|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 1882 | NP4196A | Hut0988 | rrnAC1105 | Hmu1615 | VNG1388 | HQ2562A | HVO_1659 | Hbo3177 | hla1820 |
1178 | NP4196A | 1885 | 856 | 933 | 930 | 729 | 807 | 816 | 901 | 875 |
1221 | Hut0988 | 856 | 1874 | 1082 | 1080 | 761 | 890 | 899 | 922 | 940 |
1231 | rrnAC1105 | 933 | 1082 | 1923 | 1110 | 766 | 788 | 872 | 939 | 925 |
1175 | Hmu1615 | 930 | 1080 | 1110 | 1893 | 727 | 782 | 780 | 848 | 856 |
968 | VNG1388 | 729 | 761 | 766 | 727 | 1846 | 772 | 734 | 763 | 898 |
1164 | HQ2562A | 807 | 890 | 788 | 782 | 772 | 1886 | 947 | 1065 | 1000 |
1147 | HVO_1659 | 816 | 899 | 872 | 780 | 734 | 947 | 2112 | 1181 | 1010 |
1326 | Hbo3177 | 901 | 922 | 939 | 848 | 763 | 1065 | 1181 | 2012 | 1106 |
1250 | hla1820 | 875 | 940 | 925 | 856 | 898 | 1000 | 1010 | 1106 | 1871 |
300 symbols consensus ------------------------------------PLQDWPAVLRTLF-SPPQAIWVAL #oth 111111111111111111222221222222223345457445553454225547654323 NP4196A ::::::::::::::::::::::::::::::::MVDL::RS:FEG:P---:T:G:NLL::A Hut0988 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::-MV:I:DLI::::::EET:VV::I rrnAC1105 ::::::::::::::::::::::::::::::::::MQFGF::ATII:QV::::QGTFVFS: Hmu1615 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::MQL::::IV:S::::REAVTA::I VNG1388 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::----MTD:::::V:G:HFEYGL:T HQ2562A ::::::::::::::::::::::::::::::::::MWV::SF:P:A:DFVAAV:::::::I HVO_1659 MPGFASASLIHSSVGSASTAALTSASASASASASAA:::TVGG:VDDIVRIAGLRFLGV: Hbo3177 ::::::::::::::::::MLLMQSGDRTPTSGPATS:ADSFL:E:Y::::--:RDV:F:: hla1820 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::-MSAV:TP:SEFVA:V:DR::L:: consensus LVLLAGLVAAYLVGRITRRLLRAAGVPEAVEGTAFERTARRFGTSTVGLLARLVRYFVYA #oth 611441432232424453231563111221...32..11253111..4132624332143 NP4196A G::V:::::GA:TAYLVS:A:::F::DD:::::P::::::QL:::::R:::::CGL::FV Hut0988 F::FI:T:LS:::W:M:HSV:EQ::I:::::::V::::LQNV:F:::::V:Q:AAI:::: rrnAC1105 V::AF:I:LG:::W:SS::FM:EL:::::::::P::::::GL::::::IVSN:AAL:I:I Hmu1615 SI:VL:VLL:::SW:YMHYF:SD::ID::::::::::::Q:::::::::I:T::GISI:I VNG1388 ::::C:A::G::::W:H::VML::::D:I::::TV::L:::S::T::D:T::F:STV::I HQ2562A ::FI:SV:::VIT::::T:::LQLNI:TVI::::L::::QE::::::N:ISGI::::II: HVO_1659 AI::L:::L::VA:TLVH:::VSV:::::I::::::::::D:D::::EI:SW:T::::LG Hbo3177 I::V::VAV:LIL:TL:::V:TGL:::::I::::::::::N:D::::EI:GW::::::VG