|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1627 | VNG1924 | HQ3143A | HVO_2211 | Hbo1922 | Hut1977 | rrnAC3289 | Hmu2264 | HQ1345A | HVO_1885 | Hbo1764 | Hut2241 | rrnAC2498 | Hmu2685 |
1162 | VNG1924 | 1940 | 1007 | 1115 | 1083 | 1008 | 1040 | 1048 | 721 | 864 | 857 | 905 | 864 | 894 |
1108 | HQ3143A | 1007 | 1665 | 1145 | 1145 | 945 | 924 | 942 | 666 | 756 | 754 | 779 | 749 | 725 |
1277 | HVO_2211 | 1115 | 1145 | 1655 | 1307 | 1101 | 1101 | 1111 | 713 | 848 | 872 | 881 | 934 | 860 |
1242 | Hbo1922 | 1083 | 1145 | 1307 | 1659 | 1047 | 1072 | 1053 | 702 | 808 | 853 | 885 | 864 | 853 |
1176 | Hut1977 | 1008 | 945 | 1101 | 1047 | 1680 | 1175 | 1164 | 673 | 778 | 775 | 805 | 810 | 832 |
1185 | rrnAC3289 | 1040 | 924 | 1101 | 1072 | 1175 | 1668 | 1271 | 714 | 849 | 854 | 884 | 920 | 896 |
1165 | Hmu2264 | 1048 | 942 | 1111 | 1053 | 1164 | 1271 | 1693 | 689 | 835 | 813 | 806 | 877 | 847 |
939 | HQ1345A | 721 | 666 | 713 | 702 | 673 | 714 | 689 | 1628 | 968 | 1017 | 811 | 914 | 875 |
1078 | HVO_1885 | 864 | 756 | 848 | 808 | 778 | 849 | 835 | 968 | 1632 | 1244 | 1030 | 1082 | 1078 |
1101 | Hbo1764 | 857 | 754 | 872 | 853 | 775 | 854 | 813 | 1017 | 1244 | 1620 | 948 | 1067 | 1017 |
1091 | Hut2241 | 905 | 779 | 881 | 885 | 805 | 884 | 806 | 811 | 1030 | 948 | 1655 | 1166 | 1199 |
1144 | rrnAC2498 | 864 | 749 | 934 | 864 | 810 | 920 | 877 | 914 | 1082 | 1067 | 1166 | 1655 | 1300 |
1121 | Hmu2685 | 894 | 725 | 860 | 853 | 832 | 896 | 847 | 875 | 1078 | 1017 | 1199 | 1300 | 1614 |
262 symbols consensus ----------------------------------MRFVIVGAGRVGLRTARVLREEGHDV #oth 1111111111111111111111111111111111.42111.4....5...2214432131 VNG1924 MRVSCLSLPWHTPKALLHETITQTYLLWHIVLEH:DI:::::::::S:::::VTN:D:A: HQ3143A :::::::::::::::::::::::::::::::::::DII:I:::::::::::::::::::I HVO_2211 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::I Hbo1922 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::I:G::::::::::::D:E:E: Hut1977 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:::::::::A:D:S::E: rrnAC3289 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:S::E: Hmu2264 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::DDG:::: HQ1345A :::::::::::::::::::::::::::::::::::S::V::Y::::A:::QI:ETD:YN: HVO_1885 :::::::::::::::::::::::::::::::::::N:::::Y::::S::::::::::::: Hbo1764 :::::::::::::::::::::::::::::::::::KV::::Y::::A:::L:::::::E: Hut2241 :::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::F::::M::::::T:::::: rrnAC2498 :::::::::::::::::::::::::::::::::::K:::::Y::::I::::I:QS:::E: Hmu2685 :::::::::::::::::::::::::::::::::::K:::::Y::::T::::I:DS:::A: consensus VIVENDPDKVERAREAGFEVIEGDGSRESVLEDAGIEDADAIGALTGDLNVNFAACMIGK #oth 1311618642324452111226..158142.7512226.1.211..4.114..41.2312 VNG1924 TVI:Q:Y:RA::::TE::D:V::::TS:DT:L::::DT::::::::S:::T::I:::V:N HQ3143A T:I:V:HENAAQT:G:::D:VR:::V:::::I:::V:S::::::::N::T::::::S:A: HVO_2211 :L::L:R:R:::::::N:::S:::::::E::V:::::A:::L::::A::::::::::::: Hbo1922 T:::L:T:RI:::::::::::D::::::ET::R::VA:::::::::::::::::::S::: Hut1977 :L::A::KTAD:G::::::::H::::L:P:::QTDL:S:::V::::::::A:::T:L:AS rrnAC3289 :LI:R:ENA:::::T::::::A:::AI:ET:GN:DL:A:::L::::::::D::V::::A: Hmu2264 :L:::::T::A::::E:HD::::::AV:TI:D::DLDR:::L::::::::D::V::::A: HQ1345A :V:D:::::ITH:DN:::D:::::::NA:::KQ:::DE:V:L:G::D:PT::::::LT:: HVO_1885 TV:D:NDK::D:::DE:::AVL:::GT:T::RE::::G:::::G::::P:I::::::L:: Hbo1764 TV:D::EQ::::IEKE::::V:::::N:T::RR::::::::::G::::P::::::::::: Hut2241 TM::I:AQ:A:::::E:::TVL::CND:D:::A:::AT::::AG::::::A::S:::::: rrnAC2498 :::D:::V:::::T:T:::T:Q:::NE::::V:::::S:::::G::::::T::T:::::: Hmu2685 ::::::L::AD:SA:E:::TVR:::ND:::::E:ELD:::::AG::::::T::::::::: consensus EHGCRTVLRIDEDYREEIYEKYADDVDEVIYPERLGAIGAKNALLGGNFNAIADLAQHLQ #oth 222312.1.122.21432.33.253..2121......111.1.....23312211224.3 VNG1924 H:D:::::::::::::D::R::::E:::IV::::::::::::::::::VT::::::E::: HQ3143A H:QTW::::VNK:H:::V:QT:TEG::K:L:::::::::::::::::SVR::::I::R:: HVO_2211 HF:::::::V::::::VV:Q:::KE:::IV:::::::::::::::::SIR::::I::::: Hbo1922 H::L:::::V:::::D:V:K:::EE::::V:::::::::::::::::SIR::::I::N:: Hut1977 ::::::::::::::::D::RQ:::A:::::::::::::AT::::::::SV::::I::::: rrnAC3289 :::::::M:::::::::::RR::S::::::::::::::A:::::::::IR:V::I::N:: Hmu2264 QFD::::M:::::::::::R:::G::::::::::::::A:::::::::IR:V::ID:N:: HQ1345A Q::::V:M::S::INSNV::Q:ES:::D::D::::::A:::T::::::::VLDE:TEG:S HVO_1885 :YD::::M::S::::Q::::R:::::::I::::::::A:::T:::::D::::G::TDQ:R Hbo1764 :F:::A:M:VS::::K::::R::::::::::::::::A:::T::::::::::GE::EG:R Hut2241 H::A:::::::::::Q:L:::::S:::::::::::::A:::T:::::D::VL:::TE::T rrnAC2498 :F:::::::::A:::::::::::A::::I::::::::A:::T:::::D::VL:::TEQ:S Hmu2685 :::::::::::A:::::::::::A::::IV:::::::A:::T:::::D::VL:::TEQ:S consensus VVSVTVPDDSPMRGYSVSELELPADARILAHGKADEPMTIPLPDTSLEAGDRLAVLADFD #oth 2454312541.3414424422.2352222.1.37532252.45534245..421232343 VNG1924 ::QL::T:EA::::::I:::::::G::L::F::H:ASLAL:::SET::T:::I::::E:: HQ3143A I:LM::TSK::::::TIE:VA:::Q::V::F::::D::RL::S:D:::T:::::::V::: HVO_2211 :IL:::TEE:::N:::IE:VA:::N:::::F::K:G::G:::L:D:::T:::V::::::: Hbo1922 ::LM::T:E:::::::IE:VA::GQ:::::F:::G:Q:G::MR:D:::T::::::::::: Hut1977 LIQF::TA:A:VN:::L:::::::N::L::F::Q:D:VDV:NV:A:::V::::V:::::T rrnAC3289 L:EF:IQRQ:::E:::L::::::S:S:LM::::GED:LA::D::ET::::::VVI::::G Hmu2264 L:EF:ITEQ:::::::I:::::::N::L::F::R:::LDL:GE:ET:DL::H:V:::::: HQ1345A LT:LS::V:A:IIDQT:N:I::GDHG::Y:::R:N::::::::A:IIKS:::::LVVEQN HVO_1885 LTT:S:::GA:VV:EH:ANID:G::G:VY:::RER::::::::G:VV:P::Q::L:TERN Hbo1764 ISR:VI:E:A:VV:QK::DID:DSVG::Y:::RKR::::::::G:KV::::Q::L:TEK: Hut2241 :A:IRI::G::VI:TR:VT::::G::QVY:::RD::::S::::R:TIQ::::I:IT:PPG rrnAC2498 :A:IRI:::::FV:KR:V:VD::G::H:Y:::TDH::::::::Q:KI:P::SV:IM::PG Hmu2685 :A::::::G::VV:ER:VA:D::G::::Y:::SDR::::::::R:K:A:::TV::M:SPG consensus VLDDVRQLLVGEE--------- #oth 41551.5425148754533212 VNG1924 T::S:::I:::NAPPTEV:::A HQ3143A ::EE::::I:::RLAPNRNVG: HVO_2211 ::N::::::::D:VVTAA:GGA Hbo1922 ::GN::::I::D:VTATA:GGV Hut1977 ::G:::::I:::QTPQQALGGA rrnAC3289 T:S:::SIV:::SERATALGGA Hmu2264 A:G:::SIV:::TGRAAAVGGA HQ1345A N:TE:::T:M:DN::::::::: HVO_1885 A::R::SK:L:--::::::::: Hbo1764 G::A::RT:L::D::::::::: Hut2241 AIE:::GS:AA::PAA:::::: rrnAC2498 G:::I:AT:R:DASA::::::: Hmu2685 T:::::TS:K:T-:::::::::