| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 1986 | hla0950 | HVO_A0228 | Hbo1323 | HQ3676A | hla1956 | VNG1241 | NP4208A | Hut0960 | rrnAC0514 | Hmu1509 | HQ3350A | HVO_1314 | Hbo0228 |
| 806 | hla0950 | 2249 | 662 | 638 | 606 | 701 | 709 | 805 | 714 | 678 | 689 | 693 | 748 | 712 |
| 966 | HVO_A0228 | 662 | 2297 | 1465 | 1366 | 731 | 763 | 785 | 668 | 702 | 685 | 762 | 733 | 693 |
| 1000 | Hbo1323 | 638 | 1465 | 2142 | 1655 | 698 | 750 | 790 | 751 | 780 | 750 | 750 | 735 | 765 |
| 1028 | HQ3676A | 606 | 1366 | 1655 | 2166 | 687 | 776 | 805 | 756 | 765 | 780 | 748 | 744 | 732 |
| 1260 | hla1956 | 701 | 731 | 698 | 687 | 2062 | 971 | 1059 | 1126 | 1030 | 1059 | 1109 | 1122 | 1135 |
| 1290 | VNG1241 | 709 | 763 | 750 | 776 | 971 | 1969 | 1095 | 1092 | 1232 | 1185 | 1124 | 1121 | 1104 |
| 1429 | NP4208A | 805 | 785 | 790 | 805 | 1059 | 1095 | 1951 | 1214 | 1247 | 1263 | 1145 | 1190 | 1156 |
| 1422 | Hut0960 | 714 | 668 | 751 | 756 | 1126 | 1092 | 1214 | 2006 | 1337 | 1394 | 1237 | 1246 | 1235 |
| 1474 | rrnAC0514 | 678 | 702 | 780 | 765 | 1030 | 1232 | 1247 | 1337 | 2044 | 1603 | 1278 | 1315 | 1252 |
| 1501 | Hmu1509 | 689 | 685 | 750 | 780 | 1059 | 1185 | 1263 | 1394 | 1603 | 1986 | 1338 | 1333 | 1271 |
| 1433 | HQ3350A | 693 | 762 | 750 | 748 | 1109 | 1124 | 1145 | 1237 | 1278 | 1338 | 2023 | 1388 | 1427 |
| 1445 | HVO_1314 | 748 | 733 | 735 | 744 | 1122 | 1121 | 1190 | 1246 | 1315 | 1333 | 1388 | 2002 | 1512 |
| 1377 | Hbo0228 | 712 | 693 | 765 | 732 | 1135 | 1104 | 1156 | 1235 | 1252 | 1271 | 1427 | 1512 | 2041 |
321 symbols consensus -------MMDEPSILLTNDDGIDAVGIRALYDALSAVGDVTAVAPADDQSAVGRARS--- #oth 11111123646641.1......113.2312232136423.121..4511.22.1431111 hla0950 :::::::--MTTE:::::::::::::::::A::::RDY:::V::::SN::G::G:::WWD HVO_A0228 MHDSMTDTSSSLR:::::::::::P::A:MREE:T::::::V::::EN::G:::::N::: Hbo1323 ::::::::S:GYT:::::::::::P::AT:REE:TSL::::VI::DGNR:G:::T:N::: HQ3676A ::::::M:K::Y::::::::::::P:LAT:RTE:T:L:N::V:::ESN::G:::T:N::: hla1956 :::::::-:SVERV::::::::::::L:::::G:::DY::VT:::TG:R:SA:::L:::: VNG1241 ::::::MDA:::E::V::::::::P:::::A:G:D:::N::V:::::N:::T:::M:::: NP4208A :::::::----MDV::::::::::::::::::::AE:A::::::::::::::::QL:::: Hut0960 ::::::::NE::T::::::::::S::LG:::::::T::::::::::A:R:::::SI:::: rrnAC0514 :::::::-::::T:::::::::ESA:L::V::G::T::::::::::E::::::::I:::: Hmu1509 ::::::::N::::::::::::::S::F:::::::TE::S::::::NS::::::::I:::: HQ3350A ::::::::SESL:V:::::::::::::Q:::Q:FDDIAE::V:::T::::::::QL:::: HVO_1314 :::::::-:S::::::::::::ES::F::::::::EFA::::::::T:::::::KM:::: Hbo0228 ::::::::D:AF::::::::::EST:F::::E:FDQFA::::::::A:::::::KM:::: consensus HTVVVHDHELGYAVEGTPADCVVAGLEALDPDVDIVVAGCNKGANLGAYVLGRSGTVSAA #oth 8517442122.1123...3..1221443.4435.3.11.2.5.2.2.3121.1....1.1 hla0950 T::EYTETDA::::::::::::AVADV::GL:P:V::S:::H:P:I::HI::Q::::G:: HVO_A0228 EHA:RR::PW:::L::::::::AYA:RG::A:F::::S:I:D:P:A:N::V::::::G:G Hbo1323 ::A::RE:PW:::LS:::::::AY::RG::T:F:V::S:V:D:P:A:N::V::::::G:G HQ3676A P:AI:R::PW:C:LT:::::::AY::RG::TNI::::::V:N:P:A:N::V::::::G:G hla1956 DG:DIA::::::::D:::V:::::::D::V::A:V::::::::::::::T:::::::::: VNG1241 QE:A::::D::::::::::::::::::::G:YP:L::S:V:E:G:::M:::::::::::: NP4208A R::EL:::::::::::::::::I:::G:::L:P::::::::E:::::E:::::::::::: Hut0960 TN:G:S:::::::ID::::::::::M:V:LD::::::::::D:::::::::::::::::: rrnAC0514 :E:T::E:::::::::::S::::::::::VT:T:L::::::R:::::::::::::::::: Hmu1509 :E:P::Q:::::::::::T::::::I:S:V:ET:L::::::R:::::::::::::::::: HQ3350A SD:TI:E:DW::GID::::::::::V:::C::::L:I::::::::I:::::::::::::: HVO_1314 TDA::AE::::::L:::::::T:::::::C::::M::S:I:::::I:::::::::::::: Hbo0228 ND:D:TE::::::ID::::::T:V:::::C::::M::::::::::I:::::::::::::: consensus VEAAFFDVPAIAVSMYVP--GDTDFFEKPPEEADFAEAARAARYLVDRA----LGAGVFD #oth 2.12.111..3.4.415142466538695537631351442235.354311117642322 hla0950 M::S:LGT::::::L:D-:R:NLPVPP-TLDNG:::V:GEVVVD:L:::ETGSE:PSLPF HVO_A0228 :::::LGT::V:::S:--::HAR:::CH::::Y::SRP::V::A:TE:V::::F:TD::: Hbo1323 I::::LGT::L:::AF--::HT::::LS::::Y::SRP::V:VG::E:::::::DS::Y: HQ3676A I::::LGT::L:I:A:--::HS::::IS::::Y:::RP::I::R::::::::::S:::Y: hla1956 ::::::::::V:T::::::::GE:WWKRKL:P:E::N:T::T::::AE:::::TAS:A:: VNG1241 ::::::G:::::::::M-::REEQ:G:-:TAV::YEH:VD:TTH:AHD:::::VTD:I:: NP4208A ::::::G:::::A:V:F:A:::VTIE:FD:DKT:::::S::V:::::N:::::I:::::: Hut0960 :::T::::::::::::::VRD:DKWDPLTE:PGSY:N:T:::::::::G:::::ES:::E rrnAC0514 :::T::::::M:::::I:VRE:AA:ADIEANGDSYR:::K:TT::A:H:::::VD::::E Hmu1509 :::T::::::::::::I:VRE:AA:ADVEENYDSY:::T:::S::AAHS::::M:::::E HQ3350A ::ST::::::M:::::I:GG:::PWHKQAT:VSA::D:S:::T::ARH:::::FD::::E HVO_1314 ::::::::::::L:L:::AG::LPWH::ATDPR::R::TN::SH::KH:::::EP::::E Hbo0228 ::::::::::M:::L:::PG::VPWT::ADDI::YRH::D::T::AKN:::::PE::::E consensus QADYLNVNAPV---DGNGPAP--MEVTRPSHVYDMTAEH------------------DGG #oth 6212..1.1.5233469643522462.5.3561425354112223332334344234525 