hla1820 F:::F::F:::V::A:N::::TR:::::VI:::::::::HE:D::::RI::K:SS::IL: consensus VAILAALSVAQVNYAEAFWSRFVAFLPQLFVALLVLIVGLIVGDKAELLVAERLRSIKLP #oth 4334532543435464531554532.15113.322233.2231..1215.4.11131.2. NP4196A ::A:Y:GQ:LE:MPE::ALE:IS:::::::::V::IL::::AA:::::V:S:::K::::: Hut0988 L::FI:IQT::L::PTQ::AG:S:Y:S:::I:A:AV:A:::L::::S:A:S::::::::: rrnAC1105 TTVT:V:NI::LTDP:LY:A::TS:::D::I::FAV:I:::A::::K:I:S:::::V:M: Hmu1615 G:M:L:GA:S:RFRDVSL::P:::Y::N:::::FA:MI:::A::::K:S:G:KF:::::: VNG1388 ::V:V::DA::FSIQKPL:RLLGSI::SVLA:VV:VV::VL::::V:VF:T:::::V:F: HQ2562A :GAVGS:::TDLQ:GT:L:QEA:Q:::RV::::::VLT:ILI:::V::F:D::::Q:::: HVO_1659 IS:F:T::F:G::::DR::GLVI:I:::::I:I::::I:VV::::V:::::::::AV::: Hbo3177 I:::::::I:N::::DR:::QV:E:::M::F:VVI::::IV::::V:::::::::GV::: hla1820 ::VIV::T::D:::L:Q:::GVA::::R::::IV:::::VV::::::::::::::G:::: consensus EATVLPALVKYSIFYLAALVALSQLGVATLALLVLLAAYAFGVVFLGGLAFKDLLASGAA #oth 1352225111212323.4.1..1.11.215..212121.2222332222.23221411.1 NP4196A :V:LI:T:::V::L:V:::I:::::::::G:::I:::::::::F:::::::::::S:A:: Hut0988 QIY::AP::::::::V::::::G::::::T::::::SV:V::IL::::::::H:::A::: rrnAC1105 ::::::E::::::::::V:I::G::::E:::::I::G:::::L::VC:::L::I:QA::: Hmu1615 ::EL::E::::::IF::G::::G::::::E:::I::::::::L:::::::::Q::SA::: VNG1388 ::S:VAVAAR:TVVLA:G::::::::::VA::::VFGV:LAS::VFALV:TRQ::::A:: HQ2562A :I:IISR:A:FTT::I::::::::::::::::V::::V:L:A::AFAAV::V:::K:A:V HVO_1659 QVNI::::A::TV:F::T::::::VR::::::I:::G::LL:LIVF:AV::R:::R:::: Hbo3177 QIGII::AA:FTV::::S:I:::::::::M::VIF::::L:AI:::::I::A:M:K:::: hla1820 :LG:::P:::::VV:V:::I::G:V::Q::::V:::G:::LA::LFAA::T:::V::A:: consensus GTYLLLTQPYSIGDEVRIGDRRGIVQEVDLFVTHVEADGEEYIIPNRRVFRDGIVRVR-- #oth .3111231..2...11313354.1...2.31..21.3123.321..641166.2323142 NP4196A :I:V:M:E::::::::A:DGC::::::::V:::Y:::E::::M::::K:L:E:AM:::SG Hut0988 :I::::SE::::::::E::::::V:::I:M::::::N:DA:F:V::Q:::QS:VT:F::: rrnAC1105 :L:::::E:::::::IV:::QS:::::::IL::RI:S:::::::::K:::NT::::I:G: Hmu1615 :V::V:S:::::::::::QGQQ:::::::V::::I:SE::::VV::DQ::AG::::I:G: VNG1388 :V::::R:::G:::Q:A::S:E:V:::::V:::RI:::SR::V:::HL:::::::I:HHQ HQ2562A ::::::H:::A:::::E:::T::::::I::::::::NED::L::::TLI:KR:::::::: HVO_1659 :::::F:::::::::IVV:EV::V:::F:M::::::SEDT:FV:::A::LDK:VG::::: Hbo3177 ::::::::::A::::I:V::TG::::::::::::::D::::::V:::K::EE::::L::: hla1820 :VF:::R:::G::::::VAGE::::::::::::RI::::::HVV::HS:::::::LI:E: