[C] (AtpE) COG0636 F0F1-type ATP synthase, subunit c/Archaeal/vacuolar-type H+-ATPase, subunit K 9 genomes BUD0124 10 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG2143 rrnAC1435 rrnAC3155 HVO_0312 Hbo1169 Hmu2596 Hut2133 hla0260 NP1022A HQ3248A

Pairwise sequence scores
Consensus score	521	HQ3248A	Hut2133	Hmu2596	NP1022A	rrnAC1435	hla0260	HVO_0312	rrnAC3155	Hbo1169	VNG2143
393	HQ3248A	542	304	359	310	331	362	353	361	398	340
343	Hut2133	304	464	363	306	290	330	307	314	323	343
417	Hmu2596	359	363	588	353	360	342	354	410	391	364
408	NP1022A	310	306	353	633	355	354	364	382	359	364
409	rrnAC1435	331	290	360	355	814	353	370	435	358	376
422	hla0260	362	330	342	354	353	574	390	382	372	359
406	HVO_0312	353	307	354	364	370	390	584	395	404	369
435	rrnAC3155	361	314	410	382	435	382	395	586	375	373
437	Hbo1169	398	323	391	359	358	372	404	375	548	380
406	VNG2143	340	343	364	364	376	359	369	373	380	502

121 symbols
consensus       ----------------LL----------------NALQAG-A-GPAITPSAA-------A
#oth            11122222234244544511111111111111266534664343222415121111111.
HQ3248A         ::::::::::::::::--::::::::::::::MIGL::QAQETA:::E::::::::::::
Hut2133         ::::::::::::::::--::::::::::::::::------:-:MVVLE:LS:::::::::
Hmu2596         :::::::::::::MSSA::::::::::::::::LQ:FVGST:AA:::P:L::::::::::
NP1022A         :::MFELATVASSVAPV::::::::::::::::Q:GAE:VE:G:::LDAN:V::::::::
rrnAC1435       MVKHKHEYRGVEVIGPVIALAAEWKTAMSGTASAVV::T::-:::::SAE::SYLAGGL:
hla0260         :::::::::MLEATNE:G:::::::::::::::NV::::::-::TLTD::::::::::::
HVO_0312        :::::::::MIEAIEP:M::::::::::::::::T:::SEA:SS::::AD::::::::::
rrnAC3155       :::::::::MIETIAL:V:::::::::::::::NAV::E:T:SA:::PA::G::::::::
Hbo1169         ::::::::::::::::M::::::::::::::::E:I:LQTQTA::::::K::::::::::
VNG2143         ::::::::::::::::--::::::::::::::::------:-:M:::::K::::::::::

consensus       ALAVGLAALGAGYAERGIGAAAVGAIAEDDSLFGNGLILTVLPETLVILALVVVFVV---
#oth            .121.2..211.1......1..1..2..1221.141.1..1....11..1..21.34322
HQ3248A         :I:L::::::::::::::::::M::::::::::V:::::::::::IL:::::GF:LI:::
Hut2133         ::G::F:::A:::::::::S:::::L::::::::QV:::::::::::::::::::LTL::
Hmu2596         ::::::::I::::::::::::::::::::::M::R::::::::::I:::::::::LTLGQ
NP1022A         :::::::::::::::::::::::::M::NED:::K::V::A:::::::::::::::::::
rrnAC1435       ::::::::::S:F::::::::::::::::PNM::R::::::::::::::T::T::::T::
hla0260         :::::::::::::::::::S:::::M::::D::V:::::::::::I:::::::::I::::
HVO_0312        ::S::I::FA:::::::::S::M:::::::D::V:::V:::::::::::::::::AA:::
rrnAC3155       ::::::::::S::::::::::::::::::E:M::R:::::::::::::::::::::::::
Hbo1169         ::::::::F:::::::::::::M::::::::::V:::::::::::::::::::::IS:::
VNG2143         :::::::::A:::::::::S:::::::::PD:::T::::::::::::::::::::::PTP

consensus       -
#oth            1
HQ3248A         :
Hut2133         :
Hmu2596         :
NP1022A         :
rrnAC1435       :
hla0260         :
HVO_0312        :
rrnAC3155       :
Hbo1169         :
VNG2143         F