|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3882 | Hut2193 | Hut2050 | VNG2424 | HQ1043A | HVO_2968 | Hbo1569 | rrnAC2696 | Hmu3066 | hla0571 | NP0272A |
2222 | Hut2193 | 3891 | 1636 | 1818 | 1972 | 1897 | 1988 | 2025 | 2026 | 1907 | 2012 |
2385 | Hut2050 | 1636 | 3824 | 2161 | 2128 | 2159 | 2234 | 2089 | 2150 | 2143 | 2211 |
3029 | VNG2424 | 1818 | 2161 | 3863 | 2663 | 2716 | 2807 | 2608 | 2652 | 2705 | 2725 |
3211 | HQ1043A | 1972 | 2128 | 2663 | 3911 | 3025 | 3263 | 2731 | 2844 | 2838 | 2831 |
3235 | HVO_2968 | 1897 | 2159 | 2716 | 3025 | 3846 | 3237 | 2788 | 2942 | 2945 | 2867 |
3393 | Hbo1569 | 1988 | 2234 | 2807 | 3263 | 3237 | 3902 | 2889 | 3012 | 2998 | 3037 |
3197 | rrnAC2696 | 2025 | 2089 | 2608 | 2731 | 2788 | 2889 | 3902 | 3350 | 2799 | 2884 |
3313 | Hmu3066 | 2026 | 2150 | 2652 | 2844 | 2942 | 3012 | 3350 | 3902 | 2908 | 2982 |
3256 | hla0571 | 1907 | 2143 | 2705 | 2838 | 2945 | 2998 | 2799 | 2908 | 3911 | 3040 |
3259 | NP0272A | 2012 | 2211 | 2725 | 2831 | 2867 | 3037 | 2884 | 2982 | 3040 | 3849 |
538 symbols consensus --MKVLVTDPIADAGLERLRDAGHEVETAYDVEGDALLDAVADANALIVRSGTEVTEAVF #oth 11.311..1112....32.13..22.3.322333331132231131121121.41231.1 Hut2193 :::EIV::SSVE::::AA:T::::D:R:VSVDGAEE:AV:AEG:A::::DEE:P:PA::: Hut2050 :::::::::::D::::A:::S::LD:::DF:IDTAGV:EKI::VD:MLI:-:::I:RE:: VNG2424 :::R::::::::::::D:::::::::T::::AT::::::::S::H::::::::A::D::: HQ1043A MH:Q:::::::D::::::::A:::G::::::IGDE:::NTIT:V:::V:::::D:N:::: HVO_2968 ::::::::::::::::D:::E::Y::::::::::::::E::S:::G:::::::Q::AE:: Hbo1569 :::::::::::D::::::::E:::::::::::T::::::::::::::V::::::::D::: rrnAC2696 ::::::::::::::::T:::E:::D:::::E::::::::::::::::::::::::::E:: Hmu3066 ::::::::::::::::::::E::::::::::I::::::E:::::::::::::::::DE:L hla0571 ::::::::::::::::D:::::::::V:D:E::::::::::S:::::::::::D:N:::: NP0272A :::::::::::::::::V::::::::V:N::A::QD:::::S:::::::::::::::E:L consensus EAAPDLVIVGRAGIGVDNIDIDAATDHGVIVANAPEGNVRAAAEHTVAMAFATARSIPQA #oth 32.2213..2.1..1..1..131..21..1...1.211.2.11.121113.14.12...1 Hut2193 :R:T:VQ::::T::D::G::VAT::E:::::::G::AD:Q:V::YIIGLL:::::G:::G Hut2050 :N::N:K::S:::::::::::P:::::::::::::R:::Y::::::IGL::NA:KQ:::: VNG2424 :::::::::A:::::::::::::::::::M:::::A::::::::::::L:::A::::::: HQ1043A :::S::I::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::::::T::G::::::: HVO_2968 :::::::::::::::::::::::::Q:::::::::::::::::::::::G::A::::::: Hbo1569 :::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::: rrnAC2696 A:::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::::::: Hmu3066 S::::::::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::S:::::::::::::: hla0571 :::SE::::::::::::::::E:::::::::::::::::::::::::::T::V::::::: NP0272A D::S::::::::::::::::::::::A:::::::::::::::S::::::T:::::::::: consensus HARLKGGEWAKGDYLGTELNGKTLGVVGLGRVGQEVAKRLDSLGMDLVAYDPYISEERAD #oth .61154.2.11322213.13411112..1111..1..211321.1.21211.12222..3 Hut2193 :V:::D:::::::II:S::D:::A:L::FDS::::::::::N::L:V:V:A:DGDG:::A Hut2050 :MQVQA:G:DGASFDAL::GDM:A:I:::::L:::::W:::N:::::L:::::LG:A::R VNG2424 ::::DA:S:::D:::::::S:::::::::::::::::T::::::::::::::::G:D::A HQ1043A ::::RT:::::SE:::::V:::::::::::::::::::::E:::::::::::::::D::E HVO_2968 :::::D:::::S::::N:V:::I:::::::::::::::KFS:::::I:::::::G::::: Hbo1569 :::::T::::::::::::::A::::I:::::::::::::::GI:::::::::::G::::E rrnAC2696 :D:::S::::::EF::::V:N:::::::F:::::Q:::::GG::::I:TF:::::Q:::: Hmu3066 :E::T:::::::::::::V:H:::::::F:::::::::::G:::::I:TF:::::Q:::: hla0571 :G::L:::::::EF::::V:N:::TI::::::::::::::::::::::V::::::::::: NP0272A :T::::::::::EF:::::::::::I::::::::::::K::::::::::F:::::::::E consensus QLGAELV-DLDECLERADFLTVHTPLTPETEGMIGEDELALMDGGYLVNCARGGIVDEDA #oth 13.1111212233142312212122123114321124.12523321211321.111..4. Hut2193 :I:::R:::::T::D:::::SM:AGADAIQ---L::R::DALGEA::::GTD:NV:::S: Hut2050 :M:I::::E:::L:::V:M:S:QAR::D::R:L::PE:IDRFA:DLI:LTS:::::::P: VNG2424 :::::::::IET:VA::::::I:V:::D::D:L:::A:::R:::::VI:V::::V::::: HQ1043A R:::::::EF:T:::::E:::::::::S::A:::STT::E:::::::I::::::V::::: HVO_2968 ::::::::EF:A::S:::::::::::::::::L:ST:::ET:GS::::::::::V:::A: Hbo1569 R:::K:::EFEA:::::::::::::::::::DL:STE::E::G:::::::::::V::::: rrnAC2696 :F:::::D::ED::AKS::I:I:::::::::N:::::::::L::::V::::::::I::P: Hmu3066 :F:::::DE:::::AA:::::I:::::::::N::::E:::QLED::V::::::::I::L: hla0571 R::::::E::H:A:G:G::A::::::L:::::::::::::QLE::::I:::::::::::: NP0272A ::::::S::::DV:::::V::I:::::::::N:L::A:::K:E:::V::::::::I::P: consensus LAEAVEDGVLAGAALDVFAEEPLPDDSPLLDVDDIVVTPHLGASTEAAQENVATSTADQI #oth ..3.122.4231.12.21331.224111.21112122..11112.42111111323.221 Hut2193 ::N:A:::D:Q:::::AVSVS::::::::R::EN:L:::EIASH:ATNG:SASA:V:A:V Hut2050 ::D:::S:EI:A:GV:::ST::-:E:N:::::ENV::::::::K:HN::V:::VTA::S: VNG2424 ::D:AQ:::I::::::::RT::::AA:::H:A:S:IT::::::::K::::::::D::::V HQ1043A ::A:::::::D:::V::::D::VAP::A::S::N:::::::::::::::::::::I:::: HVO_2968 :::::DA::ID:::V::::D::VSP:N:::S:::V::::::::::S:::::::V:::::: Hbo1569 ::A:::::T:D:::I::::D::VSP:N:::::::V::::::::::::::::::::I:::: rrnAC2696 ::::::::::K:::::::G::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::: Hmu3066 ::::::::I:K:::V:::::::::::::::::E::I:::::::::::::::::::::::: hla0571 :::::D::I:::::::S::::::SQ:::::::E:::L::::::::::::::::ID::EAV NP0272A ::A:::::TV::::::::::::::::::::::E:VI:::::::::::::::::V:::E:V consensus VAAFNGEPVMNALNAPSVDESAFPRIRPYIDLAETAGKIAAQLLDGRIESVEVTYAGDIA #oth 31.24131.61.1.21.52434222241133111.1221.32.12233441322.3.121 Hut2193 L:::D:Q::S::V:V::IPPD:Y:VVK::A::T::VAR::I::F::DL:::SIE:::::V Hut2050 IS:LE:DL:Q::::LS:T:A:SD::T:G:V:V::::S:::LR:FE::V::I:IE::::L: VNG2424 :::LA:D::V:::::::AER:::D::::FV:::::::TV::A:F:P:::R:D:::Q:EV: HQ1043A D:::A:A::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::S::S:S:E:::: HVO_2968 ::::RD:::I::::::::::::::::Q:::G::::::::::::::::LNE:::::T:::: Hbo1569 D::::::::::::::::::K::::::::::::::::::V:::::::::SN:::S:E:::: rrnAC2696 I::A::Q::A:::::::L::AT:KQVG::L:::D:::R::V::FG:HMSE:Q:::::::: Hmu3066 :::::D:::I:::::::I:::I::Q:::::E::D::::::V::F::QMG::::::::::: hla0571 L:::DD:::LT:::::::::T:::::K:::AV::::::V:::::::::TG::T::E:::: NP0272A :::::::::::::::::M:::::::VE:::::::::::::V::::S:V:N:::::E:::: consensus DEDVELVTASALKGVFAPLEWQVNAVNAP-RIAEERGIDVTESKTRQSEDFQSLVTVTVS #oth 4112322..122311.322211212.1.1132.231..4.31114232211.1.1211.2 Hut2193 T:TI:PI::AG:T:::D::G:DA:Q:::R:HV:D:H::::DV:TI:EAP:::N::::::: Hut2050 :::TN::::A----::N:FG::DVV:D::T::::Q:::Q:V:::R:ET::Y::::SI::: VNG2424 ::::A::::A:QQ:A::G:::::::::::::V::::::A:::T:NHR::AY::::S:::G HQ1043A ::::::A:::::::::E:::::::::::::Q:::::::::::::RL::D::::::::E:: HVO_2968 A::I::::::::::::::::::::::::::QV::::::E:V:::S:::D::::::::::R Hbo1569 E::I::::::::::::E:::::::::::::::::::::E::::::::A:::::::::::G rrnAC2696 E::::Y:::::::::::SSDL:::::::::Q::KD:::::::::::T:::Y:::I::::: Hmu3066 :Q::::::::::::::::S:L:::::::::Q:::N::::::::::::::::::::::::G hla0571 E:::D:::::::::::E::::::::::::::L::::::E::::::::T:::::::R:::R NP0272A S:::::::::::::::E:::::::::::::S:::::::G:S:T:R::A:::::::::::: consensus NGDDELSVCGTLFAGEDPRIVRIDGYRVDAIPHGHMLVARNRDEPGVIGFIGTVLGEYDV #oth 2133232.2..1.21311.1.31122121.3.3.2.112..4.2..1..31.2.2.2421 Hut2193 G:G:::::E::Q::DGE::::S::R:W:E::::::::IV::A:::::::::::::::::: Hut2050 D:VR::T:S::::GDNE::L:E:::F::::T:Y::::IS::::::::::AL:S:F::::: VNG2424 :::A::T:S::::::D:::L:E:::F::E:A:N::::::::H:T::::::::G:::TAE: HQ1043A ::::Q:A:S::Q:T:GE::::K::::::::V:::K::::::A:K::::::::S::::HNI HVO_2968 :::E:MT:S::::T:::::::::N:::L::::Y:Q::::::Y:K:::::::::::::N:: Hbo1569 :D:ES:::::::::::::::::::::::::::::Q::::::Y:K:::::::::::::N:: rrnAC2696 D:EESV:::::Q:G::E:::::::DH:IE:V:::::::V:::::::T::::::::::A:I Hmu3066 D:E:SV:::::Q::::::::::::DH::::V:::::::::::::::T::::::::::S:I hla0571 :::::IA:E::::::::A:::::::F::::V:Y::::::::T:::::::L::::::D::: NP0272A D:EE:IA:::::::DD:A::::V:::::::::G:K:M::::T:::::::H::::M:T::: consensus NIAGMFNAREAI-GGEALTVYNLDDDVPEDVLERLLADDRIIEVTYITLNG------- #oth .....2.1.14531...111..1.3422633423.33.4.23213523.335532311 Hut2193 ::::::::::::::::::S::::::EPG::::AA:ND::::L:T:VVE:::QNARE:: Hut2050 :::::A::::S::D:::MS::::::P:TPEL::E:ES:T:VTG::A:D:D-::::::: VNG2424 :::::::::::R::::::::::::A:::ARA:DE:AG::::VD::S:E:::E:::::: HQ1043A :::::::::RD:E::::::I:::::S::T::V::::::E:M:D:R:L::::ASDTK:: HVO_2968 :::::::::R:KA::::::::::::::::S:R:K::::A:::D:DL:::--::::::: Hbo1569 :::::::::RSAD::::::::::::PI::E:S:K::::E::TD:K:L::::TAE:::: rrnAC2696 :::::::G::T:::::::S:::::EQP:Q:II:::ND:S::::T::VE:GDE:::::: Hmu3066 :::::::G::V:::::::S:::::EPPTS:::D::NG::::::TK::S:DNGE::::: hla0571 :::::Y::::TQ::::::::::::Q:::DEAI:A:::::::V:::E:::DDADERPAE NP0272A ::::::::::TH::::::::::V:QE::DEAR:E:ES::::::TK::S::::::::::