Home |  Text search
[R] (PerM) COG0628 Predicted permease
8 genomes BUD0942 15 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1428

pNG5064

rrnAC2034

rrnAC3369

HVO_2870

Hbo1700

Hbo2635

Hmu0851

Hmu1654

-

hla1163

hla2195

hla2606

NP4576A

HQ2406A

HQ3040A

Pairwise sequence scores
Consensus score2664 hla2195 Hmu0851 hla1163 rrnAC3369 HQ3040A NP4576A hla2606 VNG1428 Hmu1654 HVO_2870 HQ2406A Hbo2635 Hbo1700 pNG5064 rrnAC2034
1015hla2195 3134 761 633 480 445 564 578 834 659 807 711 809 809 639 609
1219Hmu0851 761 2894 749 673 611 580 612 983 878 992 903 981 980 703 726
1064hla1163 633 749 2604 742 657 706 654 996 940 839 876 869 826 633 718
1362rrnAC3369 480 673 742 2667 1852 1757 1649 791 784 816 761 820 876 980 1028
1260HQ3040A 445 611 657 1852 2769 1634 1536 741 728 793 749 798 829 819 930
1410NP4576A 564 580 706 1757 1634 2694 1772 802 791 792 838 843 880 963 997
1387hla2606 578 612 654 1649 1536 1772 2975 830 779 785 793 862 825 888 989
1529VNG1428 834 983 996 791 741 802 830 2856 1339 1330 1304 1418 1225 922 868
1503Hmu1654 659 878 940 784 728 791 779 1339 2927 1374 1350 1466 1177 948 933
1600HVO_2870 807 992 839 816 793 792 785 1330 1374 3263 1647 1855 1221 884 872
1595HQ2406A 711 903 876 761 749 838 793 1304 1350 1647 3052 1872 1159 901 874
1659Hbo2635 809 981 869 820 798 843 862 1418 1466 1855 1872 3110 1262 930 938
1514Hbo1700 809 980 826 876 829 880 825 1225 1177 1221 1159 1262 2928 988 1080
1299pNG5064 639 703 633 980 819 963 888 922 948 884 901 930 988 2849 1696
1331rrnAC2034 609 726 718 1028 930 997 989 868 933 872 874 938 1080 1696 2890

492 symbols
consensus       -----------------------------------M--STMDRSRAAWWAFGLALAAALA
#oth            111111111111111111111111111111112457988766662654455334255424
hla2195         ::::::::::::::::::::::::::::::::MNGLTDHLPS:::LG::::V:L:GV:I:
Hmu0851         ::::::::::::::::::::::::::::::::::MIEKTEF::::VL::TLTA::VGT:G
hla1163         ::::::::::::::::::::::::::::::::::MVASLRDRHGSV::ILV:VLIT:VV:
rrnAC3369       :::::::::::::::::::::::::::::::::::-::MY::EK:FVVAL::::V:VVVG
HQ3040A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::-::--:NAR:F:VAL::::VFSVIG
NP4576A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::-::--::EK:L:VA:::VLV::VV:
hla2606         MSVQSTTAPIDRLRRSRSIGLGRKPGLSPIFYAGSRRETA::EK:FVIAL::::VG:LVG
VNG1428         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::GDTRI::G::::::I:AT:T:::V
Hmu1654         :::::::::::::::::::::::::::::::::MVEFEFDV:WP:T::V:L:FV:::::V
HVO_2870        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::ALPDIQ::::M::SLA:V::G::T
HQ2406A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::SSR:I::TQL:::VI:F:::G::I
Hbo2635         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::PLLD:::::MV:::I::V::::::
Hbo1700         ::::::::::::::::::::::::::::::::MHFGFT::I:::::I::VL:V:IFVV::
pNG5064         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::KR::RFQQ:SLFAIG::G:LIGV:
rrnAC2034       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::EY::DLGR:VLLTLA:V::LLVVG

