| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4435 | VNG2527 | HQ2477A | rrnAC2228 | Hmu0437 | Hbo1667 | HVO_0628 | hla0290 |
| 3007 | VNG2527 | 4369 | 2704 | 2681 | 2744 | 2107 | 2314 | 2377 |
| 3428 | HQ2477A | 2704 | 4370 | 3222 | 3225 | 2497 | 2587 | 2547 |
| 3675 | rrnAC2228 | 2681 | 3222 | 4427 | 3552 | 2503 | 2699 | 2767 |
| 3576 | Hmu0437 | 2744 | 3225 | 3552 | 4545 | 2411 | 2617 | 2660 |
| 2883 | Hbo1667 | 2107 | 2497 | 2503 | 2411 | 4380 | 2878 | 2788 |
| 3224 | HVO_0628 | 2314 | 2587 | 2699 | 2617 | 2878 | 4374 | 3592 |
| 3285 | hla0290 | 2377 | 2547 | 2767 | 2660 | 2788 | 3592 | 4375 |
600 symbols consensus ---------MMSSDDDIDRRAFLTAAGAAAAAAT-LAGCSG--DGGDEDGTDGGDEQDGT #oth 111111112443324422..6..31..211121111...222312434343333234334 VNG2527 MFKYAIVPYSRM:::TVS::G::K:::::TVV::ST:::TD::----------------- HQ2477A ::::::::MNI:MSSN::::T:::T::S:::::::::::::SD::SAS:E:T:TE----- rrnAC2228 :::::::::-:::G:S::::S::::::S:::::::::::::::::::GG::E:::GG::: Hmu0437 :::::::::-:Q:::PLG::D::R::::G:VTV::::::A::D::D::TP:E:::::ME: Hbo1667 ::::::::MGETMSR::::::::K:::G:::::::::::AADP:ESGTGTE:AT:T:TNG HVO_0628 ::::::::::SQDGN:VS::R::::::::::T:G:::::::::-::G::T:TES::TT:E hla0290 ::::::::::S:R:ESVS::K::G:::G::VTVG::::::D:N::E:S::S::S:GS::S consensus -E-D-TSDGGDGGDDT----TLVYARGDHPQNYDPQQSTSGEVAKVTNQIYDTLIQFEPG #oth 323233431412222331113.212..211411.1.11....12..11.21.1.13.31. VNG2527 :-:-:SGG:::::G:-::::E:::S::::::::::::T:::::S::::::F::::::K:: HQ2477A :-:-::T::NEAES:LSG:::::::::::::::::::T::::::::S:::::Q:VG:T:: rrnAC2228 :-:-:G::::::RS:Q::::::::::::::E::::::::::::::::::VF::::::AA: Hmu0437 D:AAT:AE:D::::::AGDQ::::::::::E::::::T::::::::::::F::::::AA: Hbo1667 G:T:EETTET::E:T:::::::TF:::NTSGTL:::N:::::DV:::::V::Q::M:::: HVO_0628 G:T:Q:ETETED:GS:P:::V:R:G::S:SPTL:F:N::::::::::E:L:::::N:::: hla0290 NGS::G:::S::::::S:::L:R:G::S:SATL:F:N::::::::::E:::::::N:::: consensus SGGQLTDGLATDYSLEGTTATLTLREDVTFHNGEEFTAEDFEATIRRFTDSEYEYYLGDD #oth 4213.241..2111.1.21111..1.111..1.131..5.13..32..2231.11.2.13 VNG2527 TS:E::S:::D:WT:D:::::::::::A:::S:ADL::T:VK::::::I:D::D::::S: HQ2477A :::::R:::::E::::::::::::::::::::::S:::A:VR::::::::N:::H::::E rrnAC2228 :::::E:A:::::T::::::::::::G:M:::::::::S::K::WQ:::Q:D:::::::: Hmu0437 :::E:EA::::::::::::::::::::::::S::P:::::::::F:::::P::D:::::A