|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 4621 | VNG1896 | NP5026A | rrnAC3396 | Hmu2207 | Hut2079 | HQ3070A | hla1273 | HVO_2367 | Hbo2066 |
3565 | VNG1896 | 4585 | 3114 | 3217 | 3248 | 3215 | 2984 | 3119 | 3132 | 3111 |
3620 | NP5026A | 3114 | 4512 | 3416 | 3417 | 3492 | 3014 | 3128 | 3267 | 3110 |
3852 | rrnAC3396 | 3217 | 3416 | 4687 | 3597 | 3528 | 3127 | 3277 | 3382 | 3300 |
3811 | Hmu2207 | 3248 | 3417 | 3597 | 4620 | 3647 | 3077 | 3236 | 3246 | 3239 |
3716 | Hut2079 | 3215 | 3492 | 3528 | 3647 | 4599 | 2976 | 3145 | 3179 | 3144 |
3478 | HQ3070A | 2984 | 3014 | 3127 | 3077 | 2976 | 4951 | 3300 | 3402 | 3516 |
3787 | hla1273 | 3119 | 3128 | 3277 | 3236 | 3145 | 3300 | 4768 | 3621 | 3517 |
3796 | HVO_2367 | 3132 | 3267 | 3382 | 3246 | 3179 | 3402 | 3621 | 5023 | 3792 |
3745 | Hbo2066 | 3111 | 3110 | 3300 | 3239 | 3144 | 3516 | 3517 | 3792 | 4713 |
689 symbols consensus MSDLGDF------TDFDDDDAD--S-A--------------------------------A #oth 121111.11111132226.15445443111111111111111111111111113454431 VNG1896 :::::::::::::A:HGR::--::-:-::::::::::::::::::::::::::::::::- NP5026A :::P:R:::::::DS:G:::--::-:-::::::::::::::::::::::::::::::::- rrnAC3396 :::::::::::::::::G:::AADDE:::::::::::::::::::::::::::AQSAET: Hmu2207 ::::::::::::::E::A::SESSTP:::::::::::::::::::::::::::::::::- Hut2079 ::::::::::::::E::N:::G::-:-::::::::::::::::::::::::::::::::- HQ3070A -M:::::DPSDADSETET:EE:TN:PE::::::::::::::::::::::::::DERIIN: hla1273 -MT:E:::::::::E:G::EG:GGGD:::::::::::::::::::::::::::AADPAT: HVO_2367 :T:::::::::::S:::G::P:SS:D:GGGEQAGSVAGNGRSARADPVSETESATAASS: Hbo2066 ::::::::::::::::E-::P:TE:SS::::::::::::::::::::::::::HTTDAS: consensus ------REASDDTDGAD---------------DAADDDFEAYDVTPTGEDRGLGVLSVSQ #oth 4434546344474.444113322222332323555466.263343141513.1.221113 VNG1896 ::::::D:RGG:D:P:P:::::::::::::::--:::::DRPTLEA::S:D:::A:A::E NP5026A ::::::-:RD:TN::D::::::::::::::::------:::VSA::V:T:::I:TI:A:A rrnAC3396 DDGDGAVD::EE::PTT:::::::::::::::QS::::::DM::::A:T:T::::::AAN Hmu2207 ::::::DG:TG:E:::A:::::::::::::::ADE:EA::EM:IE:S:R:::I::::A:E Hut2079 ::::::EQ::EGS:APE:::::::::::::::R:ST::::PVET:::::E::I::::AAE HQ3070A ARESPAS:PGQK::ADTGMNTHIEKSQEETTSNTESPT:DS::I::IKQ:V:::TIA::: hla1273 GRGGTE:DGE:A:::::::KN::::SIDGDGE::T:GG:A::::E:::::V::::V:::: HVO_2367 DGDGVDADRD:RD:RD:::SSTDVTGGAGATD:GD:LQ:DD::AD:V:DE::::AIA::: Hbo2066 TEEAQT::Q:PQS:SEP::ST::::::::::::TDGVS::T:::S:A:::::I:AV:::: consensus