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[M] (MscS) COG0668 Small-conductance mechanosensitive channel
9 genomes BUD0418 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1388

rrnAC1105

HVO_1659

Hbo3177

Hmu1615

Hut0988

hla1820

NP4196A

HQ2562A

Pairwise sequence scores
Consensus score1882 NP4196A Hut0988 rrnAC1105 Hmu1615 VNG1388 HQ2562A HVO_1659 Hbo3177 hla1820
1178NP4196A 1885 856 933 930 729 807 816 901 875
1221Hut0988 856 1874 1082 1080 761 890 899 922 940
1231rrnAC1105 933 1082 1923 1110 766 788 872 939 925
1175Hmu1615 930 1080 1110 1893 727 782 780 848 856
968VNG1388 729 761 766 727 1846 772 734 763 898
1164HQ2562A 807 890 788 782 772 1886 947 1065 1000
1147HVO_1659 816 899 872 780 734 947 2112 1181 1010
1326Hbo3177 901 922 939 848 763 1065 1181 2012 1106
1250hla1820 875 940 925 856 898 1000 1010 1106 1871

300 symbols
consensus       ------------------------------------PLQDWPAVLRTLF-SPPQAIWVAL
#oth            111111111111111111222221222222223345457445553454225547654323
NP4196A         ::::::::::::::::::::::::::::::::MVDL::RS:FEG:P---:T:G:NLL::A
Hut0988         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::-MV:I:DLI::::::EET:VV::I
rrnAC1105       ::::::::::::::::::::::::::::::::::MQFGF::ATII:QV::::QGTFVFS:
Hmu1615         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MQL::::IV:S::::REAVTA::I
VNG1388         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::----MTD:::::V:G:HFEYGL:T
HQ2562A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::MWV::SF:P:A:DFVAAV:::::::I
HVO_1659        MPGFASASLIHSSVGSASTAALTSASASASASASAA:::TVGG:VDDIVRIAGLRFLGV:
Hbo3177         ::::::::::::::::::MLLMQSGDRTPTSGPATS:ADSFL:E:Y::::--:RDV:F::
hla1820         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::-MSAV:TP:SEFVA:V:DR::L::

consensus       LVLLAGLVAAYLVGRITRRLLRAAGVPEAVEGTAFERTARRFGTSTVGLLARLVRYFVYA
#oth            611441432232424453231563111221...32..11253111..4132624332143
NP4196A         G::V:::::GA:TAYLVS:A:::F::DD:::::P::::::QL:::::R:::::CGL::FV
Hut0988         F::FI:T:LS:::W:M:HSV:EQ::I:::::::V::::LQNV:F:::::V:Q:AAI::::
rrnAC1105       V::AF:I:LG:::W:SS::FM:EL:::::::::P::::::GL::::::IVSN:AAL:I:I
Hmu1615         SI:VL:VLL:::SW:YMHYF:SD::ID::::::::::::Q:::::::::I:T::GISI:I
VNG1388         ::::C:A::G::::W:H::VML::::D:I::::TV::L:::S::T::D:T::F:STV::I
HQ2562A         ::FI:SV:::VIT::::T:::LQLNI:TVI::::L::::QE::::::N:ISGI::::II:
HVO_1659        AI::L:::L::VA:TLVH:::VSV:::::I::::::::::D:D::::EI:SW:T::::LG
Hbo3177         I::V::VAV:LIL:TL:::V:TGL:::::I::::::::::N:D::::EI:GW::::::VG
hla1820         F:::F::F:::V::A:N::::TR:::::VI:::::::::HE:D::::RI::K:SS::IL:

