| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4373 | HQ1955A | HVO_0282 | Hbo1201 | Hut2648 | rrnAC2759 | Hmu2831 | HVO_1998 | Hbo3592 | VNG2602 | HVO_A0451 |
| 2724 | HQ1955A | 4406 | 2442 | 2463 | 2418 | 2313 | 2466 | 2261 | 2279 | 2209 | 2360 |
| 3429 | HVO_0282 | 2442 | 4463 | 3579 | 3114 | 3002 | 3123 | 2596 | 2601 | 2446 | 2540 |
| 3433 | Hbo1201 | 2463 | 3579 | 4513 | 3128 | 3177 | 3224 | 2620 | 2568 | 2386 | 2517 |
| 3537 | Hut2648 | 2418 | 3114 | 3128 | 4497 | 3223 | 3439 | 2605 | 2637 | 2550 | 2641 |
| 3371 | rrnAC2759 | 2313 | 3002 | 3177 | 3223 | 4500 | 3459 | 2549 | 2498 | 2495 | 2547 |
| 3557 | Hmu2831 | 2466 | 3123 | 3224 | 3439 | 3459 | 4539 | 2599 | 2584 | 2541 | 2596 |
| 3163 | HVO_1998 | 2261 | 2596 | 2620 | 2605 | 2549 | 2599 | 4529 | 3920 | 2933 | 3013 |
| 3146 | Hbo3592 | 2279 | 2601 | 2568 | 2637 | 2498 | 2584 | 3920 | 4539 | 2920 | 2992 |
| 2913 | VNG2602 | 2209 | 2446 | 2386 | 2550 | 2495 | 2541 | 2933 | 2920 | 4493 | 3032 |
| 3123 | HVO_A0451 | 2360 | 2540 | 2517 | 2641 | 2547 | 2596 | 3013 | 2992 | 3032 | 4551 |
679 symbols consensus -----------------VT-DMLVVFAVILGALVLFATEPVPIDVTAIGVMVALMVLEPW #oth 221233332343335442254323..221331111.1..32.1.1..131.14.3232.3 HQ1955A ::::::::::::::MPE::VGTVL::LI:IV:::::V::::::::::L:I::T::M:G:: HVO_0282 ::::::::::::::VVAI:P:I::::::::V::AF:::::::V:::::::::S::LIQ:A Hbo1201 :::::::::VSSEVVVAI:PSIV::::I::L:::F:::::::V:I::L::::T::LVQ:A Hut2648 :::::::::::::::::--:-:VI:::I::A::::::::A::V::::::I:I::L:V::V rrnAC2759 :::::::::::::::::--:-::F:::::VA::::::::AL:V:::::A::::::LA::V Hmu2831 :::::::::::::::::--:-:AF::::VA:::::::::R::V:::::::::::L:V::L HVO_1998 VFFSTLVSVVEGLVPAA::G:::::::L::LS:::::::WL:::::::V:::L::::::: Hbo3592 MTFFSAPLVTQGLASTP::AE::::::L::L::::::::RF:::::::L:::L::::::: VNG2602 ::::MSAVSPPVALAAG:ST:V::::G:VV::::::V::WL:::::::LI::V:A::::: HVO_A0451 :::::::::::::::::::TE:::::L:::::I:::V::WL:::::::AI::T:I::::: consensus TQIL-----L----------PGD-------GLSGFASPATITVLAMFILSAGVQRTGIVQ #oth 16533332313433322451233323223222...114..211...21..3.13...21. HQ1955A :G:S:::::-:::::::::::R:::::::::V::::N:::M:I:::M:::E::R:::VI: HVO_0282 SEA:ASAGM:GAPIVLFESY::::::::::A:::::NT::L:::::::::E:::::::I: Hbo1201 SEW:VSANL:AEPIMLFDPY:RQ:::::::A::::::T::L:::::::::E::::::V:: Hut2648 STM:VEWGV:ESAVYVLRA:::SEVTAVER:::::::V:::::::::::::::R:::VI: rrnAC2759 :VLATDLGL:AEPVYVLHQ:A::GISPLDR:::::::T::::::::::::D::::::::: Hmu2831 :AL:ADAGV:AGRLYVLHE::::AVDPVAV:::::::::::::::::V:::::::::VI: HVO_1998 :::T:::::-:::::::::::QE:::::::::::::::::::::::L:::T::N:::::: Hbo3592 :::S:::::-:::::::::::RE::::::::I::::N:::::::::L:::T::N:::::: VNG2602 ::VS:::::-::::::::::TAE:::::::S::::SNK:::A::::L:::T::S:::L:: HVO_A0451 :D:S:::::-:::::::::::AE::::::::I:::S:S::::::::L:::::IS:::::: consensus LLGRKIAAFTGESESRQLGATIGVVGPISGFINNTAAVAILLPMVSDLAHKGKTSPSKLL #oth 2212133321.32551..3..11322.2..11...11....1.112.2.12131...... HQ1955A R:EEIVTSY::::SHK:::::::I:::L::I:::::::::::::::::::ENG::::::: HVO_0282 :::A::ST:::D::L::::::V:::::::::::::::::::::::T:::ER:R::::::: Hbo1201 :::A::SS:::N:::::::::::::A:::::::::::::::::::::::ER:G::::::: Hut2648 I::::VG:::::D:T::::::V:I:S:::::::::::::::::::T:::E:::::::::: rrnAC2759 I::A:::SL::D::TK::S::V:L:A:::::::::::::::::::T:I:::::L:::::: Hmu2831 I::A:V::L::D:::::::::V:I:::::::::::::::::::::T::::::Q::::::: HVO_1998 :I:::M:EYA:N:QTK::A:::::T::V:::::::PV::::V:V:A:::::::::::::: Hbo3592 :I:::M:::A:TDRRK::A::V::T::V:::::::PV::::V:VIA::::E:R::::::: VNG2602 :V:::LS::A::NK::::::::AAG::V:::V:::PV::::V:VI::::::::::::::: HVO_A0451 IV::::SS:A:::LNK::L:::::T::V:::::::PV::::V:VI::V:::::::::::: consensus LPLSYASMFGGMLTLIGTSTNILASDLAARLAIEQP--YP-LHAFSMFEFTQLGVIVLAV #oth 2...1..12..1..1......1...3332214536211345111.31....5..322422 HQ1955A ::::::::A::::::::::::L:::TI:S:::TD--::::S:::::::::::::LL:FL: HVO_0282 ::::::::::::::::::::::::::VYS:ITG:A:::--:---:::::::A::AV:M:: Hbo1201 :::::::::::T:::::::::::::::SG::-:NR:::--:---:T:::::E::L::SV: Hut2648 :::::::::::T:::::::::::::::S:::GRDLG::I:E::::::::::H::::MM:: rrnAC2759 :::::::::::::::::::::::::Q:S:E:-:D::::--:---::::::::::I::TVI Hmu2831 M:::F:::::::::::::::::::::::G:::::D:AR:GD:::::::::::::::L:V: HVO_1998 M:::F:::L::T::V:::::::::::I::Q:GR:S:::GLS::::G:::::K:::::FV: Hbo3592 M:::F:::L::T::::::::::::::I::Q:GA:S:::GLG::::G:::::K:::V:F:: VNG2602 M:::F:::L::T:::::::::L:::ETT::::DQ:G::IAG::::::::::H:::L:::: HVO_A0451 I::::::Q::::::::::::::::::T::::SG:--::::A::::DF::::I::::::LT consensus GSVYLMTIGRRLLPERIPPREDLTEEYEMAEYLTEVVVRDDSPLVGQTVQEALEETDFDV #oth .42..211143.21511324412331233421.21111244.221.12154.15644213 HQ1955A :AA::L:::YW:T:SHVT::SEFETTHR-E:F:::ITIG:T:::::M:I::::QQIE:EG HVO_0282 :V::::::::::T:G::E::R:::::F:::G::::::::E:::::::Q::R::V::E::: Hbo1201 :T:::L:V::W:T::::K::R:::::F::SD:::::T::S::::I::R::R::V::E::: Hut2648 :L::::::::Q:V:A::K:A::::S::D:::::::::::::::V:::R:G::::G::::: rrnAC2759 :T:::L:V::Y:V:S:::VE::::::F::G:::::::::Q::::I::::D:::RVSA::: Hmu2831 ::L::::V::W:T::::K::G:::Q:F:::D::::::::E:::I:::::HD:::A::L:I HVO_1998 :A:::::V:V::::K:V:AGD::L:::ALQ:::AD:::PA::S:I::::::::GND:L:I Hbo3592 ::L::::::V::::K:::AD:::V:::ALQ:::AD:::PAN:Q:I::::G:::GDDNL:I VNG2602 ::L::FVVAP:::SD:V:VED:YLT::ALGD::S:::::ES::I:::::RA:IDADR::A HVO_A0451 ::A::L:::H::::::V:VE::YV::::I:D::A::::::H::::::::ET:I::ART:A consensus DVLQLIRDGERFLEPLGRKEIQAGDVFALRTDRDTLVELLDVEGLDLVGDVRVEDALLEA #oth 