|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3362 | VNG2647 | Hut0830 | rrnAC2072 | Hmu0382 | NP0874A | hla0188 | HQ3180A | HVO_0388 | Hbo1115 |
2711 | VNG2647 | 3351 | 2549 | 2562 | 2615 | 2463 | 2462 | 2324 | 2406 | 2438 |
2846 | Hut0830 | 2549 | 3412 | 2969 | 2956 | 2599 | 2464 | 2417 | 2446 | 2461 |
2941 | rrnAC2072 | 2562 | 2969 | 3545 | 3071 | 2593 | 2500 | 2449 | 2494 | 2572 |
2949 | Hmu0382 | 2615 | 2956 | 3071 | 3397 | 2596 | 2498 | 2467 | 2519 | 2561 |
2779 | NP0874A | 2463 | 2599 | 2593 | 2596 | 3409 | 2618 | 2394 | 2488 | 2454 |
2738 | hla0188 | 2462 | 2464 | 2500 | 2498 | 2618 | 3365 | 2476 | 2606 | 2632 |
2729 | HQ3180A | 2324 | 2417 | 2449 | 2467 | 2394 | 2476 | 3400 | 2868 | 2770 |
2832 | HVO_0388 | 2406 | 2446 | 2494 | 2519 | 2488 | 2606 | 2868 | 3407 | 2947 |
2839 | Hbo1115 | 2438 | 2461 | 2572 | 2561 | 2454 | 2632 | 2770 | 2947 | 3403 |
460 symbols consensus MSDDA---QAAAGTAEGQGPVEIDPELARHLQNKREELFEEFEIRDAFPPEVLEEAEART #oth .13433221242.12111...2.2312.12132..21...1.212.2..33.34..22.1 VNG2647 :::S-:::EP:Q:SI:D::::::S:::::Q:E:::DD:::K:DLH:E:::D:VA:::::: Hut0830 :TANEEDE::::::P:::::::::E::::::E::::::::K:::P:G:::::::::K::: rrnAC2072 :TTEDA::::::::::::::::::::M::::E::::::::K:G:P:E:::::::::KE:: Hmu0382 ::NEDA::::E:::P:::::::::E:M:::MA::::::::K:::::::::::M::::::: NP0874A :T:RDE::::Y::::::K:::Q::E::::::K::::::::::::::E::S:::Q:::E:A hla0188 ::::-:::EPKP:S::D::::T:T::::DR:AE::T::::::::::E::N:::R:::T:: HQ3180A ::NN:QQS:SE::::A:::::::SVD:::R::E:::::::::G:::::::A:RQ::K::: HVO_0388 ::::::::::Y:::::::::::::A::::::::::::::::::::::::::::S::R::: Hbo1115 ::N:::::::Q::::::::::::S:DV::Q::D::::::::::::::::GP::S::RE:: consensus EDVQAEIEDEIDERRDLRDLTTWTTDPIDAQDFDDAISIEERDDEYVLWVHIADVTHYVH #oth 311541.32.214.5.1.211...1..2........1.142312312........1...2 VNG2647 :::::::QA::ED:A:M:P:P:::V::V::::::::::VL:::::::::::::::::::: Hut0830 :::GS:::A:::::::::EM::::::::::::::::::::H::::I:::::::::::::N rrnAC2072 KG::::::::V:::Q:::EM::::::::::::::::::::::E::I:::::::::::::N Hmu0382 T::::::A::V:::E:::EM::::::::::::::::::V::::::::::::::::::::N NP0874A ::PEGD:V::LE:::::::::::::::A::::::::::VKRT::G:R::::::::::::T hla0188 :::YE:::A:::::K:::::::::::::::::::::::::REEGA:R::::::::::::T HQ3180A :::NE::Q::L:S:T:::E::::::::V::::::::L::R:N:ET:T::::::::S:::: HVO_0388 DG:HE:::::LEH:K::::::::::::V::::::::L::R:NEET:T::::::::::::: Hbo1115 KG::D::QE:VEQ:Q::::::::::::::::::::::::A:NEET:T::::::::::::: consensus PDTAMWEEAVERGNTVYLPAYTIHMLPPVLAETVCSLVPNEDRLAHTVEMHIDKETLSFE #oth .212..42.22.1......2..3.....3..........21.........112312.121 VNG2647 ::SE::A::ID:A::::::G::M::::::::::::::::G:::::::::::L::DD::YQ Hut0830 ::::::SS::::A::::::G::V:::::I::::::::::::::::::::::L:P::::Y: rrnAC2072 :::K:::Q::::::::::::::V::::::::::::::::::::::::::::L:::N:GY: Hmu0382 :::::::::::::::::::G::::::::M::::::::::::::::::::::L::DD:GY: NP0874A :E::::D::L::A:::::::::T::::::::::::::::::::::::::::::G::::H: hla0188 ::::::::::K:A::::::D::::::::::::::::::::::::::::::E::D:::::: HQ3180A ::SE::T::::::::::::::::::::::::::::::::EK:::::::::E:S::::::: HVO_0388 :GSE::A:::K:::::::::::::::::A::::::::::E::::::::::E:K:D::::: Hbo1115 :GSE::::::K:::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::E::::::::: consensus EIDIYKSVIHSDARLTYTE----------AEDRLEDQSAPLHEENELVFELADQMHEQRK #oth 412......3.11.1..3211111111111.43.1.3422.222342222..131..... VNG2647 T:E:::::::::E::::KD::::::::::::Q::D:ET::::DDLS:::D:::::::::: Hut0830 N:E::::::R:::::::::AERLLDEPET:::V:::::VD:A:KTQAIW::::::::::: rrnAC2072 ::N::::::R:::::::::AERLLDEPET:::V:::::VD:A:KT:R:W::::R:::::: Hmu0382 :::::::::R:::::::::AERLLDEPET::EL::::RVD:A:KT::IWN:::A:::::: NP0874A S:::::::::::::Q::ND::::::::::C::::D:ED:::::::Q:AY:::EKL::::: hla0188 D::::::::N::E::::K:::::::::::C:E::::P:L::G:::::AY::::R:::::: HQ3180A :L:::::::::::::::::::::::::::C:TH:::SN:E::A::K:AY:::::L::::: HVO_0388 S::::::::::NE:::::Q::::::::::C:N::::PDL::::::A:::D::::L::::: Hbo1115 :::::::::E::E::::SQ::::::::::::E::D:E:L:::::CK:::::::R:::::: consensus EDGSLVLNPSRDRAHTIIEECMLKANKAVTHELMWNRGVEAMYRVHPQPTPDEWDEALRE #oth 11.......3..........1..........2.1.2.....11......1.21.22..2. VNG2647 AE:::::::R::::::::::S::::::::::::::::::::V:::::::S:E:::D::Q: Hut0830 A::::::::R:::::::::::::::::::::V:::D:::::::::::::S:E::N:::Q: rrnAC2072 :E:::::::A:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::::::::V: Hmu0382 :E:::::::A:::::::::::::::::::::::::D:::::::::::::S:E::::::V: NP0874A :::::::::K:::::::::::::::::::::T:Q:D::::::F:::::::::::N:::Q: hla0188 ::::::::::::::::::::S::::::::::T:::D::::::::::::::::Q:SK:::: HQ3180A A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TQ::::::: HVO_0388 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::K:::: Hbo1115 :::::::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::::::::::Q::K:::: consensus IQELDGVSIPGDAW-DDPRKAVNATLEQAPGRQLDKIQWAVMKVMPRAKYMNDPFGGHHA #oth .21.2..2.21431111..1...21..5125.2.2...1..1......1..1......1. VNG2647 ::::N:::::::::::::::::::::::::E:::G:::::::::::::R::::::::::: Hut0830 ::D:G::::::GG::::::Q:::::::D::E::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC2072 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu0382 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP0874A ::D::::::::E:::E:::::::::::E::R::::::::::::::::::::S:::::::: hla0188 ::::::::::::::G:::::::::A::T::D:::N:::R::L:::::::::::::::::: HQ3180A :T:::::E:SST::::E::::::SA::NSKP:A:::::R::L::::::::::::::::Y: HVO_0388 :T:::::::QSTS:::E::::::DA::S:NS:T:N:::R::L::::::::::::::::Y: Hbo1115 :M:::::K::SAKF::::::::::A::NS:::A:N:::R::L:::::::::::::::::: consensus LNFEIYGHFTSPIRRLSDLINHWIVHENDVPEDLIALCDRASDKQKDAETAEREYKQFLE #oth ...1...........1..11....113.2...3134...1..11.111.11..2.13..1 VNG2647 :::::::::::::::M:::V:::::YQ:::::T::S:::::::::QAG:::::::RD::: Hut0830 ::::::::::::::::::::::::::T:::::::V::::::::::::::QC:::::K::: rrnAC2072 :::::::::::::::::::::::::YS::::::::::::::::R:::::QC:::::N::Q Hmu0382 :::::::::::::::::::::::::YT:::::::::::::::::::A:::C::::::::: NP0874A :::::::::::::::::::V::::IYT:E:::GIAD:::H:::::::G::C::I::D::: hla0188 :::D::::::::::::::T:::::::::::::NILE:::H:::::::G:::::L:::::Q HQ3180A :::D::::::::::::::::::::::::A::::::G::::::ER:::::::::L:::::: HVO_0388 :::D::::::::::::::::::::::::::::::VE:::::::R:::::::::L:::::Q Hbo1115 :::D::::::::::::::::::::::::::::::VE:::::::R:::::::::L:::::: consensus EVGLDPYAVNNRGIEVVDDDGDADD--------------- #oth .2.1..4.1....231113244553352222422111111 VNG2647 ::::::D::::::VT:::SPTTSS-::::::::::::::: Hut0830 ::::::A:::::::::I:S:-----::::::::::::::: rrnAC2072 ::::::S::::::::::ENPD:G:EDEDAEADAADAAVEE Hmu0382 :I::::S::::::L::::E:-----::::::::::::::: NP0874A ::::::H::::::V:::::PE:::HTA::::::::::::: hla0188 :Q:::::::::::VK::E:PEE:KHTI::::::::::::: HQ3180A :Q:I::::I::::VVTI::A::II:DEGLPPNE::::::: HVO_0388 ::::::::::::::VT:::::EVI:ENGLPPQE::::::: Hbo1115 ::::::::::::::VT:::::NVV:EDGLPPAEN::::::