|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3455 | VNG1524 | HVO_B0261 | hla2274 | Hmu1658 | HVO_2871 | Hbo2637 | hla1070 | rrnAC0382 | HVO_2091 |
2405 | VNG1524 | 3549 | 2028 | 1865 | 2110 | 2210 | 2192 | 2191 | 2092 | 2002 |
2659 | HVO_B0261 | 2028 | 3497 | 2916 | 2280 | 2275 | 2279 | 2227 | 2076 | 2037 |
2546 | hla2274 | 1865 | 2916 | 3444 | 2163 | 2217 | 2239 | 2173 | 2029 | 1960 |
2668 | Hmu1658 | 2110 | 2280 | 2163 | 3441 | 2424 | 2321 | 2525 | 2110 | 2064 |
2851 | HVO_2871 | 2210 | 2275 | 2217 | 2424 | 3448 | 2687 | 2611 | 2206 | 2188 |
2817 | Hbo2637 | 2192 | 2279 | 2239 | 2321 | 2687 | 3461 | 2703 | 2272 | 2161 |
2823 | hla1070 | 2191 | 2227 | 2173 | 2525 | 2611 | 2703 | 3432 | 2219 | 2144 |
2555 | rrnAC0382 | 2092 | 2076 | 2029 | 2110 | 2206 | 2272 | 2219 | 3387 | 2456 |
2476 | HVO_2091 | 2002 | 2037 | 1960 | 2064 | 2188 | 2161 | 2144 | 2456 | 3367 |
470 symbols consensus MDRDTAEPDVDSLPGPNAREWVEYHHEHAAPSTYVYEFVWDITADAEGPFCTDVDGNVLL #oth .1.1113.51422..23142..21.2231.1.1.111....224213...1..3.....1 VNG1524 :::E::::::R:M::EK:A:::NF::N:::::::::D::::::E::I::::::::::::M HVO_B0261 :N:::::::AAA::::::EK:::F::::::::E:SH:::::V::E:D:::V::::::::: hla2274 :N::::::IA:AI:::::QR:::F:QS:S:::E:SH:::::V:RE:D:::V::::::::: Hmu1658 ::::SV::T:GD:::ER:S::::::::::::::::::::::RD:P:I::::::::::::M HVO_2871 :::E::V:R:::M::EK:::::A:::::::::::::D:::::::ES:::::::I:::::: Hbo2637 ::::::T:Q::::::D:::::::::RSN::::::::D:::::SS:::::::::::::::: hla1070 ::::::A:::TD:::DR::::::::::S:::::::::::::R::P::::::::::::::M rrnAC0382 ::::::::C:::M:::QSS::::::::T::::::::D::::::E::I::::::A:::::: HVO_2091 ::::SV::T:T:::::K:S::::::QST::T::::::::::::K::V::::::P:::::: consensus DFTSHVAAAPLGYNNPKILDRLREFDLVDPLKIAGQDFYVSGGGSPEEAELPGPAHLMDR #oth .1.2.11.2.1....1133222431.1.1.2.1....1.335144134442.1223.112 VNG1524 ::::::::::F:::::::M:::ES::::::::M::::::AG::TD::SP:I:TATQ:L:: HVO_B0261 :::C:IG::::::::E:V:SK:::::::E:M::::::M:FGA:PD::T::F::AS::::K hla2274 :::C:IG::::::::E:V:SK:::::::E::::::::M:FGS:PT::D:DF::SS:::ET Hmu1658 :W:G::G:M::::::::V::P:SA::::E:T::::::::AT:T::----D:::A:G:::: HVO_2871 :::::::::::::::::LT::MA:::::::T::::::::::D:SA:G:ER:::::A:::: Hbo2637 ::::::::::::::::::M::::::::::::::::::::::N:ER:G:E:F::::G:::: hla1070 ::::::::::::::::::MEP:A:::::::::::::::::A::E::GD-G:::SSG::E: rrnAC0382 :::C::::S::::::::M:::AD:::M::::::::::::I:T::::D:TS:::::::::K HVO_2091 ::::::::::::::::ELRS::DDL:::::M::::::::::T:::::T:S:::::::::: consensus LTDITSHYGMDTVFLSNSGAEAVENAIKICYDHRAGAKYGITFDGAFHGRTLGALSLNRS #oth ..12121.12.......1....1...1..3115552312141.2.1.......1...11. VNG1524 :::::A::DL:::::::T:::::::::::::NN--:GHRAL::::::::::::::::::: HVO_B0261 :::VS:::::::::::::::::::::M::TH::E:P::::YA:E:S:::::::T:::TK: hla2274 ::::S:Q:::::::::::::::M:::M::TH:Y::P::::VA:T:S:::::::T:::TK: Hmu1658 ::::S::::::::::::::::::::::::S::::R:-::A:::E:::::::::::::::: HVO_2871 :::L:::::::::::::::::::::::::A:::AD:::::V::E:::::::::::::::: Hbo2637 ::::::Q:D::::::::::::::::::::S::ESD:::::FA:E:::::::::::::::: hla1070 ::E::A::D::::::::::::::::::::A::DSG:::HA:::::::::::::::::::: rrnAC0382 ::::::Q:DF::::::::::::::::M:::::NCETP::::::::::::::::::::::: HVO_2091 :::L:D:::L::::::::::::::::::::::ACETP::::::::::::::::::::::: consensus KSVYRRKFPEISGIHDVPFCDDR-CSG--ESCSCGFFA-DG-A--SRLRRKLDPDRGHID #oth .3111141.112113221114224143114412112241321333251252.3334.123 VNG1524 :AIH:KG::::G:VVS::Y:T--::E:::-E::::WKT:N::PGGNVAAD::HH:::V:: HVO_B0261 :E::T:HY:QVA::ET::::A:SG:::DDDA:D:::::G:::-::::::NS:S:EG::VN hla2274 :D::T:QY:Q::::ET::::A::G:DA::A::D:::::GG::-::::::NM:A:EG::V: Hmu1658 :A::::Q::::ATV::A::::::H:TP:::::D::::TG:::-:::V:G:M:::KT::V: HVO_2871 :::::::::::::VL::::::::T::P:::T::::::P::ADSAV:K::Q::H:KK:::: Hbo2637 ::::::::::::::V:L:Y::K:T:::::G:::::::P::::SDV:A::K:::::K:::H hla1070 ::::::D:::::::::A::::::N:TA:::T::::::V::::::::Q:::::::E::::: rrnAC0382 :::::::::::::::::EYSE--:---::---------:--::GVE:::S:::A:T:::P HVO_2091 :::H::::::V:::::::YSM--:---::---------:--::GLET::D:::DTH::LP consensus PDEVAYLILEPIQGEGGYRFPSDAFMAEVAAVCDEHDIPLIADEIQSGVGRTGEMWGSDH #oth 122111313..2..1...12.122.56223124231121212..1.2.1.....2.13.. VNG1524 :E::::::M::Q:::::::V:N:D:I:DI:DIQRT::::V:S::::A:L:::::L::I:: HVO_B0261 :::::FA:::::::V:::::::E::::::GD:::TY::::VV::::::::::::::AA:: hla2274 :A:I:F:T::::::V:::::::E:::N:::::T::Y::::VV::::::::::::::A::: Hmu1658 ::D:S:I:F::::::::::::::::AT:I:DIAER:GV:IVV::V:T:L:::::W::::: HVO_2871 A:::::V:V::::::::::::::::VE:L:::V:DY:LT:::::::T:::::::L::::: Hbo2637 ::D:::I::::::::::::I::::::D:L:::T::Y::T::S::::A::::::::::::: hla1070 ::D::::::::::::::::::::::TD:I::LV:::::T::::::::::::::::::::: rrnAC0382 :E:::F:::::::::::::V:NPE:LSA:DDL:R:::::I::::::::::::::::AV:: HVO_2091 A:Q::F:::::V::::::HV::E:::R::Q:I:::::::V::::::::::::::L:A::: consensus YPIEPDVITSAKALRVGATISRSDVFPDEKSRLSSTWGAGDILASMQGALTLDAIEEYDL #oth 2421..1.11..1......112432..3123..1..1.1..222232.22.121.4231. VNG1524 TE::::::::::G::::::VANE:L::S:TG:::::::::::V:AA::VA:I:::TSDG: HVO_B0261 ::::::::A:::G::::::V::T::::T::N::G::F:G::L:::::::::::::::::: hla2274 :A::::::A::::::::::::::E:::S::N::G::F:G::V:G::M:::::E::Q:H:: Hmu1658 ::FD::::A:::::::::::ASA:::::::G::::::::::V::CA:::::I:::::::: HVO_2871 ::L:::I::G::G::::::::NDGI::::T::::::::::::VS::::VF::E::::::: Hbo2637 FS:::::::::::::::::::::::::E::::::::::::::I::L:::::::::HD::: hla1070 :AL:::::::::G::::::::::::::E::::::::::::::I::A:::::::::R:H:: rrnAC0382 :D:::::::::::::::::V::::I::S:T:::::::::::::G::R:::::A:::DH:: HVO_2091 :DL::::::::::::::::VANEAL:::TEA::::::::::::::I::T::::V:Q:Q:: consensus LDNATERGRQFRERLRDAAPDT--VTDVRGKGLMLAVEFDTKERRDAVQEAALQRGLLTL #oth 1111231.332534332333463313....3..1111...112..32.4222333...1. VNG1524 ::HVVA::E:TTD::H::D::F::::::::R:::::::::::K::E::VN:CVK::::V: HVO_B0261 ::::::::::A::L:A:D:::H:::V::::::::::::::::K:::::V::::D:::::: hla2274 :A:::R::::A::L:::D:::::::V:::::::::::::::A:::A::V::S:D:::::: Hmu1658 :::::::::A:V::F:::TAQSAA:E::::E::L::::::S::::E::I:::M::::::: HVO_2871 ::::VA:::::I::M::D:::::::V:::::::L:::::::::::::::::::K:::::: Hbo2637 M:::V:::Q::KQFV:::DLGP:::::::::::::G::::S::::ND::::C::K::::: hla1070 M::::V:::::K:TM:::DLPG:::D:::::::L::::::S::::::::KG:FS:::::: rrnAC0382 ::::A:K:TY:MD:::EISAGRSL:E::::L:::T:L::::AD:::::M:T:::H::::: HVO_2091 MA::::K:TR::SD:SRL:ER:PCL:::::L:::T:::::::D:::E:L::::SE::::: consensus GCGHKTLRLLPPLDVTEREIELGADILLDAIDDVA--------------- #oth 2..5222.2.....2.3..1212543153143322454343211111111 VNG1524 ::::::V:::::::::::::DIAV::::E:L::PDVRHAGTSKVEGEPTA HVO_B0261 :::K::I:::::::S::::::::VG:FCE:M:A::TEAVA:::::::::: hla2274 :::T::I:::::::A:::::A::TG:F:::::A:SASATAT::::::::: Hmu1658 :::R::::::::::S:R::::::SGL:A::::A::::::::::::::::: HVO_2871 S::Y:V::I:::::::A:::D:::TM:::::E::S::::::::::::::: Hbo2637 A::YDVI:I::::::::::::I::SLFC::VE::S::::::::::::::: hla1070 A:::DV::V::::::::::::::C:L:TS::A:A:::::::::::::::: rrnAC0382 :::Q:S:::::::::::::L::CL:::DSVFTE::DPVASA::::::::: HVO_2091 :::KRS::::::::::D::LD:ALEC:ET:L:S::THRVRST::::::::