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[J] (InfA) COG0361 Translation initiation factor 1 (IF-1)
9 genomes BUD0764 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2234

rrnAC2474

HVO_0136

Hbo1360

Hmu3159

Hut2309

hla0907

NP1258A

HQ3399A

Pairwise sequence scores
Consensus score746 hla0907 Hut2309 rrnAC2474 NP1258A Hmu3159 VNG2234 Hbo1360 HVO_0136 HQ3399A
640hla0907 762 605 604 599 597 644 610 620 620
678Hut2309 605 757 680 659 680 614 633 653 631
675rrnAC2474 604 680 928 676 702 648 641 655 612
684NP1258A 599 659 676 766 697 644 640 657 634
702Hmu3159 597 680 702 697 754 645 644 668 636
663VNG2234 644 614 648 644 645 760 640 645 636
688Hbo1360 610 633 641 640 644 640 761 671 648
707HVO_0136 620 653 655 657 668 645 671 761 665
680HQ3399A 620 631 612 634 636 636 648 665 766

120 symbols
consensus       ---------------------MSD--NEGRKDLRMPDDDEVFAVVTNMLGANRVKVRCAD
#oth            111111111111111111111..132252141....22..1..2.32......13...1.
hla0907         :::::::::::::::::::::::NGDGG::N::::::E:::::E:VE:::::::R:::::
Hut2309         ::::::::::::::::::::::::::-QE:T::::::E::::::::::::::::::::M:
rrnAC2474       MDRVHGPTFPNLKPLPVEVPS::::::DS::N::::EE:::::::MD:::::::::::M:
NP1258A         :::::::::::::::::::::::::::::::N::::EG::::::::::::::::::::M:
Hmu3159         :::::::::::::::::::::::::::::::N::::E::::::I::::::::::::::M:
VNG2234         ::::::::::::::::::::::::D:GG:::N::::E::::::E::D:::::::Q:::::
Hbo1360         ::::::::::::::::::::::::NE:A::R:::::::::E::::QD:::::::::::::
HVO_0136        ::::::::::::::::::::::::DE::S:R:::::N::::::::::::::::IR:::::
HQ3399A         ::::::::::::::::::::::::DE:R:SH:::::::::::::::::::::::T:::::

consensus       GVERTARIPGRMQKRIWIREDDVVLVEPWDWQDEKADITWRYEKSEADQLREEGHIQ---
#oth            .4........1....1....1.1..1.......1.1.13...1.12.1..11..115221
hla0907         :K:::::::::::::V::::::I::::::::::::G::A::::::::E:::::::L::::
Hut2309         ::::::::::K::::::::::::::I::::::::::::::::::QQ::::::::::KEP:
rrnAC2474       ::::::::::K:::::::::::::::::::::::::::::::::QD:::::::::::E::
NP1258A         :T:::::::::::::::::::::::::::::::::::VV:::::Q:::::::::::TDSV
Hmu3159         ::::::::::K:::::::::::::::::::::::::::::::D:Q:::::K::::::E::
VNG2234         :E::::::::::::::::::::I::::::::::D:::V:::::::D::::::::::E:::
Hbo1360         ::::::::::::::::::::G::::::::::::::::V::::::::::::::::::A:::
HVO_0136        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::VS::::::::::::R::::::::
HQ3399A         :N:::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::::R:R:::