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[S] (-) COG0392 Predicted integral membrane protein
8 genomes BUD0865 8 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0197

rrnAC3178

HVO_1859

Hbo1735

Hmu2575

Hut2687

hla2012

-

HQ1103A

Pairwise sequence scores
Consensus score2477 VNG0197 hla2012 HQ1103A HVO_1859 Hbo1735 Hut2687 rrnAC3178 Hmu2575
1235VNG0197 2489 783 861 907 920 973 1010 906
1330hla2012 783 2428 1006 1079 980 990 884 910
1536HQ1103A 861 1006 2554 1372 1573 1017 999 1084
1683HVO_1859 907 1079 1372 2515 1710 1064 1123 1152
1710Hbo1735 920 980 1573 1710 2660 1038 1081 1145
1529Hut2687 973 990 1017 1064 1038 2479 1243 1365
1572rrnAC3178 1010 884 999 1123 1081 1243 2494 1592
1658Hmu2575 906 910 1084 1152 1145 1365 1592 2493

367 symbols
consensus       -----------------MDGDRLRATIVGFAAALVVLAVLFWFVGIDELIDALSRADPAL
#oth            1111111111111111113443434133.1322421133.1332.2333243264.3454
VNG0197         ::::::::::::::::::NTA:VWS:::::G::A::F:::::LI::Q:I:T::G::RIP:
hla2012         ::::::::::::::::::::RQR:GL:I:GI::I:I:::::VV::A:RV:ET:LA:::::
HQ1103A         ::::::::::::::::::NI:DI:T::I::GSVIIIF:A::A:A:VE:::ATVRT:N:QY
HVO_1859        ::::::::::::::::::AREN:H::VL:::::V::F::::Y:A:V:::V:RVTM:E:TY
Hbo1735         MRCGFDGLIATTANVRD:AREN::::AL::LG:F::FVL::Y:A:V:::::TFQK:EA:P
Hut2687         ::::::::::::::::::::::K-T:LA:::G::A::GL:::A::::A:VGH::::RLP:
rrnAC3178       ::::::::::::::::::::N:V-::V:::::::A::SG:V:L:::G:TL:::AT:::EA
Hmu2575         :::::::::::::::::-MA:::-P::::::GT::::GA:V::::AGDILA::::::RSV

consensus       VAAVIAITLVWLVAWGLSLKTVLGALDVPVSVHTAFLVFAGAVFSNNVTPFGQAGGEPVA
#oth            1423534224.1531152.31.134.13513644121113213.1.11..........12
VNG0197         :VVAG:LM:G:I:LQ:TA:WI:WRI::IT:::RS:I:::::TS:A::I::::::::::::
hla2012         :::TFGLA:C::I::S:M:R::::S:::DL::T:S:::YS::::A:::::::::::::::
HQ1103A         ::L::GA::T::F::SV::H:::QT:::HL:YAAS:::::::M:::::::::::::::IT
HVO_1859        LI:IL:::::::::::A:::::::V:G:N::TARS::I:T::T::::I:::::::::::T
Hbo1735         :GL::LV:::::A::SF::::::DI:G:S:TFPK::FI::::M::::::::::::::::T
Hut2687         :L::VTM:V:::SC::M::H:::::::S::PA:::I:::SS:::::AI::::::::::::
rrnAC3178       LL::AG:AIL:::S:::A:W:::Q::GA::AP:::V:::VA::::::::::::::::::S
Hmu2575         L:::V:VAVL::CL::MA:::::DS:GA::AS:::I:::SA::::::::::::::::::S

consensus       ALLISRAADAEYETGLAAIASVDTLNFVPSIGIALVGAGYYATE-VTLG--RNLLFAAGA
#oth            .2.21432122...2.11..21.22122..123144142321332232322411442342
VNG0197         :::TTNVS::D:::A:::::GA:A::::::::L::T:TAA::IV:N:VS::PR:RSVV:I
hla2012         :A:::Q:SGSR:::::VG:::::V::V::::S:VFL:V:::::T:AAI:::ER:EV:VTV
HQ1103A         :Y::::T:::::::S:::::::::::LI:::T:::I:V::FT::::A::SRS:I:LGSIV
HVO_1859        ::::::ST:T::::::::::::::I::::::T:::I::::::::::::::::::EI:LV:
Hbo1735         :Y:::Q:S::::::S::::::::::::::::T:::::::::::::::::TN::::L:LV:
Hut2687         :::V:E:::S:::::::::::::::H::::::L:T::L:TF:V:S:N:D::Q::Y:::A:
rrnAC3178       :::::T:::T::::::::::T:::VH:L::V:Y:I::FTFV:AGA:Q:T:::::A:::::
Hmu2575         :::::E:::T:::::::::::::::H::::::F:VGAFTFV:AGA:Q:::::::::::::

