|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2051 | VNG2031 | Hut2053 | Hmu2707 | rrnAC2486 | NP3828A | HQ1091A | hla0431 | HVO_1878 | Hbo1759 |
1439 | VNG2031 | 2016 | 1237 | 1208 | 1300 | 1258 | 1200 | 1249 | 1204 | 1240 |
1521 | Hut2053 | 1237 | 2021 | 1435 | 1412 | 1227 | 1245 | 1268 | 1293 | 1294 |
1503 | Hmu2707 | 1208 | 1435 | 2064 | 1591 | 1184 | 1183 | 1186 | 1229 | 1239 |
1530 | rrnAC2486 | 1300 | 1412 | 1591 | 2081 | 1259 | 1171 | 1248 | 1258 | 1273 |
1481 | NP3828A | 1258 | 1227 | 1184 | 1259 | 2060 | 1287 | 1328 | 1326 | 1346 |
1547 | HQ1091A | 1200 | 1245 | 1183 | 1171 | 1287 | 2048 | 1425 | 1458 | 1546 |
1599 | hla0431 | 1249 | 1268 | 1186 | 1248 | 1328 | 1425 | 2068 | 1528 | 1514 |
1630 | HVO_1878 | 1204 | 1293 | 1229 | 1258 | 1326 | 1458 | 1528 | 2052 | 1600 |
1638 | Hbo1759 | 1240 | 1294 | 1239 | 1273 | 1346 | 1546 | 1514 | 1600 | 2091 |
282 symbols consensus ---MSTAEPVLSADAPLDLRLSEAELEARRDHITSFIADQVDAAGADGAVLGLSGGIDST #oth 111244565354525122.31.33..345231144..324323..212212.....1..1 VNG2031 :::::APDT:----S:::::F:A:::AE:::R:Q:::R:T:A::::ERC::::::::::: Hut2053 :::::ET:AIAKG:S::::S::A:::D:::E:::D:::::L::::V:R::::::::V::S Hmu2707 ::::AE:K::QR::D::::T::::::::Y:::::D:::E:A::::VET:II::::::::: rrnAC2486 ::::A:::SIVR::E::N:TF:::::::H::::::::EA::::::V:TV:M::::::::: NP3828A ::::TAS::TIEGTN-VE:LF::S::QR:::::VE::EETIET::::R:::::::::::: HQ1091A :::--MQQS:::T:::::::::PE:::TVES:VSQ::T:I:AD::::::::::::::::: hla0431 MSRT:DQSVL::D:P::::::::E:::NA:ER:V:::::L::D::SE::::::::::::: HVO_1878 :::-M:SVD:::E:::F::L::DE::::H:E:::T::E:T:E::::::::I::::::::: Hbo1759 ::::::EPTI::DT::::::::DD::::THN::LQ::R:V::G:::E::::::::::::: consensus LVAHLAVEALGADNLHGLVMPSEVNDDDNMSDAERVAEEL-GIEYDVIEIQPIADTFFDA #oth 2113111311.42411.12..2311333411...2..53.12.111.1113.21232313 VNG2031 T::::T:DE::::A:::::::GA:SR:Q::::::::::D::::::::V::D:FVTQLT:V Hut2053 :::::::::I::E:::::::::S:::EAT::::::::M::::::::::::N::V:::L:: Hmu2707 :TS:::::::::A:VY:::::::::REA:::::::::S::LD:::::::VE::::A:L:G rrnAC2486 ::S::::::::R:AV::::::::::RA::::::::::ND:L:::::::::N:LV:::L:: NP3828A T::Y:::A:::P:RV::IS:::S::P::DET::::::NA::D::F:::D:N::V:A:V:: HQ1091A T::DM::N::::E:V::::::::::::A::::::W::::::D:P:E::::::::ES::E: hla0431 :T:::::::::E:G:::IT::A::::P:V::::::::HD::::::::V::::::ESV::: HVO_1878 :T:F:::::::KES::::::::VA::E:M:::::G:::M::::::::V::::::E::::T Hbo1759 AT:Y::A::::KE:::::::::V::S:E:::::::::Q:::E:::::V::::::E::::T consensus FPE-AADDRMAVGNVRVRTRAVLNYFVANHENAIVLGTGNRSEALTGYFTKYGDQAVDCN #oth 3.11.12132.2..211.3.1.1..121.22242.......2.121..1.....1....1 VNG2031 ::D:::G:EV::::A:A:::::I:::::::GDGV:::::::A::M:::Y::::::::::: Hut2053 Y::::EGEK:::::::::A::::::L:::T:::L:::::::T:S::::::::::G::::H Hmu2707 Y:D::EG:QL::::L:::C::::::LA:::RDS::::::::::::V::::::::G::::H rrnAC2486 Y:D::EG:QL::::L:::C::::::L:G:::Q:L:::::::::::V::Y:::::G::::H NP3828A A:DH:::::::L:::::::::::::::::A:DGL::::::::::A::::::::::::::: HQ1091A I:::::::Q::::::Y::::::::::L:::::K:::::::::::::::Y::::::::::: hla0431 :::::::::::A:::Y:::::::::::::A::R::::::::A::M::::::::::::::: HVO_1878 :::::::::::A:::Y::::::::::::::::R::::::::A::M::::::::::::::: Hbo1759 ::::::N::::A:::Y::V:G:::::::::::K::::::::::::::::::::::::::: consensus PIGNLYKQQVRQLAAHVGVPEDLVEKTPSAEMWAGQTDEGELGLDYDTLDAILALHVDGG #oth ..11...3......331.1.311142211.21.51...13.1.34.122.11..1111.2 VNG2031 :::::::M::::::RDL:::::::T:A:T::L::D:::A::::V::::I::V::V::::: Hut2053 ::A:::::::::::R:::::QEIA:R::T:G::VD::::::::VE:::::S::::AIE:E Hmu2707 ::A::::G::::::T:::::D::A:::A:::::LD::::A:::I::P:::S::::::E:: rrnAC2486 ::AA::::::::::K:::::D::A:::A::::::::::AD:M:M::::::S:::::I::: NP3828A :::::::C::::::REL:::::::SR::T:A::E:::::E:M::G::E::::::V::::P HQ1091A :::::::::::::::S::I::E::M:::::G::V:::::E::::G:::V::::::::::P hla0431 ::::::::::::::::::::R:::MQE:T:G::E::::AA:M::::::V:::::V::::: HVO_1878 ::::::::::::::::::::::::LQ:::::::S::::::::::T::A:::::::::::P Hbo1759 ::::::::::::::::::::Q:::M:::::G::T:::::D:M:MH::::::::::::::P consensus LSASATARHLDVDEEAVDRVVELYEQSAHKRAMPPAPEPL-- #oth 12421.2342112524122.131216.5...21..1.55142 VNG2031 :P:::::T:::I:PSV:ET:RD::GA:K:::::::::---:: Hut2053 VGT:::::IVG::R:I:E::RD:F:::G:::S:::::AK::: Hmu2707 V::::::AEIG:::D::EH:RT:::G:E::::A::G:D::F: rrnAC2486 VP:AG::DQ:G:PLDV:ET:R:M::S:::::::::G:D::Y: NP3828A ::K:::V:T:::P:S::::::::::T:T:::::::::::::: HQ1091A ::VD::V:Q:::TS:DIT:::::::K:K:::Q:::::PS:SL hla0431 ::RA::V:E:::P::::::::::V:R:::::S::::::R-:: HVO_1878 ::K:::V:::G:T::Q:::::G:V:G:V:::S:::::SA:DV Hbo1759 ::K:::MD:I::TG:QI::::::::::::::Q::::::::DL