|
Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3484 | Hut1574 | NP4168A | HQ1520A | hla1846 | HVO_1396 | Hbo0154 | VNG0439 | rrnAC0657 | Hmu0735 | HQ1534A | Hbo0654 | NP4564A | Hut0609 |
2720 | Hut1574 | 3435 | 2486 | 2330 | 2476 | 2333 | 2367 | 2418 | 2603 | 2572 | 1939 | 1961 | 2030 | 2027 |
2790 | NP4168A | 2486 | 3493 | 2378 | 2573 | 2516 | 2492 | 2498 | 2692 | 2691 | 1991 | 2083 | 2114 | 2037 |
2748 | HQ1520A | 2330 | 2378 | 3487 | 2542 | 2550 | 2740 | 2523 | 2466 | 2454 | 2024 | 2104 | 2032 | 1999 |
2918 | hla1846 | 2476 | 2573 | 2542 | 3477 | 2648 | 2715 | 2622 | 2694 | 2616 | 2011 | 2139 | 2097 | 1999 |
2811 | HVO_1396 | 2333 | 2516 | 2550 | 2648 | 3585 | 2848 | 2579 | 2612 | 2545 | 1950 | 2144 | 2043 | 1975 |
2922 | Hbo0154 | 2367 | 2492 | 2740 | 2715 | 2848 | 3510 | 2607 | 2611 | 2617 | 2029 | 2204 | 1999 | 1940 |
2831 | VNG0439 | 2418 | 2498 | 2523 | 2622 | 2579 | 2607 | 3496 | 2683 | 2638 | 2030 | 2139 | 2064 | 1995 |
2987 | rrnAC0657 | 2603 | 2692 | 2466 | 2694 | 2612 | 2611 | 2683 | 3596 | 2902 | 1958 | 2150 | 2130 | 2073 |
2970 | Hmu0735 | 2572 | 2691 | 2454 | 2616 | 2545 | 2617 | 2638 | 2902 | 3506 | 2017 | 2082 | 2113 | 2119 |
2266 | HQ1534A | 1939 | 1991 | 2024 | 2011 | 1950 | 2029 | 2030 | 1958 | 2017 | 3453 | 2673 | 2398 | 2364 |
2456 | Hbo0654 | 1961 | 2083 | 2104 | 2139 | 2144 | 2204 | 2139 | 2150 | 2082 | 2673 | 3481 | 2541 | 2498 |
2363 | NP4564A | 2030 | 2114 | 2032 | 2097 | 2043 | 1999 | 2064 | 2130 | 2113 | 2398 | 2541 | 3509 | 2473 |
2258 | Hut0609 | 2027 | 2037 | 1999 | 1999 | 1975 | 1940 | 1995 | 2073 | 2119 | 2364 | 2498 | 2473 | 3473 |
482 symbols consensus ------MTTHE---------------YDVVVVGAGTAGCYAAATAADEGLDVVIVERKSA #oth 111111234532221222112211213.3111.1.11.21.1.14.6311.12221..31 Hut1574 :::::::::A::::::::::::::::::A::::::VS:::::::M:E::::::::::::E NP4168A :::::::::F:::::::::::::::::::AI::::::::::G::I::A:Y:::::D::D: HQ1520A MRRTGMSASQ::::::::::::::::H:I:I::::::::::::::::A::::I:L:::T: hla1846 :::::::SID:::::::::::::::::::::A::::::::::::I:N:::::::::::D: HVO_1396 :::::::S:D:NDTAEDSSASPRTQSV:::::::::S:::::::I:NA:Y::T:::::PE Hbo0154 :::::MT:::::::::::::::::::::::::::::S:::::::I:R:::::::::::T: VNG0439 :::::::PA:::::::::::::::::::::::::::::::::::V::A:Y:::V:::::: rrnAC0657 ::::::::::QDGNADGASATARTVSL:::::::::S:::::::V::A:Y::::::::DE Hmu0735 :::::::::::::::::::::::::::::A::::::S:::::::L:H::Y::::A:::D: HQ1534A :::::::S:EA:::::::::::::::::I::::G::::TF::::::S::::AI:L::::: Hbo0654 :::::::PAEA:::::::::::::::::M::::G::::AF::::::S::::::LL::::E NP4564A :::::::PPES:::::::::::::::::I::::G:::::F::::::QN:::::LL::::E Hut0609 :::::::S:DA:::::::::::::::::I::::G::::AF:::S::QQD::::LL::::E consensus EEAGHIACGDALKGASTFPDAIPKSQL-EPAFTNTGVDHGRFEIPQEDTVLDIPVP-GEL #oth 5.1........1..214..21.1234122311..3512213..3.512432222222241 Hut1574 S:::::::::::::::N::E:::R::I:::SI::SV::::H::L:S:G:AV::::::::: NP4168A :::::::::::::::D:::E:::::EI::SS::::D::::Q:::::::VS::::I::::: HQ1520A A::::::::::::::DK::E::::::::DS:::::::::::::::::E:::E:::::::: hla1846 :::::::::::::::D:::E::::DR:::::::::::::::::::::::::E:::::::: HVO_1396 :::::::::::::::DA::E:::::KI::::::::E:::::::::::::::::::::::: Hbo0154 D::::::::::::::DA:::::::::I:::::::::::::::::::::::::::I::::: VNG0439 S::::::::::::::DN:::V::::::::::::::::::::::::R:::::N:::::::: rrnAC0657 T:::::::::::::::D::::::::::::::::::D:::::::::::::::E:::::::: Hmu0735 Q:::::::::::::::N::T::::::I::G:::::::::::::::E:::::E:::::::: HQ1534A D::::::::::I::T:::::V:DRKY:KSES:::QRIQRAV::N:RGGS-V::DFA:DHG Hbo0654 :::::::::::I::T:::::V:DLDY:K:ES:::QNITRAV::N:RG:D-::V:FR::AG NP4564A ::G::::::::I::T:::::V:DREY:R:ES:::E:ITLA:::N:KGEN-:::GFRGNNG Hut0609 Q::::::::::I::K::::EV:DLDY:R:E::::QNIQRAQ::V:GGE:-IEY:FAT:SG consensus AVIDRWEYGRRLIEGAERAGVEFHYDTVVQDVIQDDDGRVTGVRAIRKGDVVEYEADIVI #oth 112..311.352122.444.223211..122.7.32313.4.361342145521412312 Hut1574 :::::L:F:KL:::::AD:::T:::::::NT:L:-:GA::::IE:::::EP:T:::PV:: NP4168A ::::::::::Q::DA::D::T:::::::::::L:::::::Y:FS::K:::PRT:::E::L HQ1520A :::::L:::N::::::::::TT:Q:N::::::V:N:S:T:V::K:TNDNH:I::N::::: hla1846 :::::::::::I:A:::D::::::::::IN::::TGG:::::L::K:::TP:T::::L:: HVO_1396 ::::::::::LI:::::E::ADL:::::::::K:::::T:::IV:KHD:E::::D::::: Hbo0154 :::::::::::::D::KN::::::::::::::T:N::::::::::KQN:::::::::MTV VNG0439 :::::R::::CV:D::::T::T:S:::::ES::::::::::::TG::D:RGH:FTG:::: rrnAC0657 ::::::::::C:::::NDS:::::::::::::L:::S::::::K:M::::P:T::G:M:: Hmu0735 ::::::::::L::::::Q::::::::::::::R:::::::::LE::::::HAS:::EL:V HQ1534A ::L::KR::EI:::E:::S:A:IQ::::::::C:::::T::::::T:N:T:HT:N:E:T: Hbo0654 ::V::KR::EVIL:E:D:L:TDM:::::::::S::::::::::::K:N:::::::::VT: NP4564A :IV::KR::EV:L:E:D:V:A:L::N::::::::-EN:V:R::Q:M:N::AL:::::V:: Hut0609 SIV::KR::EV:L:E:D:V:A:L:F:::::::V:T:::H:E::T:T:::ERR::P::V:: consensus DGAGALSILQDKADFSDATFDTNVSYSQFCSAYREIIEVPEPVEWDDALVFKPTERAAGY #oth .1..1..11.112125511...1.4121.1.1...121121.1222..1.1.113221.. Hut1574 :A:::::::::E::LA::::::::T::::S:G:::::::E:::::H::::L:::::S::: NP4168A :::::::::::::::E::::::::Q::::S:::::V:::D::::::::::::::K:S::: HQ1520A ::::::::::::::::NT::::::::::::::::::V::E:::::::::::::::::::: hla1846 ::::S::L:::::::EGT::::::R:::::::::::V:::::::::::::::A:D::::: HVO_1396 ::::S::L::::V:::::::::::::QH:S:::::VV::::::::S:::::::A:V:::: Hbo0154 ::::S:::::::T:::GT::::::::::::::::::V::E:::::S:::::::A:V:::: VNG0439 :A::S:::::::V:V:G:::::::::::::::::::V:::::::::::::::::D::::: rrnAC0657 ::::::::::::T:LEA:::::::Q::::::::::::::D::::::::::::::::S::: Hmu0735 :A::::::I:E::TLDS:::::::R:::::::::::V:TE:::P:::::::::AK::::: HQ1534A :A::::::::::T::TETY::::::::::::::::VL:::D:I:Y:::I:::::D-EL:: Hbo0654 ::::::::::::T:::GT:::::::::::::::::V:D:::::DY:::I::::::-EL:: NP4564A :A:::::L::::::LG::::::K:N:Q::::::::V::::::::::::I:::::A-EL:: Hut0609 :A:::::L::::::LAE:::::::THR::::::::::::E:::DF:::I::::::-EL:: consensus LWYFPRTETEINAGLGFQMTE-EPMELVDDLKRDLRNRPEFEGATVKDKLGAALPTRRPY #oth 2.....13.1..1......4211..4..13.24.147.3.13111.41....11...... Hut1574 ::::::::::::V::::::G:::::::::A:R::IE::A::KN:::::::::SI:::::: NP4168A :::::::P::::V::::::N:::::K:::::RE:ISR:::LK:::::::::::::::::: HQ1520A :::::::::T:::::::::S:::::N:::::A::::K:S::NN:::::::::S::::::: hla1846 :::::::A:::::::::::N:::::Q::EA::::::::::::::E::::::::::::::: HVO_1396 V::::::::::::::::::::::::K::::::::::E:::::::E:I::::::::::::: Hbo0154 I::::::::T:::::::::::::::K::::::::::A::::KN:::S::::::::::::: VNG0439 :::::::D:::::::::::::::::T::::::A::QQ:::::::E:T::::::::::::: rrnAC0657 :::::::D:::::::::::N:::::::::::::::QG:S:::::E:Q::::::::::::: Hmu0735 V::::::D::::V::::::::D::::::::::Q::QG:S:::N:E:Q::::::::::::: HQ1534A :::::::A::::V:::::::::D::Q::ET::Q:IMT:::LKN:::::::::S::::::: Hbo0654 ::::::SP:::::::::::::::::K:::::::::::::::::G::T::::::::::::: NP4564A :::::::P::::V::::::NK::::::::E::A:I::::::::::::N:::::::::::: Hut0609 :::::::P::::V::::::DQ::::::::T:RD:IE::E::QN:::T::::::::::::: consensus DSAVAPGFMAVGDAAGHVNPTTGGGIAGAAYAGKYAGEQAIEAISDGDVS-EAALWEYNE #oth ..11.1.13.2..1.1....21....1...21141.144.26.433.2312.26..2..4 Hut1574 ::::::::::I::::A::::::::::::::::::::AD:::::VE:::P::::T::R::: NP4168A :::T:::Y::I::::A::::IS:::::::::::Q::::A::G::E::::::::N:::::: HQ1520A ::::::::I:A:::::::::::::::::::F::M:::Q::VT:::E:::::::S:::::: hla1846 :::::::Y::::::::::::::::::::::::::::::::VK:V::::::::EN::R::T HVO_1396 :::T:::Y:::::::A::::::::::::::::::::::::AI:LDA::::::EL::R::Q Hbo0154 ::::::::V:::::::::::::::::::::::::::::::VR::::::::::E:::H::: VNG0439 :::T:::::::::::::::::::::::::::::T::::R::R:AET::::::SM:::::: rrnAC0657 :::::::::::::::::::::::::::::::::T::A:::::::EA:RTDD::::::::: Hmu0735 :::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::::MEA:R:DE::::::::: HQ1534A :::::D::L:::::::::::::::::P:::KSAHW:ALH:VD:::E::::::SR:::::T Hbo0654 ::::::::I:A::S::::::::::::P:::KSAHW:AKH:VK:::::::::::S:::::R NP4564A :::T:::Y:::::::A::::C:::::P:::K::TW:A:A::::::::NADE::::::::R Hut0609 ::GT::::I:::::::::::::::::P:::K::HW:A:V:AD::AA:::::::S:::::H consensus RVMDHFGARYAALDVYNIFSTAHDVDDLMGLLAALPGEKLAEALYS-GSTSMGLGLKLKT #oth 2.2321.3.1.23.2..232215321114333123.2311312.362.1234135.3233 Hut1574 :::E:::::::::::::::T::YEI:::T:M::S::MT::S::::::::ADLSWS::::: NP4168A :::::Y:G::::::::::::::C:L:E:L:::::M:A:::SD:::::::AEV::P:::RV HQ1520A :::GD::T:F:G:::::VL:::I::::::::::S::::::::::::::T::FSPL:I::: hla1846 :::::::G:::G:::::VL:::V::::::::::S:::::::::::E::::::SF:::::A HVO_1396 :::::::G:::S::::::L:::V::::::::I:SI:::::::::::::T::F:PV:LAQ: Hbo0154 :::::::G:::G::I:::L:::V:::E::::M:R::::::::::::::T::F:PK:IAQ: VNG0439 H:::::::::::::::::M:::I::::::::::::::Q:::::::D::::QF::K:::V: rrnAC0657 :::::::::::::::::::T::Y::::::A:::::::::::::::G:::::I:::::::M Hmu0735 :::::::::::::::::::T::Y:::::::::::M:AN:I:D:::::::AD::::::::: HQ1534A D::TS::K:F::I:L::LWG:::N::E:VEIVS:V::QQ::D::SK::TS::S:K::::: Hbo0654 D::TD::K:F::V:L:::WGM:::::E:VEIVSS:::QQ:LDS:SK:::S::::::Q:Q: NP4564A ::QTD::K:F::M:L:::WGGT::::E:TDIV::M::QQ::D::ALE:TA::SWP::I:: Hut0609 ::LTD::K:F::M:L::::G:TLT:E:ISDV:::::AQQ:IDI:GRS:TS:::::::::: consensus AVKSFGHWGTIYDLYKTKRLADELLEHYEAYPSSPSAFEAWQAERDDIMDDIYEVTGADP #oth 34513.21341532234355.321363.45..43153236.376..531254.242.123 Hut1574 :L::R::::::L:::R:::H::::::::::::E:::G:::::DR:::LIQ:V::T:::EA NP4168A L:::::::K:LKE:FD::Q:::R::::::T:::::EGLD:::ET::E::::::AQ:::E: HQ1520A IKN:Y::::Q:LNF:R::N:::D:MGQ::R:::R:E:LDS:KSA:::V::Q::D:::::V hla1846 ::::::Y::::RNF:Q::S::::::D::G:::T::A:MAN:TG:::A:::R:::T::::A HVO_1396 :AS:Y:::SR::EFF:I::::::::A::GR:::R:::L:G::V:::R:::::::L::::: Hbo0154 :KE:Y:F:SE::QF::::NV::D:MR:::R::RR:G:L:G:K::::R:::HA:::::::: VNG0439 :L::::Y:SE:M:F:RA:QQ::R::D::R::::::DGLAD:::R:::::QSV:D:::::A rrnAC0657 ::::I::L:::R:::Q::KA::R::::::S:::DR:G:::::R:::S:::::::::::E: Hmu0735 :I::::::::::::::::Q:::R::::::S::::::E:DR::S::::L::E::A:::::: HQ1534A LIDT::::DAL:E:::VS:R:T:ITQI:DT::D:::::KD:::N::EL::EF:DL:::TR Hbo0654 L::T::::DAL:E::RVRKR:K:ITTI:N::::::R:::G::DS::SV:::L:DLV:T:: NP4564A :::T::::::LFE:KQLND::T::KGV:DQ::T::DD:AD:RT:::EL:::V::L:::E: Hut0609 M:QT::::::L::A::VNKR:S::KAI:DE::TT::G::E:R:K::GF:E:F:AEF:::: consensus KY #oth .. Hut1574 :: NP4168A :: HQ1520A :: hla1846 :: HVO_1396 :: Hbo0154 :: VNG0439 :: rrnAC0657 :: Hmu0735 :: HQ1534A :: Hbo0654 :: NP4564A :: Hut0609 ::