|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3914 | HVO_1056 | Hbo0553 | VNG1721 | rrnAC0755 | VNG1284 | Hut1917 | VNG2565 | NP6112A |
3102 | HVO_1056 | 4179 | 3205 | 2858 | 2828 | 1871 | 1936 | 1548 | 1596 |
3146 | Hbo0553 | 3205 | 4149 | 2864 | 2924 | 1966 | 1910 | 1635 | 1651 |
3027 | VNG1721 | 2858 | 2864 | 4185 | 3032 | 1906 | 1874 | 1582 | 1663 |
3038 | rrnAC0755 | 2828 | 2924 | 3032 | 4228 | 1934 | 1881 | 1644 | 1625 |
2387 | VNG1284 | 1871 | 1966 | 1906 | 1934 | 4031 | 2520 | 1928 | 2027 |
2361 | Hut1917 | 1936 | 1910 | 1874 | 1881 | 2520 | 3849 | 1942 | 1923 |
2025 | VNG2565 | 1548 | 1635 | 1582 | 1644 | 1928 | 1942 | 3846 | 2488 |
2049 | NP6112A | 1596 | 1651 | 1663 | 1625 | 2027 | 1923 | 2488 | 4110 |
610 symbols consensus -----------MPADLATIARDVGRLLAAESGLMTVSVLVALVFQEFYAALAFLVAAGVT #oth 12133323333455334211..2.221343221252122.22133.12222113411243 HVO_1056 :MPRRGRTVSGW:::::V:G::::S:::M::A:::A:::::VG:R:W:::::::A:G:A: Hbo0553 MAPSRRPTVAGW:::V:I::::::S:::L::A::::::::::::::W:V:F::FT:G::: VNG1721 ::::MSRANANRRR::::::::::G:VLIAA:::SA:::::AG:::W::::G::L:G:LS rrnAC0755 :::MSRRNGGLF:T::Q:::::I:S::LM:A::::ITAA:::G:::::::FG:FT:::M: VNG1284 ::::::::::::VDR:G:::::L::M:E:LA::IF:::::P::WG::WVVP:MV:SGLIP Hut1917 ::::::::::::NGTT:::G:::::I:E:LG:::I::IV:P::WG:WFG::::GIS:L:P VNG2565 ::::::::::::HVAVD:VG:::::I:Q:V:L:LAA::A:VA:NG::F:IP::V:S:A:M NP6112A :::::::::::-MGTFS:V::::::I:QVV:LMLV::AV::V:TS::F:VP::::S::IM consensus AAVGLGARRRFADAPAPRMKHGMVIAAAGWLAVAAFGSLPFLLTAWFAPLAVLAALVPAG #oth 242.321334233.33142221.22..31.343222.21..313.235424455653134 HVO_1056 :F::::::KA:::::::::::::I::::::F:T::::::::F:::H:::QG:FT:::::: Hbo0553 ::F:::::VA:E:::D:::::::I:::::::MT:V:::::::F::Y:L:PE:A:SY:::: VNG1721 :T::GL:::::::::::K:::::::::G::F:I:VV:A::::F:::LT:P:AM:RF::TD rrnAC0755 :G::GL:N:G:S:::::Q:::::::::G:::L:::::::::::::::T:P::MDTF::V: VNG1284 LV:::TL::T:EH:AD:GRL:::M:::S::FL::::::V::::A::T:Q:DPGMLD:::R Hut1917 L:::Y:LH::::E:DS:SRL::::V::T:::F:GI:::V::::V::GVH:G-----L:T: VNG2565 GGI:T:LA:LCRG:RP:KKPDA::T::TA:AV:GVL:A:::V:V::TMR:HL:PG:T:PL NP6112A ::I:T:LAQ:Y::::SSGKLEA::T::SA:GVLTIL:G:::IFI::TIY:DP:P:WANTP consensus VD---WA----------SSLAYFRNPLNALFESMSGFTGSGLTMAIHEPSLPRALQWWRS #oth 6411154522112121231242.24..112..11..1.11....234.33..1221...1 HVO_1056 :::::Y:Q::::::::::::V:::D::H::::::::W:::::::G::::::::TI::::: Hbo0553 :::::Y:T:::::::::::IQ::::::H::::::::W::::::::VN:::::::I::::: VNG1721 AT::::TAVSVGNTTTL:::::::Q::H::::::::W::::::::::::::::SI::::: rrnAC0755 T:TST::PIRVGGTTTL::::::::::H:F::::::W:::::::::::::::::V::::: VNG1284 FT:::VPG:::::TRTF:T::A:Q::::GF:::::::::T:::::DN:AA::HT:::::: Hut1917 