GLRISEDGDETALRAYVTAGNRADVRIGKYLLVPYPD---GERLFCRITALEYAQEFRAD #oth ..213.1432.5.1.1..22..422.1.2..111..11112.3...1.411..211.32. VNG1896 ::::H:::Q::::K:::::::::A::L:T::VA:::G:::::T:::K::G:::V:A:ES: NP5026A :::::::D:D:R:::::::D::H:I:::S::VAA::::::::::::::A::::ER::::: rrnAC3396 ::::::EAE::V:::::::R::SRL:::T:::::::G:::::::::::K::::::::H:: Hmu2207 ::A:C::ER::C::::::V:::S:::::::::::::::::::::::::S::::::::::: Hut2079 ::T:::::ED:R::::::V:::::::::T:::A::::STTE::::::::::::VR::::: HQ3070A ::::A::D:::Q:::::::D::DRI:::T:::::::::::::M:::::A:V::::::HT: hla1273 :::VA::A:::T:K:F::::::EA::L::::::::::::::::::::::G::::::::S: HVO_2367 :::V:::S:R:::::F::::::ER::L::::V::::::::D:L:::::VG:::::::Q:: Hbo2066 :::VA::::::T:::F::T:::D:::L:::::::::::::D:L::::::::::::::QT: consensus DATEIHARRAMRR--DGIDERDYKFMAELEPVAVLYNDGDD--------------LKRRM #oth .........1..4114223.3.1..3.2.2.31112432221111111111111122... VNG1896 ::::::::::::S::::V::A::::L:::D:::::SDE:::::::::::::::::IT::: NP5026A ::::::::::::S:::::::H::::::T::::::::EEDG:::::::::::::::::::: rrnAC3396 ::::::::::::E::R::::::F::I::::::::::S::GE::::::::::::::::::: Hmu2207 ::::::::::::S::G::::Q:F::::T::::::::GT:::::::::::::::::M:::: Hut2079 ::::::::::::A::E::::Q:F::::T:::::I::::DGE:::::::::::::::Q::: HQ3070A ::::::::::::::::EFT::::::V:T:R:L:I:F:ETTNTTDTHDDVSDNIAT:T::: hla1273 :::::::::Q::::::DFA::::::::::::MS:V:GT:::::::::::::::::M:::: HVO_2367 :::::::::::::PA:EFE:::F::::::::I:::FS:DG:::::::::::::::::::: Hbo2066 ::::::::::::Q::Q:FE::::::V:S:D:::::FEQ::E::::::::::::::::::: consensus TDRVPKPETVVREATDASEIKTGLKIPEDGVFLGHLSVGGEKVRTAAEPPTIDYRLKDDY #oth 2......213.43.31442..1..1..22...1...1...11.3...4...1...11.21 VNG1896 P:::::::::::A:D::A:::A:::::A:::::::::::::::::::D:::::::V::G: NP5026A ::::::::::::::V:DT::::::::::A:::V:::::::Q::K:::S:::::::::::D rrnAC3396 ::::::::::::::::K:::::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::: Hmu2207 ::::::::::::Q:::K::::::::::::::::::::::::::Q:::::::::::::::: Hut2079 :::::::::P:SH:DER:A::::::::::::::::::::::::::::Q::::::::::A: HQ3070A V::::::GAI::A::::KQ:::::N::R:::::::::::::R:E:::S::::::::N::: hla1273 :::::::GAI:E::S:DA:::::::::::::::::::::::::::::::::V:::V:::: HVO_2367 V::::::QAT:G:::::TQ:::::::::A::::::::::::::::::R::::::::N::: Hbo2066 V::::::GAI:A::::PEQ::::::::AE::::::::::::::::::::::::::::::: consensus TAGDPLVFRHTLVAGGTGSGKTHASKNVLRQYLAEDRTYEM--GDGREVRMAVVQFDPQD #oth 42....2.....1..........41..2...2.432.2.23212311344311.1..... VNG1896 