| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4356 | VNG0637 | rrnAC2023 | Hmu0467 | NP2296A | Hut1394 | rrnAC1449 | Hmu1948 | hla2598 | HVO_0980 | Hbo0461 | HQ1639A | HVO_0968 | Hbo0976 |
| 3518 | VNG0637 | 4404 | 3043 | 2932 | 3296 | 3282 | 3273 | 3284 | 3388 | 3366 | 3306 | 3268 | 3144 | 3051 |
| 3301 | rrnAC2023 | 3043 | 4262 | 3374 | 3063 | 3069 | 3258 | 3211 | 3018 | 3076 | 3013 | 2984 | 3197 | 3133 |
| 3294 | Hmu0467 | 2932 | 3374 | 4159 | 3054 | 3124 | 3211 | 3268 | 3033 | 3048 | 3068 | 3074 | 3163 | 3158 |
| 3697 | NP2296A | 3296 | 3063 | 3054 | 4362 | 3417 | 3469 | 3460 | 3431 | 3488 | 3433 | 3278 | 3276 | 3113 |
| 3773 | Hut1394 | 3282 | 3069 | 3124 | 3417 | 4374 | 3731 | 3731 | 3470 | 3465 | 3429 | 3357 | 3249 | 3256 |
| 3798 | rrnAC1449 | 3273 | 3258 | 3211 | 3469 | 3731 | 4409 | 3816 | 3472 | 3454 | 3453 | 3333 | 3205 | 3235 |
| 3897 | Hmu1948 | 3284 | 3211 | 3268 | 3460 | 3731 | 3816 | 4419 | 3580 | 3518 | 3554 | 3438 | 3333 | 3315 |
| 3794 | hla2598 | 3388 | 3018 | 3033 | 3431 | 3470 | 3472 | 3580 | 4334 | 3624 | 3583 | 3535 | 3317 | 3269 |
| 3844 | HVO_0980 | 3366 | 3076 | 3048 | 3488 | 3465 | 3454 | 3518 | 3624 | 4339 | 3742 | 3617 | 3401 | 3271 |
| 3832 | Hbo0461 | 3306 | 3013 | 3068 | 3433 | 3429 | 3453 | 3554 | 3583 | 3742 | 4378 | 3856 | 3331 | 3294 |
| 3718 | HQ1639A | 3268 | 2984 | 3074 | 3278 | 3357 | 3333 | 3438 | 3535 | 3617 | 3856 | 4373 | 3253 | 3238 |
| 3612 | HVO_0968 | 3144 | 3197 | 3163 | 3276 | 3249 | 3205 | 3333 | 3317 | 3401 | 3331 | 3253 | 4423 | 3409 |
| 3517 | Hbo0976 | 3051 | 3133 | 3158 | 3113 | 3256 | 3235 | 3315 | 3269 | 3271 | 3294 | 3238 | 3409 | 4313 |
570 symbols consensus ----MSLEEPQPDT--DAG----AT-----LDYDELEALLGDHVLGREEHVNAPGFVIRP #oth 1111123465667776356111146643226463525622434124113.21.11421.1 VNG0637 ::::::TQQEDDTPDV:DA:::::PATPASGSPAA::::IE::::E::D:L::::::::A rrnAC2023 :::::AQTVHRT:-::---::::--:::::-:VHP:IEPIA::::ST:R:E:::AA:::A Hmu0467 ::::V---------::---::::--:::::--------:PESA:V:T:D:E:::AI:V:A NP2296A :::::::Q::AS:IGET:D::::GE:::::V::A:::::::E::ID::::::::A::V:: Hut1394 :::::::Q:RS:AEP::V:::::V:EDG::::::::AD:::::::D:::::::E:::::: rrnAC1449 ::::::::K:SR::AL:V:::::V:EDG::::::A:AD:::G:::D:::::::E:::::: Hmu1948 ::::::::::E:S:QL:V:::::V:DDG::::::QI:::ID:Y:I:::S::::E:::::: hla2598 ::::::::R:DS--:V:D::::::GE::::RTP:::::::::L:VD:DD:L::::::::: HVO_0980 :::::::::Q:S:DPAELE::::SGV::::SRG:::AE::::L:V:::::L::::L:::: Hbo0461 ::::::::K::DR:QSE:L:::::AK:P::TTG::IAE::::L:I::::::::::::::: HQ1639A ::::::::::E:TQSAEKT:::::EQLP::TTG::I:S::S:V:I::DD:L::::VI::: HVO_0968 MSTV::::R::QPPES::DPAAL:DDASGP::A:A:RRA:::A::AT::::H::AVQ::: Hbo0976 :::::::DTRSRELADE::::::--:::::--T:G:DT::S:LL:S:DD::H:::::V:: consensus DEVQDVLSTLRDEAGFDHLSCVTAQEYEDRYESIYHLKKYDDPTQEVSVVVPTPKDDPVS #oth .4.153.24.1341.2.2113.1.2.251.1.11..12312.1.2.2111..25344.21 VNG0637 :A::::::::KT::::::::::::E:H:::F::::::R::::::::::II:::SR:N::: rrnAC2023 ::::T::::::T:::L::CA:::::::A::F:T::::RR:A:::::L::::::ARES:T: Hmu0467 :A:ES:::::KT:::Y::CA:::::::G::F:T::::RT:::::D:L::::::LH:::H: NP2296A :::::::FA::::::::Y::N::::::::::::::::::::::::::G::::AA:GE::: Hut1394 :::E::::::KER:::::::A::::::D::::::::::::::::::L::::::SSEE::: rrnAC1449 ::::E:::::KE::::::CA:::::::D:::::::::R::N:::::L:I:::S:::::HN Hmu1948 :D::A:::::KT:::::FC::::::::Q::::::::::::::::::::::::S:R:::HN hla2598 :T::ET::I:KEQ::Y::::V:S:::::N::::::::::F::::::::::::AD:::::: HVO_0980 :::::A:FK::::::::::::::::::::::::::::T:F::R:D::::::::S::N::: Hbo0461 :D::ET:FR:::::::::::::::E:R::::::::::TS:::R:R:::::::AA::N:H: HQ1639A :D::KT:RR::NK:::::::::::D:RV:::::::::TS:::R:R:L::::::T:::::: HVO_0968 :A::SS::A:::DL:L:::::::::::::::::V::::S:::::R:A:::::::RS:::: Hbo0976 :N::ET:RR:::::::::::::::::::::::T:::M:S:::::D:::I:::::SNA::: consensus ESAAPVFRTADWHEREAYDLVGIEYDDHPDLRRILLPETWQGHPLSLDYDQDRPQIVTLR #oth 11135.13..3.........2.14.13..111.....2.......25311232..11323 VNG0637 :T:E::::::::::::::::::V::::::N:E:::::D:::::::G:::N:NK:::::FD rrnAC2023 :::V::YP::A::::::::::::::E::::::::::::::::::::R::N::Q::::SF: Hmu0467 ::G:G:YE::A:::::::::L::T:EG::::::::::::::::::RES:N::K::::PF: NP2296A QT:E::Y::::::::::::::::::EG:::M::::::::::::::G::::PEK::V:PF: Hut1394 Q:G:S::D::::::::::::::::::E:::::::::::::::::::NE:N:TQ::V:::: rrnAC1449 ::::R:YD:::::::::::::::D::::::::::::::::::::::Q::N::Q::::S:: Hmu1948 Q:G:D:YE:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N::K::::P:: hla2598 :::E::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::::M:::::::::AS:P HVO_0980 Q::E:::::::::::::::::::Q:E:::::::::::::::::::G::::::::::A::: Hbo0461 Q:GNA:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M:F::::::V:::K HQ1639A ::::::::::::::::::::I::N:E:::::::::::Q::::::::NN:::::::::::K HVO_0968 ::::::::::E::::::::::::Q:EN::::::::::::::::::G::::RT:::V:RYD Hbo0976 ::G::::E::G:::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::::::::PY: consensus EHANPLEDDHR--ADPDTMFLNIGPHHPATHGVLHVKTVLDGEQVADVEPDIGYLHRCEE #oth .2212133255256232.132.2.....1....1.24231...21122311..11..1.. VNG0637 ::K::::GHEQAAD:S::::::::::::::::::::E:::::::::::N::::::::::: rrnAC2023 ::ERL:::HRA::-G:E::HI:M:::::S::::::LNVQ:::::::A:D:::::I::::: Hmu0467 ::ERI:::RRS::-G::::H::M:::::S::::::LRVT::::T::::T:E::FI::::: NP2296A ::K:::QP:EH:S:ES:::L::V::::::::::::::A::::::I::::::::::::::: Hut1394 ::::::QE:KQSPQ::::::V:::::::::::::::::::::::IV:LD::::::::S:: rrnAC1449 ::::::K::K:SED::::::V:::::::::::::::E:::::::I::L:::::::::::: Hmu1948 ::::::Q::KQSPS::::::V::::::::::::::I::A:::::I::L:::::::::::: hla2598 ::::::QEH:K:D:ES:::::::::::::::::::L:::::::::V:::::::::::S:: HVO_0980 :::::::E::::AG:SN::YI:::::::::::::::E::V:::::V:L:S:::::::::: Hbo0461 :W::::K:::::DSEG:::Y::::::::::::::::::::::::::H::::::::::::: HQ1639A :WE:::AE::::EEEG:::YI:::::::::::::::::::::::I::ID::::::::::: HVO_0968 :N::::AE:G:::::TN::L:::::::::::::M:LQVT:::::::::::::::I::::: Hbo0976 :::::I:::S:::-:G::L:::V::::::::::::L:VT::::H:V:LD:E:::I::::: consensus QMCQQGTYRHQIMPYPDRWDYGSAGLLNEWAYARAAEDLADIDVPEYAQVIRTMGAELCR #oth .21142..............1522.1........1..212121..2...11..131.22. VNG0637 ::A:K:::::::::::::::::PG:I::::::::T::::::::::::::IL::::G:::: rrnAC2023 ::::::::::::::::::::W:G::::::::::::::A::::E::A:::::::::G::S: Hmu0467 :L::::::::::::::::::WSG::::::::::::::::IGV::::::::::::S:::S: NP2296A :::::S:::::::::::::::V:::I::::::::::::M:::E:::::::::::S::::: Hut1394 :::::::::::::::::::::TPG::::::::::::::::::::::::::L:::S:::T: rrnAC1449 :::::::::::::::::::::I:::I::::::::::::::::::::::::::::S::M:: Hmu1948 :::::::::::::::::::::I:::::::::::::::::::::::D:::::::::::MS: hla2598 ::A:S::::::::::::::::I::::::::::::::::::::E::::::::::::::M:: HVO_0980 :::::::::::::::::::::I:S::::::::::::::::::E::::::I:::::::::: Hbo0461 ::::TK:::::::::::::::A:S:::::::::::::::N:::::::::I:::::::::: HQ1639A :I:EAK:::::::::::::::A:S:::::::::::::::N:LE::::::::::::::I:: HVO_0968 ::::::::::::::::::::W:GG::::::::::T::A::::::::::::L::LA:::S: Hbo0976 ::::SK::::::::::::::W:GG::::::::::T::T::::::::::::::::T:::S: consensus IASHMLAVGTFALDVYGDFTAIFMYAIRDREIVQNILEDLTGQRLMFNYFRLGGVVWDLP #oth 112.21122112..2511..12.11131...52.11...1....1.1..1.....1..2. VNG0637 ::C::::L:::C::I:::::::::::M::::V::::::::::::M:L::L::::::::I: rrnAC2023 :L::::::A:Y::::V:E:::T:QWGV::::L::D::::::::::::::L:::::A:::: Hmu0467 :L::F::IAAYG:::ISE:::V:Q:G::::::::D::::::::::::::::::::A:::: NP2296A :::::::L:::::::F:::::V:Q::F::::V:::::::::::::::::L:::::A::V: Hut1394 ::A::::::::G::L:::::V:::::V::::V:::L:::::::::::::::::::A:::: rrnAC1449 ::::E::LA::::::F:::::V:Q:G:::::::::L:::::::::::::L:::::A:::: Hmu1948 ::A:::::S:::::IN:::::T:::G:::::V:::L:::::::::::::::::::A:::: hla2598 ::A::::LA:::::IN:::::T:::::N:::R:::L:::::::::::::::::::::::: HVO_0980 :::::I:L::::::::::::::::::M:::::::::::::::::M::::::::::::::: Hbo0461 ::::::::::::::::::::::::::M:::::I:::::::::::M::::::::::::::: HQ1639A ::::::::::::::::::::::::::M::::KA:::::::::::M::::::::::::::: HVO_0968 :L:::::::AY::::V:::::T::::M::::L:::::::::::::::::::::::::::: Hbo0976 ML::F:SI:AY::::T:::::T:::::::::QI::::::V:::::::::::::::::::: consensus EPREEFFEKIRDFLDDLPEKLEEYHDLITSNEILQMRTVDTGVLPPEVAKSYGATGPVAR #oth ...321212215.313..3325.1111213..11.3.213..3.22241.4..2...... VNG0637 :::A::::SV:::::E:::R:D::S::::::::F:A:::N::::DY:T::D::V:::::: rrnAC2023 ::::A::::::A::::::H::T::::ML:::::::L::I:::H:SA:T::A::C:::::: Hmu0467 ::::T:C:TV:S::::::Q::::::::L:G:::::::::::::::::T::A::C:::::: NP2296A ::::A:::::::::::::::TK:::N:::::::F:A:C:N::E:::A:::Q::::::::: Hut1394 :::Q:YL::V:E:T:E:::R:::::::::G:::F:::CI::::::::::::::::::::: rrnAC1449 :::::Y::::::::::::H::::I:::V:G:::F:::C::::::S:DQV:Q::::::::: Hmu1948 :::::Y:::V:::V:G:::::T:::::L:N:::::::::::::::::D:::::::::::: hla2598 :::D:::S:T:::::H:::SV::::N:::::::F::::I:::I:::::::N::::::::: HVO_0980 :::::::::::::M:G::QA::::::M::::::::A:::G::::S::::::::::::::: Hbo0461 ::::::::::::::::::TA::::::::S::::::V::I::::::::::::::::::::: HQ1639A :::D::::T:::::E:::TA::::::::S::::::V::I::::::::E:::::::::::: HVO_0968 :::::::::::T:V:G:::::R:::::L:A:::::A:::E::I:::::::D::V:::::: Hbo0976 :::::::::VYN:V:G::Q::A:::::L:G::V::L:S::::I::A:::::::C:::::: consensus GSGIDYDLRRDDPYGYYDELDWDVVTEDGCDNFSRLLVRMREVEESAKIIEQCVDLLEDW #oth 1..112.2....1....3..1.2.21.212..11.1...12.1.1..2.14..211.13. VNG0637 :::V:::V:::::::::P:::::::::::G::Y:::::::E:::Q::R::::::::::G: rrnAC2023 A::V::::::::::::::::::S::::Q:G:::::::::L::::::::::G::::::::: Hmu0467 :::V:C:::::::::::::::::::::::::::::V:::L::I:::::::::::::::E: NP2296A :::::I:::::::::::E::::::::::::::Y::V::::::::::::::::::::::E: Hut1394 :::V:::::::::::::::::::::::::M::YA:V:::LQ:::::::::R::L:::::: rrnAC1449 :::V:::I::::::::::::::N::::Q:G:::::V:::L:::::::R::::::::::Q: Hmu1948 :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla2598 :::V::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0980 ::::::::::::S:::::::E::::V::::::::::::::::::::::::Q::::::::: Hbo0461 ::::::::::::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::Q::::::::: HQ1639A :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:::::::::::::::I::G: HVO_0968 ::::::::::::::::::::::S:AV:::::::A:::::L:::::::T:VA::::::::: Hbo0976 ::::E::::::::::::N::::N::::PDG::::::::::::I::::R:V:::AE::A:: consensus PEDDRTIQANVPRTLRPDDDTEIYRAVEGAKGELGIYIRSDGTDKPARFKIRSPCFSNLQ #oth .1.1.3..2.....21.1413.2..3..1......1.1.2...12.1.....1.1.1112 VNG0637 :::E:D:::::::::K:EAG::T::T:::::::::V:::A:::E::G::::::::::::S rrnAC2023 :::::E::::::::::::P:::::::::A::::::::::::::ET:::::::G:S::HV: Hmu0467 ::::::::G:::::V:::R:A:::::::A:::::::::::::::T:::::::G:S::::: NP2296A :::::E::S::::::K::P:::V::G::A::::::::M:A::::::::::::::::C::H Hut1394 ::::::::S:::::::::P:K:V::::::::::::::::::::::::::::::::::::: rrnAC1449 :::::E::::::::::::P:K::::S:::::::::::::::::::::::::::::::::: Hmu1948 :::E:E::::::::::::P:R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::H hla2598 :::E:N:::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::: HVO_0980 :::E:N:::::::::K::E::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::: Hbo0461 :::E::::S::::::::E::K:::::::A::::::::::G::::::G::::::::::::: HQ1639A :::E::::S:::::::::::A::::::::::::::::::G:::EE:G::::::::::::: HVO_0968 :D:::::::::::::K::::::V:::::A::::::::::A::::T:::::::G:S::::: Hbo0976 ::::::::S:::::I:::::::V::::::::::::::::::::E::::::::G:S::::: consensus TLPEMSEGEYIPDLIASLGSLDIVLGEVDR #oth 2.42125.111..21.21....211..... VNG0637 A:K:::T:::::::V:T:::::VI:::::: rrnAC2023 A:S::AR:::V:::V:TI::::TIM::::: Hmu0467 S::::A::::::::V::I::::TIM::::: NP2296A ::R::T:::::::::::::::::::::::: Hut1394 :::V:::::::::MV::::::::::::::: rrnAC1449 ::::::Q::::::M:::::::::::::::: Hmu1948 :::T:::::::::M:::::::::::::::: hla2598 :::::AN::::::VV:A::::::::::::: HVO_0980 :::::::::::::M:::::::::::::::: Hbo0461 ::G:::N::::::M:::::::::::::::: HQ1639A ::::::S::::::MV::::::::::::::: HVO_0968 S::::A::::::::::A:::::TIM::::: Hbo0976 A:::IA::GL::::::::::::TIM:::::