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[L] (-) COG0675 Transposase and inactivated derivatives
8 genomes BUD0938 27 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0042

pNG5130

rrnAC1565

HVO_2075

HVO_2434

Hbo0174

Hbo0193

Hbo1310

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Hbo1889

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Hmu1823

-

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hla0747

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hla2716

NP6224A

NP6268A

HQ1012A

HQ1356A

HQ2051A

HQ2072A

HQ2549A

HQ2728A

HQ3062A

HQ3077A

Pairwise sequence scores
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506 symbols
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hla1653         L::A:::::::::WTCS:I::KIDH::T:N::TTY::N::::D:::::::::::Q:::::

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hla0747         :QS:FDL:Q:K::T::::::::::::::::::::::R:::::SF:ED:F:::PD::::::
HVO_2434        :T::FK::KN::TD::::::::R::::::::::::N::::::::::H::::::S:::L::
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HVO_2075        :::S::::::HF::::::::Q:::::::LSE::S::N:::::::::::::::F::::SL:
hla0747         :::S:::G:::W:::L::::Q:::::::LSE:NS::N:::::::::::::::F::::KLK
HVO_2434        :::F:::S::HR::::::::::::::T:::::::I::::::::::::R:::::::::::P
Hbo1310         :::F::::::SR:::::A::::::::E:::::::I:::::::::::::::::::::T::P
Hmu1823         :::F::::::SR:::::A::::::::E::::::HI:::::::::::::::::::::K::P
Hbo0193         :::F:::D::GR:::::A::::::::Q:::::::I::::G:::::::::V:::::::::P
Hbo1671         :::F::::::SR:::::AK:::::::E:::::::I:::::::::::::::::::::T::P
Hbo0174         :::F::::::SR:::::A::::::::E:::::::I:::::::::::::::::::::K::P
Hbo3401         :::F::::::SR:::::A::::::::E:::::::I:::::::::::::::::::::K::P
HQ3077A         :::::H::HPK:WEY::V::::::GIT:::::::I::::S:YDQHKER::::::::N:::
pNG5130         :::::H::HPK:WEY::V::::::G:E:::::::L::::::YDQTKER::::::::E:::
HQ2051A         :::::H:QHPR:WEY::V::::::G:T:::::::L::::::YDKAKRR::::::::H:V:
hla0181         :::::H::HPR:WEY::V::::::G:T:::::::L::::::YDSTKER::::::::D:::
hla2716         :::::H::HPR:WEY::V::::::G:T:::::::L::::::YDSTKER::::::::D:::
Hbo1889         :::::H::HPR:WEY::V::::::G:T:::::::L::::::YDQSKER::::::::D:::
HQ1356A         :::::H:QHPK:WEY::V:::::SS:T::::::::::::::YDKAKQR::::::::H:::
HQ2072A         :::::H:QHPK:WEY::I::::A:G:I:::::::L::::::YDKAKQR::::::::H::G
NP6224A         :::T:M::SR::A:Y:::::TLQT:EQTLNA::S::T:::::TD::EQ::::F:::MRV:
NP6268A         :::M:M::SR::A:Y:::::TLQT:EQTLDA::S::T:::::T:::E:::::F:::MRV:
Hbo2146         :::R:::K::HR::::::::Q::::::::LTAWDI::::::YKH:::::R:QF::RTT:D
HQ3062A         :::R::::::HR::::::::Q::::::::LTEWDI::::::YKR:::::R:QF::RTI:D
rrnAC1565       :::E:::::::W:::V::DIQI::::::LSAI:S:::::::::KQRN:::::V::N:TVD
VNG0042         :::S:::::::W:::V::::QI::::::LST::::::::S::T:::::::::F:::::V:
HQ2549A         :Q:::::N:::W::::::TFH:::::::LST::T::::K:::T::::::::RF:::::::
HQ2728A         :Q:::::N:::W::::::TFH:::::::LST::T::::K:::T:::::::::F:::::::
HQ1012A         :::S:::D:::W::::::::Q:::::::LST::::::::I::T:::T:::::F::::Q:D
hla1653         :::S:::::::W:::V::K:Q:::::::LST:::::::KI::T:::::::::F::::::D