E:::::::::::I:::::::::::A::::::::H:::R:PVD:SG:P:R::::::::::: NP5026A D::::::::::::::::::::::TA::I::::::A::R:DI:::::::RAP:L::::::: rrnAC3396 V::::::::::::::::::::::S:::::::::G--:::::::::::TPEL::::::::: Hmu2207 E::::::::::::::::::::::G:::I:::::::::::PIE::ED:D:SPCL:M::::: Hut2079 D::::::::::::::::::::::LA::::::F:::E:S:PVET:SD:T:SP::::::::: HQ3070A :S::::I::::::::::::::::::::::::L:::::::::::D:::SS:L::::::::: hla1273 AD::::A::::::::::::::::::::::::::DA::::PT:::::::S::::::::::: HVO_2367 :D:::::::::::::::::::::::::I:::::S:E:S:::::D:::::QT::::::::: Hbo2066 :D:::::::::::::::::::::::::L:::L:DS::::::::D:::DA::::::::::: consensus EYAQMHDDNPDLDAEFARRCEREGIAHGGHDDTVAFVPKVAGASYAADHHRAEQVEFTIP #oth ....1...112344234.131112212..12..3.1..434233.4133.1..112.11. VNG1896 :::::::::::A::SDR:QW:TQ:L:Y:::::::::::T:GS::::::::A::::A::V: NP5026A ::::L::::::IGT::R::L:::A:::::V:::K::::A:D:T::::S:::::::::S:: rrnAC3396 ::::::::::EMTD::E:::::::::Y::::::I:::::::::D:N:S:::::::::::: Hmu2207 ::::::::G-::PE::Q:::::::::C:::E::T::::::S:S::::S:::::::::::: Hut2079 ::::::::G-::S:D:R:::::::::C:::E:::::::E:G::T:S:E:::::::A:::: HQ3070A ::::::::::A::S:TI::Y:::E:S::::N::I:L:::EE:VT:SG:T::::::R:::: hla1273 ::::::::::::::D::::LD:::::Y::::::::L::RA:N:T:PGEG::::R:::::: HVO_2367 :::::::::::M:D:T:::Y:::::::::::::::L:::M::S::PGAN:::::L:::V: Hbo2066 ::::::::::EMTESV:::Y::::V::::::::I:L:::ED:VP:GG:N:::::L::::: consensus FSMVRDNPWLVAGSGLNDNQYPAL-HELLNRFFRQYGDSGTYDQFLTFLDDPALKEELDE #oth ..11323...1.1.3..1..13..165..4..2321.34...53.431.21...1...1. VNG1896 ::::::::::::S::::::::G::::L::D:::G:::E::::RE:CA::::::::::::: NP5026A ::::H::::::::::::::::N::VSV::K::K::F::G:::E::RS:::::::R::::: rrnAC3396 ::L:H:::::I:::S::::::G::VNT::P::K:E::EG:::SD:R:::G:::::::::: Hmu2207 ::::YS::::I:::Q::::::S::::Y::D::EKE::ED::::::T:::::::::::::: Hut2079 ::L:Y:::::I::::::::::N::VSV::K::KK:::RE::::::TS::::::::::::: HQ3070A :::::TR:::::::R::E:::::::RH::::::DE::N::::AG:K:::EN:::R::::: hla1273 ::LAQ:M::::::::::E:::::::LT:::::::D:::::::S:::SY:::::::::::: HVO_2367 :::A::L:::::::S::::::::::I::::::::D:::A:::K:::QY::::::::::H: Hbo2066 :::A::R:::::::S::E::F::::K:::R::::::::E::::E::::::::::::::H: consensus SGRVHEATFDAVKRRVRGFPGGVFDQDARPITDL--DHQFVRPGGLTVVPTYHISDSRAK #oth 2.21....11..2..26.21332..11.11..22112321.12.12111....2331.42 VNG1896 ::::::::YE::L:::N:M:N:L::::::S::A:VE:RE::Q::R:S::::::::N:::A NP5026A ::K:::::::::R::IS::-SHI::G::::::::::VSE::::::V:T::::::N::::T rrnAC3396 