[R] (-) COG1094 Predicted RNA-binding protein (contains KH domains) 9 genomes BUD0340 9 proteins a Hsa Halobacterium sp. NRC-1 b Hma Haloarcula marismortui f Hvo Haloferax volcanii g Hbo Halogeometricum borinquense h Hmu Halomicrobium mukohataei i Hut Halorhabdus utahensis j Hla Halorubrum lacusprofundi q Nph Natronomonas pharaonis x Hwa Haloquadratum walsbyi VNG2227 rrnAC2479 HVO_0134 Hbo1362 Hmu3161 Hut1973 hla0632 NP1006A HQ3051A

Pairwise sequence scores
Consensus score	1349	VNG2227	hla0632	HVO_0134	Hbo1362	HQ3051A	NP1006A	Hut1973	rrnAC2479	Hmu3161
1062	VNG2227	1366	845	956	890	901	963	979	990	990
948	hla0632	845	1324	926	987	932	860	853	858	866
1153	HVO_0134	956	926	1341	1111	1093	1000	1008	1041	1040
1095	Hbo1362	890	987	1111	1335	1179	947	941	973	984
1082	HQ3051A	901	932	1093	1179	1334	937	954	951	980
1141	NP1006A	963	860	1000	947	937	1378	1088	1099	1068
1162	Hut1973	979	853	1008	941	954	1088	1355	1136	1149
1166	rrnAC2479	990	858	1041	973	951	1099	1136	1355	1209
1152	Hmu3161	990	866	1040	984	980	1068	1149	1209	1360

188 symbols
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#oth            .1..11.2.....1..2..1.1.2..53.1.1111..13.2.311321..131131.111
VNG2227         :K:::::T::::::::D::::L:R::AA:::DI:V::QD:A::::RT::::R:MQ::E::
hla0632         ::::TV:::::::V::A:::::::::E::N:::::::::::::::ELD:::AA:V::::I
HVO_0134        :::::V:::::::::::::S:L::::S:::::::V:::N:::::D::::::::MV:::V:
Hbo1362         :::::V::::::::::::::::::::R::::::::::::::::::E:::::T:MV:::VI
HQ3051A         :K:::V:::::::::::::::::::::Q:::::N::::T:::::DD:::::R:ML:::::
NP1006A         :K::T::E:::::::::::::::K::SE::::::::::T:::RV::::::I::::G::::
Hut1973         :::::::::::::V:::::::::::::E::::::::::T:A::V:::::::::::G::::
rrnAC2479       ::::::::::::::::::::::::::E:::::::::::D:T:KV:::::::TA::G::::
Hmu3161         ::::::::::::::::::::::::::D:::::::::::::::GV::::::IT:::G::::

consensus       KAIGRGFAPEAALALLDDDMRMFELIDIDAATRNKNDLRRQKGRLIGENGRTRELMEELT
#oth            2.1....4.23.131.1211231131.14322..31.23.2...1...2......121.1
VNG2227         Q::::::K:DE::T:::::::::DT:::GR:A::D:::::K:::::::::::::::::::
hla0632         :::::::K::T::SI::H:L:TLD:::LSEH:::D:::Q:K:::I::::::::::I:::S
HVO_0134        R:V:::::::D:M:::::::M::::::::RH::::::M::::::::::::::::::::::
Hbo1362         R:V::::T:::::S::::E::A:::::LQQH:::::::Q:::::::::::::::::::::
HQ3051A         R::::::T:T:::SI:::E::T:::::L::H:::::::Q:::::::::::::::::::::
NP1006A         ::::::::::E::R::E:::QL::IV:::::::::K::::K:::::::S:::::::A::S
Hut1973         :::::::S:::::R:::G::M::DV:::::VA::P:::K:L::::::::::::::::D::
rrnAC2479       :::::::::DD:::::E:::M:::::::E::S:::::F::::::::::G:::::::Q::S
Hmu3161         :::::::N::D:::::::E:M::DVV:::::S::Q::FT:::::::::G:::::::::::

consensus       GADVVIYGSTLGIIGQPEEVDAVRRAAEMILDGAPHGAVYSFLERKHN-ELKTQGLEYHQ
#oth            ..4..11.1.2121.2.111111.2.21.1.1.....2..11...2211.1244143333
VNG2227         ::S:::::::F:V::::S:::VA:S::::L:::::::S::::::::RSE:::Q::M:::E
hla0632         ::N::V::::V:AV:::::LEV::::VG:L:::::::::::Y:::MS::::-DDDVSFNA
HVO_0134        ::::::::T:::::::::::EV::::V::::::::::::::::::::::::-:::FNVR:
Hbo1362         ::E:::R:T:::::::::::E:::::TG:::::::::::::::::::::::-:RDFDIQP
HQ3051A         ::E:::R:T:::V:::::::E:::::TG:L:::::::T::A::::::::::-:R:FNVQ:
NP1006A         :::::::::::::::A::Q:::::S::::::::::::::::::::R::::MQSNDI::::
Hut1973         :::::::::::S:::G::Q:::::E::::::E:::::S:::::::R::::M:H:::::::
rrnAC2479       ::A::::::::::::G::Q:::::E::::::::::::S::::::::::::M:HK::::::
Hmu3161         ::S::::::::::::G::Q:::::E::::L:E:::::S::::::::::::M:QK::N:::

consensus       FPG-----
#oth            36211111
VNG2227         ::::::::
hla0632         PQ-:::::
HVO_0134        NN-:::::
Hbo1362         SD-:::::
HQ3051A         SG-:::::
NP1006A         ::DGSRSA
Hut1973         :T::::::
rrnAC2479       :T::::::
Hmu3161         :H::::::