consensus       VAALAVGIPTAAYLGWRYRYEIEARVVRALTPAIRTVARVVPRVPPPS-EAGIEARIEGF
#oth            233123433433331.23.34323311443314344223321.3432314351141122.
VNG0197         :G:FVLIVGGL:VA:::L:TT:Q:A:::VA:::L:WL:::L::::V:::PER:::G::E:
hla2012         AV::IAA:V::IG::::::----RV::DR:PS:VGGL:GRLD:FDAATV::::AD:LQN:
HQ1103A         :IT::TT:LIF::TA::::::::H:::Y::::M:HW::DI:::L:DIA:::E::T:::::
HVO_1859        :I:::::V:A:V:TA:KR::GL:R:LIG::::F:::I::Y::::SV:T:ND:::R::N::
Hbo1735         :V::::VV:SVG:VA:QR::RL:D:::S:FV:L:Q::::YA::::V:T::D:::R::N::
Hut2687         :GL::ATFLG::L:::Q::::::RV::GV:::V::R:SG:L:::E::E:GNV::D:::::
rrnAC3178       ::V:::::::::V::::H:DRVQ:L:I:GVS::LTALSN::::WS::::AEN::::::::
Hmu2575         I:T::::L:::::::::::::L::A:::S::SVA:::G:::::WT::::P:AL:H:::::

consensus       FRAIERVATNRRGLAVALGLSAAGWLCQMAALWLSFAAIGAPVPFSVALLVVPVAAIAGV
#oth            14211.213212421425141331133134211221412.422354441321.2142.22
VNG0197         VASV::L:AD:T:VLKVI::AT:AL:::AI:M:VV:I:L:S:I:IY:P:F::::GTM::I
hla2012         :ED::::G:SPGR::A:V:::LS:::F:A:::TVA:::V:HE:APV:P:FA::L:YV::A
HQ1103A         ::::::::A:P:Q::::::A:TI::I:::T::::A:R:::IELRTTFI:II::I:T::::
HVO_1859        ::S::::GR:P::::::::::GF::F:::V:::VA:H:::::IA::I::F:::IG:::::
Hbo1735         ::::::I:::P::::L:::G::I::F:::LG:::::R:::IE::L:I:M::::IG:::::
Hut2687         :T::D:::GS::TILL:SLY:T::::SLST:::::L:SL:HV:::VAM:V:::::S::AI
rrnAC3178       :S::::I::D::TVLQTF::::F::V:LS:S::T:LY:V:::::VE:V::::::GS::S:
Hmu2575         :TS:D:I:GD::A:L::T:F::::::ALGV:::::LY:L:E::E::SVM:AI:::MV::I

consensus       TPLPGGAGGIESVLVALLVAT--TGVAAAVATAAVVIFRGAVYWLPMLIGGGVAAWLGAR
#oth            3.1...2.1..32224.232321342343314212122.3341121452..323153242
VNG0197         G:T:::L::::::H::::T:L:::SA::PLVA:::::H:IGGF::T:TV:::SL:V:R:G
hla2012         ::::::L::::AAF:::::P::::::P:SAV::::LV:::G:::M::A:::VS:SV::V:
HQ1103A         :::::::::::T:::F::L:APLPH:TE:I:VT::::::::I::V:VIL::::V::ISSG
HVO_1859        :::::::::::WT:AI:VA:AS:SA:SFD::::GI:V:::F:::V:VVL::L:MSTES::
Hbo1735         :::::::::::::::V::L:VPLPS:TKS::V::I:::::::::::T:L::::M::VSLG
Hut2687         ::::::L::::AAFI::I:S:::::L::S::G:G:::Y:LST:::TLF:::TT::I::E:
rrnAC3178       V:::::S:A::T:::T:::S:::AP:S::L::S::L:H:VGS:L::TV:::::::A::VD
Hmu2575         A:::::S:A:::::AT::::::::::PS:::LS:ALLY:::T::::I:V:::::SF:::D

consensus       GARS---
#oth            4543322
VNG0197         :SDAD::
hla2012         TV:-:::
HQ1103A         ANIGSPN
HVO_1859        :W:::::
Hbo1735         :S:::::
Hut2687         YRS::::
rrnAC3178       R:A:PGE
Hmu2575         R:AGDG: