|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 2419 | rrnAC0986 | NP4778A | HVO_2355 | Hbo2050 | HQ2334A | Hbo3410 | Hut2019 | rrnAC3276 | Hmu2453 | VNG2257 | HVO_2155 |
1404 | rrnAC0986 | 2428 | 1184 | 1186 | 1115 | 1175 | 1227 | 1264 | 1211 | 1223 | 1229 | 1193 |
1412 | NP4778A | 1184 | 2385 | 1263 | 1205 | 1171 | 1197 | 1230 | 1130 | 1225 | 1221 | 1185 |
1526 | HVO_2355 | 1186 | 1263 | 2461 | 1640 | 1172 | 1275 | 1232 | 1277 | 1274 | 1215 | 1219 |
1453 | Hbo2050 | 1115 | 1205 | 1640 | 2465 | 1123 | 1223 | 1111 | 1101 | 1122 | 1174 | 1151 |
1720 | HQ2334A | 1175 | 1171 | 1172 | 1123 | 2480 | 1536 | 1402 | 1472 | 1449 | 1553 | 1677 |
1850 | Hbo3410 | 1227 | 1197 | 1275 | 1223 | 1536 | 2429 | 1595 | 1617 | 1626 | 1538 | 1547 |
1777 | Hut2019 | 1264 | 1230 | 1232 | 1111 | 1402 | 1595 | 2476 | 1630 | 1686 | 1496 | 1478 |
1796 | rrnAC3276 | 1211 | 1130 | 1277 | 1101 | 1472 | 1617 | 1630 | 2438 | 1697 | 1498 | 1498 |
1795 | Hmu2453 | 1223 | 1225 | 1274 | 1122 | 1449 | 1626 | 1686 | 1697 | 2403 | 1440 | 1528 |
1717 | VNG2257 | 1229 | 1221 | 1215 | 1174 | 1553 | 1538 | 1496 | 1498 | 1440 | 2476 | 1597 |
1792 | HVO_2155 | 1193 | 1185 | 1219 | 1151 | 1677 | 1547 | 1478 | 1498 | 1528 | 1597 | 2471 |
352 symbols consensus -------ASSLLVLVAIILVATALIWKGSGWLEAASDRLAAYYGLPAVVQGAIIAAVGSS #oth 122333467345463244323253225.2441151125.241....63.1.2121.2... rrnAC0986 :::::::MAG:PGS::L:I::::V:::::AYF:R:AE::SK:::::VA:H:::VV::::: NP4778A :::::::MT:IG::LG:GA::::VV:V::SA::R::G:::RH::::RL:::T:L::L::: HVO_2355 :::::::VA:VPI::GFTV:GAI:A:::GDM:VQ:::::G:::::::I:::::::::::: Hbo2050 :::MAAT:FT:TL:LGAAV:GA::AFR:GEL:VE:A:S:G::::::P:::::VV:::::: HQ2334A MVLAGVVPQTPS:FIIV:I:::G:V:I:T::::G:AE::ST:::::P::::SVVV:I::: Hbo3410 ::::::M:E::A:N:G:::L::VG:YI::::::QS::T:SS:::::L::::::V:::::: Hut2019 ::::::MS:GV:AD:::V:LTSSA::L:::::::::::::TH::::Q:::::V::::::: rrnAC3276 ::::::M::::::EA:::VA::VA:::::D:::SS:E:::T:::::D:::::::V::::: Hmu2453 :::::::---::IDIG:::A::VA:::::::::::::E::T:::::L:::::V:::I::: VNG2257 MGAASALVG:TPGH::VVV:::L:::A::S:::::AEQ:S:H:::::::::S:VV:I::: HVO_2155 MVLGSLLR::P:AN::L::LM:G:::V:::::::SA:H:::::::::::::S::V:L::: consensus FPELASVVIAALA-GSFSLGVGAIVGSAIFNILVIPALSGLATDGD-LESNRTLVYKEAQ #oth 2..3212232336223252.1.31....11.2.11.131214453713323.52.2.1.. rrnAC0986 :::IS::::STVIHDE:::::::::::::::L::::::AA:SSEE-::R:T:DI:H:D:: NP4778A A::I::T:::TIRY:E:E::::VV::::V::::::::::A:LA::A::DTG:EV:::::: HVO_2355 ::::S:I:::T:RYQ::DI::::V::::VY:::I:::V:A:VGE:QR:A:::D::::::: Hbo2050 ::::::T:::SVRY:A:EI::::V::::V::::I:::I:T::GG:S::A:::D::F:::: HQ2334A :::F::::FT:A:::V::M:I:T:::::::::::::::::ILAQQG:V::::NI:::::: Hbo3410 ::::::::FS::S::::G::::::::::::::::::::::IV:HD::I::S::::::::: Hut2019 M::::T::::G:::::LA::::G::::::::V::::::A::L::DP:I:::::::::::: rrnAC3276 :::V:T::V:::G:::MP:::::::::::::::I:::AA:I:::DE::::S::::::::: Hmu2453 ::::::::A:::Q:::L::::::::::::::::::::V:AI:K::E:M::::A::::::: VNG2257 ::::L::LVT::D::::G::::::::::::::::V:G:A:IT:TQP::DAT::V:::::: HVO_2155 :::F:::AV::A::DV:DM::::::::::::::::::::::::::::::TS:LV:::::: consensus FYMLAVSVLVITFALAVIYFPA-DGAPLTGNVTRPLAVIPLLLYGLYLFIQYQDTSDHRA #oth ..2211231321121112.6142436515182.1211451143.11.2.31331241253 rrnAC0986 ::IIS:LI:F:V:::GAT:V:-:G:TNRAAIL:PT:VAV::MA::I:V:LHQ::A:E:V: NP4778A ::::S:AA:FLV:::::::::::E:DG:Q:::::::::SL::::L::I:V::L:V:ESN: HVO_2355 ::L:SIA:::L::S:::::R::A:T:G:D:F::::::C:::G:::::::M::H::LE::: Hbo2050 ::L:SIA:VFL::T:::V:DGTAV:D::::EI:PGI:MF::::::::I::::H::LE::L HQ2334A :::I:::A:IV::::::::L::PNRGE:V:MI:::::::::FV:L::::::W:EV::YTQ Hbo3410 :::I::::V:::::M::::::-:N::::::R:::::::M::A:::::I::::A::A:YE: Hut2019 :::::::::L:::::G:::Y:V:::VA:A:TI::::::L::A:::::V:::::::A:::: rrnAC3276 :::::::::L::M::::::Y:-:GE:T:::VI:::::A:::A:::::V:::::::A::DP Hmu2453 ::::::::::::::M::::Y:V:::ET:L::::::::L::IGM::::V:::V:::N::E: VNG2257 :::::::T:LL::::::::A:IPG:D::D:A::::::LV::::::::::::W::VG::DP HVO_2155 :::V::AT::V::S:::::::VP::P::::EL:::I:L:::::::::::::W::V:E:E: consensus D----TDTDDVNVGREWGRLVAGLAVILVAVEQLVGAVEGLGAAFGTPTFLWGVTVIAAA #oth 6223457554454612.25.331143.4222151.52184326341325.13.2.12.11 rrnAC0986 :::::-E:HS:RP:::::M:GV::VI:T:G::GM:QGALS::VI:D:::::::L:::::G NP4778A K:::T:RLERRRLAI:::L::::VGL:IAG::G::V:AI:::E:::::S::::L::V::: HVO_2355 G::LTAVV:G::PK:::LA:GGS::::::GA:L::R:AV:::D::::SP::::L::V::G Hbo2050 ASPFGV:P:A:::E:::A:::VS::::V:SA:L::R:AV:F:D::::S:::::L::V::G HQ2334A :::::VS::SIA::::::::::::IA::I:I::M::::::::SII:I:E::A:::I:::: Hbo3410 E::::-PVT::::L:Q::T:::::I::::S:::::H::KFV:NVY:A:D::::I::L::: Hut2019 STVPP::G::TDPR:Q::L:A:::V::V:::HF::ES:SA:AET::I:A::L:::I:::: rrnAC3276 E:::EDW:A:IS:::::LF:LL::::::::::N::H::RVI:R:A:VQE::L:::IL::: Hmu2453 ::::PSEAAGIDA::Q::F:L:::L::::::HY::HS:GVI:::L:V:D:IM:::I::G: VNG2257 T:::::::T::D:P:A:A::A::::A:S::::L:::::T::A:T:DI:S::A:::IL::: HVO_2155 E::::DAGVADGI::::A::LG::L::::G::::::S::S:S:T::V::::A::::V::: consensus TSLPDTLVSVRAARDGRGVTSLANVLGSNTFDLLVAIPVGVLIAGRAPVDFAMAVPMMGF #oth .....211..31.2515343..2..1...2.2...11.3.1.32.6231314512.2222 rrnAC0986 :::::AF::::::K:DDS::::T::::::::N::::::::::L::::TI::LV:I:T::: NP4778A :::::A:I::A:::IDEPAV::G::::::I::::::::A:::LG:AVA:S:TA:::::A: HVO_2355 ::::::F:::G:::Q:NAPM:::::F:::V:A::::L:::I:V::G:VIA:EEV::::S: Hbo2050 ::::::F:::V:::R:NADV:::::::::I:A:::VL:::::A::::TISLGAV:::::: HQ2334A ::::::::::::::S:D:T:::G::::::::::::V:::::::V:TV::N::T::::F:V Hbo3410 :::::::::::::K::::::::::::::::::::::::I::::V:A::IN::I:::T::: Hut2019 :::::A::::::::ED:::::::::::::::::::::::::::V:D:A:::::::::F:V rrnAC3276 :::::::::::::::D::::::::::::::::::::::L::::::TWT:::::::::F:V Hmu2453 :::::S:::::S:::DKA:A::G::::::::::::::::::::V:E:TI::E:::::F:I VNG2257 :::::A::::::::S:H:::::G:::::::::::::::I::::::::::S::V:A:L::V HVO_2155 :::::::::::S:A::NSA:::G::::::::::::::::::::V:SV:::::V::::L:V consensus LTLATVLLFTVLRTDLELTDREAYALLGAYAAFVAWVIAETAG-VTGILPN- #oth .23.12211342..2162153.1241233.54.25.343.131224442643 rrnAC0986 :GA::LVFIVFI::::::::::::T:::L:VV::C:MAL:SV::LIETVSGI NP4778A :VV:::V::AFA::GM:ISNA::W:M:LL:GS:I::LLL:SI:::ID:V--: HVO_2355 ::G:S:VF:A::::EMA::RG:::V:::T::L::::LV::SL:::::V:G-: Hbo2050 :VV:S:AF:A::::EMR::R::::L:V:T:L::L::LT::SL::LSSFIV-: HQ2334A ::::::::::::::::T::Q::S:V:GA::TL:II:I:::S:::I::::KTV Hbo3410 ::::::::::::::::S:::G:::G::V::IG::L:M:::::D:L:NFI:GA Hut2019 ::A::IA:::A:::::W:S::::LG:::I::L::G::VL::LDVLVDL:::A rrnAC3276 ::G::I::::::::::V:SEL:S:::::::::::::::V::::W:G:V::T: Hmu2453 :::::L::::S::::M:M:TA::::::V::::::V::VL::::VIV::I::: VNG2257 ::::::::::::::G:S:::A:S::::V::LG::::I:G::L:::V:LIRV: HVO_2155 :::::::::GL:::::S::RL:S:::GA::LV::G:::::::::::SL:R::