consensus       FVAYSFIGTLVFGVFLYYATRPIYRRL-RRLRLPS------------LAAAVALLVLALP
#oth            32355132333333.4..12.2427424454662521222221122335.463356452.
hla2195         Y:VG::::LT:L:L:G:::::::CV::RSVTGSRQ:::::::::::::::TLTA:SVLV:
Hmu0851         L:V::Y:::F:::I:I:::A::V::::R:VVDR:G::::::::::::F:::G::FAFEI:
hla1163         ::L:::V:AI:V:I:::::::::::WIDQWTEH:D:::::::::::::S:T:T::TVG::
rrnAC3369       VL::Q::AA:TVS:::::S::RY:TS::::::::A:::::::::::RVR:V:VMAS::I:
HQ3040A         :L::E::AP:TIA:::::S::KY:TL::E:F:::A:::::::::::SIR:GI::GS::I:
NP4576A         Y::AR::AA:TVA:::::S::RF:AL::G:::::K:::::::::::RIR:VL::S::GV:
hla2606         :I::R:VAP:TVA:::::S::RLFH:::E:F:::A:::::::::::RVR:MS::SLI:V:
VNG1428         Y:V:T:V::F:L:F::::::::V:::VD:H::SS:::::::::::::V::V:S:::::::
Hmu1654         ::::R:V::F:::L:V:::::RL:::VR::IEQ::::::::::::::V::G:S:VGMV::
HVO_2870        Y:V::::::F:::L:I::::::::W:IR::VKP:::::::::::::::::::::FA::::
HQ2406A         ::V::::::I:::L:F::::::L:Q:IN:QIGP::::::::::::::::::I:::L::::
Hbo2635         Y:F:::V::F:::I:I::S:::::::IK::V:P:::::::::::::::::::::FA::::
Hbo1700         :::DA:L::FML:L::::::::V:S:IRG:IGQ::::::::::::::IG::::::::S::
pNG5064         ::LVQ:RA::I:T::::::S:::::K::ESVST::YFSEYSLPYRRQIL:VTTIS:FL::
rrnAC2034       L:LSQ:LP::::T::::::S::::::::G::P::KSFLKRAVPYQKQVH::ATIFFFL::

consensus       LLLLVSYTLALLIQELRRF-G------------QLEQYGILPDPAADLS---RLL-DPEE
#oth            444246135633473484563645545322797658777787946574666583787387
hla2195         I:::LVVVGLR:F:VVQ:QF:DGEFV::::GTLVARIT::DAL::EQREQLVS::LN:SS
Hmu0851         F:AVTG:L:F:G:K::E:SA::::::::::AGAEVVAW-F::I:::E:E::::AVA::AT
hla1163         I::ILA:ATFVG:R:IDQ:F-:::::::::AIAN:::LRTVLE:YV::VSGSE--:----
rrnAC3369       :::::::AAV:::I:A:Q::-::::::::::::-VT::ALVDVA:THV:WLDGAESV:DL
HQ3040A         :IF::::AGV::VL:A:A::-::::::::::::-IDE:DLISVA:ENV:WFGSVSRV::F
NP4576A         :M::I:::VI::AV:A:Q::-::::::::::::-V:E:PVFESAPD:VAWFEG:EDL::P
hla2606         :IG:L:::ML::VI:A::::-::::::::::::-I:::PVAETVG:EN:WVGD:AELSNP
VNG1428         VVV:L:::T:VG::::T:VLNA::::::::PQID:TTVEA:VQ:YV:V:::::AVQ::QS
Hmu1654         A:::LA:::GIAL:Q:S::ADEIDGAG:::SGS:I:DLLAMA::YLN:T:::-V:S::TA
HVO_2870        V:G::V:AATIALR:FL:YADRLSTDE:::VPID::A:::D:TLLEGIA:::---:S:QA
HQ2406A         AF:::L::A:IAAN::IKLTNQ::::::::TLV::VDSP:TSQQL:QITDIE::IQIELT
Hbo2635         A:A:IA:A::IVVN::V:LTNN::::::::GFFD:SR:P:TS:QL:R:T:::---:::NT
Hbo1700         VV:::N::VLIAV:::SA:V:QNQQGILAALKPY:GSFES:QA:SEL:A:::T::EN:S:
pNG5064         F:::FT:::::VVPAVQQ:I:QNDLASGYLSAI:SADS:G::E:I:G:QISDL:DMS:::
rrnAC2034       FVV::G:::V:V:P::QS:F:EGGLGAAYLSQF:EL:G:SP:G:L:::GFSEV:AMG:A:

consensus       LLD-------SGQLRGSINFALESAAGLLSFLGVGLLHLFIMIALAFYLLRDGRRLARWL
#oth            64744742337876:682876457388653745555352337444111..5117445715
hla2195         I:::::::::---AG::VWSNVGA:VTA:QGVVG::FL:GLATT::YF::ANDTDVSKT:
Hmu0851         YV-::::::::SFDAA:::EIVSTGGDV:GPVSTFF:::ALG::I::::::::EHI:T::
hla1163         ---:::::::EQG:F:ILRDNVSR:R:FA:SAT:W::R::VSFT::::::::DYKI:Q:F
rrnAC3369       TVEGLYSAYQ::::KPFVD:LS:N:MV:T:VASQFF:N:::TTIVTY:::V::::IRG::
HQ3040A         TVQGLYNAYQ::::TPL:D::TAH:SV:T:MISQFT:N:::ITIVTY:::V::DKIGA::
NP4576A         TINGIIQAYQA:D:DIF:D::V:H::F:S:LITGL::N:L:VVVVTY:::I::TKARD::
hla2606         TF:GIMQAYE::::DPL::::S:Q:TL:A:T:SGLV:S:L:T:VVTY:::L::SKFHE::
VNG1428         ::G:::::::QPSV:AA::TT:R::GQYAG:::TAFV:::AV:TI:::::::DT:::E:F
Hmu1654         ::::::::::NLGGV:T:TTT::::L:Y:GVV:T::::::V:L:::::::::D::F:G:A
HVO_2870        ::EYDFRSVLTPEAL::VFDS:SV::NTFA:::::AI:::V:::F::::::::H::R::G
HQ2406A         Q:-:::::::TPDQIRRVFSS:G::GNF::VI::::V:::V:::::::::::DHQ:S::V
Hbo2635         I:SLELSSL:TESELSQ:LSSIG:::DT:A:::::GV:::V:::::::::::DH:F:::V
Hbo1700         :V-:::::::DMTDTATVEAV:S:I::TA::ILDAAFQ:::AF:F:::::::D:::SA:T
pNG5064         IVTILN::::APSV:TW:EQT:GTLISSIGVFADVGIQA:LLLSGTY:::T::P::S:::
rrnAC2034       VI:LLR::::NATVQSWLGRVSDTLI:S::L:TSL::RV:::F:GTY:::T::P::VG:F