1231.1.445414..124141232.2132.24121.351332112435153544431334 HQ1955A N:T::::RDDYYR::RLSMI::SD:A:TI:LTE:A:RT:Y::::IEF:PE:TPQGD:DAL HVO_0282 :L:::::GESV::::::P::::P::::T:::::N::::::::::::::PATVT::E:EL: Hbo1201 :LI::::::QV::::::P::::::::::::::::::::::::::::I:PN:T:DE:E::: Hut2648 ::V::::EDAV::::::Q:V:::::::::::::::::::M::D:F::L:::A:T:TE::: rrnAC2759 :IV::V:EKRT::::::Q:S:R::::::V::::::::D::::::::IIP::E:D::E::T Hmu2831 :IV:::::RRT::::::A:S:R::::::I::::::::::::A::::V:P:AV:GE:E::: HVO_1998 :::::::Y::Q:::::A::::HEN:TLR:::N:E::ERIMRS:::TF::GP:S:SE:HPG Hbo3592 :::::::Y::::D:::A::::HEN:TLR:::N:E::EYIM:A:::T:S:GP:T::D:HPE VNG2602 :::G:V::::::I::::Q:VVR:::TLTI::G:E::ADIAT:DD:S:T:APDD:RD:EPT HVO_A0451 :I::::::::::T:::A::Q:H:::TLLI:AS::::EQ:AA:DD:AIE:S:DTDEE:DPE consensus -EEGQNLVEVVIAPGSFLVGETLASSSFRQRYDANVLALRRGGELIRDRMDDIRLRVGDT #oth 4543342..1.1321.4.212115123.111.222...2.31232313.22455113..1 HQ1955A :AP::T:::I::TA::D::S::IET:G:QDQ:Q:G:::I::::KTTHE:LTEH:IQP::M HVO_0282 :DR::::::::V::::A::::S:::A::::::::T::::::::::::R:::NLP:::::: Hbo1201 G:A::::::I:V::::S:I::S:::A::::::N:T:::::::E::::R:::N:S:::::: Hut2648 P:::H::::::V:::::::::::::AN::::::TT::::::::AV::::::RT::::::: rrnAC2759 AN:RK::::::V::::S:I::::V:TN:::::::T:::::H:Q::Y:Q:::HVT::I::: Hmu2831 A::R::::::::::::E:::AS:R:TN::::::::::::::::::::Q:::RTT:::::: HVO_1998 :::EPVM:::::PS:::::::S::::T:::::::::::F:TR:KVV:::FE::DI::::: Hbo3592 :::EPV::::::PS::::::::::::::::::::::::F:TR:DVV:::FE:::I::::: VNG2602 TQDE:A::::::HS::S:A:Q::S:::::D::::::::F:SR::TVHE::::R::::::: HVO_A0451 PSDN:SI:::::PSR::::::::T::T::::::G::::::SR::V::::::E:KI:A::: consensus LLVQAAPDSIDRLNNNRDFIVAQEIDRPDYRESKIPVAVGIVAGVVALAALT-------- #oth ..112453212.14513111113.423331.43.3.3.211223..22213311111111 HQ1955A :::ESDSNT::::ADDPNVV::G:::LQQF:S::L:L:::V:LS::::::IG:::::::: HVO_0282 :::::TVE::E::D:::N:::::::E:H:::::::::::::::::::::::G:::::::: Hbo1201 ::I:G:T:::E::D:::::::::::E:H::::E:::::L:::LL:::::::N:::::::: Hut2648 ::::G:T::::::::::N::::::V:::::::::::::I::::A::G::::::::::::: rrnAC2759 :::::T:E::::::R:N:::::::VA:::F:R::::::I::::A::GV:::::::::::: Hmu2831 ::I:G:G:::::::::PN::::R:VE:::F:K::V::::::::A:::V:::::::::::: HVO_1998 :::::P:::LT::VQ:E:::::H:F:DV:::TE:T:F::A:I::::::P:FN:::::::: Hbo3592 :::::P:::LT::VE:E:::::H:F:EVT::SD:::F::::I::::::P::N:::::::: VNG2602 :::::PRSG::::SA:P:::::H:P:E::::TE:::H:I:::L:::LA:TV::::::::: HVO_A0451 :::::E::::::MAQ::::VLGH:A:E:N::TN:::H:IA:MF:::G:V:IPWAFLGNAL consensus ---------------PLPIVVSALGGALAMVLTGCLKPAELYDAVQWDVIFLLAGVIPLG #oth 111111111111111442.322..2.122.242221214.4.21.2.1.....1...... HQ1955A :::::::::::::::I:::M:A::::VII:FV:DII::::A::::::::::::S:::::: HVO_0282 :::::::::::::::F:::::A::L::::::A:K::R:T::::::::::::::::::::: Hbo1201 :::::::::::::::IV:::::::A::::::V:K::R:P::::::::::::::::::::: Hut2648 ::::::::::::::::IN:A:A::A:::G:::::::::::M::::E:::::::::::::: rrnAC2759 ::::::::::::::::VH::I:::::::::::::::R:P::::::::::::::::::::: Hmu2831 ::::::::::::::::V:::::::A:::G:I:S:::RSS:I::::::::::::::::::: HVO_1998 :::::::::::::::V::::::::::VV::I:::V:::N:::KS:E:N:::::::::::: Hbo3592 :::::::::::::::I::::::::A:VV::IF::V:::T:::SS:E:N:::::::::::: VNG2602 ::::::::::::::::FH::TT::::VV:::S::V:H:S:V::S:D:::::::::::::: HVO_A0451 ASLTGIEGLAMLASLQQ::L:T::::VV:::VA:V:::N::::S:D:::::::::::::: consensus IALEQTGAAALLADLVVATADFLPAIG-----VLGLFYLVTALLTNVISNNASVVLMIPV #oth 4.124121.5..13341432432243311111..211.33.122.22...1.....2..1 HQ1955A R::SE::G:D::GT:I:S::::::I:A::::::::::::L::AM::L:::Q:::::F::I HVO_0282 ::M:NS:::G:::E:::M:G:Y::L:A::::::::V::F::::::::::::::::::::: Hbo1201 ::M:NSA::::::EF::M:G:::SLV::::::::AV:::::::::::::::::::::::: Hut2648 ::::V::G::::::GI::V:PS::P:V:::::::::M:V:::::::I::::::::::::: rrnAC2759 T::QE::G:D:::E:F:MG:GSIL:A:GGLAV::::M:::::::::I::::::::::::: Hmu2831 L:::A::G:T:::::L:LA:PSF:PLV:::::::::M:V:::V:::I::::::::::::: HVO_1998 V::Q::::::::G:A:AS::T:::::::::::::WV:::A:G:::S:::::::::::::: Hbo3592 :::Q::E:::::G:A:A::SL:::P:::::::::WV:::A:G:::S:::::::::::::: VNG2602 :::::::::Q::GEAMA:::TV:::L::::::::WV:::F:GVI:S::::::::::L::: HVO_A0451 :::::::::M::GN::ATA:::::VLL:::::::W:::IA:G:I:E:::::::::::::: consensus AAEAAQALGANAFAFVLAVTFAASTAFMTPVGYQTNLFVYGPGGYRFTDYLRVGAPLQLL #oth .241.4511.12.1.1.1.1.......12.1......1.......3.2.1411.2...32 HQ1955A ::DT:AR:N::::::I::::::::::::S::::::::::::::::E:S::A:::G:::VI HVO_0282 :I:::AT:::DP:S:::::M:::::::::::::::::::::::::K::::I:::G::::: Hbo1201 :VDT:ET::::T:::I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hut2648 :V:::V:::::P:S:::S::::::::::::I::::::::::::::E:M::VKA:::::AI rrnAC2759 :I:T::Q:N::::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::K::::::AV Hmu2831 :::::VQ:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::AV HVO_1998 ::R:::SI:::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:S:F:::::::::: Hbo3592 ::N:::SI:::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:S:FI:::::::F: VNG2602 :V:::VE::::P:::::::::::::::::::::::::::::::::T:S:FF:::L::::: HVO_A0451 ::A::T:IN::P:::::::::::::::LG::::::::::::::::K::::F::::::::: consensus LAVVTTLGIAYFWGL---- #oth 1231.14.1.411124221 HQ1955A ::I:::::::M:::::::: HVO_0282 :G::::I:V:::FP:T::: Hbo1201 F:A:::V:::AL::VTPPA Hut2648 F:::::::::L:::::::: rrnAC2759 F::A:::::::::::APA: Hmu2831 F::::::::::::::TP:: HVO_1998 :S:::VA:::F:::VGA:: Hbo3592 :SI::V::::F:::VRA:: VNG2602 :S:::VG:::A:::V:::: HVO_A0451 :ST::V::::L:::I::::