| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2540 | HVO_2034 | Hmu0683 | VNG0897 | hla1845 | HVO_1398 | Hbo0151 | rrnAC2651 | HQ2453A |
| 1626 | HVO_2034 | 2560 | 2002 | 1270 | 1158 | 1254 | 1260 | 1227 | 1188 |
| 1500 | Hmu0683 | 2002 | 2565 | 1166 | 1076 | 1189 | 1158 | 1231 | 1164 |
| 1763 | VNG0897 | 1270 | 1166 | 2643 | 1364 | 1563 | 1564 | 1502 | 1467 |
| 1728 | hla1845 | 1158 | 1076 | 1364 | 2539 | 1624 | 1557 | 1519 | 1368 |
| 2047 | HVO_1398 | 1254 | 1189 | 1563 | 1624 | 2696 | 2187 | 1705 | 1662 |
| 1996 | Hbo0151 | 1260 | 1158 | 1564 | 1557 | 2187 | 2701 | 1670 | 1598 |
| 1943 | rrnAC2651 | 1227 | 1231 | 1502 | 1519 | 1705 | 1670 | 2570 | 1727 |
| 1811 | HQ2453A | 1188 | 1164 | 1467 | 1368 | 1662 | 1598 | 1727 | 2725 |
399 symbols consensus MSTASA---------D-L---------------SYRRTLVGAAVALLAVIALLGLV-FPG #oth .346543222221242424352311111111113334232313534422243323312.4 HVO_2034 ::::R:LL:::::::-:-:::::::::::::::DDQ::::::L:::V::::::LF:DL:: Hmu0683 ::V:DYA::::::::-:-:::::::::::::::AEH:LA::GGL:A::AV:AIT:LDL:: VNG0897 :RK---:::::::::-:-:::::::::::::::PD:G::MA:LGG:A::VVA::V::::: hla1845 :HNPL:::DVPIPIL:D:IES::::::::::::D:V:S::VGTT:V:GLLG::::L:L:: HVO_1398 :::TT-::::::::I:R:RDTEL:::::::::::::A::::G::SVFLL::::::A:::S Hbo0151 :::Q:Q::::::::LNG:LERDW:::::::::::::E::A:G::GIFL::TM:::::::Q rrnAC2651 :TND::::::::::M:R:RSA:::::::::::::S:VLIAA::FLT:::L:GF::F:A:A HQ2453A ::DS:SETTGVNPGV:PEPDKEATREKGPLAPQ:S:GLTAW::IG:I:ALL:G:TA:::D consensus SIAGDLLGILTSRSTLESALRLAVPIALAALGGIFAEKSGVINIGLEGLLIISAFTAIAV #oth 234242351443432223211113..21.11..111.11.12......11.111122243 HVO_2034 :---::VTV----GA::R::QA:T::::::I::LY::::::F::::::FM:FG:LVGA:: Hmu0683 A---:::TV----GAA:RS:QA:M::::::I::LY::::::F::::::FM:FG:L::A:A VNG0897 :V::E::::ASRPIMA:I::::::::T::::::::::::::::::::::::::S:::VL: hla1845 ::::::A::VF:T::AA:TA:::A::V::G:::::::::::::::::::::::::VSVY: HVO_1398 ::W:NF:A::::::::S:::::S:::TF:::::::S::A::V:::::::::::::::VIT Hbo0151 ::WAN:FE:::D::::S:::::S:::VF:::::::::::::::::::::::::::V::L: rrnAC2651 :TP:QIFWV:A:K:::S:T:::S:::V:::::::::::::I::::::::::::::A::FG HQ2453A T:L:I:AD:I:DKD:FAA::::S::::F:::::::S:RA:::::::::::::::::::Y: consensus AWALGGEGAI----ALWVGFLAGILASVLLAGLFAVVCIRFKADQIIAGLAVWLIALGLA #oth 2333234434334151.3114322231321242.1112.212.1..1......111..11 HVO_2034 ::L:A:D:S:TQA:H:::A:V:VAVV:GV::T::::LL::YE:N::V::::::F:G::FG Hmu0683 ::LIS:::::TQG:D::LAI:VAVAFCA::TVA:::LT::Y:::::V::::::F:G::FG VNG0897 ::::::TTSA:::::::T::AG:V:::::::::::::::KYE::::::::::::V::::: hla1845 :SVV:IGN:VLGVP:I::::::::A::TA:S:V:GI:::E:::::::::::::::::::: HVO_1398 TAIV:P:MTVVGLP:I:I::F::::S:::FSA:::::::::::::::::::::::::::: Hbo0151 PAV::P::TTLFLPN::::::::::::::F:A::::::::Y::::::::::::::::::: rrnAC2651 :D:T:-----::::S::L:::I::V::T::::V::::::E:R:::::::::::::::::: HQ2453A TDIT:-----::::EI::::SG:VV::::::L:::::T:E:R:::::::::::::::::: consensus PFAATVFYGGVNTPSLGTT-DTITVPVLAE---------IPFFG-ALFDASPAVYLMLIA #oth ..312.4211211332234164352131321111111112233.2332213141233332 HVO_2034 ::::::LW:::SS:::PNI::::A:::::::::::::::::VL:RLF:::::L:L:TIVV Hmu0683 ::G:::VW:::SS:T:PNV:NNVV::G::::::::::::L:VL:RL:::T::L:L:T:VL VNG0897 :::SS:VF::K::T:INRF:SEW:::::HDAFVNSGVGILSYV:HV:LR:N:I::::FG: hla1845 ::MS:::F::::::N::AR:----------:::::::::---I::WHYS:T----MVV:: HVO_1398 ::::::Y::::::DN::::LG:W:I:::SD::::::::::::::::F:::D::::M::V: Hbo0151 ::S:::Y::::::DYI:::LP:WEI:::SD:::::::::L::::::V:S:T::::A:::: rrnAC2651 :::SQ:::::P::S:V::F:::::::T::::::::::::::::::::::::::::I:FL: HQ2453A :::SQ:I:NSP:::TV::::RS:S::::::::::::::::::::::::S:::S::ML::: consensus VVASWYVLNRTAFGRWVRAAGENPKALDTAGVDVSRVRYAGVLLSGVLAGMGGAALSLG- #oth 2321.41131.31.3122.1....3....1.12.21..113123..322.31.12.1231 HVO_2034 A::A:A::F::RY:Y::Q::::::E::::::I::N:::::T:VF:::M::L:::V::I:: Hmu0683 T:LA:V::Y::RY:Y:IQ::::::E:::::::::N:::::T:IF::AM::LA::T::I:: VNG0897 :AV::::::H:::::::E:S::::N:::::::N:H::::VS::V::L:S::::::::V:H hla1845 TL:::WA:::::::KHL::::::::::::V:IS::K::H:::::::::S:V::S::A:S: HVO_1398 :P:::::::::::::H:::S:::::::::V::::::::::::::::F:::I::S:::::: Hbo0151 :P:A:F:::::S::GH:::S::::R::::V::::::::::SA::::F:T:I::::::::: rrnAC2651 :A:::::::::T::::::::::::::::::::::::::::A::::::FS:::::::AIN: HQ2453A :::::::FE::::::::::S::::::::::::N:N::::::::I:::::::::S::::D: consensus IGQ-FTGNGQTMVNGKGFIAIVAYLFGNYNPLGAFGASLLFAGLDALQIRLQQIG-IAVP #oth 2.11.3.215..12.1.1...111.......3.121134..211123.232.2543132. HVO_2034 ::SG:::T:V:::D:R:W:::::::::::::::TY::::::GAM:M:::Q::T::::SL: Hmu0683 ::SG:::T:V:::D:R:W:::::::::::::I:::L:::::GAM:M:::Q::TV:::SL: VNG0897 V:S::V:::T::ID:::::::AT::::::::::T:::AM::S::ES:::GI::FTPYE:: hla1845 :::::I:S:D:::Q:::::::::::::::::::TL::GV:::::::I::::::L::Y:I: HVO_1398 L::::V::N::::::::::::::F:::::::V::::::F:::::E:A::::::VPGYG:: Hbo0151 L::::L::N::::::::::::::::::::::F::::::F:::::E:V:::::::QGY::: rrnAC2651 :::::::::P:::::::::::::::::::::V::LLSTT:::::::V:L:::TADV:::: HQ2453A L::::::::A:::::::::::::::::::::I:::L:TM:::::::I:TVF:LQ:::GL: consensus DSLIQTIPYVAVLVVLALVGRTRIPEAAGEHYESGED-- #oth 3312222.1.3.211.22..2..2.312.13.1112321 HVO_2034 G:ITGLF:::::::::VG::Y::V:S:V::S:DTE:-:: Hmu0683 G:ITGLF:::::::::T:::Y::V:A:V::A::TESE:: VNG0897 SQ:::V::::T:V:::V:::::::::::::Y::::D:R: hla1845 :T:V::::::V:IL:::::::::L:::::::::TED-:: HVO_1398 ::::::V:::T::::::::::::::A:S::::DT:D:NR Hbo0151 :E::::::::T::::::::::::::K::::::D:::::: rrnAC2651 :::V::::F:::I:::::::K::L:::::D::::::E:: HQ2453A QQ::RV::F:M:I:I::F:::::L::S:::::::::K::