|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2402 | Hut0589 | NP5036A | rrnAC3071 | hla0193 | VNG2122 | HQ3234A | HVO_0329 | Hbo1151 | Hmu2758 | Hut2725 |
1753 | Hut0589 | 2631 | 1579 | 1582 | 1610 | 1601 | 1617 | 1585 | 1606 | 1625 | 1631 |
1915 | NP5036A | 1579 | 2436 | 1802 | 1870 | 1787 | 1792 | 1733 | 1799 | 1716 | 1663 |
2004 | rrnAC3071 | 1582 | 1802 | 2976 | 1859 | 1916 | 1807 | 1791 | 1849 | 1861 | 1816 |
2036 | hla0193 | 1610 | 1870 | 1859 | 2390 | 1842 | 1885 | 1945 | 1933 | 1695 | 1722 |
2100 | VNG2122 | 1601 | 1787 | 1916 | 1842 | 2394 | 1903 | 1913 | 2008 | 1726 | 1831 |
2090 | HQ3234A | 1617 | 1792 | 1807 | 1885 | 1903 | 2387 | 2018 | 2019 | 1770 | 1837 |
2102 | HVO_0329 | 1585 | 1733 | 1791 | 1945 | 1913 | 2018 | 2404 | 2026 | 1691 | 1791 |
2131 | Hbo1151 | 1606 | 1799 | 1849 | 1933 | 2008 | 2019 | 2026 | 2392 | 1703 | 1800 |
1889 | Hmu2758 | 1625 | 1716 | 1861 | 1695 | 1726 | 1770 | 1691 | 1703 | 2422 | 1815 |
2009 | Hut2725 | 1631 | 1663 | 1816 | 1722 | 1831 | 1837 | 1791 | 1800 | 1815 | 2361 |
397 symbols consensus ------------------------------------------------------------ #oth 111111111111111111111111111111111111111111111111111111112222 Hut0589 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MAEI NP5036A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3071 MCGADGQIPLKRLCSPGQCSVLAVRDNATLTRGGIVNTLNHGNQWGRYDTRRDSRRHHPR hla0193 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG2122 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3234A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0329 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1151 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu2758 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2725 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus -----------------MGFEEM-----DVDTIWMDGEFVDWEDAQVHVLTHALHYGTGV #oth 2222122222332232234.232111112231..22.1131111.12...1.2....111 Hut0589 TFTPSGFGQGMSDGTMPT:::AKREASDTL:::::::::IP::::TI:::S:::::::S: NP5036A ::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::::::DE::T:::::S::::::: rrnAC3071 APRLSAHRRGRAMSDRPEM::--:::::GT:R:::::::::F::::T::::::::::::: hla0193 ::::::::::::::::::::D:::::::::::::KN::YL:::::TT::::::::::S:: VNG2122 ::::::::::::::::MPS:S::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:I HQ3234A ::::::::::::::::::E:D:::::::::E:::Q::S::::D::T::::::G::::::: HVO_0329 ::::::::::::::::::::D:::::::::S:::QS::YK:::::T::::::G::::::: Hbo1151 ::::::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::D:::::::::G::::::: Hmu2758 :::::::::VGTMSERPEM::--:::::G:E:::Q::::::F:::::::::::::::::: Hut2725 ::::::::::::::::::S::D::::::::G:::::::::::::::::::::G::::::: consensus FEGVRCYDTDNGPAIFRWEEHLDRLYQSAKPYDMEIPFTREELTEATLELIRRQDLESCY #oth ...1.3.1.34.1.1...12..2.114.1221131.42431.1.2..211142221422. Hut0589 :::::::E:AD:::L:::DA::::::N::AM::LD:G:D:::::T:::::LA::::GG:: NP5036A :::A:::::ED:::L::::::::::FE:::VL:HD:DH:H::I:D:::R:::E:G::::: rrnAC3071 :::::::::EQ:::::::::::::::K::::::LD:E:SKD::::::T:::ETEGF:::: hla0193 :::::::::EQ::::::::::::::FD:::M:::::EYS:::I:::::::LD::::D:A: VNG2122 :::::V::::::::::::DD::Q:F:E::::::LD:E::PD:::D::V:::Q::::G::: HQ3234A :::::::::Q::::::::D:::E::::::Q:::::::Y::::::T:::::L::EK::::: HVO_0329 :::::A::::R:::::::::::E::::::::::::::Y:::::::::::V:::N::DGG: Hbo1151 :::::::::EK:::::::::::E:::D:T:::::::S:EP::::::::::L:::::NEA: Hmu2758 ::::::::::D:::::::::::::::E:::V::I:::Y:P:::::::V:::::EG::::: Hut2725 :::::S::::::A::::::D::::::::::::G:::::N::::::::::::E:E::P::: consensus IRPIAFYGYDSLGVSPGDC---PTDVAIAAWPWGAYLGEEALENGVDVMVSSWRKHASSQ #oth 1..2111.133..11.424111.2423212...12...12.113.11221.1...2111. Hut0589 V:::::::::R:::::TTPTKL:ER::::::::ES::::S:::D:I:AG::::::YGHD: NP5036A :::LVY:::N::::::E:::::::KTMV:C:::::::::D:I:::::::::T:::::::: rrnAC3071 ::::VY::F:::::::K:::::::KTT::::::::::::::::E:::::::::::::::: hla0193 :::L:YF:::::::::K::::::::LVL:::::::::::::::E:::::::::::::::: VNG2122 :::L:Y:::E::::::::::::::::::::::::::::DD:::::::::::T:::::::: HQ3234A :::V:::::G::::::::N::::V::::::::::::::::::TK::E::I:::::::::: HVO_0329 ::::::::::::::::K:N:::::E:::::::::T::::D:::::::::::::::::::: Hbo1151 :::::::::E::::::::::::::N:T::::::::::::D:::::IE::::::::::::: Hmu2758 :::::::::GP::LN:SES::::VET::GV:::::::::::::E:I:TAI:::::::::: Hut2725 ::::::::::M::LN:::A::::VK::::V:::::::::::::E::::AI:::::F:::: consensus IPTNAKTTGLYVNSMLAGEEARRNGYTEAIVLNKEGNVAEGPGENIFLVRDGEIYTPGLA #oth 1.122.1..2.1.12..22..32.114...1..1..2........1.112..112.1.11 Hut0589 ::PT:::::A:::GV::TD::A::::D::::::S:::::::::::L:::D:::::::::: NP5036A ::::V:A::P:I::::::::::::::V:::::::::K::::::::::M:N::::::T::S rrnAC3071 ::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M:::::::::::: hla0193 V:::V:::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::M:N::::::T:P: VNG2122 :::::::::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::::::::::LF::::S HQ3234A ::::::::::::::L::::::::::::::::::::::::::::::::MI::::::::::S HVO_0329 ::::::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::M::::K::::::S Hbo1151 V:::::::::::::L:::::::::::R::::::::::::::::::::::::::L:::::S Hmu2758 :::S:::::A::::V::SL::KG:D:G:::::::::::::::::::::::::::::T::: Hut2725 :::::::::P::::V::SL::EE:::::::L:::::Q::::::::L::::::::H::::: consensus ESILDGITRDTVITLAEERGYTVHDDATISRGELYTADELFFTGTAAEVTPIRSVDDVEI #oth 112.1....312.2..213..1.12424.1..1.21......1.1.1.....12..132. Hut0589 :DA::::::QS::E::R:A::::::::R:G:::::::::::::::::::::::::::RA: NP5036A :::::::::::::E::RDL::::::E:A:G::Q::::::::::::::::::::::::T:: rrnAC3071 ::::E::::N:A::::::M:::::EE:::::::::::::::::::::::::::::::N:: hla0193 Q:::E::::::::E::K::::::::E:V::::Q:::::::::::S:V::::::::::T:: VNG2122 ::::::::::::::::::::::::::VS::::::H:::::::::S:::::::KQ::N::: HQ3234A :::::::::N:::E::RD:::::::R::::::::N::::::::::::::::::K::N::: HVO_0329 Q:::::::::::::::R::::E:D:S::::::::N:::::::::S::::::::K::N:V: Hbo1151 :::::::::N:L:::::::::E::ENTS::::::N:::::::::S::::::::Q::N::: Hmu2758 :::::::::RS::::::DL::::::::::::::::A:::::::::::::::::::::N:: Hut2725 ::N::::::Q:::D::::::::::A:::::::::::::::::S::::::::::::::T:: consensus GAGTRGPVTEELQQAFFDLVERRTDDHEEWFTYV--- #oth .5.22....111.21...22234535212..321322 Hut0589 :::SK::::DD::TR:::::SGPV:T::A:::R:H:: NP5036A :N:G:::::::I::R:::::DGKL:GYD:::LP:ETE rrnAC3071 :E::K::::D:::S::::VI:--SG:R::::H::::: hla0193 :S::C::::::::S:::::::::::A:DD::::L::: VNG2122 :S:::::::::::T:::::::--AG:R::::H::::: HQ3234A :D:S:::::::::::::::ID:E:SA:::::::L::: HVO_0329 :E:::::::::::S::::::::::::::::::::DEQ Hbo1151 :N:S:::::::::::::::::::::::D:::::L::: Hmu2758 ::::K::::D:I:TR:::IL:EPPEQYDD::K::::: Hut2725 :L::K::::D:I::::::V::--SGER::::::::::