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| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3212 | VNG1774 | NP4502A | Hut0481 | HQ3336A | rrnAC1708 | Hmu2254 | hla1130 | HVO_2311 | Hbo1997 |
| 2012 | VNG1774 | 3142 | 1625 | 1613 | 1557 | 1606 | 1580 | 1631 | 1666 | 1703 |
| 2117 | NP4502A | 1625 | 3285 | 1659 | 1584 | 1742 | 1773 | 1682 | 1672 | 1738 |
| 2085 | Hut0481 | 1613 | 1659 | 3198 | 1555 | 1800 | 1706 | 1623 | 1683 | 1693 |
| 2157 | HQ3336A | 1557 | 1584 | 1555 | 3293 | 1699 | 1679 | 1807 | 1915 | 1955 |
| 2263 | rrnAC1708 | 1606 | 1742 | 1800 | 1699 | 3253 | 2151 | 1695 | 1716 | 1856 |
| 2172 | Hmu2254 | 1580 | 1773 | 1706 | 1679 | 2151 | 3255 | 1684 | 1716 | 1850 |
| 2207 | hla1130 | 1631 | 1682 | 1623 | 1807 | 1695 | 1684 | 3250 | 1955 | 1899 |
| 2373 | HVO_2311 | 1666 | 1672 | 1683 | 1915 | 1716 | 1716 | 1955 | 3365 | 2068 |
| 2359 | Hbo1997 | 1703 | 1738 | 1693 | 1955 | 1856 | 1850 | 1899 | 2068 | 3282 |
470 symbols consensus MR-NTGVISGVSVSHERASVDEIEAAAADSQRTAVESLLARPGVEEAFALQTCNRAEAYV #oth 14333.3131221114211222323.25424324226..352412.11211..1.4.2.. VNG1774 :NG::::V:::R::::T::L::LA::S:A:TEA:LDA::EQ:P:::::V::::H:V:::: NP4502A :TVE::IVV:A::::SH::I:Q::T::DG::Q::::E::SKE::S:::V::::::::::: Hut0481 VK:EP:Y:TAA::A:QHG::ED:D:::::::LAG::Q::EA:H:T:::V::::::::R:: HQ3336A :-::::::C::R:::N::::E:::L:GERDS::IM:T::T:D:IT:S::I:::::S:::: rrnAC1708 ::GD::A:V::CI::::::::QL:T:::::E:H:::::::N:A::::I:::::::T:G:: Hmu2254 VKAG:::::::::A::H:T:EDR::::TE:::H::::::TE:A::::::::::::I:G:: hla1130 :K:E::A:T:I::AYS::T:::::::GG:GV:AT:SD::::D:::::::I:::::S:::: HVO_2311 :::DS::::::::A:D::::R:::::SS:DVQ:V::R::::D::S:::S::::::::::: Hbo1997 ::::A::::::R:::DH:T:::VAS:SD:DV::T:::::TNEE:S:::::H::::::::: consensus VTDDAEDGRRALADFAPDVRDGAVRRMDHEESLRHLLRVAAGLESLVLGEDQILGQVRRA #oth .344643144..6424452412422612.121.2..11..3....1.3.....1..3142 VNG1774 ::A:QAS:::::GGAGFNPAG:GAIS:G::D::::::::::::::::V::::::::L:D: NP4502A :AN:S:T:TA:::GYLAG:D:D:I:MLS:NQ::K::MA::C::::::I::::::::::D: Hut0481 :S::P:A::A::QAAM::EV:ST::TLG:::::::::::::::::::P::::::::::D: HQ3336A :A:G:VA::::::S::::::::::VD:S::::::::::::T:::::::::::::::FK:: rrnAC1708 :VS:H:::LE::EL:TRA:P:DV:VE:G:::::::::::::::::I::::::::::L:T: Hmu2254 ::EEGT:D--::SL:TDS:D:D::V:::::Q::::::::::::::I:::::::::::::: hla1130 :::RTI::SV::ES:::E::G:::::L::::::E::M:::S::::::::::::I::L:E: HVO_2311 :::::T::::::D:::::::::S::H:::::T::::M:::S::::::::::::::::KAG Hbo1997 :::AQAT:::::T:::::::::::VE::::Q:::::M:::::::::::::::::::IK:S consensus YEDARGVGGIGPMLEDAVTKAIHVGERARTETAINEGAVSLGSAAVRLAARETD--LTGA #oth 2241153112122.42122..3.......3..3....22.111...21155374112535 VNG1774 :DA:KDA:::DHV:RE:::::M::::::::::::::::T:::T::::::E:K:Q:::AD: NP4502A :::::::::V::T:N:::L::L:::::::::::::::::::::::::F::ERHG::V::S Hut0481 :::::H:D:L::V::E:::::::::::::::::::::V::::::::E::E::R::::EA: HQ3336A I:V:::I:AL:::::AG::::::::::::S::S:::::::I::::::::GQSVG:::N:R rrnAC1708 ::T:::::::::::::G:::::::::::::::K::::V::IA::::::LKQ:SS::::DG Hmu2254 :Q:::A:::::SV:::GI:::::::::::::::::::S::IA::::G::TD:CT:::D:E hla1130 ::ESKSA:::::V:K:G::::L:::::::N::S::::V::::::::::::D:I:::::DG HVO_2311 I:A::EQDA::::::::LM::V:::::::D:::::::::::::::::::RG:L:APIGEV Hbo1997 F:E:::A:::::::D:::::::::::::::::E:::::L::::::::::KS::T:::D:: consensus TALVVGAGEMGTLAAKALAS--DVSELVVANRTVPNAEHVAEEVDVPASAVGLDDVEAAI #oth 411.1....11311122224145233231....422.34213424451513413335433 VNG1774 R:V::::::::A:::::F:::AT:A:I:I::::PAR:VR::DM:S:::E:TT:A:ARGRL NP4502A ::::::::::A:::::::DD::PA:RVI:::::RER::RL:::LSTT::V::V:S:DE:A Hut0481 ::::I::::I:::::::VDARS::AH:Y:::::::H::::TSI:::A:::I:::::ASVV HQ3336A K:::I::::::S:V:ES::::TNI::V:I::::IE:::SI::TINS::Y::S::SLTEV: rrnAC1708 :::::::::::Q:::E::SE::E:DR:L:::::::H:::I::S::ID:::LA::GI:::V Hmu2254 :GV:::::::::R:::S::P::T:DR::::::::::::Y:::T:::E:T::S::A::SLL hla1130 S:V::::::::::::RT:DD:TP:::I::::::::::AF:::::ET::E::P:A:LATV: HVO_2311 E:::::::::::::T::::::V::GD::::::::A::R:L:R::PGVSK::::G:LGGRL Hbo1997 ::::I::::::::::ES::A:AGIG::::::::L:H::::::::::::R:LP:SA::::: consensus DAADVVISATGSPDYVIDPAALADAGETVVIDIAQPRDVPPAADDLDGVTVHDLDALESV #oth 53.23122..113233354643523122532.11...114233344443514.2.31.32 VNG1774 ::::::VT:::::EH:LPAS:F::::D:::V:L::::::A:G:GGH:::A:::::D::A: NP4502A ::::::V:::::E:::::T:D:GGV:::C:L::::::::A:G::GI:::A:Y:::TI::: Hut0481 :R::L:V:::::A:PIVE:::FETT:D::::::G::::I::IV:EQP:TD:F:::D::A: HQ3336A TE:SIIMT:::YGK:L:E:TDIDG::::FI::L::::N:H::TA:IENAI:Q:I:::::I rrnAC1708 SE:SA:::::::G:Q:F:IGTFS:S:DVSIV:::::::::AG::R:PS:::Y:::::::: Hmu2254 SE:R::VT:::::EPQL:TET::T::::F:V:::::::::TD::S:SNI::C:M:T:::L hla1130 PD::L::A::::::P::RSEHVTG:DRL:C::::::::IE::LA:R:K::LY:I::::D: HVO_2311 RD::L::T::S:::::VT:NQ:D:::::ML:::::::::D:D:S::A::R:::I:D::T: Hbo1997 E::::::::::::E::LSSPHVETS:::TL::L::::::D::V:S:PDIV:::M:G::A: consensus TAETRERREEAAREVEAMIDEEFDRLLTQYKRKRADEVISAMYESAERVKAREVETALSK #oth .431235.241.43.141112.12111431..2...41.15..12.132.32.253.243 VNG1774 ::A::::::D:::::::::ET::E:::::::::::::::AR:::::D:L:S:::Q::VHR NP4502A :D:A:AK:R:::ET::T::::::EH:M:::::::::Q::A::::G:::I::::LR::V:: Hut0481 :::::AN::A::AR::DIVED:LAH:::R:::T:::D:::T::::::::::::::Q::GS HQ3336A :K::EAS:QA:::::D:::::::::::ES:::Q::::A::E:::A::H::R:::::::E: rrnAC1708 :::::NK:QR::EA::RIV:::::::::::::::::R:::T::::::Q:::A:INS:::A Hmu2254 :E:::DQ:RT::TA::::V:::::H::N::::::::Q:::::::::DH:::S:LQ::F:: hla1130 :RK:::S:::E::::::I::::L::I:EA:::::::NA:::::AG:D:::::::DR:V:: HVO_2311 :DR:A::::R::S::::::::::::::AA::::::::A::S:::A::H::R:::S::::: Hbo1997 :D::::L:R:::ER::S:::D::E:::KSF::::::RA::G:::A::E::Q::L::::A: consensus LEAQ--G-LTDEQRETVESMADALVGQLLAAPTKSLRDAAEEDDWSTIQTALQLFDPDFG #oth 21321225122313121221..2112.1.1...2...1..42...4..51.14..2.313 VNG1774 :::E:S:S:SADE::V:::::::::S::::::::::::::A:::::::A:::E::N:E:E NP4502A F::EREDG:SEREH:I:::::::::::::S:::Q:::::::::::A::NA:::::G:GLE Hut0481 :D--::-::D::E::V::A:::S::N:::::::::::::::A:::A::D:::A::::::: HQ3336A ::K::::T:::N::::IS::::T:IN::::::::::::::A::::T:::::MT::::N:: rrnAC1708 AD--::-:FD:::A:V::A::::I:S:I::::::::::::::::::::H::::::::::: Hmu2254 :D--::-::D:D:QAV:::::::I:S:::::::Q:::E::Q:::::::N::::::::::: hla1130 :::::::G::::::::::DL:::::::::::::R::::::G::::E::R:::R::::E:D HVO_2311 ::S::::D:::::::::::L:::::::I::::::::::::GD:::T:::::M:::N:::: Hbo1997 :D:::::E:::D:::::AAL:::::::::S:::::::E::V::::D:::::MT::::::S consensus G--P---TPPEGPR----GA---D---DALRGDI---PRRMLEQL--SDD #oth 44435654434336222135433133323434341112654335333411 VNG1774 -::-:::-------::::--:::-::::GMPF:A:::S:GGDAASAE:E: NP4502A PEPTELP:V:D::E:::::VP::-:::EE::ERM:::SSG::::FSTN:: Hut0481 E::-:::--T:F:P::::SV:::-:::ADVDA:V::::D:-FSR:VDA:: HQ3336A :DT:QPDR:DDI::::::A:ERG:ISG:D:PD:V::::NHIA:KV::::G rrnAC1708 ::::DQA::::FTK:::::MSVE:IP::GM:DE:::::NA::DR:::::: Hmu2254 PD:TTAGG::AFSE:::::MSVD:IP:EGM:EE:::::AS:::::::G:: hla1130 -::-::::L::::GASGS:H:::-:::::AP:::EVP:GSVA:E:::-:: HVO_2311 DLGASESAG:S::SIEFS:EPPE:LDRE::E:EV::::::V::::::::: Hbo1997 :GE:SFD:-:S:::::::::IPE:ASN::DD:QH:::---V::S:::A::