|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1408 | VNG2452 | hla1386 | HQ3047A | Hbo1368 | HVO_0128 | NP0870A | Hmu2607 | Hut2806 | rrnAC3145 |
936 | VNG2452 | 1457 | 737 | 782 | 803 | 761 | 803 | 838 | 741 | 777 |
977 | hla1386 | 737 | 1519 | 775 | 889 | 890 | 785 | 809 | 742 | 781 |
1002 | HQ3047A | 782 | 775 | 1468 | 901 | 845 | 772 | 816 | 836 | 853 |
1146 | Hbo1368 | 803 | 889 | 901 | 1437 | 1032 | 800 | 936 | 870 | 871 |
1009 | HVO_0128 | 761 | 890 | 845 | 1032 | 1397 | 764 | 808 | 791 | 852 |
930 | NP0870A | 803 | 785 | 772 | 800 | 764 | 1298 | 823 | 836 | 769 |
1058 | Hmu2607 | 838 | 809 | 816 | 936 | 808 | 823 | 1441 | 908 | 969 |
1050 | Hut2806 | 741 | 742 | 836 | 870 | 791 | 836 | 908 | 1458 | 1034 |
1031 | rrnAC3145 | 777 | 781 | 853 | 871 | 852 | 769 | 969 | 1034 | 1371 |
207 symbols consensus MRVIGTVGLPGSGKGEAAAVAREAGVPVVTMGDVIREECRDRGLDPAEHHGRVAKALREE #oth .3.211..11....1.2.4..22411..11......42..4..1...22..32.32..2. VNG2452 ::::::::M:::::S:::T::AN::I::LV::::::Q::::::::::Q::::I:Q:::D: hla1386 :N::::::::::::::::N::E:V:I:::V::::::A:::R:::::::::::M:GT:::: HQ3047A ::::::::::::::S:::::::RLDI:::::::::::V::N::H:::::::T:::S:::: Hbo1368 :K::::::::::::::::S:::::::::::::::::N:::E:::::::::::I::::::: HVO_0128 ::::::::::::::::L:E:::N:::::::::::::::::K::::::TD::KI:T::::: NP0870A :::::::::A::::::F::::E:Q:::::::::::::A:::::::::::::E::QS:::: Hmu2607 :::LA:::::::::::::N::::LD:::::::::::A::::::::::TE:::::T::::: Hut2806 :T:F:I::::::::S::::::::LD:::::::::::GA:::::::::T:::E::::::A: rrnAC3145 :T:::I::::::::S:::N::A:MD::::::::::::::::::::::TD::T:::::::: consensus NGPAAIAERSLPLIEDELEDS--DTVLVDGIRSDVEVDRFRDAFGDDFTLVSIEAPFELR #oth 2.22...321..3125412231133.1...2..32.123.24...23.4..313..125. VNG2452 H::G:::HQ:::I:::H:T:A::T:::::::::::::TT::::::::::::HVS::R::: hla1386 E:DD:::T:T::::REAAA:GER:::::::L::T::LE:::E:::::::::AVR::::I: HQ3047A E:::::::::::I:KTK::L:::E::::::L:::I:L:C:::::::::I::::::::KS: Hbo1368 E:LD:::A:::::::A::::::::V:::::L::EY:L:::E:::::::V::::::::D:: HVO_0128 E:DD:::A::::MV:QH::SN:::V:::::L::G::L::::E::::::V:::V:::::T: NP0870A ::::::::A:::H::SA:::A::A::V::::::G::::T:ES:::::::::A::::::E: Hmu2607 ::::::::::::::::::AS::::A:::::V:::::::A:EE:::AS:S:::::::::V: Hut2806 ::::::::A:::H:::G::::::EH:V::::::::::E::QA:::EE:L:::V:::::T: rrnAC3145 ::::::::::::M::A:::SN::::::::::::::::EA:ET::::T:L::E:D:::::: consensus AERLDDRGRD-DSDDDGEALQERDERELGFGMGEAMDRADVVIENTDSLAAFRERIRTLL #oth 33.143.1.1335252413.53.14..231.1132222.1.4.3.221.34124324422 VNG2452 KA:IE::D:PG:T:--::P:DA:ED::R::::DD:I:L:::R:::::::D::HDAV:D:: hla1386 :::::::::::E::S:L:::R:::A::IEL:L::TLE::::E:D::GT:::::G:V:EV: HQ3047A VK:::K:::::ET:L:ET:::K:E::::::::::::::::::::::E::SK:H:T:QYF: Hbo1368 ::::L:::::::::V:R:::K::E:::::::::TV::::::::Q:::::ER:::::Q::: HVO_0128 ::::L::D::::::T:V:::KK:ER:::D::::D:::::::::Q::GT::EY::T:TK:F NP0870A KD:INE::::G:----::T:A:::N:::R::LD::LA::N:R:N:DG::D:::::AAEV: Hmu2607 EA::AE::::G:R::G::S:E::::::R::::DA::E::::H:D:::::E::QSKV:::: Hut2806 :D:::L::::ASVE:G::S::D::::::::::::::EM:::T:::V::::D:Q:::E::: rrnAC3145 :K:::L::::TAAE:G::S:ED::D:::::::::::EL:::T::::ET::::QRTV:::I consensus --ADGPDALAEDAD------------- #oth 225434645746544543542211111 VNG2452 AADTPHTEVPDNH:::::::::::::: hla1386 GV:E:EGNAD:V::ADPATPNAGGDGS HQ3047A ::TQRIVDTT:H::SSQHQHTQ::::: Hbo1368 ::Q:::::VES:ESEVEGNA::::::: HVO_0128 ::EE::E::::ADA::::::::::::: NP0870A ::EST---------::::::::::::: Hmu2607 :::::I::YRSQY:AAEGDA::::::: Hut2806 ::T:::S:::D:ERIELAEGNA::::: rrnAC3145 ::R:::E::NQ---:::::::::::::