hla0950 G::V::::V:A::A:DEAA:DPTYRL:E:ARGF:VIEF::PGEAEPEDENVPEGWEFSER HVO_A0228 EV:L::::::A::::VPS:-R:::R::::FAD::QQVD:DPDAGALPDGDREHDLDD:EV Hbo1323 DV:L:::::::::::SPN:-:::VML:E:Y:D:GQQV:E::::::::VEDEDDELGP:ER HQ3676A DV:L:::::::::::TAN:-:::VML:D:Y:D:EQEV:Q::::ASADDVSDDVTLESNEH hla1956 R:::::::::IANP::ERDT:AP:R::A::TW:G:E:A::::::::::::::::::DGN: VNG1241 T:::::::::H::P:ADATGE:::V::::::A:::::AQ::::::::::::::::::T:D NP4208A A:::::::::L::PPET:H::::::I:E:::::E:DG:R::::::::::::::::::::E Hut0960 ::::::::::L:AVE::AT::::::I:T::R::E:G:VE::::::::::::::::::N:E rrnAC0514 :C::::I:::::::AEW:D:Q:::T::::::L:E:D::Q::::::::::::::::::::D Hmu1509 :C::::::::::::ADR:::E:::AI:E::R::Q:G::R::::::::::::::::::N:E HQ3350A ::::::I:::::::AA:E::T::L::::::R:::::::::::::::::::::::::DGN: HVO_1314 :C:::::::::SGP::-:::D:::Q::V::EL::::::F::::::::::::::::::EN: Hbo0228 E:E:::::::M::PN:QD:::::I:I:T::KM:A:::R:::::::::::::::::DDEN: consensus T----VTLHDRIWERMAEGDIP----------DPVGTDRRAVVDGRVSVSPLTAPHTTEH #oth 511112524.35.3746632321123221131125.1..1.421241.1...22314555 hla0950 RGEMGME:R::F:REFLR::VA:::::::::::DP:S::L:A:E:E::I:::SSSRSIAG HVO_A0228 Y:::::R:Q:IS:PDSVGFEN:FPLDDEHRDRY:::S::::M:::E::::::AVH:GHAT Hbo1323 R:::::E:R::T:PDAVGWEN:FPLAETHRERY::::::::M::AA:::::::VS:GVAD HQ3676A L:::::Q:R::T:PGVVGWES:FPPTDEHRRRY::::::::L::AA::::::SVT:GSPD hla1956 R:::::SFS:P::GK:N:::V::::::::::::S::::::::I::E::::::SV::AA:P VNG1241 ::::::::Y::L::A::A:::H::::::::::::D:::::::L::H::::::::::S::: NP4208A ::::::RIQ:H::::::::T::::::::::::::P::::::::E::::::::::::P:TG Hut0960 E::::IE:::::::W::::T::::::::::::::D::::::::ED:I::::::::::::: rrnAC0514 A:::::::::::::H::D::::::::::::::::E::::::::::K:::::::::::::: Hmu1509 ::::::::::::::::::::::::::::::::::E::::::::::K:::::::::::::: HQ3350A :::::::::::V::::RTD:::::::::::::::S::::::::::HI:::::A::::::: HVO_1314 ::::::K::::V::::ET::::::::::::::::D::::::::E::::::::::::::HR Hbo0228 R::::I::::::::::QS::::::::::::::::Q::::::I::::::::::::::::KR consensus HEALDALAETYERS------- #oth 243126234547776323321 hla0950 DR:GEVVEDPAAD:AAGIEQD HVO_A0228 DPR:ASIV:SLSEQVE::::: Hbo1323 SAR:ADVI::F:VE::::::: HQ3676A SA::ATIV::VDVA::::::: hla1956 DAG::E::AA:G:VTENVR:: VNG1241 :D:::GI:TEF---::::::: NP4208A ::G:AG:::K:Q--::::::: Hut0960 ::T:::::AE::KTE:::::: rrnAC0514 ::::::I:::::PDDGGEAAD Hmu1509 :::::G:::::D::::::::: HQ3350A ::::::::S::LD:I:::::: HVO_1314 :::::::::::LE-::::::: Hbo0228 :D:::S:::S:LAE:::::::