Hbo1667 KT-S:RE:::::W::::::V::::::::::::::::::D:VV::FN:::NPD::H:P::K HVO_0628 QS-T::Q::::E:::::QS:SI::::G:M::::::::::::V::Y:::V::D::::A::: hla0290 ES-T::::::S::::D:E::S:::K:G:::::::::::Q:::::Y:::V:::::::A::: consensus YRSGYGPFTLGNWIDSVDADGDYELTIQLTQQYAPFLRNLAMFAAAVLSKAQIESLG--- #oth 32.1.111.1.2.122132211122..2.2.41........1..1111.331.1121111 VNG2527 -::::ASI:F:D:V:::E:T::::V::D:::::::::::::I::::I::RD::::::A:: HQ2477A N::::::::F:::V:T:E:T:E::V::E::::::::::::::::::I:::S:::::D::: rrnAC2228 T::::::::::D::E::::SQ::::::E::::F:::::::::::S::::::::::::::: Hmu0437 N:::::::::::::E::::SQ:G::::E:S:R:::::::::::::::::::::::FDASP Hbo1667 :I:A:::::::::VK::SK::::A:::::N:K::::::::::::SSI::EKA:KE::::: HVO_0628 :V:A:::::::S:::EIQV::::SM::::::S:::::::::::::S:H:L:A::EY:::: hla0290 :V:A:::::::::::EIQV:::::M::::::T:::::::::::::::H:E:A::EY:::: consensus --QTDLGTEPVGTGPFEFDNLDNSNQRIRLTANDDYWGDGPNVDEVVFKTIGENSTRAQD #oth 13143.13313...1.31331.2312111.3.2521..42.3.3411.21222.2..1.4 VNG2527 DA:PE:::D::::::::::Q:::ET::V::::F:::::GA:S:SA:I:::T:S:Q::::G HQ2477A :N:VQ:::::Q:::A:::SE:::::::VL:S::A::::N::::EQ:::::::Q::::V:: rrnAC2228 DS:A:::S::A:::A:Q::T:::P:E:::::::N:::::::::GT:I::::T:::::V:: Hmu0437 DA:VG:::::I:::::A::Q:::P:D:::::::ESF::P::::GS::::::S:::::V:: Hbo1667 ::-Q::SKK:::::::K:E:W:T:::Q:::S::T::::EV:K::::::TSV:S:T::::T HVO_0628 ::-:E:SSN:::::::QLS:::DA:E:V::E::SE:::E:::::::::V:::Q::::::A hla0290 ::-:::SENA:::::::LNT::D::EQ:::D:Y::::::::Q:::A::V:V::::::::S consensus LINGASHITDNLDAQSSQQVENADSATLVRKNGINVGYMAFNMARREEFRDRRVRQAISH #oth 121.42111.1.1122223222122.513213...2....1.333412.1223.11.113 VNG2527 ::::DA::::::::::I:K:SS::::SVRQ::::::::::::HD:KPA:::PL:KR:::M HQ2477A V:::S::::::::S:::::L:::G::R:AS::::::::::M:QS::::::S:K::R:::Y rrnAC2228 V::::::::::::SSGF:RA:ESGT:::L::D:::H::::M::::F:P::::Q:::::A: Hmu0437 V::::::V:::::SDGF:RADSS:T:::L:::::::::::M::E:M:P:::::::R:V:L Hbo1667 :DS:GAD:I:G:G::A:KI:::SSN:K::S:A::::::::::::KV:A::NKK::::::Y HVO_0628 :AS:ELD:I:G:G::::V:::::SN:N:::TE:::I::::::::S::::::::::::V:: hla0290 :AS:ELD:I:G:G::::::::S::::E:::TE:::I::::::I:AV:::Q:::::::V:: consensus AINTEAIVNQIYQGFATQASQPLPPDVLGHNDDLDPYPTDKEQAQSLLEEAGYGDGFSFE #oth .1.1211.13.13.1.23.2..1.11.1.1.11121..3.222.211.21..11.111.. VNG2527 :::RDE::DS::::::AS:N:::::::::::::I:S::H:PQ::E:M:AD::VT:-L::: HQ2477A :V::Q:::DS:::::::T:D:::::::::::E::E::::::DE:RR::N::::::::E:: rrnAC2228 :V::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M::::::::::E:: Hmu0437 :V::::::::::::::::::::::::::::::G::::::::DE:R::::::::::::E:: Hbo1667 ::::::L::N:FK:I:E:::::I:SN:F:Y::::S:::Q:L:K:E::::::::::::::: HVO_0628 :::::::::E::S::::::::::::N:::::::I::::Y:P:E::R:::::::::::::: hla0290 ::::::::::::A::::E:::::::N:::::::IE:::Y:P::::::::::::::::::: consensus LATFSNPRGYNPSPVQTANQVKSDLAEIGIEVEINQFS-FGPYLDYTAQGRHDACFLGWY #oth ....2...1...1.231.32.2.1.312.23.3...1.4.321.2..43.1....11..1 VNG2527 ::::::::::::N:I:::T::::::::::VD:::::::Q:SA::E::YD::::::LS::: HQ2477A :::::::::::::::E:::::R:::E:::LT:::::::T:SS::S::D:::::::::::: rrnAC2228 :::::::::::::::N:::::::::E:::LT:N:::::N::::::::SA:K::::::::: Hmu0437 :::::::::::::::::::::R:::QD::LS:::::::D::::::::D:::::::::::: Hbo1667 ::::K:::T:::::LSA:QL:::N:::L::::S:::Q:::N:F::::NS:K::::::::M HVO_0628 ::::Q:::::::::I:::ET:A:N:G::::::D:::Q:::::F:E::::::::::::::: hla0290 ::::Q:::::::::L:::ET:A:N:G:V::::::::Q:::A:F:E::::::::::::::: consensus TDNADPDNFMYVLLHPQVEEDEVPDGQDWVSFDTDGYNTLNVSAWANTDYMELVREAQRT #oth .........3.1..1.212422212111111113211121.211.1231..31.231.31 VNG2527 ::::::::::::::::GTDI:D::AD:NYIAWE-:KN:VS:::::VD:::::F:DKG::: HQ2477A ::::::::::::::D:K:PL:A:::::N::::::E::SP:::AG::HSE::S:::::::S rrnAC2228 :::::::::L::::D::::M:A:::::::::::S:::::::::G:::::::::::::::: Hmu0437 :::::::::L::::D:::PL:D:::::::I::::::::::::::::::E:::::::::S: Hbo1667 :::::::::F:A:::::::DS:FTE:E::::::SK::::::AAG:::R:::Q::ED::T: HVO_0628 ::::::::::::::::::::G:LTE::::::::AE::::S:R:::::R:::D::EQG:S: hla0290 :::::::::A::::::::::S:LTE:::::::::E::::S:R:::::QE::D::E:G:Q: consensus YDEADREELYNEANQIAHDEAPWVFLDYAEELRGVNEAVV-DGYTVASVGGPYLNLVELQ #oth 12343.333.51.322.2111...12.1.321.11213.13321232211..1.12.1.4 VNG2527 ::D:A:QQY:HQ:S:::::Q::::Y::::DLI::::::::AES::PT:::::F:DR:::A HQ2477A ::D:T:::::V:::R::RE::::::I:::QT:::::::::S:S:::T:::::F::T:::: rrnAC2228 :A:G:::TM:E::S:L:Y::S:::::::::T::A:::T::E:S:::S::::::::T:::: Hmu0437 ::TNE:DTM:Q:::KL:::::::::V::::T::AI:::::E:T:::S::::::::T:::: Hbo1667 ::KET:A:K:KQ:AKV::E::::::::H:K:::::SNK:-:S:FVL:PIS::F::::S:D HVO_0628 ::::E::S::::::::::::::::Y::::D:::::SNR:-:S:FQI:AIS:::::::S:N hla0290 TT:S::A::::::M::::::::::Y::::::::::ANR:-:N:FQI:AIS:::::::S:E