| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2933 | Hmu0321 | Hbo1705 | VNG1964 | HQ1731A | HVO_2133 | rrnAC0548 | Hmu1348 | hla2214 | HVO_1537 | Hbo0008 |
| 1363 | Hmu0321 | 3133 | 917 | 986 | 1049 | 1114 | 1100 | 1134 | 980 | 995 | 968 |
| 1500 | Hbo1705 | 917 | 2887 | 1145 | 1035 | 1170 | 1213 | 1297 | 1149 | 1091 | 1155 |
| 1640 | VNG1964 | 986 | 1145 | 2898 | 1216 | 1257 | 1485 | 1482 | 1218 | 1150 | 1100 |
| 1915 | HQ1731A | 1049 | 1035 | 1216 | 2961 | 1558 | 1797 | 1639 | 1202 | 1160 | 1148 |
| 2018 | HVO_2133 | 1114 | 1170 | 1257 | 1558 | 2927 | 1735 | 1665 | 1301 | 1247 | 1216 |
| 2119 | rrnAC0548 | 1100 | 1213 | 1485 | 1797 | 1735 | 2939 | 2038 | 1273 | 1298 | 1241 |
| 2147 | Hmu1348 | 1134 | 1297 | 1482 | 1639 | 1665 | 2038 | 2941 | 1298 | 1265 | 1230 |
| 1627 | hla2214 | 980 | 1149 | 1218 | 1202 | 1301 | 1273 | 1298 | 2931 | 1321 | 1170 |
| 1660 | HVO_1537 | 995 | 1091 | 1150 | 1160 | 1247 | 1298 | 1265 | 1321 | 2978 | 1551 |
| 1576 | Hbo0008 | 968 | 1155 | 1100 | 1148 | 1216 | 1241 | 1230 | 1170 | 1551 | 2935 |
435 symbols consensus MNIEARIQRRQRRGGGP-RLIQDYEALSPVAHIDEPVGRGPTLERLLDHLDPVFDGRLPP #oth 12232..61.423445323324253322.35.452.321.142.22..412.2.2151.2 Hmu0321 ::F:D:::::Y:SQA:T:QRVV:RAV:::TT:LA::T::::L::LV::Q:::I:A:E::R Hbo1705 ::L:E::LQ:K:::DRR:Q:VLEEAS::::W:SP::T:::::I:::::R:E:::EH:T:E VNG1964 :DLD:::T:::::STDA:A::T:F:P:::::::T::SD:::AF::::::FS:A:::A::: HQ1731A :D:K:::R::RDHNAQ::QF::R::::::A::L:::::::QL::Q:::YF::::::E::: HVO_2133 :D:::::::::::D:E::::LV::DS::::::T:D::NC::V::::::Y:::::::H::: rrnAC0548 :D:::::K:::::N:E:::::::::SI:::V::E::AD:::V::::::::::::::Q::: Hmu1348 :::DE::K:::::::::::::::::S::::::::D:SD:::VF::::::::::::::::: hla2214 V::DD::E::LGYDV:A:GVLV:ID:V::MS:TES::::::GI:::::VFE:A:A:S::: HVO_1537 :RL:D::T::R::::KRR::VR:LS::D:T::PR::T::::::::I::::::::::E::: Hbo0008 :RLTD::D::R:::D:TH::VR:LS::N:TH:LT::::::::::::::R:::A::::::E consensus NAYVHGPKGSGKSAVVTALFAHLARLPSEQRAVIHTTTRAAAP-------PSPEFVYVDA #oth 24214.16.3....1221.26316444466664.3.211344311111115525111.13 Hmu0321 DT::W:ER:T::::ILA::VH::D:H:RPLGQL:R::AGTHS:::::::::V::L::::T Hbo1705 :V:::::A::::::::S:::SQFT::L:SPEDS:V::::GGSA:::::::DTRS:A:::L VNG1964 :::L:::P:A::::::S::::R:::HATG-D:::::S:::GT:QPSTPASAM:A:::::R HQ1731A :G::Y::I:::::::L:S:LS::KE::V:T:E::::S::VQT::::::::S::T:::::: HVO_2133 ::::Y:::::::::::::::D::V:VS:VNN:A::::::VQ:T:::::::FA:R:::::: rrnAC0548 ::::Y::C:::::::I:::::N:EQ::T::Q:I:::::::QP::::::::T::S::::N: Hmu1348 ::::S::F::::::I:::::GR:G::ST:::S::::S::::::::::::::::::::::L hla2214 S:::::::::::::I:S:::QR::SH-:GP:RA:Q:S:::VE::::::::TL:G:::::: HVO_1537 D:H::::::V::::::A:::E:::SALPAR:S::::A::T::T::::::::TTS:A:::: Hbo0008 SFC:V::::A::::::A:::E:::ATAPT:HGA:Q::::::TS:::::::AVT::AA::: consensus REATSEFAFYHAVLDALVDESVPEHGVGTEALRDRLHDALAG-GRGAVVAVDHVGEPETV #oth 151314.312232.34242232.421222442343164715548453.221..4624425 Hmu0321 HRTA:G:E::AT:::R:T::PA:QRA::I::V:EE:DAV::-:E:PV:PI:::LTASRH: Hbo1705 :::::::E:::TI:::MTS::I:QR:LS:TD::T:VSRH:R::::IL:::M::AD:NG:D VNG1964 :T::TP:::S::::::::S::::T:::S:A:I::::A::V:AHPT:V::::::-----:T HQ1731A :S:::A:G::RS::SS:I:Q:::::::::DS:::QV:TQVQ::TP:::IC:::IA::RSL HVO_2133 ::T::A:::::::::::::::::KQ:IK::::QS::K:::D:PKT::::::::LE:SG:L rrnAC0548 ::TA:::::::::::::::D::::::I:::T:KS::::LVR:QRT:I:I::::I::::SI Hmu1348 ::T::R:::::R:::G:::DR:::::IS:SE::R:::EM:GAASI:V:I:::::::QGST hla2214 :R:PTR:RL:::A:::VS:DP:::::I::DE:AES:RE:VNT::PDL::::::AN::::P HVO_1537 :D:PT:::LL::A:ET:SK:P::SQ:::V::::E::TARV:H:DEH:::::::::::::: Hbo0008 :A:D::::LLR:::A:VA:DA:::R::::A::::::R:E:DR:F:RL:::::::::SK:: consensus DAETLVDLLAGLPSRVSWLAVGRADPDET--------ALTWYTAASIAVEPYRRQVLVDV #oth 444443433442345333132..4513541111111154385454527242.3235.122 Hmu0321 TP:RVAT:FDR:TAD:G:VG:::SP:A--::::::::::D:TPP:A:EFT::ETST:::: Hbo1705 RLASFAGE:ES:GH:T::V::::T::E:V::::::::LPDPRATRTVT::::H:AE:T:L VNG1964 T:APVAE::TA::D:AR::::::SE:SDA:::::::::::AH:DRDLRIDA:Q::T::G: HQ1731A :ES:::::A:S:::N:::::I:::S::Q:::::::::Y::T::G:E:G:SR::::::::I HVO_2133 :G:AF:::C:::::K:::::I:::P::::::::::::V::D:::GA:QF:::QS:::::: rrnAC0548 Q:PA::::F:::::N:::::I::D::ST:::::::::E::R:::E::SIDR:Q::M:::: Hmu1348 :::A:I::F:::::N:::::I::D::E::::::::::L::E:::TT:P:::::::M:::: hla2214 S:T:I:EW:TAVSD::VPVCL::EK:A--:::::::::IE:EPDEVV:F:::::H:::EL HVO_1537 S:A:A:ET:SSVSPH::V:T:::DPRSDATEAGDDDD:TDVTD::::::SA:E:HS:::I Hbo0008 TL:::DSTFEEMSPAL:YV:::::F::AH::::::::------VE:VE:PR:E:HA:::: consensus LMTRASDGLARQALDHEQARRIAEWADGDAHDALAALFGAADAAARAGADRITDADVDAG #oth 124.31512425235154425212.1..1.1.1.21143.157.6643554246432531 Hmu0321 :::::D:A:GQH::G::H:Q:L::::::::N:::::::V:::::L::ESEQ:E:THITT: Hbo1705 :TA:V:T::T:N:TT:Q:L::L:A:::::::::::::L::V:I:LDDDSGV:E:DHL::: VNG1964 VT::::LA:GQH:FTQQH:::::A:S::N::::::::AV::H::DS::RS:L::::IE:: HQ1731A ::Q:::M:::::::N:DL::QV:A::::N:::G::V::S:::N::GV:Q:QL:ESNIN:A