| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4938 | VNG1313 | hla1530 | HVO_2815 | Hbo2553 | NP4322A | rrnAC1083 | Hmu1799 |
| 3822 | VNG1313 | 4940 | 3478 | 3446 | 3352 | 3217 | 3477 | 3251 |
| 4046 | hla1530 | 3478 | 5055 | 3680 | 3650 | 3273 | 3600 | 3431 |
| 3966 | HVO_2815 | 3446 | 3680 | 4977 | 3886 | 3265 | 3488 | 3326 |
| 4012 | Hbo2553 | 3352 | 3650 | 3886 | 4966 | 3356 | 3579 | 3338 |
| 3857 | NP4322A | 3217 | 3273 | 3265 | 3356 | 4946 | 3651 | 3461 |
| 4294 | rrnAC1083 | 3477 | 3600 | 3488 | 3579 | 3651 | 5047 | 4040 |
| 3946 | Hmu1799 | 3251 | 3431 | 3326 | 3338 | 3461 | 4040 | 4798 |
683 symbols consensus ---------------MDLDDIDTIAVLGAGNMGHGIAEVAALAGYDVRLRDIKEEFVQDG #oth 1122222222222221442125322111111.....1....21..2.41...32.1.13. VNG1313 :::::::::::::::::V:::HS::::::::::::::::::M:::T::::::SA:L:::: hla1530 ::METFNHDGSDPFG:Q:E:VQRVT::::::::::::::::::::::A::::E:::::G: HVO_2815 ::::::::::::::::NV::V:S:T::::::::::::::::::::::V::::ED::::Q: Hbo2553 ::::::::::::::::E::::N::T::::::::::::::::::::Q:N::::N:::::N: NP4322A ::::::::::::::::EI:::E::::::::::::::::::::S::T:N:::::::::::: rrnAC1083 MRETLKPRPAVERYV::FE:::::::::::::::::T:::::::::::M::::D:::E:: Hmu1799 :::::::::::::::----------------::::::::::I:::::QM::::::::::: consensus YDQIEWSLGKLAEKDQLSQDEADAALDRVTPLVDLEEAVADADVVIEAVPEKMEIKKDVY #oth .12.....3....21112223.21..211324.1232113.1.1.1.1...1.2..21.. VNG1313 :::::::::::::S:::TEAA:::::::ISTH:EVSD::D:V::::::::::::::T::: hla1530 :::::::::::::::RIGE::::::::::EAF::::DSL::::::V:V:::::A:::::: HVO_2815 ::K:::::N::::::R::::D:::::A::STA:::G:::::::::::::::::A:::E:: Hbo2553 ::::::::::::::::::DE::N:::E::ATY:::A:S:S:::::::::::::D:::::: NP4322A :E::::::E:::::::ITDEK:ED:::N:::Y::V::::G:::F:::::::Q:D::Q::: rrnAC1083 ::N:::::N::::R:::T:E::::::::::::::V::::S:V:::::::::::::::::: Hmu1799 ::N:::::D:::::E:::::::::::E:::::::M:A::G:::::::::::::::::::: consensus TEVEEHAPEHAIFATNTSSLSITELSEVTERPEQFCGMHFFNPPVRMQLVEVISGAHTDD #oth 4111121.2311121.......11.11..1..21.1...........3.......21131 VNG1313 ::::A:::AD:V:::::::::::D::::::::AR:::::::::::::E:::::::::::: hla1530 D::V:Y:::E:V:V:::::::::::::::D:::R:::::::::::::D:::::::K::SE HVO_2815 A:L::Y::D::V:::::::::::::::::::::R:::::::::::::D::::::::::A: Hbo2553 ::L:AA::D:T:::::::::::S::AD:::::::::::::::::::::::::::::E:AE NP4322A SD::::L:::::VTS::::::::D:::::::::::A:::::::::::::::::::E:::E rrnAC1083 :::::::::N:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::SG: Hmu1799 GD::AY:::D::::::::::::::::::::::G::::::::::::::P:::::::E:S:: consensus ETLDAIEALAEDFGKTPVRVRKDSPGFIVNRILVPLMNEAAWLVHDDDATIAEVDSTTKF #oth 21123213..1211......1......1........1...1.3.23131.2111.1.1.1 VNG1313 AV:EC::S::A::::::::::::::::V::::::::L::::::::::E:::::::::::Y hla1530 D::EL::G:::SM:::::::::::::::::::::::::::::I:ESG::::ET::::::: HVO_2815 ::::LV:D:::SM:::::::::::::::::::::::::::::I::AG:::M::::A:::Y Hbo2553 ::M:V:SD:::AMD::::::H:::::::::::::::::::::A:ESG:T::::::::A:Y NP4322A :::AVT:::::::D::::::::::::::::::::::::::C:M:SE:A::VE:I:::::: rrnAC1083 D::E:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::: Hmu1799 :::::::::::A:D::::::::::::::::::::::::::C::::::V:::::::::::: consensus DMGLPMGSFELADQVGIDVGYHVLEYMHEVLGEAYEPCPLLEEKVEEERLGKKTGAGFYD #oth 11.....1...2.1..2..221..2..21...22.2.1.2.2131.3131.2.1.3.1.. VNG1313 :::::::A:::::::::::SHD::D::QD:::T::::::V:VDH::AGD::R:S:::::: hla1530 :::::::::::::::::::::::::::::::::::R:::::V::::A:E::::::S:::: HVO_2815 :::::::::::::Y::::::::::::::::::D::::::::S:::::GD::Q:::::::: Hbo2553 EI::::::::::::::::::::::Q:::::::D:::::::::::::::K::::::K:::: NP4322A :::::::::::G::::H::T:::::::ND::::::::A:F:::LI::::Y:::S:E:V:: rrnAC1083 :::::::::::S::::N:::L::::::::::::P:A::::::::::N:E::::::K:::: Hmu1799 :::::::::::S::::N:::L::::::::::::Q:A:::::::A::D::::::S:E:::: consensus Y-EDG-GADIPTDAGREDVANRLLAVMANEVAGLVGNDVADPAAIDRAVMLGGGFPDGPA #oth .11113.121.2.22211144..41......12.2211..1232..2..2..111.1... VNG1313 :GD:AA:::V::::I:A:I:D::T::::::::K:::GG:::::E::E:::::A:Y:E::: hla1530 :::N::::E:::::IDA::RK:::::::::::::A::::::AP:::::::::A::::::: HVO_2815 :::::A::E::H:E:S:A:K::::G::::::::::::::::::::::::K:::R:::::: Hbo2553 :::::E::QV:S:QTS:::SR::M::::::::::IQ:::::AD::::::::::::::::: NP4322A :::::D:::V:::::S:AI::::I:::::::GN::::::::::D::E:::::A::::::: rrnAC1083 :::N:::V:::::::::::EH::V:::::::GK::E::::PV:D::Q::Q:::::::::: Hmu1799 :::N:::V:::::::::::EH::::::::::GK::E::::PVGD::E::::::::::::: consensus KMADEAGLETLVDTLDELHEETGAARYEAADGLREAAESGG-FHGD------G--DDDAP #oth .2..42.133.212.2322121134.113324.222.42.33.11311111223414235 VNG1313 ::::A::ITY:HE::VAA::A::Q::::P::T:A:M:AA:ES:::R:::::::DE:A:GR hla1530 :L::SE::AE:::V::D::::::EK::::T:F::::::A:S:::::ESADTD:ET:G::L HVO_2815 ::::S::IAA:::A:::::D:::E:::::VEY::DL:Q::EG:Y:::::::G:EDESGDA Hbo2553 ::::D:::::::E:::::::K:::E::::V:L:::L::::DR:::S::::::DGG::AD: NP4322A :I:::T::D:::E::E::AD:VDHP:F:VS::::A::DE::::::G::::::-:::::GG rrnAC1083 :I::KT:::::I:::E:T::::::D::AV::::::::::::::Y:S::::::-::::::: Hmu1799 :L:::::::A:::A:ETAR:::::::::LSA::EA::RE::::YD:::::::-::EEAES consensus AEFDNISVEY-RDRVGHIELDRPHRMNTISGDLLDELSDAIDLLEDDDEVRAILLTGAGD #oth 52123242321324111121..11.1..11411211112.1.4143..1..12.11...1 VNG1313 R:::AV::SV:DGN:::::::::::::::::E::AD::::::V:G:::D:::V::::::E hla1530 :AY:TLN:AV:E::I::V:I:::::::::::E::::::::::R:DA::D::::::S:::: HVO_2815 PA::A:A::V:::G::::T::::::L::::VE:M::::E::::CA::::::TV::::::: Hbo2553 Y::E:::::I::::::::::::::::::::S::V:D::G:::A:GA::D::::::::::: NP4322A VD:T::EIT:PG:M::Q:V:::EA:::::NE:::::::E:::::::::::::L:I::::: rrnAC1083 :::::VT:::PG:M::::::::::::::V:P::M:D:A::V::::N:::::::::::::: Hmu1799 TDYES::LS:PEEY:AQ:::::::::::V:P:MM::IA::V:H:SE:::::::::::::: consensus RAFSAGADVQSMA-GNADPLEAIELSRKGQQTFGKLEECDKPVVAGIDGYCLGGGMELAT #oth 1........111.21311.331211..2..2......2322..1.1...11....1..12 VNG1313 K::::::::T:::::::::V::V::::M:::::::::AA:E::::A:::::::::::::: hla1530 :::::::::::::A:G:::IT:V::::Q::::::::::S::::::A:::::::::::::: HVO_2815 :::::::::T:I:A:GG::V:GV:I:::::::::::::L::::::::::F:::::::::M Hbo2553 :::::::::::::G:AG::TAGA:::::::R::::::::::::I:A::::::::::::SM NP4322A :::::::::T:::::S::::D::D::::::S:::::::::M::::::::FA::::F:::L rrnAC1083 K:::::::::A:::S::T::D::::::::::::::::::SM:::::::::A::::::::: Hmu1799 ::::::::::::::S::T:::::::::::::::::::S:PM:::::::::A::::::::: consensus CADLRIASERSELGQPEHNLGLLPGWGGTQRLARIVGEGRAKEIIFTADRYDAETMADYG #oth 12.2.2.11...1.1...1...1......1..42.1.2.....11.111.12111111.1 VNG1313 :::M:L::::::::::::D:::::::::::::KH::::::::::::::::FAP::L:::: hla1530 AT:::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::E:::L:::: HVO_2815 :::::::T::::::::::D::::::::::V::Q::::T::::::::S::::::::::::: Hbo2553 :::::::TK:::F:::::::::I::::::V::Q::::T:::::::::::::E:::::::: NP4322A :C:F::::::::::T:::::::::::::::::M::A:F:::::VV:::E:F:P:::Y::D rrnAC1083 :::::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::G:::::DE::E:: Hmu1799 :::M:V::::::::::::D:::::::::::::SN::::::::::::::E:::::E::::: consensus FINEVVDNDE-FEERALELAKDLAAGPPVAQRYTKRAMHAGRDDTDAGLEVEAQAFGHLM #oth 111.1.3212122.1.4.31332.1...11121..1..22.12.211...1.112..212 VNG1313 ::::::TTEA::::::W:::R:::::::I:MK::::::R:::::::::::I:::S::Q:: hla1530 ::::::PD:::LD:::R::VES::::::I::K::::::::::T:GE:::::::MG:::V: HVO_2815 :V::::E::DD:::::F:Y::RF:Q::::::::::::::N:WE:::S::::::::::L:F Hbo2553 ::::L:E:::::::Q:F:Y::QF:Q::::::::::::::N:WE:::::::::::S::L:F NP4322A VVT:::::ED::::::H:F:A:::::::IS::L:::::LR:WE:I:::::I::::::::: rrnAC1083 :::::::::A:LH:::::M:::M::::::::KL:::::L:::::I:::::::S::::::I Hmu1799 :V::::P::::ID:::::::A::::::::::EL::K::L::::::::::::::::::::I consensus NTDDLMEGITAFMGDGEPEFEGK #oth 3.2.1...23..22.11.1.4.1 VNG1313 ::Q:::::VS::SA:R::::N:E hla1530 ::::::::V:::::::::::::: HVO_2815 T:S:::::VA::TS:RD:::T:E Hbo2553 T:::::::M::::::R::D:K:E NP4322A E:::::::::::::::::::::: rrnAC1083 G:::V::::N::::::::D:::: Hmu1799 G:::V:::::::::::D:D:Q::