::::::::::ELA:::::::::::::::NVA:G:::EL::: NP1576A :N:::::L:A:::::::::::::::::::AAT:::::::::::::::D:E::ATGQT:L: Hbo2874 :FD:::YI:AI:::::::::::::::L::::Q::::::::::::::-N:::::::TM::: VNG2068 :SA::V:::A::::::::::::::::V:::GY:::::::::::::::M::::::::V::: HQ3102A :S::Q::::::::::::::::::::::::RNA:::::::::::::::MD::::::::::: HVO_1916 ::E:K:::::::::::::::::S::::A::E:ATRLAAEGMTQQAAA:N:S::::S:::: Hbo1788 :T::KW:::::::::::::::::::::Q:RA:::::::::::::::::G::::::DT::: Hut2020 :F:::A:::::::::::::::::::::::::Q:::::::::::::::MAAE:::::V:I: Hmu3123 :LQ::T:::L::::::::::::::::VQ:R:::::::::::::::::::EE::::SL:L: consensus TVFLVILATVVFEGGLARQIAEYLDVIPMRVIIVGGGRVGRALAERLEDRGENVVIIEQD #oth 2..22.25.123.1.1..321231212..11111...2..12.12..13.1.31111142 hla0410 :::A::F:::AI:A::::::GDV:G:S:::T::I::::::::::T:::R:::Y:::V:I: NP1576A A::I::F::::V:A:::::LGDFFG:T::KT:::::::::::::T:::R:::F:::V::: Hbo2874 ::::::VS::::::::::H::QA:::::::TL:I::::::Q::T::::E:D:E:L::DN: VNG2068 ::::T::L:::::::F::H::QA:N::::::::::::T:::::::::::::::::LV:D: HQ3102A :::::::I:::A:::F:::::::::I:::::LV::::T::::::D:::N::::::L:::S HVO_1916 :::::::T:::::A::::R::::::::::::L:I:::K:::::::::A:::::::L:::: Hbo1788 :::::::V:::::::::::::::::::::::LVI:::K:::T:::::::::::::L:::: Hut2020 :::::::::A:V::::::YV:Q:F::::::::::::::::::::D:::::::::::::D: Hmu3123 V:::A::L:AI:::::::Y::::::::::::::::::K:::S:::::::::::I::::KN consensus DEVVERARNEGFTVHHGDGTDTDVLRSAGADNAKIVVAATGDDDVNLLVAQLANSKFDIE #oth 3352243.33.32135..122222.231.241.141321.11..3...12...622.221 hla0410 ::EI::::S::::::E:::S::ET::G::IGD::R:ITV:::::I:::AC:::IT::::: NP1576A ::ELA:::EA:::::Q::A:ES::::A::IED::R:I:::A:::R::::C:::G:::G:: Hbo2874 :QT::TL:AD::S:R:::::QQE::E::::N::RV:A::::T:::::::::::KNT:GV: VNG2068 P:A::::::::Y:::S:::S:::E::A:::E::::LT::::::::::::::::D:::::D HQ3102A Q::::VG::::LA::::::::::::A:::G:::R:::G:::::::::::S:::R::::P: HVO_1916 Q:::QT:::M:::::::::A::S:::::::A:::F:::::::::::::::::::::::P: Hbo1788 P:II:T:::::H:::Q::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P: Hut2020 ETQ::EI::D:::AII::::::::::ES::N:::T:::::::::T::::::::STN:E:: Hmu3123 QS:::S:::A:Y::EY:::A:::T::A:::::::::A::::::::::::S:::S::::V: consensus TVIARANNPDNVDAFEDLGVRTISSSMATAWAIDNYIERPAIANWMTEIGRSGDVQEVEV #oth 5131.1.2.2.21..13211431124311.322.14....1233..2111341.1..1.1 hla0410 A:YS:V:E:::::::DSI::KA:D:PT:::V:::DE::::::TH::S:L:D:H::::::: NP1576A N:LS:V:Q:E::::::TV::TA:DAP::::F::::E:::::::H::::L:DDH::::::M Hbo2874 R:V::V:Q:G:I::::::DIEP::TG:SV::SM::V::::::SR::::L::T:::::I:: VNG2068 :I:::::::::I::::::::S:V:::L::::G:::I:::::LS::::::::::::::::: HQ3102A :IL::V:::::AE::::::::N::T:I:::Q:L::::::::MMD::G:::Y:::I::I:: HVO_1916 S:L:::::::::E:::E::::::::TI:::Q:L:::::::SMS:::G::::::::::::: Hbo1788 :I::::::::::::::E::::::::VL:::Q::::::::::MM:::S::::::::::I:: Hut2020 D:::::::::::E:::::::::::::::V::::::Q:::::::H:::D:D:V:::::::: Hmu3123 R:::::::::::E:::::::::::::::::::M::Q:::::::::::D::HE:::::::: consensus TSEELVGRTIREIGPELPDGCLIALVSRDGETRVPNADFTIEHGDHITFIGRRDAVRDAM #oth 132522.4223123332.533321134.223351.41142215..42.31.3512.2314 hla0410 :A:N:A:K:::DLNAQI:::TFV:V::::::NH::S::SVL:Y:::V::::DT:::KR:: NP1576A :A:::A:G::::LNA:M:S::IV:VIG:GDD::::S::DR::Y::::::L:DA:::DR:V Hbo2874 :NVAI::E::S:LMA:::ED:HL::L:::ETNQL:HPED:::R:::L:::::TE:::Q:I VNG2068 :::::::L::ADLDDD::G:VI:::AG:::DNQ:::PE:::Q::::L::L::KE:::::L HQ3102A :::D:I::P::D::::::PDS::::IK:::NI:::E::L:L::::QV:V::G::E:K::I HVO_1916 :A:R:I::::::V:::::::::VT::::N:D:T::::EY:LQE::R::I::E:E:::::E Hbo1788 ::::I::K:V:D::::::N::::T:I:::::SS::S::::VQ::::::I::GH::::E:: Hut2020 :::N:I::SL:::::::::S::::::N:::::I::::E:::QA::KV:LL:ES::::EG: Hmu3123 CGGTF::KP:N:::SM::EA::::::T:::::T::T:::V::K::M::LL:::ES::EG: consensus KFCHPD-- #oth 55333542 hla0410 :RF::HD: NP1576A :RF::HE: Hbo2874 DH:TG-:: VNG2068 NW::::DG HQ3102A ::I:::K: HVO_1916 ELVN:E:: Hbo1788 Q:I:::E: Hut2020 A:::QS:: Hmu3123 QMVDSPAD