consensus       R-RFDD-DGVLREYLEAVDRDLESILFGNILNALATGLIAVIVYNGLNVIAPAGVEIPYP
#oth            667343564355415532.42175122..2222543232166315432654.54381152
hla2195         TELVGGR:STAYA:AI:::A::::VF:::L:FVV:SSIL:TVT:AAT:LV::P:LQV:MV
Hmu0851         :EEVGE:ESA:WL:ATL::::FQVVY:::VRTVVVVA:L:LG::::::::::P:LK::I:
hla1163         :RS:EH:QPAAVTFV:Q::A::TT:YT::LITIG:S::L::ST:YV:DI:::::TGVQF:
rrnAC3369       L::::::GAII::::::::EE::AV::::L::V::IS:::IAAFT:Y::V:::A::V:::
HQ3040A         L::::::EAII::::::A::E:::V::::L::V:SIS:::IG:F:VY::FV:SPA:V:::
NP4576A         L::::E::AIV::::::::DE::AV::::L::VIVIS::::A:FM:Y:AAV::P::V:::
hla2606         L:T:::::A:V::::::::AE::AV:Y::L::VI:ISI:::VA:T:Y:::::EL::V:::
VNG1428         HS::A:S:::V:A:TA:I:A:FSN:F:::::F:FI::V::S:TF:V:QIVF:SSLS::::
Hmu1654         GHLTAE:RT:FE:FVA:::ESFDKVFY::::::MI:::VGG:::TL::Q::::S:A:::A
HVO_2870        QSM:A:DH:I:EA:MRG::::FNN:F:::::::IL::T:G::A:SL:::L:::::R::A:
HQ2406A         :S::G:ER:::ET::D:::N:FT::F:::::::VI::T:G:LA:SI::IT:::::A::AA
Hbo2635         :MN:A:DR::MEA:CT:::::FKN:F:::::::VL::T:G::A:TV::MVG:D::Y::AA
Hbo1700         :ENLSGHG::MDA:MT::::::RT:Y:::::::F:IAV::AVS::AI:LF::PSLW::S:
pNG5064         FDH::E:S::VES:AI:::DE:S:::::::::::V::I:GIV:FSAY:S:S::A:QV:FA
rrnAC2034       LDT::G:S::::::AA:::EE:S:::::::::::V::V:GIF:FSLY:LV::GS:Q::FA

consensus       ALAGALTGVASLIPVVGMKIVYVPVAVYLAVPAVLSGPGS--LWFVAAFLAVALVVVDTI
#oth            5141411.411.1.2112.1114.443543483585347614443444353334222.42
hla2195         LV::F:::L:::::::VG::::I:IVAL:GFQ::STDQ:QGS:V::GVV:VAYVLLL:IL
Hmu0851         NVLAL:::A:T:V:I:VG:::::::T:::GLA:IE:D:AT::I::PV:VAV:::L:L:LF
hla1163         F:L:L:::::T:::AI:::LI:Y:YTG::VWQV:SK:E:::::::PVV:FL:TV::::V:
rrnAC3369       T:::::::I:::::::::::I:L:LTGIT:L:V::D:QS::L:AY:LG::LI:V::::::
HQ3040A         ::::G:::I:::::::::::::F:LTILS:::IL:G:NP::N:TYI:GL:VI:I::I:::
NP4576A         ::::::::::::::::::::::L:L::AA:::V::D::TE:L:VYIVG:::L:VI:::::
hla2606         :::::::::::::::I::::::L:L:AVT::::A:GDEI::A:VY::G::VL:AI:::::
VNG1428         T:M:L:::A::::::::I:L:WI:LLGW:::A:AR::G:-::YG:::V:GV::A::I:F:
Hmu1654         ::V:V:A:G:::::I::::L::::M:A::::L:GT::E:-::W:::V::A::SF::::V:
HVO_2870        ::I:L:A::::::::::::L::::I:G:MGLE:AIAN:PG::::::LL:A::SF:I::::
HQ2406A         ::L:LVA::::::::::::L:::::::::::TSYFTN:ET:::::T:S:V::S:II::::
Hbo2635         ::V:L:A::::::::::::L::I:::I:::GVSYF:N::A::F:::I::I::SF:I::::
Hbo1700         T:L:::::A::::::::::::::::T:L:::E:A:TA:DA::F:VAL:YG::S:::::::
pNG5064         P:V:::::AG::::::::::::F::GAI:T:G::A::QAT:AIGY:LL::IL:F::::::
rrnAC2034       P:V:::::IG::::::::::::L::::L:::S::VT:QTA:A:AW::L::V:T:::::::