consensus       VAILAALSVAQVNYAEAFWSRFVAFLPQLFVALLVLIVGLIVGDKAELLVAERLRSIKLP
#oth            4334532543435464531554532.15113.322233.2231..1215.4.11131.2.
NP4196A         ::A:Y:GQ:LE:MPE::ALE:IS:::::::::V::IL::::AA:::::V:S:::K:::::
Hut0988         L::FI:IQT::L::PTQ::AG:S:Y:S:::I:A:AV:A:::L::::S:A:S:::::::::
rrnAC1105       TTVT:V:NI::LTDP:LY:A::TS:::D::I::FAV:I:::A::::K:I:S:::::V:M:
Hmu1615         G:M:L:GA:S:RFRDVSL::P:::Y::N:::::FA:MI:::A::::K:S:G:KF::::::
VNG1388         ::V:V::DA::FSIQKPL:RLLGSI::SVLA:VV:VV::VL::::V:VF:T:::::V:F:
HQ2562A         :GAVGS:::TDLQ:GT:L:QEA:Q:::RV::::::VLT:ILI:::V::F:D::::Q::::
HVO_1659        IS:F:T::F:G::::DR::GLVI:I:::::I:I::::I:VV::::V:::::::::AV:::
Hbo3177         I:::::::I:N::::DR:::QV:E:::M::F:VVI::::IV::::V:::::::::GV:::
hla1820         ::VIV::T::D:::L:Q:::GVA::::R::::IV:::::VV::::::::::::::G::::

consensus       EATVLPALVKYSIFYLAALVALSQLGVATLALLVLLAAYAFGVVFLGGLAFKDLLASGAA
#oth            1352225111212323.4.1..1.11.215..212121.2222332222.23221411.1
NP4196A         :V:LI:T:::V::L:V:::I:::::::::G:::I:::::::::F:::::::::::S:A::
Hut0988         QIY::AP::::::::V::::::G::::::T::::::SV:V::IL::::::::H:::A:::
rrnAC1105       ::::::E::::::::::V:I::G::::E:::::I::G:::::L::VC:::L::I:QA:::
Hmu1615         ::EL::E::::::IF::G::::G::::::E:::I::::::::L:::::::::Q::SA:::
VNG1388         ::S:VAVAAR:TVVLA:G::::::::::VA::::VFGV:LAS::VFALV:TRQ::::A::
HQ2562A         :I:IISR:A:FTT::I::::::::::::::::V::::V:L:A::AFAAV::V:::K:A:V
HVO_1659        QVNI::::A::TV:F::T::::::VR::::::I:::G::LL:LIVF:AV::R:::R::::
Hbo3177         QIGII::AA:FTV::::S:I:::::::::M::VIF::::L:AI:::::I::A:M:K::::
hla1820         :LG:::P:::::VV:V:::I::G:V::Q::::V:::G:::LA::LFAA::T:::V::A::

consensus       GTYLLLTQPYSIGDEVRIGDRRGIVQEVDLFVTHVEADGEEYIIPNRRVFRDGIVRVR--
#oth            .3111231..2...11313354.1...2.31..21.3123.321..641166.2323142
NP4196A         :I:V:M:E::::::::A:DGC::::::::V:::Y:::E::::M::::K:L:E:AM:::SG
Hut0988         :I::::SE::::::::E::::::V:::I:M::::::N:DA:F:V::Q:::QS:VT:F:::
rrnAC1105       :L:::::E:::::::IV:::QS:::::::IL::RI:S:::::::::K:::NT::::I:G:
Hmu1615         :V::V:S:::::::::::QGQQ:::::::V::::I:SE::::VV::DQ::AG::::I:G:
VNG1388         :V::::R:::G:::Q:A::S:E:V:::::V:::RI:::SR::V:::HL:::::::I:HHQ
HQ2562A         ::::::H:::A:::::E:::T::::::I::::::::NED::L::::TLI:KR::::::::
HVO_1659        :::::F:::::::::IVV:EV::V:::F:M::::::SEDT:FV:::A::LDK:VG:::::
Hbo3177         ::::::::::A::::I:V::TG::::::::::::::D::::::V:::K::EE::::L:::
hla1820         :VF:::R:::G::::::VAGE::::::::::::RI::::::HVV::HS:::::::LI:E: