|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 746 | hla0907 | Hut2309 | rrnAC2474 | NP1258A | Hmu3159 | VNG2234 | Hbo1360 | HVO_0136 | HQ3399A |
640 | hla0907 | 762 | 605 | 604 | 599 | 597 | 644 | 610 | 620 | 620 |
678 | Hut2309 | 605 | 757 | 680 | 659 | 680 | 614 | 633 | 653 | 631 |
675 | rrnAC2474 | 604 | 680 | 928 | 676 | 702 | 648 | 641 | 655 | 612 |
684 | NP1258A | 599 | 659 | 676 | 766 | 697 | 644 | 640 | 657 | 634 |
702 | Hmu3159 | 597 | 680 | 702 | 697 | 754 | 645 | 644 | 668 | 636 |
663 | VNG2234 | 644 | 614 | 648 | 644 | 645 | 760 | 640 | 645 | 636 |
688 | Hbo1360 | 610 | 633 | 641 | 640 | 644 | 640 | 761 | 671 | 648 |
707 | HVO_0136 | 620 | 653 | 655 | 657 | 668 | 645 | 671 | 761 | 665 |
680 | HQ3399A | 620 | 631 | 612 | 634 | 636 | 636 | 648 | 665 | 766 |
120 symbols consensus ---------------------MSD--NEGRKDLRMPDDDEVFAVVTNMLGANRVKVRCAD #oth 111111111111111111111..132252141....22..1..2.32......13...1. hla0907 :::::::::::::::::::::::NGDGG::N::::::E:::::E:VE:::::::R::::: Hut2309 ::::::::::::::::::::::::::-QE:T::::::E::::::::::::::::::::M: rrnAC2474 MDRVHGPTFPNLKPLPVEVPS::::::DS::N::::EE:::::::MD:::::::::::M: NP1258A :::::::::::::::::::::::::::::::N::::EG::::::::::::::::::::M: Hmu3159 :::::::::::::::::::::::::::::::N::::E::::::I::::::::::::::M: VNG2234 ::::::::::::::::::::::::D:GG:::N::::E::::::E::D:::::::Q::::: Hbo1360 ::::::::::::::::::::::::NE:A::R:::::::::E::::QD::::::::::::: HVO_0136 ::::::::::::::::::::::::DE::S:R:::::N::::::::::::::::IR::::: HQ3399A ::::::::::::::::::::::::DE:R:SH:::::::::::::::::::::::T::::: consensus GVERTARIPGRMQKRIWIREDDVVLVEPWDWQDEKADITWRYEKSEADQLREEGHIQ--- #oth .4........1....1....1.1..1.......1.1.13...1.12.1..11..115221 hla0907 :K:::::::::::::V::::::I::::::::::::G::A::::::::E:::::::L:::: Hut2309 ::::::::::K::::::::::::::I::::::::::::::::::QQ::::::::::KEP: rrnAC2474 ::::::::::K:::::::::::::::::::::::::::::::::QD:::::::::::E:: NP1258A :T:::::::::::::::::::::::::::::::::::VV:::::Q:::::::::::TDSV Hmu3159 ::::::::::K:::::::::::::::::::::::::::::::D:Q:::::K::::::E:: VNG2234 :E::::::::::::::::::::I::::::::::D:::V:::::::D::::::::::E::: Hbo1360 ::::::::::::::::::::G::::::::::::::::V::::::::::::::::::A::: HVO_0136 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::VS::::::::::::R:::::::: HQ3399A :N:::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::::R:R:::