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[K] (VacB) COG0557 Exoribonuclease R
9 genomes BUD0308 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2647

rrnAC2072

HVO_0388

Hbo1115

Hmu0382

Hut0830

hla0188

NP0874A

HQ3180A

Pairwise sequence scores
Consensus score3362 VNG2647 Hut0830 rrnAC2072 Hmu0382 NP0874A hla0188 HQ3180A HVO_0388 Hbo1115
2711VNG2647 3351 2549 2562 2615 2463 2462 2324 2406 2438
2846Hut0830 2549 3412 2969 2956 2599 2464 2417 2446 2461
2941rrnAC2072 2562 2969 3545 3071 2593 2500 2449 2494 2572
2949Hmu0382 2615 2956 3071 3397 2596 2498 2467 2519 2561
2779NP0874A 2463 2599 2593 2596 3409 2618 2394 2488 2454
2738hla0188 2462 2464 2500 2498 2618 3365 2476 2606 2632
2729HQ3180A 2324 2417 2449 2467 2394 2476 3400 2868 2770
2832HVO_0388 2406 2446 2494 2519 2488 2606 2868 3407 2947
2839Hbo1115 2438 2461 2572 2561 2454 2632 2770 2947 3403

460 symbols
consensus       MSDDA---QAAAGTAEGQGPVEIDPELARHLQNKREELFEEFEIRDAFPPEVLEEAEART
#oth            .13433221242.12111...2.2312.12132..21...1.212.2..33.34..22.1
VNG2647         :::S-:::EP:Q:SI:D::::::S:::::Q:E:::DD:::K:DLH:E:::D:VA::::::
Hut0830         :TANEEDE::::::P:::::::::E::::::E::::::::K:::P:G:::::::::K:::
rrnAC2072       :TTEDA::::::::::::::::::::M::::E::::::::K:G:P:E:::::::::KE::
Hmu0382         ::NEDA::::E:::P:::::::::E:M:::MA::::::::K:::::::::::M:::::::
NP0874A         :T:RDE::::Y::::::K:::Q::E::::::K::::::::::::::E::S:::Q:::E:A
hla0188         ::::-:::EPKP:S::D::::T:T::::DR:AE::T::::::::::E::N:::R:::T::
HQ3180A         ::NN:QQS:SE::::A:::::::SVD:::R::E:::::::::G:::::::A:RQ::K:::
HVO_0388        ::::::::::Y:::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::S::R:::
Hbo1115         ::N:::::::Q::::::::::::S:DV::Q::D::::::::::::::::GP::S::RE::

consensus       EDVQAEIEDEIDERRDLRDLTTWTTDPIDAQDFDDAISIEERDDEYVLWVHIADVTHYVH
#oth            311541.32.214.5.1.211...1..2........1.142312312........1...2
VNG2647         :::::::QA::ED:A:M:P:P:::V::V::::::::::VL::::::::::::::::::::
Hut0830         :::GS:::A:::::::::EM::::::::::::::::::::H::::I:::::::::::::N
rrnAC2072       KG::::::::V:::Q:::EM::::::::::::::::::::::E::I:::::::::::::N
Hmu0382         T::::::A::V:::E:::EM::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::N
NP0874A         ::PEGD:V::LE:::::::::::::::A::::::::::VKRT::G:R::::::::::::T
hla0188         :::YE:::A:::::K:::::::::::::::::::::::::REEGA:R::::::::::::T
HQ3180A         :::NE::Q::L:S:T:::E::::::::V::::::::L::R:N:ET:T::::::::S::::
HVO_0388        DG:HE:::::LEH:K::::::::::::V::::::::L::R:NEET:T:::::::::::::
Hbo1115         KG::D::QE:VEQ:Q::::::::::::::::::::::::A:NEET:T:::::::::::::

consensus       PDTAMWEEAVERGNTVYLPAYTIHMLPPVLAETVCSLVPNEDRLAHTVEMHIDKETLSFE
#oth            .212..42.22.1......2..3.....3..........21.........112312.121
VNG2647         ::SE::A::ID:A::::::G::M::::::::::::::::G:::::::::::L::DD::YQ
Hut0830         ::::::SS::::A::::::G::V:::::I::::::::::::::::::::::L:P::::Y:
rrnAC2072       :::K:::Q::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::::L:::N:GY:
Hmu0382         :::::::::::::::::::G::::::::M::::::::::::::::::::::L::DD:GY:
NP0874A         :E::::D::L::A:::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::G::::H:
hla0188         ::::::::::K:A::::::D::::::::::::::::::::::::::::::E::D::::::
HQ3180A         ::SE::T::::::::::::::::::::::::::::::::EK:::::::::E:S:::::::
HVO_0388        :GSE::A:::K:::::::::::::::::A::::::::::E::::::::::E:K:D:::::
Hbo1115         :GSE::::::K:::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::E:::::::::

