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[L] (SbcD) COG0420 DNA repair exonuclease
9 genomes BUD0173 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0512

rrnAC1841

HVO_0853

Hbo0683

Hmu0963

Hut1061

hla0343

NP1518A

HQ1700A

Pairwise sequence scores
Consensus score3237 HQ1700A NP1518A VNG0512 Hut1061 rrnAC1841 Hmu0963 HVO_0853 Hbo0683 hla0343
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2361Hmu0963 1818 1917 1750 1951 2223 3214 1902 1920 1954
2405HVO_0853 1871 1773 1769 1896 1909 1902 3321 2299 2165
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2455hla0343 1909 1767 1819 1884 2015 1954 2165 2200 3314

533 symbols
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Hmu0963         ::::::::::::::::::V::::D:::N:::::V::::GSGA:::::::::::::::T::
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Hbo0683         :::::::::::::::::::::::R::::::E::VA:::AD:::::::::::::::::::R
hla0343         :::::::::::M::T:::::V:::::::::AA::::::EGE:::::::::::::::::::

consensus       DLLGTIDILRRLDDAGIPFLAVVGNHESTRDAQWLDLFERLGLATRLDDEPRVVGDT-AF
#oth            .2111244.15.33.31....1.....31.21.....1.311..2..132.321222111
HQ1700A         ::::::::::D:RE:D::::::::::::::HG::::::::::::E:::NS::YIN:NL:L
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Hbo0683         ::::::S:::Q::::E::::::::::::::GG:::::::N::::E::G:D:H::::::::
hla0343         ::M:::S:::::::::V:::::::::::::GG:::::::::::::::G:D:T::::::S:

consensus       YGLDHVPRSRRDDLDYDFAPHDADHAALVSHGLFTP----FAHADWDTEAVLTESNVDFD
#oth            ....2.1423.1212.414312233.1..3..1.2.111114223.132211441312..
HQ1700A         :::::::P:::EE:A:E:N::E:T::::::::::::::::::::::E::T:::TAS::::
NP1518A         ::::F:::NQ::::E:E::T::CE::::::::::E:LVPDYGNVE::I::::EA::I:::
VNG0512         ::::Y::Q:K:::H::TV:D:::::::::::::::::::::PY:N::LD:::ADAT:E::
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rrnAC1841       ::::F::::Q::::::::G:::::S::::T::::Q::::::DYG:::A:EI::::S:E::
Hmu0963         ::::Y::::Q::A:::E::S:G::::::::::Q:Q::::::DYGT::AT:IVD:AT::::
HVO_0853        ::::::::::::E:::Q:D:V:::R:V::A::::::::::::::::E::T::A:::::::
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hla0343         :::::::V::::::::A:DD::::Y::::A::::E::::::GY::::::T:::::D::::

consensus       AMLLGDNHAPGTAQVDDTWVTYCGSTERASASERDARGYNLVTF-------DDDVDIRRR
#oth            .3.1..2.3133431321.1..1.....1.12.233....1.2.3211111224.5.2.1
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HVO_0853        :V::::::V:D::EL:G::::::::::::::::::P::::::E:T::::::P:A::::::
Hbo0683         :F:I::::::::E:::G::::::::::::::A:TE::::::::::::::::::E::::::
hla0343         ::::::::T:DV:K::G:::::P:::::::::::EG::::::::DADAAGG::R:E::::

consensus       SLDTRPFVFVDVDLAADEGAERVRERVREHDLDDAVVIVEITGEGEPVTPAAIEEFATDR
#oth            313..1.1..221.2531.52312421213113...131424.1.1412..51.3.2513
HQ1700A         ::E:::::::S::::TG::T:::CD:L::Y::G::::VI::::D:DS:P::T::T::::H
NP1518A         GIK::::::::LE:G:T::FNY::D:LL:Y:::::::R:TLD:D::D:S::R::S::::E
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rrnAC1841       G::::E::::::::GPK::V::::S::GQ:::E::::::S:S:D:D:::::SV:S::L::
Hmu0963         G::::E::::E:E::G:::L:H:::::G:Y::S::::::HVD:::::I:::G:::::L:Q
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hla0343         A:::::::::E:::REG:::A::::K::Q:::G::::L:DV::::D:::::::::::::E

