|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 5267 | VNG1511 | hla1641 | HQ1797A | HVO_2889 | Hbo2657 | NP2874A | Hut0586 | rrnAC0979 | Hmu1670 |
3354 | VNG1511 | 5174 | 2615 | 2535 | 2575 | 2565 | 2673 | 2505 | 2550 | 2719 |
3593 | hla1641 | 2615 | 5411 | 2825 | 3091 | 3040 | 2747 | 2674 | 2690 | 2816 |
3489 | HQ1797A | 2535 | 2825 | 5667 | 3122 | 3346 | 2636 | 2462 | 2656 | 2605 |
3694 | HVO_2889 | 2575 | 3091 | 3122 | 5449 | 3475 | 2741 | 2592 | 2699 | 2703 |
3659 | Hbo2657 | 2565 | 3040 | 3346 | 3475 | 5239 | 2800 | 2599 | 2642 | 2741 |
3536 | NP2874A | 2673 | 2747 | 2636 | 2741 | 2800 | 5178 | 2812 | 2887 | 2990 |
3415 | Hut0586 | 2505 | 2674 | 2462 | 2592 | 2599 | 2812 | 5439 | 3077 | 3024 |
3540 | rrnAC0979 | 2550 | 2690 | 2656 | 2699 | 2642 | 2887 | 3077 | 5410 | 3470 |
3692 | Hmu1670 | 2719 | 2816 | 2605 | 2703 | 2741 | 2990 | 3024 | 3470 | 5470 |
810 symbols consensus --MGSCIICGTSVD--GHICD--THEEDVLFEFRGDSPDQLTPGRYYRGTVDGFAEFGVF #oth 111231121142321113211114.2..12.1.1.24151.232.1.2.3...1.1.... VNG1511 MQ:AT::V::S:T:::::::A::::::::V:D:::::::::::::F:::::::::::::: hla1641 ::::::::::VDI:GG:R:::::P:Q:::V:D::::::K::V:N:F:::V:::Y:::::: HQ1797A ::------------::---M:WI::D:::W:D::::::Q:::A::::::::::::D:::: HVO_2889 ::------------::---M:WI::::::W:::::N::H::V:::F:::::::Y:D:::: Hbo2657 ::------------::---M:WI::D:::W::::::::H::::::::K:E:::::::::: NP2874A ::::N:::::::T::::LV::::V:Q:::::::T:NE:S::::::F:K:::::Y:::::: Hut0586 :::::::::::::E:::::::::I::::AV:::::ST::E:::::::::::::::::::: rrnAC0979 ::::::::::K::E:::R:::::L::::A::::::SRA:::SVD:::::S:::::::::: Hmu1670 :::::::::::::::::::::::L::::::::::::H:N:::TN:::S:S:::::::::: consensus VDIGDGVTGLLHRSELDRRLESLDWEPGDTVFVQVKNVRDNGNIDLGWSIRQSDREFRGV #oth 112244......1.1113.211.3.241.2.2.2.2211...11..31...12421...5 VNG1511 ::V:GT:::::::::VPG:VD::A:DV::D:::::TD:H::::::::::::E:M:D:::E hla1641 I:LSP:::::::::::::::D::G:::::E::::::G:::::::::A:::::A::::::: HQ1797A I:LAS::::::::::::::::T::::SD:::::::::::::::::::::::::QS::::S HVO_2889 ::LASN:::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::S::::A Hbo2657 ::LAS:::::::::::::::::::::A::::::::::I:::::::::::::::E:::::S NP2874A IN::-N::::::::K::Q:I:::::DE::E:S:::N::::::D:::DS::::TAD::::M Hut0586 :::::S::::::E::::S:::::S:Q:::::Y:R:T:::::::V::S:::::A:D::::: rrnAC0979 :::::S:::::::::::Q::D::::DS::::Y:::::::::::V:::::::::E:::::: Hmu1670 :::::R:::::::::::Q::D::::::::::::K::::::::::::::::::AE:::::T consensus LIHDPDGDHDGLPEEEDEDD-------------------------------DAAAEPDDG #oth 212115435464234733354322222343221111111111111111111668641344 VNG1511 :V:::AN:S:AALPAD::A:SD:::::::::::::::::::::::::::::----TT::: hla1641 :VQ:--::TEH::::GG:E-:::::::SDA:::::::::::::::::::::E:D::::EL HQ1797A E::::T:AN::E:VGSET::NTDAELTTEATATPSVSRGGSDADAATVKRTP::TSTE:T HVO_2889 R:::::::A::Q:V:Q:AESGGPTTVKTRPKT:::::::::::::::::::GKTTK:AGV Hbo2657 R::::N:ED::K:V::SD:S:::::::SSA:::::::::::::::::::::PVKKK:K:V NP2874A :VQT:::E:--::DAA:D:EAD:::::ADE:::::::::::::::::::::QTGGS:ESS Hut0586 ::D:::E::EL::::T::PI::::::::::::::::::::::::::::::::EQST::ES rrnAC0979 :VD::EIG:SV:L:N::DEV::::::::::::::::::::::::::::::::EE:A:EST Hmu1670 ::D::EF:TAR:ADDVE::ESG:::::::::::::::::::::::::::::NGRE::AT: consensus DT--TDDERDADSQ-------D-D------A-E---TGGDAAAADEAERAEDADDTAEAA #oth 334333525354543233333363454554353445454564853554734642545345 VNG1511 :::::::S:::ETA:::::::-:-::::::-:-:::--------:GGK:VS:::A:T:R: hla1641 :V::A:::TADA:D::::::::ESADVDEA:EPDEGD:DVS:E:::VAK:DE:::EGG:D HQ1797A S:AS::ETIS::TDQETPGESANTEAGITA:ETETK:ETVSVS:ENTST:TN:AS:QSPS HVO_2889 S:SSEQT:S:::AEPEPEPKPES:AGDEDR:PTAGDVVD:I::NG:S:QEA::EPES:PE Hbo2657 S:::KSR::NGE:::::::::-:-::::::-:-:::----TTN::DGAV::SDA::QD:: NP2874A :DGP:TQ:PSV:E::::::::-:-::::::-:-::::::NPSDPEL::M:TES:EDD::: Hut0586 PESTESEST:SKQT::::::::ATTTGAVRTR:DSQ:::G:VGLE:S:S:SA::ES:S:G rrnAC0979 ADES:SQSD:ES:A::::::::D:SGASQPDS:SSTSA:AVSR:SDDD:V:GTASVGGND Hmu1670 :D::A:S:PS::D:TAEATTT:T:SSADDQTA:ATT:DA:::KVSQ:DDS:RVERS:SVV consensus SDAEEAEADEDDDEA----------DAEA-------ELTDERERVAIDSLDDRVGDAVRI #oth 354445444432425111111111136452124445364335361523414132123222 VNG1511 A::SFEFSGA:::DT:::::::::::H:T:::::::--------:RV:A:::H:D:::TV hla1641 ETD:GD:S:A:EG:N::::::::::ESG:DESAEDDD:D::::::E:GT:T:A::::A:: HQ1797A :TTQGIDV:D:::DELSNQSPPVSDSPQKTESEALN::A:D::P:S::::S::::SD:Q: HVO_2889 ::S:SK:DA:S:::Q::::::::::EV:T:::DADA:SA::A:::TLA:I::::::VI:V Hbo2657 AET:S:::ETAEA:T::::::::::PTHE:::::AEAE::RF:L:S:EN:S::::::::: NP2874A AE::::::GDV:A:S:::::::::::IDR:::::::--------::VET:R:::::V::L Hut0586 :ADV:GT::::VEDE::::::::::P:::::::::::R:P:PPS:DVGD:EGWI::T::: rrnAC0979 :GSNT:VMT:S:E:::::::::::::::S:EASQSD:T:::PVAA::GD:::H::AD::L Hmu1670 GQGSTGT:ES::TS::::::::::::::S:::DDAVDQQRDHPV::V:::::HE::D::L consensus EGEIVSVRQTSGPTVFELRDETGTVDCAAFVEAGVRAYPEVEEGDIVRLDGEVERRRGEL #oth 2.11243...1...1..23.1114112.....1......21253131213.2.141.112 VNG1511 ::::TAA:::::::::::T::::A::A:::::::::::::I:P:AV:Q:T:T::::::D: hla1641 D::V::::::G::::::VL::::V::V:::::P::::::DI:I::A::I:::::SH::DV