|
Pairwise sequence scores | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3168 | Hut2519 | VNG1804 | hla1304 | HQ3319A | HVO_2345 | Hbo2027 | NP4516A | Hut0750 | rrnAC3353 | Hmu2227 |
1832 | Hut2519 | 3224 | 1634 | 1666 | 1682 | 1624 | 1618 | 1613 | 1722 | 1704 | 1648 |
2549 | VNG1804 | 1634 | 3199 | 2184 | 2209 | 2264 | 2339 | 2182 | 2209 | 2308 | 2316 |
2479 | hla1304 | 1666 | 2184 | 3251 | 2361 | 2359 | 2323 | 2190 | 2042 | 2193 | 2208 |
2538 | HQ3319A | 1682 | 2209 | 2361 | 3178 | 2494 | 2597 | 2125 | 2100 | 2217 | 2233 |
2612 | HVO_2345 | 1624 | 2264 | 2359 | 2494 | 3167 | 2647 | 2274 | 2140 | 2263 | 2261 |
2752 | Hbo2027 | 1618 | 2339 | 2323 | 2597 | 2647 | 3181 | 2332 | 2220 | 2413 | 2423 |
2511 | NP4516A | 1613 | 2182 | 2190 | 2125 | 2274 | 2332 | 3150 | 2217 | 2363 | 2395 |
2467 | Hut0750 | 1722 | 2209 | 2042 | 2100 | 2140 | 2220 | 2217 | 3147 | 2431 | 2413 |
2703 | rrnAC3353 | 1704 | 2308 | 2193 | 2217 | 2263 | 2413 | 2363 | 2431 | 3188 | 2704 |
2689 | Hmu2227 | 1648 | 2316 | 2208 | 2233 | 2261 | 2423 | 2395 | 2413 | 2704 | 3187 |
434 symbols consensus -------------MSQSYVIIGDGIAGSSAAETIREEDPDADITVLTDEGEALYNRILIK #oth 1122222121111133.1..2...1..1...13121231..21.12.2.1.3........ Hut2519 MTSQSIRED::::RDD::::::::V::::::DVLA:QTD::S:::::A:S:P:::::::: VNG1804 :::::::::::::::A::::::::::::::::A:H::A:::::::::::::T:::::::: hla1304 MTTHINHESEPSR::D:::::::::::A:::::L:::A:::E:::::::::S:::::::: HQ3319A ::::::::::::::T:::::::::V::::::::L:G:A:::::::::::::S:::::::: HVO_2345 ::::::::::::::::::::V::::::A:::::L:::E::::::II:::::P:::::::: Hbo2027 ::::::::::::::T::::::::::::::::::L:::E:::::::V:::::::::::::: NP4516A ::::::::::::::CA:H:::::::::::::::::::::::::::I:E:::::::::::: Hut0750 ::::::::::::::TT:H::L:::::::::::::::A:::::V:II:::::P:::::::: rrnAC3353 :::::::::::::::T:H:::::::::A::::::::A::::SV::::::::::::::::: Hmu2227 :::::::::::::::T:H::::::::::::::S:::A:::::V::I:::::::::::::: consensus EFAKGKLPEAPISIHEPEWYDERDIDLELNTLVTDIDPDAHTIETHEGDTYEYDKLLVAT #oth .1...11.11111..232..111.1214.1.3125123243315113.24441.1..112 Hut2519 :Y:::TV::ETVQ::DQA:::::::::::D:R:ST:ET:DNAVV:AA:ER:H:::::::: VNG1804 :Y:::::::::::::D::::::::::IQ::::::R:N:::::V:::::TEI::::::::A hla1304 :Y:::::::::::::QES:::DH:V::R:::V:V:::IENDA:H::::::F:::T::L:V HQ3319A :Y::::::A::::::DVS:::D:::N:::::::V:::VTE::::::H::V:DW::::L:: HVO_2345 :::::::::::::::DES:::D::V::::D::::::::EG::VTA:D:TE:D:::::L:V Hbo2027 :::::::::::::::::::::::::E:K:::::::V:::G::::::::E:LSW:::::SV NP4516A :::::::::::V::::::::E::::::R:::V::GV:V:::EVY::D:E:VA:::::::: Hut0750 :::::T:::E:V::::E:::E::::::A:::RI:SV:T::KVV:A:D:T::::::::::: rrnAC3353 :::::::::::::::::::::::::::Q:::H:::::::::E:Q:::::::::::::::: Hmu2227 ::::::::::::::::::::E::::::::::H::EV:T:::E:H:::::S:::::::::: consensus GGTPTQLPVENADAEGIHHFWTFQDARAIREHAEEADSGVIVGAGLLGIDLAAICAAQDV #oth ....431..3.1..2.122...12...5.1333241152211.1......2..1211.32 Hut2519 ::::RS:::P::::::VTS:::IE:::R:::K:AA:ET:T:::G::::::Y:::A::::: VNG1804 ::::ND::::::::D:V::::::E:::R::::::A::T::V::::::::::::::GG::: hla1304 ::::Q::::G::::D::::::::::::K:KQSV:D::RA:::::::::::F::::G:::: HQ3319A ::::::::::::::N:V::::::::::D:KSNI:S:::S:::::::::::::::T::::: HVO_2345 :::::::::::S:::::::::::::::D:K::I:G::NS:VI::::::::::::T:::E: Hbo2027 :::::::::D:S:::::::::::::::K::S:M:::::S:V:::::::::::::T:::G: NP4516A :::::::::D:S::::VN:::::E:::::K:N::S:::::V::::::::::::::G::GL Hut0750 :::::R:::::S::::V:Y::::K::::::D::A::ET:::::::::::::::::G::N: rrnAC3353 ::::A:V::::S::D::::::::::::G:::::D:::Q:I:::::::::::::V::::EI Hmu2227 ::::A::::D::::D::::::::::::N:::::::T:DAI:::::::::::::::G::GI consensus DAKYLMRGNRWWRYALSEEGAEIIHDALRERGVEPVFESGVDHFEVDDDGHVTAAVDPNG #oth 1141.1.133.111.1.24.12.2.2112141.1..1311.11.11.11121321..32. Hut2519 ::S::I:ED::FSR:M::T::A:V::::D::::T::L:TT:::::T::::::V:T::SE: VNG1804 ::::::::::::::::::A::::::EG:::K:::::::::::::::::::ALA::::G:: hla1304 E:::::::DS:::::::::::::M:::M:::::::::G:::::::::E::::E::::::: HQ3319A EG::::::DC::::::::Q::S:::::::::::::::Q:::::::::ET::::T:::::: HVO_2345 EG::::::KA:::::::::::::::E:::::N:::::D:::::::::::DR::T:::::: Hbo2027 EG:::::::C::::::::::G::::N:::::N::::::::::::::::::R::T:::::: NP4516A ::H:::::EA:::::::QD:::::::::E:M::T:::D:::::::T::::R::::::::: Hut0750 E:D::::::::::::::LD::::::E::::K::T:::::::ER::::::::::G:::A:: rrnAC3353 :::::::::::::::::::::::::E::E:N::::::::::::::::::::::G::::D: Hmu2227 :GTF:::::::::::::LD::::::::M:GV:::::::::::::K:::::::E:::::D: consensus DRYDADFAGVAIGLDFNTEFLQGTDIETDNGIVVDEYMRTNVEDVYAAGDITQFHDTILG #oth 3521322111...121.1221421332511.141.1311.422111....21214.3211 Hut2519 :V::S:CV:::::TES::A::E::P:PV:D:VL::GRLQ:DDP:::::::VA:Y::RR:: VNG1804 V:H::::::::::::::V:I::D::ATIE::VH:::::::E:D:I::::::::YW::::D hla1304 :::EC:::::::::N::::LVED:SL::E:::::::F:::::DN:F::::::T:N:LV:: HQ3319A :Q:::::V:I::::N::::I::N:P::C:D::I:::::Q:SH:::F::::::::Y:R::: HVO_2345 :::::::V:I::::N::::I:G:::::Y::::YT::F::::HD:IF::::::E:::L::: Hbo2027 :E:::::V:I:::::::::I:::::::C::::I::::::::H:::F::::::::::V::: NP4516A ::FE:E::::::::N:::::::::G::::::::T::H:::::D:::::::::::::V:V: Hut0750 EFH:GA::A:::::::::D::ED:PV:L:D::::::H:::G:::::::::L::YF:V::D rrnAC3353 NH:EGEW::::::::::::::N::GL:L:D:V::::::Q:::::I:::::L:::Y::::D Hmu2227 N:::G::::::::::::::::A:S:::::D::::::::Q:::::::::::::::Y::::D consensus ERAQNGAWGSAKEQGSIAAKNMVADYGE----EEFRWVSSYSITHFDFPFLSFGHPTLGD #oth 3221..1....12..53.151.212435211123.12.11.11...1..11...1.12.1 Hut2519 RPVK::S::::AA::EH::E::L:PA:AG::::H:EF:P::TV:::S::MA:::::G::E VNG1804 ::::::S:::::Q::AL:GRT:L::S:HDVEI:P::::::::::::::::::::F::I:: hla1304 :Q:K::S:::::Q::T:::R::L-E::S:::::::E:::::::::::::::::::::::: HQ3319A ::G:::::::::::::::::::I-E:NS:::::P:E:::::::::::::::::::::::: HVO_2345 D::::::::::::::T:::::::-:::S:::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo2027 :::::::::::::::T:::::::-:::T:::::::::::::::::::::::::::::::: NP4516A D::::::::::::::N::GQ:::::GP:::::AT:E:::::::::::::::::::::R:: Hut0750 ::::::S::::::::VV::E:::::EPV:::::T::Y::::::::::::::::::::I:: rrnAC3353 SQ::::::::::::::V:GT:::::AE:::::K::::::::::::::::::::::::R:: Hmu2227 ::::::::::::::::V:GA:::::AE::::::::::::T:::::::::::::::::::: consensus DEAERKYSDTEWRRLAFKDGKLVGGVLIGDLSPQSKFKQLIREERDVADQKDLLLEEEFD #oth 254.2223141...1122..321......1.131232.21322335.312424.234513 Hut2519 TYR::T:GE::::::::R::M:::::::::::VLQPL:E:TASG:R:QGRAGE::APT:: VNG1804 ETC::S:G:N::::::::::Q::::::::N:A::::Y::::K::AV::::Q:V::QDN:E hla1304 :SI:ATTAEG::::V:L::::V:::::::::::::A::::M::G:::S::R:::M:PG:S HQ3319A :T::A:H:::::::::::::RI::::::::::::::Y:::M::R:V:SG:R:I:MQ:::E HVO_2345 :HV:A:::::::::::I::::I::::::::::::T:Y:K:M::QV::SG::EI:VKQD:Q Hbo2027 ::::A::::::::::::::::I:::::::::A::::Y:K:M::::V::::::V:MQ:Q:E NP4516A ETV:K::D:ET:::V:L:::RVI:::::::::A::VL:K:A:KQI::S::T::::::GV: Hut0750 :::::::::::::::T::::Q:I:::::::::Q:QA:::I:::::P:G:::EA:::P:V: rrnAC3353 :::::::::S:::::::E::Q:::::::::::Q::A:::::::::Q:::K:E::::K:V: Hmu2227 EDC::::::::::::T::::::I:::::::::Q:::::K::::::E:::K:E:::::DV: consensus -LDDL--AGAAAAQ #oth 13232445533644 Hut2519 G:A:VTA:SPI:SD VNG1804 :M:E:::-:::TQ: hla1304 :V::::::A:TEQ: HQ3319A :::::EPIETVIE- HVO_2345 :::::::E::::E: Hbo2027 :IE::DLEEE:PVE NP4516A :IEAF::E:::T:D Hut0750 :::A::::PP:VEK rrnAC3353 ::EEVKAQTP:P:E Hmu2227 :IER:EEVAP:Q:E