| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5012 | NP4174A | rrnAC1074 | Hmu1627 | VNG2071 | hla1057 | HVO_1917 | Hbo1789 |
| 3490 | NP4174A | 4941 | 3153 | 3175 | 2676 | 2858 | 2964 | 3070 |
| 3519 | rrnAC1074 | 3153 | 5004 | 3489 | 2668 | 2832 | 3065 | 3066 |
| 3594 | Hmu1627 | 3175 | 3489 | 5033 | 2573 | 2933 | 3033 | 3115 |
| 3474 | VNG2071 | 2676 | 2668 | 2573 | 4981 | 2976 | 3139 | 3098 |
| 3793 | hla1057 | 2858 | 2832 | 2933 | 2976 | 5215 | 3432 | 3553 |
| 4031 | HVO_1917 | 2964 | 3065 | 3033 | 3139 | 3432 | 5084 | 3833 |
| 4145 | Hbo1789 | 3070 | 3066 | 3115 | 3098 | 3553 | 3833 | 5133 |
709 symbols consensus -------MDWRDAEREFDDEVVGRTTLPRMFEASAARNADRPAQRYKGGIYDRSL-TPGV #oth 1232333231221.2214.3.1324.1312.142.3.11234..4....2.2...1233. NP4174A ::MSSSTAA:KQ::A::E:::::EN:I::L::Q::S:H:::D::W::::V:E::::::D: rrnAC1074 :MTGGNHA:::Q::E:YT:::I:DD::GE::A::::::::TT::L::::V:::::::DD: Hmu1627 MAGSRTVPS::E::::YS::::AD::I:EL:::T:Q:::::T::L::::T::::::::A: VNG2071 :::::::::P::::::Y::H:IA:Q::S:T::DA:E:H::S:::A::::V::::::A:E: hla1057 ::::::::N:QE:::::A:D::V:E:::::::R::E:::::L:::::::::::::VSS:: HVO_1917 ::::::::::::::AA:::P:IE::::::::::::S:::S:V:::::::::R:::VAE:: Hbo1789 ::::::::::::S:ET:E:::::D:::A::::N:::::TGE:::Q::::::::::VSS:: consensus VPAAPDGDYASLTYDEMREIVRNLAAGFRELGVEADTRVGIFSHTRMEWAQSDFAILAAG #oth 311.12.222521.331252.23.1....1..13413..12213......12.112.1.. NP4174A L::::S:EFE::::ET:Q::::::S:::::::::N:::::::AN:::::::::::::::: rrnAC1074 I:::::::::A:S:ER:HQL:KY::::::D:::GS:A::::L:N::::::L::::::S:: Hmu1627 M::::::::::I:::::QSM:H:::::::::::DH:::::L::S::::::L::::A:::: VNG2071 :DP::::GVET:S::AL:D:::T::::::D:::T:GD:::V:A::::::::C:L:V:::: hla1057 L:P:SE:E::DV::A:::A:::R::::::::::DD::::ALYAQ:::::::T:::V:::: HVO_1917 ::::::::::G:::::::G:::R::::::D::I:SGD:::VL:::::::::T:::V:::: Hbo1789 :::::S::FSE:::G::::::::::::::::::::GS:::::::::::::::::G::::: consensus GVVTTVYTSSSPRQVQYLLSDPGADGVVVENAALLDRVLAVEDDL--DLSFIVTIDD-YD #oth 13.....12..23.231.13.12.32..1..4111211211112.212.311123.2151 NP4174A ::::::::E:::N::::::D::N::::::::GE::E:::E:::E:::::::::V::::F: rrnAC1074 ::::::::D::SK:::::::::E:SA:::::::M::::::I::::::S:::::VM:::T: Hmu1627 :I::::::E::::::K:::::::::::::::E:::::L:E:::R:::E::::::::E::: VNG2071 :A:::::A::::A:IAH::G:S::V::::::D::RQ::RE::S::D:::E:VA:M:T:-- hla1057 AT:::::A::::N::R::IE::E:TV::A::RE:::E:F::V:::EHE:DA:::F:::V: HVO_1917 :::::::::::E::T::::::::::A:::::E:::E:::::::E:::::R:::VV:E::: Hbo1789 :A:::::::::E:::R::::::::T:::::::E::Q:::::::E:::::::::L:::PA: consensus G-D------------DRDDVYTLGEVHRRGAEAFDEDAYQSWLDERDPDDLASLIYTSGT #oth 332222222111111221.232.331132.33211331.21113211231.......... NP4174A :H:::::::::::::::::ILS:A:::DL:D:H::Q:::E:R:A:::L:::::::::::: rrnAC1074 V:-::::::::::::::E::H::KT:Y:::E:T:S:T::::::::::::::::::::::: Hmu1627 T:-::::::::::::::::::::::L:EI::K:Y:DAR:R:::E::S:S::::::::::: VNG2071 -:-::::::::::::PS::TRP:SA:YD::RD:::P::::G:I:D::::::::::::::: hla1057 TT:LDAEIGTDSENLST::::::::::AL:D:::::::::::I:AV:VG::::::::::: HVO_1917 :H:::::::::::::::E::L::::LY:::E::Y::A::E::::::::E::::::::::: Hbo1789 :SGMGGAVR::::::::::I::::D::EI::T::::E:::::IN::::SS:::::::::: consensus TGQPKGVRLTHRNFRSNVNQCYKRFGPRPDKD-DLPTITADSRTLSFLPLAHVFERLAGH #oth ..2....3...3..12.112411.211...133.4.3234342311.......1..21.. NP4174A ::K::::Q:::::::::::GLR:::A::::::E:::A:DERD:V::::::::::::V::: rrnAC1074 :::::::::::::::A::::TR::I::::::PS::::::::T:SIA:::::::::::::: Hmu1627 :::::::K::::::::::::V:::LA::::::P:H::LSPGTTSI::::::::::::::: VNG2071 ::T::::A::::::HA:L::SRR:::::::RG::A:AV:S:::H:::::::::L:::S:: hla1057 :::::::::::A:::E::S:::R::AD:::R:S:V:G:S:E:T:::::::::::::M::: HVO_1917 :::::::::::W:::::::ES:R::::::::G::T:V:GP:AV:::::::::::::M::: Hbo1789 :::::::K:::N:::::::::::::::::::E::V::L:NGMV::::::::::L:::::: consensus FLMFASGATVAYAESPDTLREDFQLVRPTTGTSVPRVYEKLYDAIRDQASESPVKERIFE #oth 131211..3.3.1.11..111.22222.2323.......111.42.41.321152211.2 NP4174A ::::G:::::S::::T::VAD:I:I:K::GAS:::::::RI::SL::E:P:A-----V:N rrnAC1074 :F:Y::::A:S::::::::AD:L:T:K:M::L:::::::RIF:NM:T::::::L:K:::D Hmu1627 :V:::A::::G:V:D::::AD:IK:I::D::A:::::::RIF:RM::::::::I:::::: VNG2071 ::PL::::Q:C::::::::::::G:FE::SA::::::::::::T::E::AD:::S::V:: hla1057 YM:::A::::G::::::::::::G::::::T:::::::::::::::E::G:::::::::: HVO_1917 :M:::A:::::::::::::::::::::::V::::::::::::::::A::::::A:K:V:: Hbo1789 ::::::::C::::::::::::::::::::V::::::::::::::::SE::K::T:K:::: consensus WAVDVGRAYHRTDDPGPGLTAKHALADRLVFSQVREALGGNIEFFISGGGSLSAELCALF #oth 11231122313214..53.5112312.2..12321132..211.11.......22.1111 NP4174A R::PIA:QWAN:ES::L::KL:YK:M:K::Y:S:::QM:::::::V:::::::KQ:AE:: rrnAC1074 :SM::A:E:A::EN:::I:::::S::::::Y:T:K:R:::::::MV:::::::KT::ET: Hmu1627 :ST::A:EWA:::::::L:GL:::VS::::Y::LK:N:::::::MV:::::::K:::ET: VNG2071 ::TR::::A:T:::::I::R:A:::::T::::DI:D::::E::::::::::::P:::::: hla1057 :::G::K:H:EA:E::AV:N::C:V:::::::S::::I::::D::::::::::::::::Y HVO_1917 :::G::Q:::T::A::YL:::::R:::::::G:::D:::::LD::::::::::::::::Y Hbo1789 :::::::E::ES:S::VI:S:::::::K:::D::::::::R::::::::::::::::::Y consensus HGMGLPILEGYGLTETSPVISVNPPEDPRIGTIGPPVVDVEVKLDTTVVG-DQFADADGD #oth 21.111.2........1..21...1.2323..2.4.14221242.331124235444412 NP4174A D:::I::::::::::::::V:::::::Y:S::L:::LSN:::R::E:::SD::K:N:::: rrnAC1074 L::::T:::::::::::::L:::::::I:P::L:A:LPA:D:HI::G::DASE:DGVT:: Hmu1627 L::D:T:V::::::::A::V:::::::V:P::M:V::::E::::::H::DQ:D:-ETSR: VNG2071 :::::::::::::::::::LA:::Y:::IV:::::::T:T:LTV:E:IASPE:RQRC::A hla1057 :A:D::::::::::::::::::::::E:KV:::::::::T::AI:GA::::EEV::LP:: HVO_1917 :A:::::Y::::::::::::::::::A:K:::::Y:LRN::T:::::::::::LGE:G:E Hbo1789 ::::::::::::::::::::A:::::E:K:::::T::::::::::K::::::VTG::G:: consensus VGELLVRGPNVTDGYWNRPDATAAAFTDD---------------DGGG-----WFRTGDI #oth 2...112..2.22...13131.231.244112121122222223124411111..1...1 NP4174A I:::H:K:::::E::::::G::EE:::Q-:::::::::::::::::--:::::::::::: rrnAC1074 ::::::D:::::Q::::A:::::R:::EI:::::::::::::::::TQ:::::::::::: Hmu1627 :::::::::::A::::::EKE::QS:EP-:::::::::::::::::--:::::::H:::: VNG2071 A::::A:::Q:F::::GL::::D:::VTR:::::::::::::::E:KE:::::::::::V hla1057 :::::::::Q:::::::::::::E::::PDRLPEDAVVAGDPPEER::DPDDP::::::: HVO_1917 :::::::::S::E::::D:EE:E:::VE:::::::::::::::DE:RR:::::::::::V Hbo1789 ::::::K:::::E::::::EE::::::::::VPSDANGESESEG:S:::::::::::::V consensus VERRPDGYIAFRERAKQLLVLSTGKNVAPGPIEDAFATSDRVEQAMVLGDGQKFVSALIV #oth 11212.1122121.1.1211.1....1..1....4.1212312.21.2..21..12.22. NP4174A I:QTD:D:LIYHD:L:::I::D::::I::Q::::E::::E:ID::::I::N:::IA::F: rrnAC1074 :::TD:DFLIYHD:L:E::::::::::::Q::::Q:::N:::D:V::V::D::::G:I:: Hmu1627 :::TE:DFLIYHD:L:EVI::::::::::Q::::::S:::::A::::V::D:::IA:MF: VNG2071 ::L:::::VR:L:::::::T:::::::::::::::::A:PL:A::::V:::::::::IL: hla1057 :QL:::::::::::::::::::::::::::::::R::ANEF:::CV:::::R:::::::: HVO_1917 :::::::::::::::::I:::::::::::::::::::S:PV:::C::::::R:::::::: Hbo1789 ::L::::::::::::::I::::::::::::::::S::S::V:::C::::::R:::::::: consensus PNFEALRRWADREGIDLPDDPEAICRDDRVRERIQEEVDAVNENFEKYERIKQFRLVPEE #oth .1114242..1421111.11452312.2..31212311141.241132.3..4.21133. NP4174A ::L::VE::::K::::::::S::::A:S::::YVN:::EE::KTLS:S:K::E:::::I: rrnAC1074 ::::E:H::::S:::::::::::LVD:E::HAWV:TA::::::EL:RV::::S:A::SR: Hmu1627 ::::Q::::::::::::::SEAEM:D:E::HAW:::A::E:::DL::V:T::K:V:L:R: VNG2071 :::D:VSE::ASQE:A::::RD:::::E:::A:::SA::D::TG::P::::::::::AT: hla1057 ::::K:AA:::TR:::I:E::TG::::::::::::V:::R:::E::S::Q::R::::K:: HVO_1917 :S:DG::E::AE:::::::::K:V::::::Y:::ET::::A:::::S::::::::V:::: Hbo1789 :S::EI:E::::::Y:::::ARG:::::::K::::S:I:Q::::::P::Q:::::::::: consensus FTEENDLLTPTMKKKRRNIRDRFADQVSDIYDDDAAAA----------- #oth 1114...1..1..1..11123213142532.314666442211111111 NP4174A W:AD::::::S::I::::VMEQ:EE::Q:::G::YNK-::::::::::: rrnAC1074 W:A:::::::S:::::::::SAYREKLAE::GEQQVE:A:::::::::: Hmu1627 W:A:::::::S:::::::::KA:E:RL:E::E:PVTVDD:::::::::: VNG2071 :::A::::::::::::HH:::::::A:G:V:::SEFST::::::::::: hla1057 :::::::::::::::::::L:::G:EIEI::E:A----::::::::::: HVO_1917 :S:G:::M:::::::::::L::Y::E::L:::E:RGTEERRSRERDATQ Hbo1789 :::N:::M:::::::::::L::Y::::DLL:TE:::::TQN::::::::