LE:::GT::::::::::PT::A::E::::V:::::::::T::::TDD:AV:::T:::::T VNG2565 N-:::--::::::::::ATTRV:LH::::V::TI:::::T:::::TT:GD:::::H:::: NP6112A EM:::IS::::::::::DTTDV::H:::GF:::I::::ST:::::VV:DD:::S:H:::: consensus LIQWVGGVGVIVLTVAILAR--PGSGSYALYESEAREEKIH--PSVVSTVRTIWKIFVGY #oth 12111.....1...11..2.1111...11.121...21.1111..111..211.212212 HVO_1056 :::::::::::::::S::S::::::::::::RG:::::::::::::::::::V::::::: Hbo0553 :::::::::::::::S:::::::::::::::R::::::::::::::::::::V::::::: VNG1721 :T::::::::V::::S:::::::::::::::R:::::K::::::::::::::V::LV::: rrnAC0755 F::Y:::::::::::S::S::::::::::::Q::::::::::::::::::::V::LV::: VNG1284 F:E:::::::::::T::::::::::::LT:::::::S::::::::I::::::::W::LLF Hut1917 FSE:I:::::::::T::::::::::::LT:::::::S::::::::I::::::::W::ILF VNG2565 :TE:::::::::::::::R:GDGS::::T:::::::S::::::::IIT::QE::RL:::L NP6112A FTE:I::::::::::::::::::::::LT:F:::::KK:SKVL:::::::KE::::YL:L consensus TLVSIALLFVAGRASD--YG--------------------LPLWD--WQAINHAMTGLAT #oth .242232.25.133222222431111111111111111111.4.32211.1..2...12. HVO_1056 ::L:VVV::::I::::::::AT::::::::::::::::::::::EVA:::L:::::::S: Hbo0553 ::::VTV::::I:L::::::SS::::::::::::::::::::::EAG:::L:::::::S: VNG1721 :V:GV:V::::I::::::::AA::::::::::::::::::::V::AA:::L::T::::T: rrnAC0755 :VL:F::::G:IL:::SE:AES::::::::::::::::::::::EVA:::L:::::::T: VNG1284 :FF::L::WI::----::--::::::::::::::::::::M:M::::--::::::::::: Hut1917 :F:::LA::A::----::--::::::::::::::::::::M:I:G::--::::::::::: VNG2565 ::GA::::LL::----::--::::::::::::::::::::M:P::::--::::G:::I:: NP6112A :VA::L::LF::PVWAAAT:QASFVEELLAVLGNGDPAVGM:::P::--::::G:::I:: consensus GGFSVTDNSIATYDSPLIEAALLPIMVLGAIAFPVHYLILQGRDLRNLYGDLQTRWLFIL #oth ...11222..22.2213123122.1.41.1....1..3215212443343....1.1234 HVO_1056 :::A:::G::G::::::::TV:::::A::::::::::A::KN::VDR:W::::::::LV: Hbo0553 ::::::N:::T::::::::FV:::V:S::::::::::VV:RD::FSE:L:::::Q::L:A VNG1721 ::::::::::::::A:V::::::::::A::::::I::RL:AD::HGV:R:::::::::V: rrnAC0755 :::::::::::::N:::V:TV:::::I::::::::::VV:HD:QV:E:VT:::::::::: VNG1284 ::::I::::::::G:AA:DF::I:V::::S::::I:::V:::-::::::T::::::V:GF Hut1917 ::::I::::::::::A::D:V:I:::L::S::::::::::::-::::I:E::::::V::Y VNG2565 :::A:RAG::GA:N::A::Y:TV:::IA:S::::::::LFT:-::::V:A::::::VVAW NP6112A :::::HAA::GE:G-:I:QY:VI::::A:S::::::::::K:-EIK:F:A::::::V:GW consensus FAVGVVLLAAQNLVSGPATT--AF-------GQADSL----ADAFRDATFQFVSALSCTG #oth 243.313.4331465434332423454454515444433334423.324.111..211.. HVO_1056 ::::A:A::V:::::L:::AGS::VETADYF:L:GVAGGPES::V:::A:HW::::T::: Hbo0553 :I::::V:GI::V::I:F:::K::EGGANWL:IGSLINPVV::::::S:::WI::::::: VNG1721 LGG:::V:::::VAAV:V:P:D:VTQWTPAI:DVPV:SPAQ:::A::::::W::::T::: rrnAC0755 