|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2665 | Hbo2028 | NP0660A | VNG0226 | Hut3001 | HQ1855A | Hut0407 | rrnAC0296 | Hmu1377 |
1465 | Hbo2028 | 2715 | 1038 | 1073 | 1056 | 1138 | 1068 | 1236 | 1150 |
1578 | NP0660A | 1038 | 2622 | 1114 | 1098 | 1058 | 1176 | 1221 | 1163 |
1647 | VNG0226 | 1073 | 1114 | 2632 | 1393 | 1474 | 1114 | 1209 | 1318 |
1651 | Hut3001 | 1056 | 1098 | 1393 | 2758 | 1492 | 1232 | 1283 | 1327 |
1752 | HQ1855A | 1138 | 1058 | 1474 | 1492 | 2771 | 1175 | 1267 | 1263 |
1632 | Hut0407 | 1068 | 1176 | 1114 | 1232 | 1175 | 2615 | 1414 | 1396 |
1846 | rrnAC0296 | 1236 | 1221 | 1209 | 1283 | 1267 | 1414 | 2678 | 1601 |
1845 | Hmu1377 | 1150 | 1163 | 1318 | 1327 | 1263 | 1396 | 1601 | 2600 |
387 symbols consensus --D-QLTRRRLLGAAGAAVA-GLAGC---------T-----SAPGSDTAATNEREADADD #oth 134675311441435232233341.12222222233443454532664346444444444 Hbo2028 MG:LP:S::DF:I::::G:FGTYT:S:::::::::-:::::APQ:KT:GSAT:TSTS:VA NP0660A ::MPE:::::::A::AGGI::::::::::::::::-:::::-:A::RESPPPATP::PNP VNG0226 ::-:MPS::DV:RLGAGVL:A:T:::::::::::::DTAPNRVAAAE::::TT::TTT:S Hut3001 MTPETS::::F:ALG:T:L:SAI::::::::::STSLSAPE:S::ESPSPSAAG:SPET: HQ1855A MT:SKIG::::::LT::::LG:::::NTQTQSQSN:QTGST:MS:DLS:E::L::Q:TA: Hut0407 ::-:------------M::L::::::VESPTGDVA:SASEQ:::TTN:TVE:QVDEP:T: rrnAC0296 :MKQS::::AM:::L:T::::AT::::::::::::QSPGTG:DS::::GEQP:-S:::VA Hmu1377 :M:D:Q:::GV::SMA:::GASV::::::::::::-:::::Q::AL:AT:GS:GQSAS:G consensus TSRSPYTAVYRDVIDSVVLVRTYT------EDERGGQGSGFVYDDGHVVTNEHVVGDAEE #oth 545241451.342321.251246411111135433.2.11121325421..2..225333 Hbo2028 PR::SDDSK:DSA::A:A:::AFGVENPVTGQ::R::::A::IN:TS::::::::SG::R NP0660A E:Q:R::D::EAT:E::AF:----::::::G::Q::G::::::-::F::::Q::IA:L:D VNG0226 R:E:::::::::::::::MI::QS::::::-----:::T:WL:N:TTL:::A::::RS:T Hut3001 :AE::::R:::ET:P::TT:Q:T:::::::-----:::T::Q::E::::::A::::T:S: HQ1855A :ATN::GE::::T:::::::QPEG::::::PRA:-:::T::L::SN::I::A::T:E:TT Hut0407 -D::R:AD:::S:S::::QI:VI:::::::PFGTA:T:::::::ER:L:::::::SN::: rrnAC0296 Q:D:V::N::QE:A:A::SI:V:A::::::::S::::::::LI::E:I:::::::AGGD: Hmu1377 -----:S:::EQ:V:::AT::::::::::::NS::::::A:::S:DYL::::::::::D: consensus VYVRFRDGEWRTASVVGTDPYSDLAVLEVDDTPDSATPLPFVEAPPTVGTEVVAIGNPFG #oth 431116522.43251212.441...2253255.331511314454152.21.211.1.12 Hbo2028 :DIQYTT:::TS:EI::::MFA:::I:D::HV:E:VR::Q:SLR::QI::::S:::S::: NP0660A :N::::R::::D:G:IA::V:A:::::S-T:I::Y:MS::L::TV:P:::::L:L:S::: VNG0226 :N:::N::T:E:GR:R::::N::::AVT:T:::AA::::ALRT:S:VA:::::::::::A Hut3001 AQ:::H::T:ASGP::::::H:::::I:PGTV::::A::::GDQ:::I:R:::V::::YN HQ1855A ADI::SQ:::::G:::::::H::::AIAI:SP:E:VS:I::IPG:A:I:QR::::::::N Hut0407 L:::YPSTG::E:::::::SD::::::S::EH:PA:GS:SL::DE:A:::::::::::Y: rrnAC0296 Y::::A:TG::::::::A:V:::::::RIGA:::-V:::S:::TE::::::::::::::: Hmu1377 I:::Y:ESG:IESA::AV:A::::::I::T:K:A:::::S::::D:G::::::::::::: consensus LSGSVSAGIVSGVNRTIPAP-TGFSIPDAVQTDAAVNPGNSGGPLVTLDGDVVGVINSGG #oth .411113..1..21.3343123323.1111....211.......11321.4.11122112 Hbo2028 :K::M:K::I::::::AFN:I::V:::N::::::::::::::::::NTE:S:::::SA:: NP0660A :ES::::::I::K::SPNH:V:D::::NT:::::GLE:::::::V::M::::T:IAVA:A VNG0226 :N:T:TT::I::T::A:::::::YR:::::::::::::::::::::S::::::A:V:::: Hut3001 :D:::TS:::::TD:L::S::A:YQ::::I:::::::::::::::MD:::S::::V::KQ HQ1855A :::T:TS::::::::S::::::::T::::I:::::::::::::::MS:::Q::A:::::: Hut0407 :::::::::::::D::LSS::GE:::::TI::::::::::::::::N:E:E:::::SA:Q rrnAC0296 :::::::::::::D::LQSA:NN:::A:::::::P:::::::::::::E::::::::::: Hmu1377 :::::::::::::D::L::A:N::::::::::::::::::::::::::::T::::::::: consensus GDNIAFAISAALTRRVVPSLIETGDYEHPYLGVRLTDVTPRVAEANDLDEARGVLVVEVI #oth 1211111..22.221.213..22.513.212.1426412.5212..2.5234.1213513 Hbo2028 AE::G:::::::S:::I:::::N:Q:H::F:::DYAP:G:L:::::::T:PN::I::T:: NP0660A :A:VG::::PL:A:::LTE::Q::N:::::::IQ:IE:::T:::::::::::::::::TA VNG0226 ::::::G::::::D:::::::D::::::A::::SF:P:::T::D::G:T:S::L::MS:D Hut3001 ::S:::G::::::Q::::E:::S:T:::A:M::S:DV::::L::::::A:PQ:L:::QTV HQ1855A ::::::G::::::Q::I:R::::::FN:S:I:::FES:::EI:R::G:KTP::L:I:D:: Hut0407 ::::GL:::S::::N:::A:::::S:::::::I::L::::A:::::::S::S::Y:T:T: rrnAC0296 :::V::::::P::Q:::::::Q::::D:::M::G:RS:S:::::::N::PGS::YITR:V Hmu1377 ::::G::::::::::::::::DS:A:D:S::::::::L::PIV:::::RT:E::YID::V consensus DDGPADGVLQGSDGETVVNGQAVPVGGDVILAVDGTPTPTRQDLGSFLALETSPGDTIPV #oth 522.2223.3313424424144121.1.1134342433525341325.1.2141.22353 Hbo2028 :::::E:I:RA::ETVERR:VSI:::S:I::E:::V:VRD:NE:LAH:S::::::E:::L NP0660A P:::P:QT:R:A::::::GD:L::T:::::VGLA:SQVDSNA:::TI::::L::::RTTA VNG0226 PS::SA:R:V:::AT:I:D:G::R::::IV:::N::RVH:LE:VL:L:::H::::::VS: Hut3001 RG::::S:::P:SI:-Y:G:RQ::::::::R:I::::ME:FE::A:Y:::::R:::::E: HQ1855A :GA::::I::S::RQQI:D:TR:R:::::::G:G:QKIL:TE::::Y:::Q:N::E:V:I Hut0407 EGD:S::::::ATE:::::::SI:::::::THIE:E::::S:Q:::V:::::QV:QPATI rrnAC0296 S::::A::::::::::TIS:T:I:T::::VRQM:D:::::::A::::::::::::E:VD: Hmu1377 T::::E:::EP:N::E::::VR:G:::::VV:M:E::::S::H:S:::::::T:::::A: consensus TVLRDGARQTVEVTLGARPEP------ #oth 423.2.53212222114.134211111 Hbo2028 :IY:N:IT:P::L:::T::T:S::::: NP0660A ::I:::E:::ID:PI:S:::::::::: VNG0226 RL::::D:R::D:E:::::SG:::::: Hut3001 AI::::DER::::::D:::DRSTSPLR HQ1855A ::::N:Q:::LTIE::Q:::-:::::: Hut0407 R::::::TE:L:::I:S:S:AE::::: rrnAC0296 L:E::::QE:::L:::T:::::::::: Hmu1377 D:::E:S:E::DL:::E:::R::::::