|
Pairwise sequence scores | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2477 | VNG0197 | hla2012 | HQ1103A | HVO_1859 | Hbo1735 | Hut2687 | rrnAC3178 | Hmu2575 |
1235 | VNG0197 | 2489 | 783 | 861 | 907 | 920 | 973 | 1010 | 906 |
1330 | hla2012 | 783 | 2428 | 1006 | 1079 | 980 | 990 | 884 | 910 |
1536 | HQ1103A | 861 | 1006 | 2554 | 1372 | 1573 | 1017 | 999 | 1084 |
1683 | HVO_1859 | 907 | 1079 | 1372 | 2515 | 1710 | 1064 | 1123 | 1152 |
1710 | Hbo1735 | 920 | 980 | 1573 | 1710 | 2660 | 1038 | 1081 | 1145 |
1529 | Hut2687 | 973 | 990 | 1017 | 1064 | 1038 | 2479 | 1243 | 1365 |
1572 | rrnAC3178 | 1010 | 884 | 999 | 1123 | 1081 | 1243 | 2494 | 1592 |
1658 | Hmu2575 | 906 | 910 | 1084 | 1152 | 1145 | 1365 | 1592 | 2493 |
367 symbols consensus -----------------MDGDRLRATIVGFAAALVVLAVLFWFVGIDELIDALSRADPAL #oth 1111111111111111113443434133.1322421133.1332.2333243264.3454 VNG0197 ::::::::::::::::::NTA:VWS:::::G::A::F:::::LI::Q:I:T::G::RIP: hla2012 ::::::::::::::::::::RQR:GL:I:GI::I:I:::::VV::A:RV:ET:LA::::: HQ1103A ::::::::::::::::::NI:DI:T::I::GSVIIIF:A::A:A:VE:::ATVRT:N:QY HVO_1859 ::::::::::::::::::AREN:H::VL:::::V::F::::Y:A:V:::V:RVTM:E:TY Hbo1735 MRCGFDGLIATTANVRD:AREN::::AL::LG:F::FVL::Y:A:V:::::TFQK:EA:P Hut2687 ::::::::::::::::::::::K-T:LA:::G::A::GL:::A::::A:VGH::::RLP: rrnAC3178 ::::::::::::::::::::N:V-::V:::::::A::SG:V:L:::G:TL:::AT:::EA Hmu2575 :::::::::::::::::-MA:::-P::::::GT::::GA:V::::AGDILA::::::RSV consensus VAAVIAITLVWLVAWGLSLKTVLGALDVPVSVHTAFLVFAGAVFSNNVTPFGQAGGEPVA #oth 1423534224.1531152.31.134.13513644121113213.1.11..........12 VNG0197 :VVAG:LM:G:I:LQ:TA:WI:WRI::IT:::RS:I:::::TS:A::I:::::::::::: hla2012 :::TFGLA:C::I::S:M:R::::S:::DL::T:S:::YS::::A::::::::::::::: HQ1103A ::L::GA::T::F::SV::H:::QT:::HL:YAAS:::::::M:::::::::::::::IT HVO_1859 LI:IL:::::::::::A:::::::V:G:N::TARS::I:T::T::::I:::::::::::T Hbo1735 :GL::LV:::::A::SF::::::DI:G:S:TFPK::FI::::M::::::::::::::::T Hut2687 :L::VTM:V:::SC::M::H:::::::S::PA:::I:::SS:::::AI:::::::::::: rrnAC3178 LL::AG:AIL:::S:::A:W:::Q::GA::AP:::V:::VA::::::::::::::::::S Hmu2575 L:::V:VAVL::CL::MA:::::DS:GA::AS:::I:::SA::::::::::::::::::S consensus ALLISRAADAEYETGLAAIASVDTLNFVPSIGIALVGAGYYATE-VTLG--RNLLFAAGA #oth .2.21432122...2.11..21.22122..123144142321332232322411442342 VNG0197 :::TTNVS::D:::A:::::GA:A::::::::L::T:TAA::IV:N:VS::PR:RSVV:I hla2012 :A:::Q:SGSR:::::VG:::::V::V::::S:VFL:V:::::T:AAI:::ER:EV:VTV HQ1103A :Y::::T:::::::S:::::::::::LI:::T:::I:V::FT::::A::SRS:I:LGSIV HVO_1859 ::::::ST:T::::::::::::::I::::::T:::I::::::::::::::::::EI:LV: Hbo1735 :Y:::Q:S::::::S::::::::::::::::T:::::::::::::::::TN::::L:LV: Hut2687 :::V:E:::S:::::::::::::::H::::::L:T::L:TF:V:S:N:D::Q::Y:::A: rrnAC3178 :::::T:::T::::::::::T:::VH:L::V:Y:I::FTFV:AGA:Q:T:::::A::::: Hmu2575 :::::E:::T:::::::::::::::H::::::F:VGAFTFV:AGA:Q::::::::::::: consensus VAALAVGIPTAAYLGWRYRYEIEARVVRALTPAIRTVARVVPRVPPPS-EAGIEARIEGF #oth 233123433433331.23.34323311443314344223321.3432314351141122. VNG0197 :G:FVLIVGGL:VA:::L:TT:Q:A:::VA:::L:WL:::L::::V:::PER:::G::E: hla2012 AV::IAA:V::IG::::::----RV::DR:PS:VGGL:GRLD:FDAATV::::AD:LQN: HQ1103A :IT::TT:LIF::TA::::::::H:::Y::::M:HW::DI:::L:DIA:::E::T::::: HVO_1859 :I:::::V:A:V:TA:KR::GL:R:LIG::::F:::I::Y::::SV:T:ND:::R::N:: Hbo1735 :V::::VV:SVG:VA:QR::RL:D:::S:FV:L:Q::::YA::::V:T::D:::R::N:: Hut2687 :GL::ATFLG::L:::Q::::::RV::GV:::V::R:SG:L:::E::E:GNV::D::::: rrnAC3178 ::V:::::::::V::::H:DRVQ:L:I:GVS::LTALSN::::WS::::AEN:::::::: Hmu2575 I:T::::L:::::::::::::L::A:::S::SVA:::G:::::WT::::P:AL:H::::: consensus FRAIERVATNRRGLAVALGLSAAGWLCQMAALWLSFAAIGAPVPFSVALLVVPVAAIAGV #oth 14211.213212421425141331133134211221412.422354441321.2142.22 VNG0197 VASV::L:AD:T:VLKVI::AT:AL:::AI:M:VV:I:L:S:I:IY:P:F::::GTM::I hla2012 :ED::::G:SPGR::A:V:::LS:::F:A:::TVA:::V:HE:APV:P:FA::L:YV::A HQ1103A ::::::::A:P:Q::::::A:TI::I:::T::::A:R:::IELRTTFI:II::I:T:::: HVO_1859 ::S::::GR:P::::::::::GF::F:::V:::VA:H:::::IA::I::F:::IG::::: Hbo1735 ::::::I:::P::::L:::G::I::F:::LG:::::R:::IE::L:I:M::::IG::::: Hut2687 :T::D:::GS::TILL:SLY:T::::SLST:::::L:SL:HV:::VAM:V:::::S::AI rrnAC3178 :S::::I::D::TVLQTF::::F::V:LS:S::T:LY:V:::::VE:V::::::GS::S: Hmu2575 :TS:D:I:GD::A:L::T:F::::::ALGV:::::LY:L:E::E::SVM:AI:::MV::I consensus TPLPGGAGGIESVLVALLVAT--TGVAAAVATAAVVIFRGAVYWLPMLIGGGVAAWLGAR #oth 3.1...2.1..32224.232321342343314212122.3341121452..323153242 VNG0197 G:T:::L::::::H::::T:L:::SA::PLVA:::::H:IGGF::T:TV:::SL:V:R:G hla2012 ::::::L::::AAF:::::P::::::P:SAV::::LV:::G:::M::A:::VS:SV::V: HQ1103A :::::::::::T:::F::L:APLPH:TE:I:VT::::::::I::V:VIL::::V::ISSG HVO_1859 :::::::::::WT:AI:VA:AS:SA:SFD::::GI:V:::F:::V:VVL::L:MSTES:: Hbo1735 :::::::::::::::V::L:VPLPS:TKS::V::I:::::::::::T:L::::M::VSLG Hut2687 ::::::L::::AAFI::I:S:::::L::S::G:G:::Y:LST:::TLF:::TT::I::E: rrnAC3178 V:::::S:A::T:::T:::S:::AP:S::L::S::L:H:VGS:L::TV:::::::A::VD Hmu2575 A:::::S:A:::::AT::::::::::PS:::LS:ALLY:::T::::I:V:::::SF:::D consensus GARS--- #oth 4543322 VNG0197 :SDAD:: hla2012 TV:-::: HQ1103A ANIGSPN HVO_1859 :W::::: Hbo1735 :S::::: Hut2687 YRS:::: rrnAC3178 R:A:PGE Hmu2575 R:AGDG: