| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4472 | VNG1997 | hla1194 | HQ3074A | HVO_1963 | Hbo1832 | NP4982A | Hut0336 | Hmu2561 | rrnAC3203 |
| 3525 | VNG1997 | 4475 | 3219 | 3197 | 3280 | 3291 | 3227 | 3240 | 3115 | 3154 |
| 3718 | hla1194 | 3219 | 4428 | 3412 | 3511 | 3555 | 3359 | 3425 | 3271 | 3237 |
| 3676 | HQ3074A | 3197 | 3412 | 4605 | 3590 | 3774 | 3368 | 3270 | 3119 | 3190 |
| 3874 | HVO_1963 | 3280 | 3511 | 3590 | 4462 | 3859 | 3526 | 3387 | 3296 | 3392 |
| 3880 | Hbo1832 | 3291 | 3555 | 3774 | 3859 | 4493 | 3527 | 3388 | 3287 | 3302 |
| 3815 | NP4982A | 3227 | 3359 | 3368 | 3526 | 3527 | 4462 | 3580 | 3489 | 3480 |
| 3783 | Hut0336 | 3240 | 3425 | 3270 | 3387 | 3388 | 3580 | 4480 | 3660 | 3596 |
| 3692 | Hmu2561 | 3115 | 3271 | 3119 | 3296 | 3287 | 3489 | 3660 | 4511 | 3674 |
| 3719 | rrnAC3203 | 3154 | 3237 | 3190 | 3392 | 3302 | 3480 | 3596 | 3674 | 4459 |
621 symbols consensus MSDTDAT-------------------TADSDTLRTPIVAVLGHVDHGKTSLLDKIRGSAV #oth .3152432231111111111111111444444.................1...21..... VNG1997 :P:A:T-::::::::::::::::::::D:PGD:::::::::::::::::::::::::::: hla1194 :T:----:::::::::::::::::::HTNA:::::::::::::::::::::::T:::::: HQ3074A ::::::DADTDAVSTTETSMNADANAN::G:::::::::::::::::::T:::TV::::: HVO_1963 :::::S-::::::::::::::::::::SQ::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1832 ::::::DAPS:::::::::::::::::TE:NA:::::::::::::::::T:::::::::: NP4982A ::ES:T:D::::::::::::::::::AG:GTA:::::::::::::::::::::EV::::: Hut0336 :AEHTP:D:::::::::::::::::::TE:SS:::::::::::::::::T:::::::::: Hmu2561 ::EP:SHADD::::::::::::::::D::AGG:::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3203 :::::P::::::::::::::::::::::TD:::::::::::::::::::::::::::::: consensus SEGEAGAITQHIGATAVPLDTISEMAGDLVDPTDFDLPGLLFIDTPGHHSFSTLRSRGGA #oth 211.1........1.11..211123..3.13.31.................1...1.... VNG1997 I::::::::::::::::::::V::V::S:::::E:::::::::::::::::::::::::: hla1194 :::::::::::::::DI::::::::::E:I:::::::::::::::::::::::::A:::: HQ3074A ::D::::::::::::::::E:V:::::E::::A::::::::::::::::::T:::::::: HVO_1963 :::::::::::::::::::::V:Q:::S::K:E::::::::::::::::::::::::::: Hbo1832 :::::::::::::::::::::V:Q:::S::N:D::::::::::::::::::::::::::: NP4982A TA::::::::::::::::::::::L::Q::S:E::::::::::::::::::::::::::: Hut0336 T::::::::::::S:::::SV:G:::::::::E::::::::::::::::::::::::::: Hmu2561 TA::S::::::::S::::::V::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3203 TA::S:::::::::::::::V:::I::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus LADIAILVVDVNDGFQPQTEEAIDILKRTGTPFIVAANKIDTTPGWNPNDGQPIQRTYEA #oth .....11....1.1....14..11..21.1...1.....1..2...1.2213.1171316 VNG1997 :::::::::::::::::::::::R:::D:::::V:::::::::::::::PDA:V:G::DD hla1194 :::::V::::::::::::::::::::R::::::V:::::V::::::::Q:::::::SL:: HQ3074A :::::VV::::::::::::I::L:::Q::::::V:::::V::::::T:T::S:::P:::S HVO_1963 :::::::::::::S::::::::::::::::::::::::::::::::::QE:A:::K:::E Hbo1832 ::::::V::::::::::::I::L::::::::::V:::::::::::::::::S:::E:::N NP4982A ::::::::::::::::::SY::L::::::Q::::::::::::V::::::PDE:V:::L:: Hut0336 ::::::V::::T::::::::::L:::R::Q:::::::::V::I:::::T:D::::ASK:R Hmu2561 :::::::::::::::::::M:::::::::Q::::::::::::V::::::E:E:VRVSK:K rrnAC3203 :::::::::::::::::::L:::::::::Q::::::::::::V::::::E:::V:Q:MD: consensus QSDRARSDLDEKLYEIIGELSDEGFSADLYWRVQNFQKNIGVVPVSAETGEGVPDLLTVL #oth .1321233.124...1..31..3...2.2.....1.24.1..1.1..3.1..1....2.1 VNG1997 ::::V:::::DA:::L:::M::A:::S::::::::::::V::I::::::::::::::::: hla1194 ::E::E:M:N:N::::::Q:::A:::::::::::D:::::::::L::I:::::::::::: HQ3074A :PSA::DR:::R:::L::D:::::::G:::::::::T::V::::L::I:S:::::::A:: HVO_1963 ::Q::::K::::::::::::::R:::S:F::::::::S:::::::::L::::I::::G:: Hbo1832 :::N::QR::QN::::::N::::::::::::::::::::V::::L::M::::I::::A:: NP4982A :::::E:R:N:Q::::::::::::::::M:::::::RE:::::::::::::::::::::: Hut0336 :P::VQ:::::R:::L::Q:::::::::F::::::::N::::::L::M:::::::::::: Hmu2561 ::::VQG:::::::::::Q:::N:::::M:::::D::N:::::::::::::::::::::M rrnAC3203 ::::VQ:::N::::::::::::N:::::M::::::::A:::::::::::S::I::::::M consensus MGLSQRYMKEEMAIDVGGPGAGTVLEVKDERGFGTTVDVVLYDGTIRADDTIVVGGLNEP #oth ...1..11121.21125...3..1...1121...1.2.312...21142.32...15421 VNG1997 :::A:::::S::EVTID:::::::::::::Q::::::::I:::::::SG::V:::AQP:: hla1194 ::::::F:::::::::Q:::E:::::::::::::A:I:T:V:::VV:NG:Q:::::QD:: HQ3074A ::::::::R:Q::::IT::::::I::::::::::A:::::::::SV:P::I:::::TDG: HVO_1963 :::::::::D::::::A:::S:::::::E:::::A:L:::::::::::G::V::::A:D: Hbo1832 :::::::::::::V::::::::::::::E:::::A:::::::::SV:ES:::::::V:G: NP4982A :::::::L::::S:::::::V:::::::E:::::::L:I:::::::::::::::::K::T Hut0336 :::::::L:::::V::T::::::::::T::::::::I:A:V:::::::::QL:::::E:: Hmu2561 :::::::L::::S:::::::V::::::T:A::::::::A:V:::::SE::E::::::DG: rrnAC3203 ::::::::::::E::TS:::V::::::::TQ:::::L:AII::::::N:::::::::QG: consensus IVTEVRALLQPRPLAEIRTEKRFEKVEEVAAAAGVKIAAPDLDDAMAGAPVRVVRDRDVD #oth .1.11....2.2111.1...23.23.2423..1.2.1...1.22......2..1111123 VNG1997 :::D:::::K:GD:::M::::::GN:DRMQ::::L:V:::::::::::::I:::G::::A hla1194 ::::I:::::::::E::::::K::::A::G:::::::::::::R:::::::::::::P:E HQ3074A :::D:::::::::N::::::N::DR::IAQ:::::::::::::N::::::L::::N::RA HVO_1963 :::::::::::::N:::::::::D:::::R::::::::::::E:::::::::::G:::L: Hbo1832 :::::::::::::N:::::::::D:::::R::::I:::::::::::::::I:::::QP:: NP4982A :::D:::::::Q:::::::::Q::Q::A:G::::I::::::::::::::::::::::P:E Hut0336 :::::::::::::::::::::E::::DS:::::::::::::::::::::::::::::P:E Hmu2561 :::::::::K:Q:::::::::Q::R::S::::D::::::::::::::::::::::::::: rrnAC3203 :I:D:::::R::::E:::::QE::Q:D:::::D:::::::E:G:::::::I::I::::RS consensus EVIAEVEAELAEIEVETAEEGVVVKADTLGSLEAMANALEEAEIPILRAEVGDVAPRDVA #oth 2.15..12...222.5.3.1.1.1..........2231.31211.121....11....11 VNG1997 D:VT::::::::VA:::G:::I::::::::::::LVS::::::::VMS:::::::::::: hla1194 ::VE::K::::::::::::N:::::::::::::::::::R:::V:::::::::I::::I: HQ3074A N:VS:::::::D:A:::::::::::::::::::::::::K::DV::::::::::::::I: HVO_1963 ::VR:::::::D:::T:E:::::::::::::::::::::Q:::V:::::::::::::::: Hbo1832 