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#oth            ...21..1.3.34253243522213....13.132.13211.13214221241.22332.
HQ1700A         ::::::::::::H:PE::N:DTT:::::::A::EQ:I:::D::T::H:I:TMI:SDSIS:
NP1518A         :::::::::N:T:DV:ADAP:::IA:::::K:A:::::::::::MG:QL:::::DGEI::
VNG0512         :::LT::N::::FDTGDDAPDV:::::::::::EQ:::D:::D:P:::::RI::DDTL::
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rrnAC1841       :::::::::H:::T:E:::T:::I:::::::::T::::D:::::::H:I:::I:::::::
Hmu0963         :::::::::H::F::::::V::A:::::::E::H::::::::::::::I:::I:::::P:
HVO_0853        :::::::N:K:D::D:DGDLAT::T::::::::::::::M:::S::L:::::::::::::
Hbo0683         :::::::::::SM:ET:T:V:::::::::::::::::SD::::T::L::::::::::T::
hla0343         :::I::::::::V:ETDA:::::::::::E:::::::E:M::::::F::E:A:::DTIP:

consensus       SNVRDEVERRVEELL--DSDDLDAFTGAAA------------------------------
#oth            212423144224332124634333356354111111111111111111111111111111
HQ1700A         ::I:NT:TEEIS:::::NNES:::::QTSSADTNTFDKTTSTSPEGTQSDSSILSADYTT
NP1518A         ::LS::I:::::SA:::EDGG:EDIA:T::::::::::::::::::::::::::::::::
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Hut1061         :::D:S::S::R::V:::EG:AEQ:KP:P:::::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC1841       A::K:::::H:R:::SE:::A:E:D:D:::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu0963         :::A:T::E::AD:V::EAG::A::D::D:::::::::::::::::::::::::::::::
HVO_0853        :::::::RE:::S::::S-::P:::VA:ER::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo0683         A:::E::KT::DS::::E::::::::P:DT::::::::::::::::::::::::::::::
hla0343         T:::ET:K:::::RI:D:L::::::DRGET::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       -----------------------EDADADTEDNGDDAADDEADAADEDE---------A-
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HQ1700A         NSPSSNKETENHTPFVQQPQSTVK:D:T::KIDS::MSN::NMDIIA:TNRFTNISQD:N
NP1518A         :::::::::::::::::::::::---::::G:::E-:G:SG:TTGS:S:::::::RADGK
VNG0512         :::::::::::::::::::::::---------------::D:::::D:G:::::::::-:
Hut1061         :::EGDGEADDGDNMEAGDSDDT:GS:S:D:PA::SI::AP:EDGT:S:::::::GSE:N
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Hmu0963         ::::::::::::::::::::::::S:HPE::AD:GH:PT:DRSS:TDET:::::::::-:
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Hbo0683         :::DGTESEGKESTPSATDVTTET::TDESD:SIET::TT::NTT::::::::::VAVET
hla0343         :::::::::::::::::::::::V:G::EA:::EAEL:::::EL::DET::::::DGEPI

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HQ1700A         TDT:T::NI:SDSNAEPSIDRTEETELSDDES:TSETDESNSASS:F:::D:-
NP1518A         T:PS::GDA:ETG:ARTEAESNESSQTQETDGQPAEN::::::::::S:::Y:
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Hut1061         DTQANGEG:D:P:QPNDGQTEKDGNQPNDEQT:DGE::::::::::A::G:Y:
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Hmu0963         :-::AAGE::S::P::::::::::::::::::-:::::::::::D::::G:Y:
HVO_0853        EA:T::D:ETT::T:S::::::::::::ETAA:PAAS:::::::RD:SLGD:A
Hbo0683         H:TT::DA:V:T:ETTDTDTTVDTDTEDDTAT:ADAENGNAEPNQ:F:::D:-
hla0343         G:K:::::ASA::I::::::::::::::::::-:::::::::::E:VS::DY: