| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2839 | hla0892 | HVO_1862 | Hbo1737 | HQ1101A | Hut2684 | VNG2012 | rrnAC3176 | Hmu2577 | NP2278A | rrnAC1637 | Hbo3924 |
| 2030 | hla0892 | 2976 | 1840 | 1787 | 1768 | 1525 | 1400 | 1483 | 1412 | 1395 | 1253 | 1246 |
| 2002 | HVO_1862 | 1840 | 2891 | 2012 | 1949 | 1461 | 1373 | 1433 | 1467 | 1362 | 1315 | 1247 |
| 2065 | Hbo1737 | 1787 | 2012 | 2897 | 2171 | 1464 | 1395 | 1383 | 1508 | 1393 | 1374 | 1349 |
| 2006 | HQ1101A | 1768 | 1949 | 2171 | 2872 | 1494 | 1467 | 1337 | 1482 | 1319 | 1262 | 1272 |
| 1844 | Hut2684 | 1525 | 1461 | 1464 | 1494 | 2892 | 1377 | 1413 | 1592 | 1481 | 1376 | 1355 |
| 1801 | VNG2012 | 1400 | 1373 | 1395 | 1467 | 1377 | 2848 | 1458 | 1490 | 1508 | 1384 | 1450 |
| 1763 | rrnAC3176 | 1483 | 1433 | 1383 | 1337 | 1413 | 1458 | 3177 | 1623 | 1385 | 1277 | 1251 |
| 1893 | Hmu2577 | 1412 | 1467 | 1508 | 1482 | 1592 | 1490 | 1623 | 2914 | 1473 | 1404 | 1399 |
| 1753 | NP2278A | 1395 | 1362 | 1393 | 1319 | 1481 | 1508 | 1385 | 1473 | 2978 | 1481 | 1517 |
| 1672 | rrnAC1637 | 1253 | 1315 | 1374 | 1262 | 1376 | 1384 | 1277 | 1404 | 1481 | 2795 | 1731 |
| 1647 | Hbo3924 | 1246 | 1247 | 1349 | 1272 | 1355 | 1450 | 1251 | 1399 | 1517 | 1731 | 2732 |
436 symbols consensus ------MEPSSPADAPP-PEALASVFDVYEVRRDD-DRIRYYGEPLVPEDMLERELWPAF #oth 111122564642447.412451554.42442423223534.4.3145445525353426. hla0892 MPEHEDV:::EAS:V:R:::P:RTF:R:D:IC:E::G:V::V::SYI::RT:L:K:V:E: HVO_1862 ::::::::Q:ES::G:::V:::RA::::H:::S:G:R:RI::::S::::Q::V::I:S:: Hbo1737 :::::::D:VDS:EI:::I:::Q:::SLH:T:::G:E::L::::S::::Q::V::V::S: HQ1101A ::::::::SLD::VD:::VD::Q:::HL::TQ::G::::L::::S::::Q::I::A:::: Hut2684 :::::::S:DE::NS::SVG::T:::H::R:E:::::E:::I::::ISPGN:ST:VG:L: VNG2012 :::::::P:E::::::S::A:FGDR::::D:QHR::GELL:F:Q:GADRATI::::::L: rrnAC3176 ::::::-MSG:A::P:S::DR::G::S:SS:::T::GTVQ:L:N::::P:AVAEQ:R:V: Hmu2577 :::::MNRTD::TT::S:V:D:::::Q::Q::::G:::LL:V:R:R:QP:AV::R::DR: NP2278A ::::MDTDQ:VAG:G:S:::S:LPA:RTTD:E:R:DGS:V:::R:QMDS:S:::HV::Q: rrnAC1637 :::::MATQ:::PEL:D::::::DT:H:::ID:TAE:GV:::::::TESEQVIHRIA::: Hbo3924 :::::::SETA:G:::H::SHF:DT::::::ESTA::AV::::::RSDHESVV:AVA:L: consensus RDAGYDVRLER-------------------------------------ETGER--VLVAR #oth 143..3154566533322332111111111111111111111111122662362332113 hla0892 :::::::DV:T:::::::::::::::::::::::::::::::::::::VE:GH::TV::T HVO_1862 :G:::::EAQVS::::::::::::::::::::::::::::::::::::GL::T:D:VIVE Hbo1737 :Q:::EIQVATTP:::::::::::::::::::::::::::::::::::AGR:D::II::: HQ1101A :E:::EIEVAST::::::::::::::::::::::::::::::::::::::R:D:::V::: Hut2684 ARR::::SVT:RHG::::::::::::::::::::::::::::::::::DG:PAPYA:::E VNG2012 :EH::::::TD:::::::::::::::::::::::::::::::::::::R::::::::::T rrnAC3176 :QR:::::::ELGPESATGTTVTSNGETTVVDDPGANDSIAPGGAVNTRP:QY::A:::E Hmu2577 :ES::EIS:::EYDTDADTPM:::::::::::::::::::::::::::P:HGW::::::: NP2278A ::H::E::FDVVVDSTPDPIT:::::::::::::::::::::::::GV:V:Q:RQA:::E rrnAC1637 :QR::R:A:K:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::M::W::::I:H Hbo3924 ::R::T:SM:H::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L::Y::A:::: consensus PRSVGID--GIPWTNIGLFLATVLSTLFVGA-AWYYI---DIAANPLT--VLRAWPFTAA #oth 16463441112.14.351231.321.131.257..2324245454.371132312..32. hla0892 :FDH:RA::::::M:::M:A:::::::::::YG::::GWEE:::::::::M::::::::: HVO_1862 :A:Q:VE::E:::K::T::AL:I::::::::Y:::::PLS:::::::V::L:Q::::::: Hbo1737 :VTN:T:::::::K:L:::F::::::MI:::L:::HVPGSE:LS::A:::::Q::::::: HQ1101A :IDTS::::::::K:ML:::::IV:::L:::IT::::PPS:LL:::::::I:Q:L::::: Hut2684 :E:::::::::::G::VMLVL::AT::YA:T:W::::::::::GD::N::L::::::::: VNG2012 :ADAADTDT:V::::VA:::::LA::::::::N:::V::::----:FSPA:V::I:::L: rrnAC3176 :VGTDTG:::V::L::::L:::IA:::Y:::S::::::::PV:K:::R:::FE::::MV: Hmu2577 :H::::::::::::::L:A:L:TA:::L:::VQ::HV::::LG::::G:::F:::::V:: NP2278A ::R::V::::V::::VVM:V::::T::YA:T:I:::-:::QPVGG::D::L:AG:::A:: rrnAC1637 E::L:V:::::::L:V::AVL:L::::YA:T:R::GL:::SVLED:TA::M:A::::A:: Hbo3924 E:::::::::F:T::VI:::::::T:::A:S:Q::G:::::TLSH:AR::IVE:::::V: consensus VLGVLATHELGHYVASRYHGVDASLPYFIPFPFPFGTLGAVIRMRGRIPDRKALFDIGVA #oth 31.1.42..1...23211.2.311...21.22542..2..1.312132.1.42.....11 hla0892 :::::M:::::::::G::::::V::::V:::V::::::::I::::::M:S:R:::::::: HVO_1862 :::::SV::::::AVG:::::NV::::L:::I::::::::I:::::QM::::T::::::: Hbo1737 :::::T:::::::AL:::::::V::::L:::IV:::::::I:Q:::Q::::::::::::: HQ1101A I:::::::::::::MG:::::NV::::V:::I::::::::I:::::QM:::R:::::::: Hut2684 ::::::::::::::M:::::::::::::::V:P:I::M::I:::::Q::S:::::::::: VNG2012 :M:::G::::::::M:KH:D:::T::::::::SL:::M:::::::::M:S:N::::::A: rrnAC3176 M::::GI::::::A:A::::::VT::::::::SYL::M::::NI:::::::T:::::::: Hmu2577 ::::::V:::::::::::::::::::::::::TLI::M::::::K:::::::::::::AS NP2278A ::::::V::::::AL::::D:Q::::::::V:TFI::F::::S:K::::::E:::::::S rrnAC1637 A::I::I::F:::IM::::E:E::::::L:::NVL:::::::S:NDH::::::::::::: Hbo3924 :::::GV::::::::::::D:Q::::::L:L:TLL::M::::::NDTL::::S::::::: consensus GPLAGLVATVVVTVIGLSLDPVTVPERVA--AASGVVIRFNNPPLLQLIAAVLGEQTAYA #oth ..1...5.122.211.1423.352376441367526717122.1.264113341433624 hla0892 ::I:::I::::::A:::::::LR::AEI:::N:::T::::::::::GI::DLI:QP:::E HVO_1862 ::::::C::::::::::::E:M:::SE:L::GR::DM:V:::::::DA::T::NRP:E:: Hbo1737 ::::::A::I:::AV::::P:M::::SMV::RG::Q::I:::::::N::::I:::::S:P HQ1101A ::::::T:::I::::::TQS:IQI:A:AM::EQ::QM:I:::::::DI::T:I::P:::N Hut2684 ::::::A::IA:::V::H:::IA:::QALQA:DE:AS:K::D:L::T:L:DLV:QP:D:P VNG2012 ::::::::A:::S::::V:P:::::PG:::NS::A:HVD:GY:L::RG::::::::F::: rrnAC3176 :::::::::TI:::::::I::I::::::::NSDT::I:T::Y:L:F:ALE:LVNALGLGT Hmu2577 ::::::::::::SA:::Q::::VTQDAI::AGSDAP:V::H::L::E::::AT:--:LET NP2278A ::::::::A:A:A:V::H::::E::Q::L:E:EEA:E:ELGY::::EFL:WAT:Q:LT:E rrnAC1637 :::::::::::::A::VT:P::E:TRGIV::----TN:ELGY:L:::G::::M:::LE:: Hbo3924 ::::::G:::I::AV:VT:P::E:-----::--GAFP:QLGY:::I:::::A::::LV:: consensus D--PRLTVNPVVIGGWVGMFFTFLNLLPVGQLDGGHIVRAMLGERQETVAAAVPGALFGL #oth 411245532.11311.2.2.2.2...1.......1.23.133.523233133..53.222 hla0892 ::::G::AH:::::::::::::L:::::::::::::M::::::P:::::::L::::::SI HVO_1862 :::::TV:H:::::::::::::V:::::::::::::M::::::::::SL:::::LV::SI Hbo1737 ::::TT:AH::I::::::::::V::::::::::::::I::::::A::RL::F::I::::: HQ1101A :::::MS:S:II::::::::::V::::::::::::::L:::::TT::R:::L::VS:IA: Hut2684 -::RG:A:::::F:::::::V:::::I::::::::::L::A::Q:::::::::::V::AM VNG2012 :::::TA:::::M:::I:::V::::::::::::::::L:SLV::TAGRF:PL::T::LS: rrnAC3176 EVG:GES:H:I:FA::A::::::::::::::::::::::SIV:R::::I:::::::::A: Hmu2577 L::RSG:IH:::F:::::::I:::::::::::::::::::LY::::::I:::::A::::: NP2278A ::::TVVA:::IF:A:::L:V:::::I:::::::::V::S:F:::A:S:::V::VG:::: rrnAC1637 N:::Q:LP::::::::::A:V:::::::::::::S:VA:SLF:D:LSL:QL:::V::::: Hbo3924 :::AS:MA::::V:::::A:V::::::::::::::::::::F:RAHG:IQRL::A::::: consensus AAYLYFGRG---YG--QSVGLWAFWGLLALVIAYAGPATPIDDTPLGPPRLALGLLTFVL #oth 211.43753111642242431.54..332424347.315.331531175.522144.121 hla0892 ::::::W:::::F:LD::::::T:::VFS::::FN:::N:T:EER::W::::V:IG::AV HVO_1862 :G::HYI:::::L:LN::::::F::::MSTF:::N:::K:::E:::::A:MVV::V::A: Hbo1737 ::::HY:L:::::SFNE:::I:::::F:SIF:::R:::D::::A:I::A:M:V:::::A: HQ1101A S:::HY:L:::::AFNE:::::::::V:SAFV:FK:::N::::A:::I::VL::V:::A: Hut2684 :GG:::LTE::::T::::TI::GI::VI:::MVQ::S:::LREGSI:MK::::AG::::: VNG2012 G:::WIV:D:::A:::NAA:I:LL::V::S:VSLS:TV::V::R::DRR:V:::VV:::: rrnAC3176 :G::::T:DPPPV:F:GVW:::V::::F:TGL::::::R:TV::A:DRR:AL:::F::L: Hmu2577 :G::::LQD:::VT::NA::I:VM:::::TGL:::::::::R:S::DSK:TL::VF:::: NP2278A ::::FISGT:::SS::NASV:::::::I:::LS:V:H:E:VF:E:::T::M:V:AI:::: rrnAC1637 :G::VAFE::::G-::RAA:::::::I::::FGRL:S:::L:E:::::G:W:V::::::: Hbo3924 G::::AFGD:::G-:::::S::VV::F:T:FF:RM:S:E:L::SA::AS:::I:G::LL: consensus GALCFLPVPIELVT-- #oth .311.31..2236641 hla0892 ::::::L::::VI:A: HVO_1862 ::A:::L:::QVIPG: Hbo1737 ::::::L::::MM:V: HQ1101A ::::::L::::VA:VS Hut2684 :::::M:::::I:VP: VNG2012 :::::M::::Q:G-:: rrnAC3176 :IA::T:::F:ISAV: Hmu2577 :V:::T:::F:::::: NP2278A :V:::T:::::::GA: rrnAC1637 :M:::V:::LVITM:: Hbo3924 :V:S:T:::LV:T-::