|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3211 | VNG1873 | Hmu2367 | Hut0970 | NP2430A | hla0944 | HQ3212A | rrnAC3419 | HVO_2588 | Hbo2261 |
2559 | VNG1873 | 3217 | 2648 | 2653 | 2360 | 2371 | 2302 | 2337 | 2307 | 2342 |
2633 | Hmu2367 | 2648 | 3239 | 2954 | 2439 | 2390 | 2286 | 2484 | 2368 | 2371 |
2581 | Hut0970 | 2653 | 2954 | 3247 | 2439 | 2347 | 2282 | 2464 | 2342 | 2345 |
2731 | NP2430A | 2360 | 2439 | 2439 | 3181 | 2493 | 2472 | 2635 | 2560 | 2576 |
2830 | hla0944 | 2371 | 2390 | 2347 | 2493 | 3495 | 2604 | 2643 | 2704 | 2701 |
2752 | HQ3212A | 2302 | 2286 | 2282 | 2472 | 2604 | 3206 | 2595 | 2731 | 2728 |
2843 | rrnAC3419 | 2337 | 2484 | 2464 | 2635 | 2643 | 2595 | 3194 | 2717 | 2707 |
2907 | HVO_2588 | 2307 | 2368 | 2342 | 2560 | 2704 | 2731 | 2717 | 3195 | 3041 |
2915 | Hbo2261 | 2342 | 2371 | 2345 | 2576 | 2701 | 2728 | 2707 | 3041 | 3572 |
478 symbols consensus ----------------------------------------------------MFMSYDKV #oth 11111111111222212222222222222222221121222122212121223423.111 VNG1873 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--:::::I Hmu2367 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SYD:::: Hut0970 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::ADA::Q: NP2430A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--:G:::: hla0944 :::::::::::MAVAVRRGSTDRVRAAKSADTGALAASGKAAGTLRGSNNART::::::: HQ3212A ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--:::EQI rrnAC3419 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GYD:::: HVO_2588 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::QI Hbo2261 MAPATIGEVKTATTPVLGVAVESRLPYNRDEAATLAGSERTAILYRRSGNRGL:::::QI consensus EVPDEGEKITVADEDTGELDVPDNPIIPIIHGDGIGTDVGPAAQKVLDAAAEATGRSIEW #oth 31.34.24142522232..31.12.11.........1....1..2..4...2...1213. VNG1873 :::EG:A:VSY-::AAD::::::T::::::::::::K::::I::D::S:::::::HD::: Hmu2367 :::A:::::E:V:::ND:::I:E:::V:::::::::K::::::::::E:::N::::E:S: Hut0970 S::S::QP:E:I:::AD:::I:E:::V:::::::::K::::::::::N::::::::E:A: NP2430A :::A::::VA:DED:--::I:::D:V:::::::::::::::::::::Q:::D::::E:N: hla0944 D:::D::A::L:::E::::N::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::A: HQ3212A TA:EA::R:::TNAE:::::I::T::::::::::::::::::::Q::E:::::::::::: rrnAC3419 ::::::QQ:Q:TED:--:::::E::::::::::::::::::::::::E:::N::::D:S: HVO_2588 ::::D::::::-::E::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::VS: Hbo2261 :::EN:::::L:::E::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus MRVYAGESAREKYDENLPEDTVEAIREHRVAIKGPLTTPVGAGFRSLNVALRKTLDLYAN #oth 1111..3.1.22.1....11.13.1221211.....................12..1.2. VNG1873 :E:::::::::M:::::::E::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::::: Hmu2367 :::F::::::::::::::D:::N::D::::::::::::::::::::::::::Q:::F:S: Hut0970 ::::::::G::R::::::D:::N::D:F::S:::::::::::::::::::::Q:::F::: NP2430A :::::::::::::::::::::I::LK:FK:S::::::::::::::::::::::K::::T: hla0944 ::::::G:::DM::::::::::S:::D::::::::::::::::::::::::::::::::: HQ3212A L::::::::::R:G::::::::S:::D::I::::::::::::::::::::::QE:::::: rrnAC3419 ::I:::Q:::D:::::::D::::::K:FN::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_2588 ::::::S:::D:::::::::::S:::N::::::::::::::::::::::::::K:::::: Hbo2261 L:::::::::K:::::::::::Q::KD::::::::::::::::::::::::::K:::::: consensus VRPTYHLDGVPSPVKNPEEMDMVTFRENTEDVYAGIEWEAGTDEVEQVREFVEEEMGFDD #oth 1....112.....1.3.13...1................1..21122.12.1.22.3412 VNG1873 :::::Y:::::::M:A::::::::::::::::::::::::::::A::::S:::D::D::: Hmu2367 :::::Y:::::::M:A::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::D::::: Hut0970 :::::Y:::::::M:A:::::::::::::::::::::::E::::::E::D:::::::::E NP2430A I::::::::::::::Q::Q::::::::::::::::::::::::::QE:K:::::Q::Y:: hla0944 :::::Y::::::::::::K:::I::::::::::::::::::::::::::D:L:DD:EIA: HQ3212A :::::::S:::::::::SA:::::::::::::::::::::::AGADE::D:L:NQ:DY:E rrnAC3419 ::::::IE:::::::D::::::::::::::::::::::::::::::E:K::::D::N::E HVO_2588 :::::::::::::::::SA::::::::::::::::::::::::::QK:K::::::::A:G Hbo2261 :::::::::::::::::SA::::::::::::::::::::::::::Q::K::::::::H:: consensus VIHDGPVGIGIKPITEFGTKRLVREAIDYALENDRDSVTLVHKGNIMKFTEGAFRDWGYE #oth 11...21...2...1.2.1...1.2..1..1131.12....1..........1.21..1. VNG1873 :M:::DI:::L:::S:K:S:::::::::::I:::::T:::::::::::::::Q:G:::M: Hmu2367 :M::::I:::::::::::S:::::K:::::I:H:::K::::G::::::::::Q:TE::M: Hut0970 TM::::I:::::::::Y:S:::::K:::::I:H:::K:::::::::::::::Q:G:::M: NP2430A :::::E::::V:::::::::::::Q:::::::K::::::::::::::::::::::::::: hla0944 ::::::::::V:::S:::S:::I::::::::A:::::::::::::::::::::::::::: HQ3212A :M::::I:::::::::::::::::Q::::::::N:P:::::::::::::::::::::::: rrnAC3419 T:::::::::V:::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::::: HVO_2588 :::::::::::::::::::::::::::E:::::::P:::::::::::::::::::::::: Hbo2261 :::::::::::::::::::::::::::E::I::::::::::::::::::::::::::::: consensus VAEEEYGDDEI--TEDELWEEYDG-EIPEDAVVVKDRIADNMLQQLLTRTDEYDVIATMN #oth 1.3..1114211111.3..123.1215.11322122.1..1...1211..1211.1.11. VNG1873 ::::::P:::VFAAP:S::::Q:EVD::::::M:EE:L::A:::WMQL::::F::L:MP: Hmu2367 ::D:::P:::VFAAP:S:::TQ:EID::::::M:ES:L::A:::WMQL::::FS:L:MP: Hut0970 ::::::P:E:VFAAP:S:::TQ:EVD::::::M:EE:L::A:::WMQL::::F::L:MP: NP2430A ::R::::EEV::::::T::::R::::P:::::::N::::::::::I:::::Q:::L:MP: hla0944 :::::::::V::::::Q:::AH::::Q::GTL:::::::::::::::::::::S:::::: HQ3212A ::::::::IT:::::::::D::::::Q:A:TLLI:::::::::::::::::Q:::::::: rrnAC3419 :::::::EHV:::::::::D::::::A:::SL::N::::::::::::::::::::::::: HVO_2588 L::::F::VT::::::::::::::::R:::K:::::::::::::::::::AD:::::::: Hbo2261 L:A::F::VT::::::::::::::::K:::KI::::::::::::::::::AD:::::::: consensus LNGDYMSDAAGAQIGGLGIAPGANFGDGRCLAEPVHGSAPKYAGQDKVNPTAMILSGRLM #oth .....1...1............2.2.4111...........1..1111....2.....21 VNG1873 :::::L::::::::::::::::::::A::::::::::::::R:::::A::::L::::::L Hmu2367 :::::L:::::::::::::::::::::A:V:::::::::::R:::NMA:::::::::::: Hut0970 :::::L:::::::::::::::::::::A:V:::::::::::R:::NMA:::::::::::: NP2430A :::::L:::C::::::::::::::I::::V::::::::::::::::::::::::::::I: hla0944 ::::::::::::::::::::::I:R:H:::::::::::::::::::::::::::::::E: HQ3212A ::::::::::::::::::::::G:::::L:::::::::::::::::::::::I:::::I: rrnAC3419 ::::::::::::::::::::::::::SA::::::::::::::::E::::::::::::::: HVO_2588 ::::::::::::::::::::::::::E:L:::::::::::::::E::::::::::::::: Hbo2261 ::::::::::::::::::::::::::E:L:::::::::::::::E::::::::::::::: consensus FEYMGWKDAADLVRDAVEETISSGDVTYDLERQIEDGEKLATSEYAEAVVENIEELA- #oth 1112..21.24.1.....3..3314....12..3111211212111121132143..1 VNG1873 :::I::D::ST:::::::D::E::T:::::A::RD:A:EVSSTT:::::IDR::D::: Hmu2367 :D::::::::::::::::::::::T::::::::L::A:::G:E::SD:I:::::K::: Hut0970 :D::::DE::::::::::::::A:K::::::::L::A:::G:E::::EI:A:::Q::: NP2430A L:F:::D:::::::::::Q::VDRK::::I:::V::A:::::::::::::D:LYD::: hla0944 LD:L::S:::::::::::::::::Q:::::H::::G::::::::F:D:::DK:D:::: HQ3212A :::::::::GE:::::::Q::LD:::::::H::::::T::::::F:D:::R::D:::S rrnAC3419 L::::::::GQ:::::::::::::N::::::::::G:T::::::F::K::::::K::: HVO_2588 :::::::::GK:I:::::K:::D::::::::::::G:N::::::::DK:::::K:::: Hbo2261 :::::::::GK:I:::::K:::E::::::::::::G:N::::::F::KI::::N::::