LT::::G:SV::AW:V:::::E::ATQSFLPVSVPM:NAAQL::V::S:::W:::::::: VNG1284 ::L:TA::T:VL:QQ:YYV:ESVAVAGVVLH:S:AT:::::FQTV:Y:L::::::A:::: Hut1917 MSL:SA::W:FL-----YV-::--::::::::PY::P::::LS:L:YGG::::::AT::: VNG2565 ::::AAV:S:LLFYT-----::--:::::::::Y::::::::AS::IGL::::::T:N:: NP6112A ::I:S:::TTVL:LG:D:S-::--:::::::::F:TF::::EET::A:F::::::A:N:: consensus FQTA------PIGA-----WSAGGKLLVAGAMVIGGAAGSTVGGIKIIRGYTLIRGIIWQ #oth .12111111221.511112152222332321.33.1......1.1.1..32.221.2321 HVO_1056 ::A::::::::L:::::::::D:::I:LS:::TL::::::::::::::::::IS:::R:: Hbo0553 ::S::::::::::K::::::::::::ILS::::::::::::::::::::A::IS:::A:: VNG1721 ::S::::::::::N::::::I::::I::V:::T::::::::::::::::A::AV::F::: rrnAC0755 ::S::::::::::R::::::L::::V:::::::L::::::::::::::::::IV:::::: VNG1284 :::::::::GAL:SG:::::T:PAQ:T::FG::V:A::::::::::L::LL::VK::LFR Hut1917 ::::VDATNVAL::::::::P:QAQ::::FG:FV::::::::::::L:::L:::K::RY: VNG2565 :G:T::::::T::RGTERV:QT:PT:FACLG:LT:A::::::S:::L::VI:::K:TA:: NP6112A :G::::::::A::GGTERAM:::ATF:LCLG:LT:A::::::::L:L::VL:::K:T::: consensus FRRVFLPANAVRTLRIDGRRLSRTEMEREFSEAAIVALLWVILL-VVGSVVLLNLA-GPD #oth 2221.3.43112433223.3.2243242.14..12133..243.1333322123422215 HVO_1056 :S:::::ES:IVNIEMN:::::::::D:::::::::SM:::L::::GS::L:V::::::E Hbo0553 :::::::::T:VSIQM:::::D::::::::::::::S::::::::::S:LL:V::::::N VNG1721 :S:::::S:::V:A:::::T:D:DA::Q:::::::::::::V:::FAT:L::V::::::S rrnAC0755 :S:::::T:::I:A::GN:T:D:ES:::::::::::T:::L:I::IIS::::T:V::::A VNG1284 I:G::Y:SD::::F:L:::A::D::AAQ::E::::ITF::LVF:G:AAF:FM:AIPM::: Hut1917 IGD::Y:DS:::R:D::D:::TEA:AN:::V::::I:V::TTF:::::T:L::VILPAEE VNG2565 I:D::R::S:I:S:::GD:K::EHQAQ::YA::TL:FV::LAF::AI:VA:::AAL:S:Q NP6112A V:DI:A:DH:::Q:QMGK:T::EEQVQA:YT:::V:FV:::LC::I::VA:::WTL:S:: consensus -FTYADALFEVASAQGNVGLSSGITGPD-MPPLAEGMFLFNMWIGRLEIIPVLVFARAAL #oth 12331212.1.1...1...112...1.51123421411231..1.......11.222342 HVO_1056 :::::::::::::::::::I:T:::::W::N:W::T:::::::V:::::::::::::S:I Hbo0553 :::::::::::::::::::::T:::::T::N::::::::L:::V:::::::I::::::I: VNG1721 ::S:::::::::::::::::::::::::::S:I::A:::::::::::::::::::::::I rrnAC0755 ::G::::::::::::::::::::::::S:::AI:::::VL:::V:::::::I:::I::G: VNG1284 AY:VENV::::::::::::::::::::G:::TVTKA::::::::::::::::::LL:GLF Hut1917 ::SL:N:F:::::::::::::::::::ESL:T:GKIS::GH:::::::::::::A::TL: VNG2565 :HPLEYV::D:M:::S::::DA:::S:G:::A::K::LII:::V:::::::IA:LIS:V: NP6112A :HPAEYVI:D:M:::S::::DA:::::::::DA:KV:LI:::::::::::::A:LLG:I: consensus SGLDPY---- #oth 3413413111 HVO_1056 Y::N:-:::: Hbo0553 Y::E:-:::: VNG1721 :::::-:::: rrnAC0755 Y::::-:::: VNG1284 :T:EV:D::: Hut1917 :RGGM:Q::: VNG2565 RHG:F:R::: NP6112A QQ:NL:RTDG