D::::::S:::::::D:E:::::::::::::::::::::R:::V:::::::::::::::: NP4982A :::::::::::D:Q:V:E:::I::::::::::::I:A:::::::::V:::::::::::I: Hut0336 ::::::::::::V::Q:::::I::::::::::::ISST::DE::::M:::::::::::IR Hmu2561 :::L:::E:::GF::S:::::::I::::::::::LSGT:::H:::VM::::::::::::R rrnAC3203 :::::::E:::::::T:Q:::::I::::::::::LSST:::E:::VM:::::A::::::R consensus VAETANEPEHRAILGFNVDVLDNAEDEAEQE-DVRLFEDDVIYQLVEEYEDHVEEIERAQ #oth 2.2.142441322.1.2..3.421342114512.22.421.....113.242.314222. VNG1997 M:T:VDSEK::VL::::::::PA:AEN::R::S::V:NS::::::::D::AF:DAQ::E: hla1194 ::::::QD::K::::::::L:A:::T:L:NA:::K::T:E:::::I:D::TY:::KQ::: HQ3074A I:S::::ERNQTV:::S::::S::S::L:ES:N::::T::::::::D::KSY:D:Q:::: HVO_1963 ::S::R::::KV:::::::::S:::A:LDKN:::K::::::::::::::::::N:MK::: Hbo1832 ::S::R:M:NKV:::::::::A:::::L:KTG:::::K:::::::I::::EF:::RK::: NP4982A ::S::E::K:E:V:A:::::::D::R:::EK:::K::A:::::::::::D:Y:T:::E:: Hut0336 ::::::::T:::::A:G::I:EDTAAL:::::::::::N::::::::::D:::TA::ES: Hmu2561 :::::G::IN::V:A:G::T::D::RL:D:::::EI:A:::::::I:H::::::A::T:: rrnAC3203 :::::G:STNQ:::A:S:::::D:R:L:::::::K::::::::::::S:D:::TA::E:: consensus QEQILDKIVRPARFRILQDHVFRQSDPAVVGVEVLSGTLKRNSNVVKWEGNEPERVGQLK #oth 112111113..21.11.4..1...12.......131.2231.641342222144.2.411 VNG1997 K:AVF:N::::::::::K::::::N:::::::::V:::::::TP:GGI:::DLD:A:IV: hla1194 ::TV:::V:::S:::::P::T:::N:::::::::I:::VQN:R::GYF::::F::::::S HQ3074A ::TV:::::::C:::::E:::::::S::::::::::::::N:QYII::N::::A:I:E:S HVO_1963 ::T::::::::C::::::::::::NN::::::::M:::I:N:M::::::DG::N:::::S Hbo1832 ::TV::::M::C:::::E:::::::S::::::::::::::N:A:::::::::TT:::::S NP4982A ::::::::E::C:::V:K:::::::N:::::::::::::::::R::::D::::::::E:: Hut0336 ::::::N:T::::::::D::T::::::::::::I::::IV:::H:ARFD:G::::::::: Hmu2561 :D::::N:T:::::Q:::::T::::::::::::I:A:RI::::::ALFD:D::::::H:: rrnAC3203 :::::EN:T:::K:::::::T::::::::::::I:::E:R::V:::R::NG:AN:::T:: consensus GIQDQGEDVDEARAGERVSVSIDGPTVGRQIEEGDELWTELPEKHAKILEQELKDEIPAD #oth 21.23.1.111.12.411121.1......112...2..312......1.1...521123. VNG1997 :::::::::::::::N:::::::::::::D:K::::::VD:::::::V:D:::TSDL::: hla1194 :::K::D::::::::::::IA::::::::D:::::T::::I:::::::::::::E::T:: HQ3074A :::E:::::SS::::T:::IA:::::::::::::::::V::::::::::::::I:::::: HVO_1963 :::EN::::SS::::S::::A::::::::::A::::::I::::::::::::::R:D::T: Hbo1832 :::E:::::S:::::N::::A::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::: NP4982A SL::A:D:I::::T::Q:AA::::::::::::::::::A:V::::::::::::A::::T: Hut0336 ::::E:D:::::::::::A::::::::::D::::::::I::::::::::::::TE::::: Hmu2561 S:::E:::::::GR:D::A:::::::::::::::::::::::::::::::::::ED:TG: rrnAC3203 T:::E:::::S::::::MA:::Q:::::::V::::D::V:I:::::::::::::ED:SV: consensus EREALSMYLDKHRKRDPFWGK #oth .1...44..134.31...... VNG1997 :::::KS:::IM::::::::: hla1194 :::::AA::ETK::::::::: HQ3074A :L:::TS:::S:::::::::: HVO_1963 :L::::G::E:::R::::::: Hbo1832 :L:::TG::::::Q::::::: NP4982A :L:::R:::::Q::::::::: Hut0336 :::::::::::R:NK:::::: Hmu2561 ::::::Q::E:Q:N::::::: rrnAC3203 :::::::::E:::N:::::::