consensus       PDLVLRPYVSGRRLHVGLLMLAYILGPLLFGWYGIFLAPILLVLVVHFARTVLPELLTGE
#oth            .243211221166115122132.32.2332121.2.12.221143542345322423565
hla2195         :QSF:Q::L:::::NAI::LF::L:::I:::::::::M:::F:::LEAI:I::::::S::
Hmu0851         :IMIV::VFA:QST:R:AM:FS::F:G:::S:::V:FG:L::IAAI:LV:VG:S::AH:D
hla1163         ::FFI:S:::KGE:NM:::L:T:V::VVA:::::V:F:::V::VFI::V:DI::V::GSD
rrnAC3369       :::L:::LL::EST:::::::::T:::VVL:F::L:F::::::VGMT::N:A::R::GAS
HQ3040A         ::I::::LL::DET:::::::::T:::VVL:F::L:F::::::IGLT::N:A::R::NTA
NP4576A         ::::::::F::N:T::::::::::F::VV::F::L:F:::::::GLT::D:A::R::GVD
hla2606         ::I:::::F::KTT::::::::::F::VV::FH:L:::::V:::ALT::D:A:IR::G:D
VNG1428         ::::V:::::::D::L::V::::VF:::IW:::::::G:MV::F::::::L:::::VA::
Hmu1654         :::LV::::::GE::T:A::F:::::::IW:::::::G::V::::T::::I:::::V:D:
HVO_2870        ::::::::::::S::::AV::::TF::::::::::::M:MI:::F:N:::L::::::A:K
HQ2406A         :::::::::::::::::AV:V::TF:::::::::V:::::I:::::N::LY:::T:ISR:
Hbo2635         ::::::::::::T::::AV:I::TF:::::::::::F::MI:::::N::KY:::::V::T
Hbo1700         ::FL::::::::N::T:TV:F:::I::A::::::L::G:L:::IA:::V:I:::::V:::
pNG5064         ::FLI::::::N:T::::::F::::::IV::A:::::G:::::::AQ:F:::A:YVA:::
rrnAC2034       ::FLI::::::DLT::::::F::::::IA::F:::::G:M::::AAQ:F:IIV:YII::T

consensus       PIRP-----------------------------------------------DAVPPDQAR
#oth            787687753674245345344343354245223335433224321232332446886799
hla2195         ::::EASVAEDIGTDPEEVHAEQDDFQGDSDPDPEPEPESDSDS:DSDSDS:SQ:KSDRD
Hmu0851         RVTAMVTTAHGLGSMPQP::::::::::::::::::::::::::::::::::GD:::E:A
hla1163         ATTR:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::---------
rrnAC3369       EP--::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::GIH:::L:
HQ3040A         NNADTTPSPSG::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--:N:TSNS
NP4576A         :DDG:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::RSIA:S::T
hla2606         :EEVGPE::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--::RG:RQ
VNG1428         G:A:VPA:::::::::::::::::::::::::GADDTPAS:::::::::::::D:ESA:D
Hmu1654         :::AREVDPAAL:::::::::::::TGDTD::GA::::::::::::::::::::GGERDG
HVO_2870        ::::YMVDPAHLVDGPPVEELTADEADDTQREPAETERSSEGESDVPETFT:RDETRSG:
HQ2406A         Q:::YSVDPGVAVRQQQISVSDSVVVGDGH::GRRKDSSAEKSS:VKE:::::AVS:VDE
Hbo2635         ::Q:YAVDPATV::EDDSELVDRSVQSDVA::GADEMPAADDDA:VSDVTSE:SAETSN:
Hbo1700         :LK:DARGRNPL:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:IDDE:QK
pNG5064         :---:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::----:::SK
rrnAC2034       ----:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::--:ETT:TS

consensus       LDEFDS------
#oth            756764644412
hla2195         P:QGR:::::::
Hmu0851         TG:A:APVGE::
hla1163         ------::::::
rrnAC3369       :ED:S-::::::
HQ3040A         DESPS:PAAND:
NP4576A         ::R:RR::::::
hla2606         ::::--::::::
VNG1428         P:DTAA::::::
Hmu1654         DEGTP:GA::::
HVO_2870        DSRSP:DAGVDG
HQ2406A         S::S:GSS::::
Hbo2635         A:DGP:AS::::
Hbo1700         ISD:EATSTADD
pNG5064         :Y:Y--::::::
rrnAC2034       :S:Y::GES:::