HVO_2133 ::::V:AAGS:RT:::RL::D:::::::::::::V:::::::E:V:NQHRS::A:::AD: rrnAC0548 ::::T:N:::Q:G:::G:::H::D::::N:::::::::I::EL:EER:Q::::Q:N:::A Hmu1348 ::::::::::P:::S:::::T:::::::N:::::::::I:::D:SQREGT:VGQD::E:A hla2214 :TS:C:T::G:D::T:D:I:EVS:::::::::::::VT:::IT:E::::STVRPE:L:E: HVO_1537 :VA:::::V::S::P:VAT:EV::::::::::::S::Y:::TL::AD:::T:DTEY:C:: Hbo0008 :TR::::::V:DGI:::TVSEV:A::::::::G:::::S::VV:TDD::T::GSSH:A:: consensus IEAVPRPCVSLGRVLALPENRRRVLRELVALDPDDRSSVTAATEAIAA-PAVDLSPSTVK #oth 2341.43322.3211211332231.3423413444451.55124222366531..44.12 Hmu0321 :AD::TQA:::T::F::SADCLS:::::::::::RHPT:D::AA:::DRDPI:::TR::R Hbo1705 M:S:::::IA:::::T:S:::LT:::R:::::AT:::::GR:AST::-:S:AS::E::IT VNG1964 :QD:::GG:V:::P::VSDAKQ:::AA:LDT:AT-HG:::E:AD:VT:T:G:S::Q:::T HQ1731A ::SI:E:::::SA::S::A::Q::::H::N:S::E:E::NM::D:LS-:-:L:::A::I: HVO_2133 :A:::Q::::::::FS::::::Q::H::L::R::QQQ::R:TSQH::-:KS:::::T::: rrnAC0548 :AE::D::::::V::S::T::QT:::::ID:EESE::::::T:::::SAQS::::AG::: Hmu1348 ::QI:::S:::A::::::D:KQ:::::V:E::ST::E::::T::::::KAT:::::G::: hla2214 :::::::S:A:::::::S:S:::L:Y:::S:SD:::A::S::::T::SRK:::::::::R HVO_1537 :D:::DDGC:::::F::::S::::::AF::::DEETA::ST:::H:::S:R:S:::A::R Hbo0008 CD:::EDGCA::::F:::AS:::::AV:AS:::A:C::::V:AD::::H:S::::AA::: consensus RFLYELAEDGIVRRVRAE-RTDGKGRPPSRVEPRFPTTAFRRLYDAAR------------ #oth .4.1.2134.232.1645264433.1.121223212262.52.53464444333311111 Hmu0321 :::R:::T::VLE:T:SS:GESQA:T::ELL::::SPIL:K::::HT:SPGETTAASQSD Hbo1705 :Y:::F::S:::E::PVK:E:N:A::::::::T:V::R::L::TRG:D:::::::::::: VNG1964 :L::::SG::::E::::T:T::SA:::::::AV::AP::::::RAR:-:::::::::::: HQ1731A :::::M::A:VI:::Q:::TEQQ::::::::V:Q::LYV:Q::::LR:RGQSNHP::::: HVO_2133 :I:::::::::T:::T::::VER:::::::L::::::VV:E::FA:Q-:::::::::::: rrnAC0548 :::::M::S:V:D::E:T:V:N:Q::::::::::::P::::::::LQQ:::::::::::: Hmu1348 :Y:::M::G:::E::QSG:LES::::::::::L:::PA:::::::LE:G::::::::::: hla2214 :V:::::DA:LLD::T:R::S:::::::::LV:::::LV:QE:F:RPSWSV::::::::: HVO_1537 :V::::SDL::::::SDSDS:::P:::AT:PV:N:S:L:::G:D::E::::::::::::: Hbo0008 :V:::::D:::::::DTGLGD::P::::T:P::N::::V:D::GG:GDSVTRSER::::: consensus --------------- #oth 111111111111111 Hmu0321 GSITATAPSRTESER Hbo1705 ::::::::::::::: VNG1964 ::::::::::::::: HQ1731A ::::::::::::::: HVO_2133 ::::::::::::::: rrnAC0548 ::::::::::::::: Hmu1348 ::::::::::::::: hla2214 ::::::::::::::: HVO_1537 ::::::::::::::: Hbo0008 :::::::::::::::