A:D:::::::::::::Q::-:A:::::::::::Q::IS::::D:::::I:::::T:::TA Hmu2207 :::::::::::::::AY::-:::::::::::::M::VK::::S::IS:::::::N:::S: Hut2079 T:::::::Y::::::AL::-:N::::::::::::::V:E::::::::::::::VN::::T HQ3070A ::::::::::::::::W:V:DNI:::S:::::E::::::L::::::S:I::::L:ST:V: hla1273 :::I::::::::::::::V:::::::::K:::E:::::TL::::::S::::::LPT::Q: HVO_2367 ::::::::::::::::::V:S:::::::::::E::::::L:::::::::::::L:S:::: Hbo2066 ::::::::::::::::::V:N:::::S:::::E:::::EL::::::::I::::L:T:::: consensus ETVVLAVSSLLVDDKLSNDPDSDRIKETPLVLGMDEAHNFLTDADSVQARKVIGKFTEAA #oth 232...112111.2....3.4221.32...22.........2...2..121.12..11.. VNG1896 :::::::::::::Q::::::RY:A::R:::LV:::::::::S::::::::::V::::::: NP5026A T::::::A::I::E::::::TH:::::::::::::::::::::::::::DR:::::A::: rrnAC3396 S:I::::::::I:Q:::::::Y::::::::::::::::::::::::::G::::::::::: Hmu2207 T:::::LA:M:::E::::S:RY::::::::I::::::::::::::N:::::::::::::: Hut2079 ::::::L::::::E::::::TYE::G:::::V:::::::::::::::::::::::::D:: HQ3070A :M::::::::::::::::N:Y::::N::::LI:::::::::::::T:::::::S:::::: hla1273 :I:::::AG::::::::::::::::E::::LI:::::::::A:::T:::Q::VQ:::::: HVO_2367 :LF:::::A::I::::::::S::::::::::::::::::::::::::::Q:::Q:::::: Hbo2066 :MF::::::M:I::::::T:::Q:::Q::::::::::::::A:::N::::::VS:::::: consensus KQGRKERLGLFLITQDPQDIADPVFKQINTTVVLNLGDEDAISAVNIPSNLESKVPYMEK #oth ..........1.......11.211...1.1121.........31....23.24.....22 VNG1896 :::::::::::::::::::::G:::::V::::::::::::::Q:::::AT:Q::::::NT NP5026A :::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::K:::::::::G::::::Q rrnAC3396 ::::::::::Y::::::::::::::::::::M:::::::::::::::::::::::::::: Hmu2207 :::::::::::::::::::::::::::::S::::::::::::::::::A::::::::::: Hut2079 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H::A::::::Q HQ3070A :::::::::::::::::::::ES::::V::KLI:::::::::NS::::AA::N:::::K: hla1273 :::::::::::::::::::V:ES:::::::K::::::::::::S:::::::AG::::::: HVO_2367 :::::::::::::::::::::::::::V::K:::::::::::KS::::P:::D::::::: Hbo2066 ::::::::::::::::::GV:E:::::V::KL::::::::::KS::::P:::D::::::: consensus GQMVVYSPDNSEPVELQGLSTCVTRHGRD #oth ..3.1......1...24..34.1.1..22 VNG1896 :::::::::::::::V:::A::::::::: NP5026A ::::::::::::::::R:::N:L:::::: rrnAC3396 ::R:::::::::::::I:::::::::::: Hmu2207 :::::::::::::::I:::A::::K:::E Hut2079 ::L:::::::::::::I::PE:::::::: HQ3070A ::Q:I::::::::::I:::RH:L::::E- hla1273 ::::::::::::::::I:::K::::::D- HVO_2367 :::::::::::D::::T::::::::::D- Hbo2066 ::::::::::::::::V::::::::::E-