|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3237 | HQ1700A | NP1518A | VNG0512 | Hut1061 | rrnAC1841 | Hmu0963 | HVO_0853 | Hbo0683 | hla0343 |
2227 | HQ1700A | 3926 | 1691 | 1703 | 1771 | 1850 | 1818 | 1871 | 1950 | 1909 |
2176 | NP1518A | 1691 | 3417 | 1690 | 1913 | 1932 | 1917 | 1773 | 1746 | 1767 |
2018 | VNG0512 | 1703 | 1690 | 2979 | 1609 | 1798 | 1750 | 1769 | 1768 | 1819 |
2245 | Hut1061 | 1771 | 1913 | 1609 | 3584 | 2032 | 1951 | 1896 | 2019 | 1884 |
2423 | rrnAC1841 | 1850 | 1932 | 1798 | 2032 | 3217 | 2223 | 1909 | 2021 | 2015 |
2361 | Hmu0963 | 1818 | 1917 | 1750 | 1951 | 2223 | 3214 | 1902 | 1920 | 1954 |
2405 | HVO_0853 | 1871 | 1773 | 1769 | 1896 | 1909 | 1902 | 3321 | 2299 | 2165 |
2492 | Hbo0683 | 1950 | 1746 | 1768 | 2019 | 2021 | 1920 | 2299 | 3600 | 2200 |
2455 | hla0343 | 1909 | 1767 | 1819 | 1884 | 2015 | 1954 | 2165 | 2200 | 3314 |
533 symbols consensus MTRVIHTGDTHIGYQQYHSPERRQDFLDAFRQVIDDAIDADVDAVVHAGDLFHDRRPELT #oth .11.1......3..2..1314.14...2..52.23..33521...1.....1...1.5.4 HQ1700A :::::::::::::::::::QI::E:::N::N:::T::C:::::::I:::::::::::S:: NP1518A ::::L:::::::::R:::T::::E:::S:::::A:::VEM:::::::::::::::::G:V VNG0512 :A:::::::::L::::::A:Q:::::::::DA::T::::EG::::::::::Y:::Q:G:R Hut1061 ::Q:L::::::L::R:::::::QG:::S::Q:::::::E::::::::::::::::::R:Q rrnAC1841 :::::::::::V:::::NV:D::D:::::::::VR:::AD:A:::::::::::::::A:: Hmu0963 ::::::::::::::::::V::::D:::N:::::V::::GSGA:::::::::::::::T:: HVO_0853 :::::::::::L::::::::::::::::::ER:VA::L:G:::::::::::Y:::::::P Hbo0683 :::::::::::::::::::::::R::::::E::VA:::AD:::::::::::::::::::R hla0343 :::::::::::M::T:::::V:::::::::AA::::::EGE::::::::::::::::::: consensus DLLGTIDILRRLDDAGIPFLAVVGNHESTRDAQWLDLFERLGLATRLDDEPRVVGDT-AF #oth .2111244.15.33.31....1.....31.21.....1.311..2..132.321222111 HQ1700A ::::::::::D:RE:D::::::::::::::HG::::::::::::E:::NS::YIN:NL:L NP1518A :::::V:::ET::S:::::::I:::::TK::::::::::TM::::::G:::VP::E:::: VNG0512 :I:D::AL::P:Q::D:::::::::::G:::::::::::T::::E::::S::::A::::: Hut1061 :I::ALGT::E::A:S:::::I:::::GK::::::::::S:D::I:::E::T:I:E:::: rrnAC1841 :IM::LTV:EE:SE:::::::::::::AK::::::::Y:S:::::::::::T:I:::::: Hmu0963 :V:::L:V:E:::::D:::::::::::AK::::::::Y:S:::::::::::::I:::::: HVO_0853 :::::LAA:::::::::::::I::::::::GG:::::::::::::::GRD:H:::GV::: Hbo0683 ::::::S:::Q::::E::::::::::::::GG:::::::N::::E::G:D:H:::::::: hla0343 ::M:::S:::::::::V:::::::::::::GG:::::::::::::::G:D:T::::::S: consensus YGLDHVPRSRRDDLDYDFAPHDADHAALVSHGLFTP----FAHADWDTEAVLTESNVDFD #oth ....2.1423.1212.414312233.1..3..1.2.111114223.132211441312.. HQ1700A :::::::P:::EE:A:E:N::E:T::::::::::::::::::::::E::T:::TAS:::: NP1518A ::::F:::NQ::::E:E::T::CE::::::::::E:LVPDYGNVE::I::::EA::I::: VNG0512 ::::Y::Q:K:::H::TV:D:::::::::::::::::::::PY:N::LD:::ADAT:E:: Hut1061 ::::F:A:AA::::A:::E:::TT::::::::::Q::::::S:G:::A::I:EQAT:::: rrnAC1841 ::::F::::Q::::::::G:::::S::::T::::Q::::::DYG:::A:EI::::S:E:: Hmu0963 ::::Y::::Q::A:::E::S:G::::::::::Q:Q::::::DYGT::AT:IVD:AT:::: HVO_0853 ::::::::::::E:::Q:D:V:::R:V::A::::::::::::::::E::T::A::::::: Hbo0683 :::::::KA:::::A:::E::::A:::::G::::::::::::::::E::T::G::::A:: hla0343 :::::::V::::::::A:DD::::Y::::A::::E::::::GY::::::T:::::D:::: consensus AMLLGDNHAPGTAQVDDTWVTYCGSTERASASERDARGYNLVTF-------DDDVDIRRR #oth .3.1..2.3133431321.1..1.....1.12.233....1.2.3211111224.5.2.1 HQ1700A :L:::::::::VET:E:A::::::::::T:TA:ES:::::::::::::::::T::::::: NP1518A :V::::E::ATKQE:A::::::::::::T::::::D::::::::::::::::GA:R:S:: VNG0512 :V::::::T:D:::LG:::::::::::::::::::P::::I:S:SSDA:::TT::A:S:K Hut1061 ::::::D:T:ARRE::G::L::::::::::::::E::::::::::::::::::G:::::: rrnAC1841 ::::::::D::KQ::E:A::::::::::::::::AD::::I::::::::::::E:Q:T:: Hmu0963 :L::::E:::::K:::EA:L:::::::::::D:::D::::I::::::::::::::T:T:: HVO_0853 :V::::::V:D::EL:G::::::::::::::::::P::::::E:T::::::P:A:::::: Hbo0683 :F:I::::::::E:::G::::::::::::::A:TE::::::::::::::::::E:::::: hla0343 ::::::::T:DV:K::G:::::P:::::::::::EG::::::::DADAAGG::R:E:::: consensus SLDTRPFVFVDVDLAADEGAERVRERVREHDLDDAVVIVEITGEGEPVTPAAIEEFATDR #oth 313..1.1..221.2531.52312421213113...131424.1.1412..51.3.2513 HQ1700A ::E:::::::S::::TG::T:::CD:L::Y::G::::VI::::D:DS:P::T::T::::H NP1518A GIK::::::::LE:G:T::FNY::D:LL:Y:::::::R:TLD:D::D:S::R::S::::E VNG0512 ::N::E:::::A::GPTD:TAFIQ::L::RA::::::V:T:::D:DT::::E::R:GD:: Hut1061 :IE::::::::LE:::G:::::::T::GQ:::E::::::T:E::::R:P::T:::::R:: rrnAC1841 G::::E::::::::GPK::V::::S::GQ:::E::::::S:S:D:D:::::SV:S::L:: Hmu0963 G::::E::::E:E::G:::L:H:::::G:Y::S::::::HVD:::::I:::G:::::L:Q HVO_0853 T:E::::A::E::::G:::I::::Q::::F::E:::::::LR::::T:::::V:S::VEE Hbo0683 :::::::A::S:E::D:::::::::Q::Q::V::::A::::::::::::::S::::LSE: hla0343 A:::::::::E:::REG:::A::::K::Q:::G::::L:DV::::D:::::::::::::E consensus GALVARVTDRREI-ADEREI--DVSFADPDDAVRERVRELGLSEAARDVDETVRASKVAD #oth ...21..1.3.34253243522213....13.132.13211.13214221241.22332. HQ1700A ::::::::::::H:PE::N:DTT:::::::A::EQ:I:::D::T::H:I:TMI:SDSIS: NP1518A :::::::::N:T:DV:ADAP:::IA:::::K:A:::::::::::MG:QL:::::DGEI:: VNG0512 :::LT::N::::FDTGDDAPDV:::::::::::EQ:::D:::D:P:::::RI::DDTL:: Hut1061 :::::::N::::::DE:AAY::::R:::::::::D:IDQ::::P::AEL::V:::::::: rrnAC1841 :::::::::H:::T:E:::T:::I:::::::::T::::D:::::::H:I:::I::::::: Hmu0963 :::::::::H::F::::::V::A:::::::E::H::::::::::::::I:::I:::::P: HVO_0853 :::::::N:K:D::D:DGDLAT::T::::::::::::::M:::S::L::::::::::::: Hbo0683 :::::::::::SM:ET:T:V:::::::::::::::::SD::::T::L::::::::::T:: hla0343 :::I::::::::V:ETDA:::::::::::E:::::::E:M::::::F::E:A:::DTIP: consensus SNVRDEVERRVEELL--DSDDLDAFTGAAA------------------------------ #oth 212423144224332124634333356354111111111111111111111111111111 HQ1700A ::I:NT:TEEIS:::::NNES:::::QTSSADTNTFDKTTSTSPEGTQSDSSILSADYTT NP1518A ::LS::I:::::SA:::EDGG:EDIA:T:::::::::::::::::::::::::::::::: VNG0512 AA::ER:IQ:A:AV:::-------------:::::::::::::::::::::::::::::: Hut1061 :::D:S::S::R::V:::EG:AEQ:KP:P::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1841 A::K:::::H:R:::SE:::A:E:D:D::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0963 :::A:T::E::AD:V::EAG::A::D::D::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0853 :::::::RE:::S::::S-::P:::VA:ER:::::::::::::::::::::::::::::: Hbo0683 A:::E::KT::DS::::E::::::::P:DT:::::::::::::::::::::::::::::: hla0343 T:::ET:K:::::RI:D:L::::::DRGET:::::::::::::::::::::::::::::: consensus -----------------------EDADADTEDNGDDAADDEADAADEDE---------A- #oth 111323323333333323233235344525554645452443653533211111165445 HQ1700A NSPSSNKETENHTPFVQQPQSTVK:D:T::KIDS::MSN::NMDIIA:TNRFTNISQD:N NP1518A :::::::::::::::::::::::---::::G:::E-:G:SG:TTGS:S:::::::RADGK VNG0512 :::::::::::::::::::::::---------------::D:::::D:G:::::::::-: Hut1061 :::EGDGEADDGDNMEAGDSDDT:GS:S:D:PA::SI::AP:EDGT:S:::::::GSE:N rrnAC1841 :::::::::::::::::::::::SGGT::A:A:T:T:E::TD:G:AVN::::::::::-: Hmu0963 ::::::::::::::::::::::::S:HPE::AD:GH:PT:DRSS:TDET:::::::::-: HVO_0853 ::::::::::::::::::::::ES::E:EESESVE::::G:DA::V::T::::::AET:A Hbo0683 :::DGTESEGKESTPSATDVTTET::TDESD:SIET::TT::NTT::::::::::VAVET hla0343 :::::::::::::::::::::::V:G::EA:::EAEL:::::EL::DET::::::DGEPI consensus -GADDTATTGGADDD-----------------D-----------GQSTMEEFL #oth 54544447555437453443442443442344244242222222524121113 HQ1700A TDT:T::NI:SDSNAEPSIDRTEETELSDDES:TSETDESNSASS:F:::D:- NP1518A T:PS::GDA:ETG:ARTEAESNESSQTQETDGQPAEN::::::::::S:::Y: VNG0512 :--------------:::::::::::::::::-:::::::::::RPT:V:::Q Hut1061 DTQANGEG:D:P:QPNDGQTEKDGNQPNDEQT:DGE::::::::::A::G:Y: rrnAC1841 :-:::K:PVD::::::::::::::::::::::-:::::::::::::ASV:::: Hmu0963 :-::AAGE::S::P::::::::::::::::::-:::::::::::D::::G:Y: HVO_0853 EA:T::D:ETT::T:S::::::::::::ETAA:PAAS:::::::RD:SLGD:A Hbo0683 H:TT::DA:V:T:ETTDTDTTVDTDTEDDTAT:ADAENGNAEPNQ:F:::D:- hla0343 G:K:::::ASA::I::::::::::::::::::-:::::::::::E:VS::DY: