[R] (-) COG0730 Predicted permeases 7 genomes BUD1219 11 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG5074 VNG5223 VNG6071 VNG6455 rrnB0294 HVO_1361 Hbo3414 - Hut0952 hla0253 hla1446 NP4590A -

Pairwise sequence scores
Consensus score	2377	hla1446	NP4590A	VNG5074	VNG5223	VNG6071	VNG6455	Hbo3414	hla0253	Hut0952	rrnB0294	HVO_1361
1272	hla1446	2543	1855	1008	1008	1008	1008	1068	1317	1277	1303	1334
1402	NP4590A	1855	2434	1115	1115	1115	1115	1192	1348	1326	1382	1358
2042	VNG5074	1008	1115	2332	2332	2332	2332	1651	1208	1193	1316	1251
2042	VNG5223	1008	1115	2332	2332	2332	2332	1651	1208	1193	1316	1251
2042	VNG6071	1008	1115	2332	2332	2332	2332	1651	1208	1193	1316	1251
2042	VNG6455	1008	1115	2332	2332	2332	2332	1651	1208	1193	1316	1251
1690	Hbo3414	1068	1192	1651	1651	1651	1651	2325	1291	1237	1340	1290
1452	hla0253	1317	1348	1208	1208	1208	1208	1291	2523	1518	1665	1667
1484	Hut0952	1277	1326	1193	1193	1193	1193	1237	1518	2504	1814	1734
1645	rrnB0294	1303	1382	1316	1316	1316	1316	1340	1665	1814	2460	1997
1573	HVO_1361	1334	1358	1251	1251	1251	1251	1290	1667	1734	1997	2492

357 symbols
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#oth            112133322233351331.12..221.21..............1.121.11231.1..11
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NP4590A         ::::::::::LTPQ:A:::::::FMV:VF::::::::::::::T::IL:::AP::I::SM
VNG5074         ::::::S::-::::::SF:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG5223         ::::::S::-::::::SF:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG6071         ::::::S::-::::::SF:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
VNG6455         ::::::S::-::::::SF:A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo3414         :::::-----::::M:G::::::::::::::::::::::::::::::L:::AN:::::::
hla0253         MLSSLTGI:DSSPEML::::::::VV:L::::::::::::::::::ML:::AT::::::M
Hut0952         ::::::::F:LAASMLV::::::FMV:V:::::::::::::::::MI::FETTT:::::M
rrnB0294        :::::::I::LSLAM:V::::::::::V:::::::::::::::::::::::T::::::::
HVO_1361        ::VSVF::::MSAGML::::A::V:::V::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       AFVFGTSVIATLKHRDHGQVDYKLGVIMTVGMTIGIEAGKRVVDALEALGNADLVISVAY
#oth            1.....1..11.1.1.4.11..1.132.231213.1.2.244135.232.4.2511123.
hla1446         T:::::A:::::::H:T:::::R::AL:F::IAL:::G:S:L:FG:::::I:EA:VGI::
NP4590A         ::::::A:::::::H:V::::::::AL:F::IAV::::::ML:FF:::::R:EV:VGS::
VNG5074         :::::::::GA:R:::::H:::::A:::::A:::::::::::::::H:A:::::::::::
VNG5223         :::::::::GA:R:::::H:::::A:::::A:::::::::::::::H:A:::::::::::
VNG6071         :::::::::GA:R:::::H:::::A:::::A:::::::::::::::H:A:::::::::::
VNG6455         :::::::::GA:R:::::H:::::A:::::A:::::::::::::::H:A:::::::::::
Hbo3414         :::::::::GA::::::::I::::AAL::L:::A:::G:::::FL::E::S::::V::F:
hla0253         ::::::A:::::::H:L::::::::A::IA:T:V:::V:RAS:FY::E::L::GI:::V:
Hut0952         ::::::A:::::::::L::::::::GL:I::T:A:::V:RIGLYF:QDR:L:G:IVG:T:
rrnB0294        ::::::::::::::::M:::::::::L:IA:T:A::::::EI:LH::T::L:GSI:::T:
HVO_1361        ::::::::::::::::L::::::::IS:II:T:V:L:V::EI:LY::E::L:GNI:::T:

consensus       VGLLAGVGLFTLRDALRAGGTGASV----------------D-IPDLAKKV-QSYEIPPM
#oth            131.131.3332131233214452411112233444335342211212311112342...
hla1446         IFV::AI::LFT:S::NGDDE:DDEAGDGDASDESGGSNGD:D::AI:Q::::::N::::
NP4590A         :V:::AI:GVFV:S:-AG:DSAD:A:::::::DSEGGDGSE:D:::I:::I:K::T::::
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Hbo3414         :::::L:::::::::W:D::SDR:T::::::::::::::::-:--::TDR::::IRV:::
hla0253         :F::G:I::MIT:ES:ASD:G:-GI::::DHDAAAAEDLSEYE:::I:::IQ:TVR::::
Hut0952         :V::G:::::VT:N:::DD:DESD:::::DHHD:AEAEIDP:E:::I:::I::::T::::
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consensus       VTLRGGVRVSAWIILGVGLVVGVLSGFLGVGGGFIRMPAMMYGIGVPAAIAVGTDLFQIT
#oth            211411331.31313332332.22..1.......21...23.41.11312.1..111323
hla1446         M::AD:QKA:L:T:S::SAG:::I::::::::::V::::IY:V::TSL:A::::S::TGL
NP4590A         :::TD:SKA:M:T:S:::GG:::V:::::::::::::::IY:I::::L:A::::S::GAL
VNG5074         :::::D:::::S::F:I:::::::::L:::::::LL:::::::L:::::::I:::IL:::
VNG5223         :::::D:::::S::F:I:::::::::L:::::::LL:::::::L:::::::I:::IL:::
VNG6071         :::::D:::::S::F:I:::::::::L:::::::LL:::::::L:::::::I:::IL:::
VNG6455         :::::D:::::S::F:I:::::::::L:::::::LL:::::::L:::::::I:::IL:::
Hbo3414         :S:N::ST::V:V::VT:GAI:I:::::::::::LL:::::::L:::::V:::::IL:::
hla0253         :::::DI:::V:V:TA:AFST:I:::::::::::::::::I:A::::TPV:::::::E:V
Hut0952         M:IG::IK::L:MV:::AFAT:L:::::::::::::::::F:L::::VP::::::::E:V
rrnB0294        IS:::::S::L:M::::AF:T:L::::::::::::::::LF:L::::VP::::::::E:V
HVO_1361        I::::::K::L:M::LLAFAT:L::::::::::::::::LF:L::::VP::::::::E:M

consensus       ISGAFGAFVYARDGFVDLPVVAPLLAGSALGARIGSAATNIVDEDDIKGYFGTMLLAGSV
#oth            4..13.112.123.411121.33..3...1...1.121133.1112112..15...3112
hla1446         L::GV:::T:G:A:VI::GI:TA::L::::::::::G::AY:N:::VTI:::I:::IA:I
NP4590A         M:::V:::T:GLS:VI::G::TA::V:::::::::::::AY:::::VTI:::V:::LA:I
VNG5074         ::::::::::::::::AI::::T::::::::::::AGVS::::::::::::A::::::::
VNG5223         ::::::::::::::::AI::::T::::::::::::AGVS::::::::::::A::::::::
VNG6071         ::::::::::::::::AI::::T::::::::::::AGVS::::::::::::A::::::::
VNG6455         ::::::::::::::::AI::::T::::::::::::AGVS::::::::::::A::::::::
Hbo3414         V::::::::::QE:S:A:::::S::L:::::::V:A:::KL::::G:::::AA::::::L
hla0253         F::GI:SYL:GQS:G:::GI:V:::F:::::::::::::AV::A::::V:::G:::::::
Hut0952         F::GL:S:L:GLE:A:::SI::::::::::::::::T::SL:::SE::I:::L:::G:A:
rrnB0294        F::GL:S:L::L::G:::SI:L:::::::F:::V:::::S:::::E::V:::L:::G:AL
HVO_1361        F::GI:S:L::QS:G:::SI:::::::::::::V:::::S:::::E::I:::L:::L:AL

consensus       AVAAKEVGTAYDIAVLNTVSIALIFGAAVVVSGAILLAAVCALRDDNADFWCRLS--
#oth            1.2322323412443.332131.2411124.422132433523.6456654533431
hla1446         :::LG:AAAWLSMP::DQI:FV:LV:S:LF:CAT::YHGAL:V:RERGTPPSA--::
NP4590A         ::::G:LA:WL:AP::D:::FV:LV:S:AF:TAV:FYYGAT:V:NGTRVG-----::
VNG5074         :::::R:::::::::::::::::::::T:::::::::::::Q:::::::::::::AT
VNG5223         :::::R:::::::::::::::::::::T:::::::::::::Q:::::::::::::AT
VNG6071         :::::R:::::::::::::::::::::T:::::::::::::Q:::::::::::::AT
VNG6455         :::::R:::::::::::::::::::::T:::::::::::::Q:::::::::::::AT
Hbo3414         S:T:::LSGPLG:DA:E:::M::::::T:L::T:VV::::::::SGGGGT::::TST
hla0253         ::GIG:I::YLGNET:E:LGLV:VI::::::AA::VFTTLRS::ATRNHVSATAD::
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