consensus       TPDAPGNETAGIDLGISNFAAVAYEDGESELYPGNRLKQDKYYFTKE--IAECDDSPSER
#oth            4534323421.1....4.311222353453..11141.1.41.14281151612124154
HVO_2075        :N:SA:DKV:::::::K:I:T::F-SD:YV:::::S:::::H:::RAEYDT:GENG::::
hla0747         :N:ST:::V:::::::T:I:T::F-PD:YV:::::SI::::H::KRSEYDT:GKNG::NK
HVO_2434        VE::::DNA:::::::K:YL:I::D:::A:::S::V:::::H:::RDEYDT:GENG::R:
Hbo1310         VE:::::N::::::::::YL:ID::::::::::::V::E::H:::R:EYQT:GENG::K:
Hmu1823         IE::::DA::::::::::YL:ID::N:P:::::::V::E::H:::R:EYQT:GENG::K:
Hbo0193         VET:::DN::::::::::YL:ID::::AN::::::V::E::H:::R:EYQT:GEN:::K:
Hbo1671         VE:::::N::::::::::YL:ID::::P:::::::V::E::H:::R:EYQT:GENG::K:
Hbo0174         VE:::::N::::::::::YL:ID::::::::::::V::E::H:::R:EYQT:GENG::K:
Hbo3401         VE:::::N::::::::::YL:ID::::::::::::V::E::H:::R:EYQT:GENG::K:
HQ3077A         ::::::T:::::::::::::::::STEDAD::::::::::G:::P::::::T:::AGGN:
pNG5130         ::::::T:::::::::::::::::STEDAD::::::::::G:::P::::::N::::SGD:
HQ2051A         ::::::::::::::::C:::::::STE:A:::::::::::G:::P::::::T::::GGQE
hla0181         ::N::::::::V::::::::::::STEDAD::::::::::G:::P::::::K::::GGD:
hla2716         ::N:::::::::::::::::::::STEDAD::::::::::G:::P::::::K::::GGD:
Hbo1889         A:T:::T:::::::::C:::::::STE:AD::::::::::G:::P::::::K::::GGD:
HQ1356A         ::T:::T:::::::::C:::::::STE:AD::::::::::G:::P::::::K::::GG:E
HQ2072A         ::::::T:::::::::C:::::::STE:AD::::::::::G:::P::::::K::::GGD:
NP6224A         ::ET::EK:::V::::C:T::ISV-GD:TL:::::A::E:AH::RQQEYETAGENG::DH
NP6268A         ::ET::EK:::V::::C:T::ISV-GD:TL:::::S::E:AH::RQQEYET:GENG::DH
Hbo2146         -:EP::D:V::V::::C:::::SF-G:::V::::GA::E:E:::::K::K:K::::S:RE
HQ3062A         -:EP::DDV::V::::C:::::SF-G:::V::::GA::E:E:::::K::K:K::::S:RE
rrnAC1565       I:ENSAEK:V::::::C::::L:F:NQ::::::L:C::::D::YS:H::::R::::S::E
VNG0042         VSES::EK:V:V::::N::::L:::::H:::::L:C::::D:::S:R::L:Q::::D::Q
HQ2549A         ASES::EK:V:V::::K::::L:::::H:::::L:C::::D:::S:R::::R::::N::Q
HQ2728A         ASES::EK:V:V::::K::::L:::::H:::::L:C::::D:::S:R::::R::::N::Q
HQ1012A         VAE::SEN:V:V::::N::::L:::::HG::::L:C::::D:::S:R::::R::::N::Q
hla1653         VDE:::EK:V:V::::N::::L:::::H:::::L:C::::D:::S:L::::R::N:D::Q

consensus       ATRLRQKLSRRRTHFFHTLSKHIVERCVEEGVGTIAVGDLSGIREDENG--ESKNWGKHG
#oth            3431452325.33.12.31224.143.2243114121141421.33245125422..532
HVO_2075        LMWA:R::AE:E:::Y:::TDT:ITE:A:R::::L::SWPEDV:DSD--::----:::T:
hla0747         S:WA:R::AD:E:::::V::DT:ITE:::R::::L::SWPEDV:DSD--::----:::T:
HVO_2434        :L:A:::::::KD::L:A:::::::Q:IDHE::R:::::::D:::::::::D:R:::TRR
Hbo1310         :RKA:::::::KD::L::::::::::::::::EK:::::::D:::N:::::D:R:::ASE
Hmu1823         :RKA:R:::::KD::L:::::::::Q:::::::K:::::::D:::G:::::D:R:::PS:
Hbo0193         :RKA::R::::KD::L::::::::::::::::EK:::::::D:::::::::D:R:::AS:
Hbo1671         :RKA:::::::KD::L::::::::::::::::EK:::::::D:::N:::::D:R:::ASE
Hbo0174         :RKA:::::::KD::L::::::::::::::::EK:::::::D:::::::::D:R:::AS:
Hbo3401         :RKA:::::::KD::L::::::::::::::::EK:::::::D:::::::::D:R:::AS:
HQ3077A         ::N:QK:W:E:::::::S:A:::::::::N:::R:NI:::E:V::::D:::S::::::::
pNG5130         ::::HH:W:E:::::::S:A:::::K:I:RS::R:N::::E:::::::A::K:::::R::
HQ2051A         ::::HA:W:E:::::::S:A::::Q::I:N:::H:N::K:A:V:::D::NGN::::::::
hla0181         ::::HH:WAE:::::::S:A:::::::::KE::R:N::::E:V::::::::S::::::::
hla2716         ::::HH:WAE:::::::S:A:::::::::KE::R:N::::E:V::::::::S::::::::
Hbo1889         ::::HH:W:E:::::::S:A:::::K:I:R:::R:N::K:A:V:::::::::::::::::
HQ1356A         ::::HA:W:E:::::::S:AT::::::I:NS::R:NI:K:A:V:::N::NGN::::::::
HQ2072A         ::::HA:W:E:::::::S:AT::::::I:N:::R:NI:K:A:V::::T::::::::::::
NP6224A         :EWA:::K:::QA::L:AV::D:::Q:AGRN:::::::HPKN:::::D-::----::R::
NP6268A         :EWA:::K:::QE::L:A:::D::QQ:ADR::::::::HPKN:::::D-::----::R::
Hbo2146         ::::DR:RAG:::::L:A:::S::NE:::R::::LV::::G:::::DEN:G:PR:::D::
HQ3062A         ::::DRTRTG:::::L:A:::V::AE:::R::::LV::::G:::::DES:G::R:::D::
rrnAC1565       ::::HA:K:N::::Y:::::::::::::D:N::V::I::::::::::D::::M:D:::::
VNG0042         ::::NE:K:A::::Y:::::::::Q:::D:::::::::::::V::::EN:G:::::::::
HQ2549A         V:::NH:K:A::::Y::::::::::::::::::::V::N::D::V::ET:N:A::::R::
HQ2728A         V:::NH:K:A::::Y::::::::::::::::::::V::N::D::L::ET:N:A::::R::
HQ1012A         ::::NH:K:A::::Y::::::::::::::::::::V::::::::::DDT:NK::::::::
hla1653         ::::N::K:A::::Y:::::::::Q:::D:EI:::V:::::::::::EN:G:::::::::

consensus       NLDLHGWAFDRFTSLLEYKAEEEGIEVEEVSER--DTSKTCSCCGRKRDSNRVERGLYVC
#oth            .12..3.1.31257413113375225375431411311231261.7555431321.111.
HVO_2075        :KK::T:::::IYQY::::GKIR:V::LKEN:W:::::::::R::DDTKG::KH::::::
hla0747         :KK::T:::::IYQY::::G::R:V::LKEN:W:::::::::R::DDTT:::::::::::
HVO_2434        :KK::::E:::::R::::::::H::L:DRK::::::::::::::::::EAK:::::::::
Hbo1310         :KK::::E::::AR::NTRPRNTASSLTVWTR:::TPRRRVRVA::FGIATAWSE:---:
Hmu1823         :KK::::E:G::AR::::::::H::L:DR:D:E::N:::::::::QI:A:::::::::::
Hbo0193         :KK::::E:::::R::::::::H::L:DR:D:E::N:::::::::KI:::::M:::::::
Hbo1671         :KK::::E::::AR::::::::H::L:DR:D:E::N:::::::::KI:::::::::::::
Hbo0174         :KK::::E:N:::N::::::::Y::L:DR:D:E::N:::::::::KI:::::::::::::
Hbo3401         :KK::::E:N:::N::::::::Y::L:DR:D:E::N:::::::::KI:::::::::::::
HQ3077A         ::::::::::::::I:::::KG:::KIV::D::::::::A:CV:::TDENQ:::::::::
pNG5130         ::::::::::::::I:::::KV:::::M:::::::::::::CV:::ED::Q:::::::::
HQ2051A         ::::::::::::SNI:::::KV:::::G:::::::::::::CV::::D::Q:::::::::
hla0181         ::::::::::::S:I:::::RV:::::L:::::::::::::CT::KTD::Q::H::::::
hla2716         ::::::::::::S:I:::::RV:::::L:::::::::::::CT::KTD::Q::H::::::
Hbo1889         :::::::::::::KI:T:::KV:::D:V:::::::::::::CV::::D::Q:::::::::
HQ1356A         ::::::::::::SNI:::::KV:::::G::::H:::::N::CV::::DE:Q:::::::::
HQ2072A         ::::::::::::SNI:::::KG:::::V:::::::::::::CV:::TDE:Q:::::::::
NP6224A         :KR::D:::ETLL:H:::::Q:R::D::R:D:AGLK:::::CE::TEA::::::::::::
NP6268A         :KR::D:::ETLL:HI::::Q:R::D::R:D:AGLK:::::CE::AEA::::::::::::
Hbo2146         :::::::::::::T::D::::A:::D::L::::::::::S::A::HTD:NQ:::::::::
HQ3062A         :::::::::::::T::D::::A:::T::QE:::::::::S::V::HTDKNQ:::::::::
rrnAC1565       :::::S:::::::DM:::::::V::S:KR:::E::N:::S::S::CE::T::::::::::
VNG0042         :::::S:::::::D:::::::M:::S:::::::::::::S::::::T::A::::::::::
HQ2549A         :::::S::::::RK::T::S:T:D:T::QE:::::::::S:::::::::G::::::::::
HQ2728A         :::::S::::::RK::T::S:T:D:T::QE:::::::::S:::::::::G::::::::::
HQ1012A         :::::S:::::::D:::::::M:::T:::A::E::::::S:::::::::A::::::::::
hla1653         :::::S:::::::G:::::::M:::TF:Q::::::::::S:::::::HEA::::::::::

consensus       ESCDT--------------VANADVNGAENIR------QKVSPSPPTL-GDRSNGWLAQP
#oth            552451111121111111124121312121212232323533525862332222132121
HVO_2075        S::GL:::::::::::::::G:::C:::::M:::::::::IT:::HG-:E:::::CV:::
hla0747         S::EL:::::::::::::::::::C:::::M:::::::::IT:::HG-:E:::::CV:::
HVO_2434        :::GV::::::::::::::TM:::::::V:::::::::R:ITQN:::-:E:M:::R::R:
Hbo1310         T:VRR::::::::::::::A-----------:::::::RR--------:-----------
Hmu1823         :::E:::::::::::::::TM:::::::V:::::::::R:ITQ::::-:::M::::::::
Hbo0193         S::E:::::::::::::::TM:::::::V:::::::::RRITQ::::-:::M::::::::
Hbo1671         S::E:::::::::::::::TM:::::::V:::::::::R:ITQ::::-:::M::::::::
Hbo0174         S::E:::::::::::::::TM:::::::V:::::::::R:ITQ::::-:::M::::::::
Hbo3401         S::E:::::::::::::::TM:::::::V:::::::::R:ITQ::::-:::M::::::::
HQ3077A         ::::A::::::::::::::AF::::::::::CFDLN:::SN:E:A:D:G::::T::::::
pNG5130         ::::A::::::::::::::AF:::::::::::LDIDE:ESN:E:TGQ:S::::T::::::
HQ2051A         :EH:D::::::::::::::AF:::::::::::LNIND:ESN:E:SAS:DE:::T::::::
hla0181         DE::A::::::::::::::AF:::::::::::LDSN::ESN:E:A:D:G::::T::::::
hla2716         DE::A::::::::::::::AF:::::::::::LDSN::ESN:K:A:D:G::::T::::::
Hbo1889         DE::A::::::::::::::AF:::::::::::LNINEAESN:E:::G:D:N::T::::::
HQ1356A         :EH:DGDGDGDGDGDGDGDAF:::::::::::LDINHTESN:E:A:D:G::::T::::::
HQ2072A         :EH:DGDGDGNGD::::::AF:::::::::::LDINHTESN:E:A:D:G::::T::::::
NP6224A         AN:EL:::::::::::::::::S:L:A:::M:::::::AT:T:N:TQ-:-:::::C::::
NP6268A         :::EL:::::::::::::::::S:L:A:::M:::::::AT:T:N:TQ-:-:::::C::::
Hbo2146         :K:N:::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::LA:DG:::D:::::::
HQ3062A         :E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::LA:DG:::D:::::::
rrnAC1565       NE:EL::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::N:RS-:E::::::::::
VNG0042         D::::::::::::::::::::::::::::::::::::::N:::::V:DG:::::::::::
HQ2549A         DT:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:S:N:SVN:::::::::
HQ2728A         DT:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:S:N:SVN:::::::::
HQ1012A         DD:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:SLN:SVN:::::::::
hla1653         DE:G::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S:N:SVN:::::::::

consensus       GVFLFDRESG-FAPREQVVDCKP---
#oth            43523363616272464347543111
HVO_2075        S:H:::S:::C::::::::S---:::
hla0747         S:H:::::::TVR::::::S---:::
HVO_2434        VAY::TQT::R:::S::A-G::::::
Hbo1310         ----------:------------:::
Hmu1823         ::::::::::R:P::::G-::R::::
Hbo0193         ::::::::::R:T::::G:-::::::
Hbo1671         ::::::::::R:T::::G:-::::::
Hbo0174         ::::::::::S:NT:::G-A::::::
Hbo3401         ::::::::::S:NT:DTGSLQTVISQ
HQ3077A         S:Y:H:LSH:::S:::::::::::::
pNG5130         ::Y:Y:LSC:::Q:QRE:::S:::::
HQ2051A         ::Y:H:LS::::Q:QG::::::::::
hla0181         ::Y:H:LSR:::Q::TE:::::::::
hla2716         ::Y:H:LSR:::Q::TE:::::::::
Hbo1889         ::Y:H:LS::::Q:Q:::::::::::
HQ1356A         ::YFH:LSR:::Q::IE:::::::::
HQ2072A         ::Y:H:LSR:::Q::IE:::::::::
NP6224A         S:R:::KST:RV::Q::::P---:::
NP6268A         S:R::EKST:RV::Q:::RP---:::
Hbo2146         A:R::::SE:R::::::::NHE::::
HQ3062A         A:H::::SE:C:::::::::RES:::
rrnAC1565       STL:::K:T:V:::Q::::S---:::
VNG0042         ST::::N:T:A:::Q::ATS---:::
HQ2549A         ST::::K:T:A:::E:R:RS---:::
HQ2728A         ST::::K:T:A:::E:R:RS---:::
HQ1012A         ST::::K:T:A:::E:R:RS---:::
hla1653         STL:::K:T:A:::Q:::TS---:::