| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 6076 | pNG7379 | HQ1767A | hla0217 | NP1478A | HVO_1088 | Hbo0592 | VNG0412 | Hut1293 | rrnAC0184 | Hmu0715 |
| 3520 | pNG7379 | 5902 | 3640 | 2627 | 2920 | 2839 | 2846 | 2966 | 3054 | 3055 | 3041 |
| 3473 | HQ1767A | 3640 | 6187 | 2454 | 2915 | 2834 | 2784 | 2932 | 2995 | 3047 | 2862 |
| 3735 | hla0217 | 2627 | 2454 | 6506 | 3063 | 3459 | 3475 | 3144 | 3138 | 3126 | 3089 |
| 3998 | NP1478A | 2920 | 2915 | 3063 | 6019 | 3457 | 3284 | 3262 | 3449 | 3408 | 3477 |
| 4433 | HVO_1088 | 2839 | 2834 | 3459 | 3457 | 6242 | 4168 | 3619 | 3600 | 3618 | 3675 |
| 4171 | Hbo0592 | 2846 | 2784 | 3475 | 3284 | 4168 | 6218 | 3520 | 3432 | 3427 | 3527 |
| 4541 | VNG0412 | 2966 | 2932 | 3144 | 3262 | 3619 | 3520 | 6105 | 3898 | 3923 | 3923 |
| 4674 | Hut1293 | 3054 | 2995 | 3138 | 3449 | 3600 | 3432 | 3898 | 6125 | 4328 | 4341 |
| 4760 | rrnAC0184 | 3055 | 3047 | 3126 | 3408 | 3618 | 3427 | 3923 | 4328 | 6095 | 4654 |
| 4750 | Hmu0715 | 3041 | 2862 | 3089 | 3477 | 3675 | 3527 | 3923 | 4341 | 4654 | 6107 |
912 symbols consensus MEYHEAANFLFDLRRFAPKPGTEATRRLLAHLGDPH-ESIDCVQIAGSNGKGSTARMTES #oth .511.1132.33.1125313.1142241.34212131424351.11..........1213 pNG7379 :::::S:DY:QS:Q:RR::L::DT:A:M:S:::::D:G:F:S:::::::::::::::::: HQ1767A :D:::::DV:TG:QQRR::L:V:T:A:M::::DN:::A:::::::::::::::::::L:Q hla0217 :H:::::A::::::::SV:::::RVAA::DQV:N:E::DVSF::V::::::::::::::: NP1478A :::::::::::::::YPSRT:V:P:::::E:V:VAD:TD::I::VG:::::::::::V:: HVO_1088 ::::::V:::::::::QV:::::SI::::S::::::::GVSF::V::::::::::::VDA Hbo0592 :Q::::VR::::::::QV:::::SV:S:::EFD:::::DVTF::V::::::::::::::: VNG0412 :R:D::::::L::::YG::::::S:AD:::S:::::QDGP:Y::::::::::::::F::: Hut1293 :H::::::::::::::::R:::D:::E:::A:D:::::::SA:::::::::::::::L:A rrnAC0184 ::F::::::::E::::::RA::D::QD::SS::::Q::GLR:I::::::::::::::V:R Hmu0715 :KF::::::::::::::LR:::::::S:::Q::::::D:L:::::::::::::::::V:R consensus ILREAGLDVGLYTSPHLDDVRERVRVNGRKIPKAALVEFVEEVKPYLTERAADGDPPTFF #oth 3.121.24...1...113321112112.24331322441115341344332132341.3. pNG7379 V::A:::::::F:::G:NGF::QIT:::GRV:::RVT::::QIE:CINQL::ED:K::H: HQ1767A ::DD:::R:::F:::G:N:F::QI::E::T:A:KHVSKY::RLV:C:ETLR::N:E::H: hla0217 :::::::S:::::::::SALAD::::D:LAMTE::IAD:::::::W:V::::N:E:L::: NP1478A V:::::Y::::::::::::L::::::D::PVS:Q:VCDY::DI:::VRTEMP::A::::: HVO_1088 M:::S:AH::::::::F:::::::::D::::::S::SA::A:A::::V::::::E:L::: Hbo0592 :::::::T::::::::FET::::A::D:::::ES:IC::::RA::W:V::::::E:L::: VNG0412 :::A::::::::::::F:::::::T::::RMS::::TT:I:TIT::V:::::::AA::Y: Hut1293 V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::E::A:D:::A::S:::: rrnAC0184 T::::::::::::::::::::::I:I::::LSE::::::::S:RADM::Q::AN:S:::: Hmu0715 T::::::::::::::::::::::I:::::::TES:I:::::S:E::V:D:::::TS::L: consensus ETLTALALWEFDRADVDVAVLEVGIGGRYDATSAVDPVASAVTSVSLEHTDLLGDTIAEI #oth .22.121445.33441.1.11...2..22....111.4.2...2111..132..1.142. pNG7379 :V::::::YH::VE::::::::::::::::::::::::::::::I::::::::::::E:: HQ1767A :A:::VS:AH:AAM:::I:I:::::::::::::::::I::::::::::::E:::E:VDV: hla0217 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:KT::::::::::::::G:::E::SV::E::G::::::L:::DAD::::::A:S::::R: Hbo0592 :EK::::E::::R::::GA::::::T:::HTTT:::::V::::::::::::TE::::::: VNG0412 :::::H::::G:T:::::::D:::::V::H:GA:::::R:::::::::::::TAGR:::A Hut1293 ::::::::::::::::::A::::::::H::VE:::::::RI:S::::::::P:E:::L:: rrnAC0184 :Y:::H:::E::::::AG::::::::V:EV::::::::V::::::::::::EG::::::A Hmu0715 :::::H::::::R::::::E::::D:V::V:G::::::V::ADTA:::::::GEAG::S: consensus TYEGRVN-IEAAVSLAGDDWAVETRLPLLGAHQARNAGIAAALARQ----VA-DVDAE-- #oth 446.25334144132523536233611.1.31..4...1.23.11211113633326422 pNG7379 :EN:MRSAV:NRI::T:SN::L:SN:K:::Q:::E:::V::T::::::::LI::::T::: HQ1767A :ET:IPSP::S:::IV:SE:::::H:::V:::::T:::V::T:::::::::Q:::SID:: hla0217 A:::::SPTD:E:T:::EVDG-TY:I::V:D:::T:::::V::::RTAGALGNGT::SLP NP1478A RDR::DD:::Q::V:D::::H:::A:::::::::::::V::::::T:::::G:N:STA:: HVO_1088 S:G::::HQ::::TVET:AETLDV:I:::::Y::::::::VS:::::::::RP:I::::: Hbo0592 RS:::::HQ:S::AVVA:::S:DS:I:::::Y::E:::::CV::::::::ITDEL:S:ID VNG0412 :::::T:HT:::::IT::::S:A:EI::::D:::E:::V:::::::::::T::G::DD:: Hut1293 EHG::DG:::SPIT:S:QGLD:::::::::E:::::::V::::::::::::::::TD::: rrnAC0184 ::D::EG:L:G:::VD:SG:R:D:Y:::::::::Q::::::T:CQ:::::::::ISQT:: Hmu0715 :DH::EG:L:GS::I:::E:G:::K:::::::::I::::::T:C:::::::S::::EA:: consensus --TIERGLRNAHWPGRFEVMGTDPLVVLDGAHNPGACERVAETLAEFDYDDLHLVFGAMH #oth 222243..15.21.....23443.51....1...224352342245121.4.12.411.3 pNG7379 ::::SE:::A:TL::::::RS:::M:::::S:::::M:TLTTLIGRYE:::::V::A::Q HQ1767A :::::T:::G:T::::::L:SHS:R:::::S:::::TATLGSL:ERYE::E::V::A::Q hla0217 DEAVRD::AR:T:::::::VD:A::T::::::::A::RTL:G::::Y::::::::Y:::: NP1478A ::D:::::::::::::::::NRE::::::::::::S:AG::A::ST:A:::::::::::C HVO_1088 ::A:H:::::::::::::::::E:T:::::::::D::AQ::TV:D::::::::::Y:::: Hbo0592 ET:L:::::T:Y::::::::E:::F:::::::::::::S::SV:DD::V:A::::::::: VNG0412 ::A:A::::S:::::::::::A::V::::::::::::GA::::V::::::R:LT:::::: Hut1293 :::LAT:::R:::::::::LDRE::::::::::::G::::::::DT:E::E::::V:::C rrnAC0184 ::DL::::::::::::::::NES::::::::::::SI::T::::SS::::N::V:I:::V Hmu0715 ::::A:::::::::::::I::R:::::::::::::GV:::V::::A::::E::V:A:S:V consensus DKDHRAMAAALPDADHVVACRPDVDRAEDAEVLAAAFEDAGAA-TVETRSDVAGALERAL #oth ..13452252.15333151141354.2124331142227534415134452.34.32513 pNG7379 ::EYEQ:I:T::AVETAF:T::A::::AST:S::::::GQA:-:QIQQVES:PE:T:::I HQ1767A ::::E::IQS::SITTAY:TE:A:E:::T::T::PILQMNAK-:::::IQS:PE:T:E:I hla0217 ::::VGA:S::::::SA:T::::L:::::P::::::LRT::VD:D:TAGD:::A:::T:V NP1478A :::::G:VE:::::TVAYT::::IQ:::T:DS:::V::AV:G:AA::PVGA:ED:V:::: HVO_1088 ::::GE:VG:::EVAS::T:KA:IS:G::P:I:SSV::RLNGP:A:::GGA::A::D::R Hbo0592 :::Q:K:VE::::::S:IT:::NNP:S::P:T::HV:::::VD:DITVGD::LS:V:T:R VNG0412 ::::G:::::::TP:::W::E:VP::::::D::::V::::::G:::SVTRA:ES:VAD:I Hut1293 ::::HGI:D:::AP:::T:TH::::::::EQ:V:H:::SET:::E:Q:::::::::ADT: rrnAC0184 ::::ERI::::::P::::::Q:N:::::SHH:V:::V:N:TD::::::::::::::DI:: Hmu0715 :::L::I:G::DG:::::::E::R:::::EQ:V:K::R:ET:::S::::::::::FDV:: consensus AAAGA--DDCVLVVGSLYAVAEARTRWTRTVVPKRVDSLA---DARETLERAH-----VT #oth 24.24111.31124...12.11..4313.5531454545311142544335431111135 pNG7379 :T::E::::F:::A::::::::::D::S:L::::ENLQQ::::STG::AGVEN:::::-- HQ1767A ET:::RS::L:::T::::::::::D::::LL::VNRS:SI::::IGVGK:SDNAVSER:N hla0217 ER:DL::G::::L::::F::::::AARM:::T:RT:SGSDPDAN:ARA:DIGG::::::P NP1478A ::::S::::A:I:C:::F:::A::R::::HY::T:MVDRG:::A:V:::R::D::::::P HVO_1088 :R:DP:::::::::::::V::::::T:::A::::THRT:D::::::R::D::N::::::A Hbo0592 DR:D::::::I:A::::FL:::::QA:::::TEAT:RDRG:::::TAL::::::::::LS VNG0412 :E:T:::::L:::A:::F::::::::::::FAETD::::D::::::DA:::::::::::: Hut1293 D:::P::::A:::S::::::R::::::::PN:::::E:I::::::EDV::GS:::::::: rrnAC0184 D::DS::G:A::::::::::R::::N:S:SL:::Q::::::::E::::I:S:::::::I: Hmu0715 DG::E::::::::T::::::::::Q::I:PTI:::::GV::::S::::IDA::::::::: consensus --D-AGAWRMRGKGV-HRVLKTRLQPRQAQYLKEELLSLGGDCAVSGLGAQ-----DGEL #oth 216254643433542341424221133213425423343..5144223452111113434 pNG7379 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::H:D:::N::::::::::::::N:::::::FYDI:::::Q:RA::D::::::::::::: Hbo0592 :P::::::T:::P::::::::::::::::::FYDT:::L:Q::A:I:::A:::::::::: VNG0412 :-TH::::EGER::::::::::::::::::::D:LE:::A:::S:A:N:::V::I::::: Hut1293 D-ER::::E::::::::::::::::::::::H::A:E::::::E:ID:::::V::::::: rrnAC0184 DTSAA:::::::::::::C:I::::::::::::::E:::A:::::::::A::L:I::::: Hmu0715 DR:R::::::::::::::C:I:::::::::::D::E:::S:::S::A::::VL::::::: consensus RPGAEPVPVEEEIDRVVPVIEAL------ADLDVLISVDTRKAAVARAALDAGADILNDV #oth ....1211234.32.13.12.22111111233233211....22.131..2.....2... pNG7379 :::::::SI:T:::::::::::V::::::SS::TTV::::::::::D:::::::::V::: HQ1767A ::::::::IS:::::I:::::::::::::SN:E:P::I::::::::D:::S:::::V::: hla0217 :::::::::D::::::::TL::IQSVPAV::SN:::::::::P:::A:::::::::I::: NP1478A :::::::::DA:KR::I::V:SI::::::::S:A:V:::::::::::::::::::::::: HVO_1088 ::::DE:::D:::R::A:::::I::::::::::::V:::::::::GA::::::::::::: Hbo0592 :::::E:::::::R:I:::L:::::::::D:V:A:L::::::::::E::::::::::::: VNG0412 ::::DA:S:AD:L:::L::::RI::::::S:::::L:::::::E:::Q::E::::::::: Hut1293 ::::D:::A:K:R::::::::R::::::::SE:MT::I::::VP::E:::E::::::::: rrnAC0184 :::::::::::::::::::::R:::::::SE:::A::::::::P:::::::::::::::: Hmu0715 ::::DEI::::::E:I:::::R:::::::::::AAVA::::::P:::::::::::::::: consensus SGLEDPEMRFVAAEYDVPVVVMHSIDAPVDPDRDVDYDDVVEDVIDELTERVLLAEKAGI #oth 1.13..2.2311.13122211...132..1.45433.....4.2343.2.2211..3..2 pNG7379 :::S:::::::V:DH:AS:IL:::LS:::::G:T:T:::::D::LRD:::QI::::Q::: HQ1767A ::FD::::P::V::H:AEL:L:::LS:::::::RAT:::::T::MN::::QL:R::R::: hla0217 T::A:::::E:V:DAGC:::::::L::::::TN:PE:::::D:::AA:R::LA:::T::: NP1478A ::::::D::L:::D:::::::::::HT::::AA:IE:::::A:TVAA:S::::::::::L HVO_1088 T:::::::::L:::RGA::I:::::::::::S:E::::::::::::::::L::::::::: Hbo0592 T:::::::::L:::R::::I:::::::::V:GK::::::::G::::::R::I:::::::: VNG0412 T::D::::::::::::A:I:::::::::::::S:P::::::D:::A:::::::::::::V Hut1293 T::D::A:AHL:::H:::I:::::::T:::::H::H:::::::::E:::::::::::::L rrnAC0184 :::::::::L:::::::::::::::ET:::::S:IH:::::::C::Q::::I:::::::L Hmu0715 :::::::::L:::D:::::::::::EV:::::SA:::::::::C::Q::::::::::::L consensus DREQIIVDPGLGFGKSAAESFELLDRLDEFEALGCPVLVGHSHKSMFGLVGRE-ADDRLE #oth 2.33221...3....241.4.2121.451.51.11.2.2...1..123423561321336 pNG7379 ::::::I:::C::::N:::::::V:::H::Q:::::::::::R::::AEMSDA:EA:::P HQ1767A Q:D:::::::C:::::P::::::V::I:::::::::::::::R:::LATMNQP:D:E::S hla0217 :::KV::::::::::::T:A:D:I::VG::A::D::::I:::::::Y:A:::G:E:::EH NP1478A ::::::I:::::::::P:::::::G::KA:T:::::::::::R:::::::D:DS::E::S HVO_1088 P:RNL:::::::::::K::N::::G:T:::A:::::I::::::::::S:::E::PG:N:A Hbo0592 P::NV:::::I:::::N::N:::::::G::D:::::L:F::::::::E:::SK::G:N:P VNG0412 P::R:::::::::::::::G::::::A:::H:::G:::::::::::::A:D:Y:P:EGGY Hut1293 ::S::L:::::::::TD::N::V::::G::::::::L::::::::::EMID:G:P:E:Y: rrnAC0184 ::D:::::::V:::::PT:D:K:::::P::::::::I::::::::L:::::Q:::G:C:: Hmu0715 :::::V::::::::::::::::::G::E::QS::::I::::::::::E:::A:::G:C:D consensus ATVAATALAADRGADIVRVHDVPENVAAVRVAEAAR---------------DPERFED-- #oth 1.3.3111..1....21.1..231131113213.35111111111111112417635644 pNG7379 P:L:T:::::E::::A::::::S::N:VLKTVS:TA::::::::::::::AR:SQLRQQ: HQ1767A ::I:V:T::::::::V:::::AG::A::::A:A::K:::::::::::::::H:Y:A::DT hla0217 ::::::::::::::::::A::IA::R:::D::A:VNGSLRERGGADENGDG:::GGAKGN NP1478A :::::S::::E:::::::::::A::::::KT:A::S::::::::::::::::::A:TE:: HVO_1088 ::::G::I:::::::::::::::::::::N::L:S::::::::::::::::::N:::ADA Hbo0592 ::::::::::::::::::::::::::T::N::L::::::::::::::::::::D::TE:: VNG0412 ::A::S::::::::::::::::::::::::::::T::::::::::::::::TGADA:-:: Hut1293 P:::::::::E::::VI:::::AA:::::D:V:::D:::::::::::::::::GS:DG:: rrnAC0184 ::I:G:T:::E::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::QK::::: Hmu0715 ::I:G:T:::E:::::::::::::A:T::N:V:::D:::::::::::::::E:GS:V:EG consensus ------------ #oth 333211111111 pNG7379 :::::::::::: HQ1767A TEIDAETEADDR hla0217 AAGE:::::::: NP1478A :::::::::::: HVO_1088 ERED:::::::: Hbo0592 :::::::::::: VNG0412 :::::::::::: Hut1293 :::::::::::: rrnAC0184 :::::::::::: Hmu0715 ::::::::::::