consensus       EIDIYKSVIHSDARLTYTE----------AEDRLEDQSAPLHEENELVFELADQMHEQRK
#oth            412......3.11.1..3211111111111.43.1.3422.222342222..131.....
VNG2647         T:E:::::::::E::::KD::::::::::::Q::D:ET::::DDLS:::D::::::::::
Hut0830         N:E::::::R:::::::::AERLLDEPET:::V:::::VD:A:KTQAIW:::::::::::
rrnAC2072       ::N::::::R:::::::::AERLLDEPET:::V:::::VD:A:KT:R:W::::R::::::
Hmu0382         :::::::::R:::::::::AERLLDEPET::EL::::RVD:A:KT::IWN:::A::::::
NP0874A         S:::::::::::::Q::ND::::::::::C::::D:ED:::::::Q:AY:::EKL:::::
hla0188         D::::::::N::E::::K:::::::::::C:E::::P:L::G:::::AY::::R::::::
HQ3180A         :L:::::::::::::::::::::::::::C:TH:::SN:E::A::K:AY:::::L:::::
HVO_0388        S::::::::::NE:::::Q::::::::::C:N::::PDL::::::A:::D::::L:::::
Hbo1115         :::::::::E::E::::SQ::::::::::::E::D:E:L:::::CK:::::::R::::::

consensus       EDGSLVLNPSRDRAHTIIEECMLKANKAVTHELMWNRGVEAMYRVHPQPTPDEWDEALRE
#oth            11.......3..........1..........2.1.2.....11......1.21.22..2.
VNG2647         AE:::::::R::::::::::S::::::::::::::::::::V:::::::S:E:::D::Q:
Hut0830         A::::::::R:::::::::::::::::::::V:::D:::::::::::::S:E::N:::Q:
rrnAC2072       :E:::::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::V:
Hmu0382         :E:::::::A:::::::::::::::::::::::::D:::::::::::::S:E::::::V:
NP0874A         :::::::::K:::::::::::::::::::::T:Q:D::::::F:::::::::::N:::Q:
hla0188         ::::::::::::::::::::S::::::::::T:::D::::::::::::::::Q:SK::::
HQ3180A         A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TQ:::::::
HVO_0388        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::K::::
Hbo1115         :::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::Q::K::::

consensus       IQELDGVSIPGDAW-DDPRKAVNATLEQAPGRQLDKIQWAVMKVMPRAKYMNDPFGGHHA
#oth            .21.2..2.21431111..1...21..5125.2.2...1..1......1..1......1.
VNG2647         ::::N:::::::::::::::::::::::::E:::G:::::::::::::R:::::::::::
Hut0830         ::D:G::::::GG::::::Q:::::::D::E:::::::::::::::::::::::::::::
rrnAC2072       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hmu0382         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP0874A         ::D::::::::E:::E:::::::::::E::R::::::::::::::::::::S::::::::
hla0188         ::::::::::::::G:::::::::A::T::D:::N:::R::L::::::::::::::::::
HQ3180A         :T:::::E:SST::::E::::::SA::NSKP:A:::::R::L::::::::::::::::Y:
HVO_0388        :T:::::::QSTS:::E::::::DA::S:NS:T:N:::R::L::::::::::::::::Y:
Hbo1115         :M:::::K::SAKF::::::::::A::NS:::A:N:::R::L::::::::::::::::::

consensus       LNFEIYGHFTSPIRRLSDLINHWIVHENDVPEDLIALCDRASDKQKDAETAEREYKQFLE
#oth            ...1...........1..11....113.2...3134...1..11.111.11..2.13..1
VNG2647         :::::::::::::::M:::V:::::YQ:::::T::S:::::::::QAG:::::::RD:::
Hut0830         ::::::::::::::::::::::::::T:::::::V::::::::::::::QC:::::K:::
rrnAC2072       :::::::::::::::::::::::::YS::::::::::::::::R:::::QC:::::N::Q
Hmu0382         :::::::::::::::::::::::::YT:::::::::::::::::::A:::C:::::::::
NP0874A         :::::::::::::::::::V::::IYT:E:::GIAD:::H:::::::G::C::I::D:::
hla0188         :::D::::::::::::::T:::::::::::::NILE:::H:::::::G:::::L:::::Q
HQ3180A         :::D::::::::::::::::::::::::A::::::G::::::ER:::::::::L::::::
HVO_0388        :::D::::::::::::::::::::::::::::::VE:::::::R:::::::::L:::::Q
Hbo1115         :::D::::::::::::::::::::::::::::::VE:::::::R:::::::::L::::::

consensus       EVGLDPYAVNNRGIEVVDDDGDADD---------------
#oth            .2.1..4.1....231113244553352222422111111
VNG2647         ::::::D::::::VT:::SPTTSS-:::::::::::::::
Hut0830         ::::::A:::::::::I:S:-----:::::::::::::::
rrnAC2072       ::::::S::::::::::ENPD:G:EDEDAEADAADAAVEE
Hmu0382         :I::::S::::::L::::E:-----:::::::::::::::
NP0874A         ::::::H::::::V:::::PE:::HTA:::::::::::::
hla0188         :Q:::::::::::VK::E:PEE:KHTI:::::::::::::
HQ3180A         :Q:I::::I::::VVTI::A::II:DEGLPPNE:::::::
HVO_0388        ::::::::::::::VT:::::EVI:ENGLPPQE:::::::
Hbo1115         ::::::::::::::VT:::::NVV:EDGLPPAEN::::::