HQ1797A :::::EA:::G::::::::::S:::E:::::::::::::D:GD::::::N:::::::::I HVO_2889 ::::A:::::G:::::::::::AIA:::::::::::::::::V::Y::I::::::::::: Hbo2657 :::V::T:::G:::I::I:::::V:::::::::::::::::G:S::::::::::V::D:: NP2874A ::VVA::::::::::::::::::I::::::::::::::::I:TD:V:::::::RL::D:I Hut0586 T::::DA:::::::::::::G::S:::::::::::::::S::::AV:EI::::RE::::: rrnAC0979 :::V:GI:::::::::::Q::::::::::::::::::::::::D:YI::S:D:RE::::: Hmu1670 :::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::DIV:E:::::::D:R:::::I consensus QVETEELVALEGDEAETVEQRLADALDDRARPDTVDPLA-ADDAVAALSDDLVDAATAIR #oth .1.12313512323123.45123212431.1.24443.114142221343423111231. VNG1511 :::::AVTE:T::R:DE:RN:MDA::::::A:A:TAL::PD::::::VH::I::::::V: hla1641 :::S:A::L:::E:::::RR:::E::TAE:::EGLQ::::G:ET::E:A:G:L:::E::: HQ1797A ::::N::TP:::AA:::::N::V:::TAE:::E:ATV:::T::PLS:::SQF:::::::: HVO_2889 :I:::::TI:D::::D::A:::::::S:E::::A:A:::::HEP:::VGKS:L:::E::: Hbo2657 ::::::::::::E::DA:V:::D::MAA:::::S:E:::::HAP:E:VTEQ:R:::ETV: NP2874A ::::DS:::::D:AR:D::S:MDA:IEN::::ES:E::::D::::S:IT::IA::::E:: Hut0586 :::::::ELFDE:KR:A:LEEIEAT:SE:::::EI:::V:::E::::E:ESIR:VVGE:: rrnAC0979 :::::D:DV::AE:R:E:::::::::::E:::::A:::::E:T:::::::E::E:::Q:: Hmu1670 :::::A::::DDE:RQ::VD:M::::::::::AA::A:::E:PTIE::A::::::::::: consensus RAVLESRPVVVRHPATADGYVAGAAIERAVLPLIREEHARADAEYHYFDRRPLEDGVYGM #oth 1.1122..11...42.21..11.3.2...3..113121424..3..121...11232.22 VNG1511 :::IDA:::I::::T:VE:::::T:::::L:::::D::::E::::::V:::::D:AF:TI hla1641 ::::::::I::::::::::::::::V:::::::::::::KS:::::::T::::D:P:::: HQ1797A ::::::::I::::A:::::::::::::::::::VK:::::::::::F:T::::D:P:::: HVO_2889 ::::::::I::::T:::::::::::V::::::::::::P:D:::::::T:::::EA:::: Hbo2657 ::I:::::I::::::::::::::::V::::::R:::::E:::::::::T::::D:PI::: NP2874A :::::::::::::D::T::::::::::::::::::D:YES:::V::::::::::::::D: Hut0586 :::::D:::I:::S::T::::G:::::::::::V:DR:D:R::::::I::::I:GD:::L rrnAC0979 K:::TD:::I:::AN:::::L::S:L:::A:::VT:Q:R::::K::::::::I:G:::D: Hmu1670 :::ITD:::I:::S:::::::::V:L:::T:::VAD::R::::Q::::::::::G:::D: consensus DDATNDVTRMLQDRERHDEKLPLFVFVGAGGTAESLDGLDLLDVYGAPRVVIDAAVADDA #oth 12..3.2.4..3223..1.21..211212.2.42.2.122..31.1244..2.3542143 VNG1511 ::::G:::S::EAAH:::::H:::::::T:S:T::T:A:::::I:D:DT::V:GGY:::: hla1641 :A::::A:::::::D::::Q::::LL::T:S:T::A::I:::S:::VNA::V::E:::PE HQ1797A :T::::::Q::::N:::::::::V:L::V:::VD::::IE::G::D::::::::GDL:E: HVO_2889 :A:::::::::E::D::::::::VLLL:::S::::::::G::G:::SE:::V:::P:::E Hbo2657 :A:::::::::::NQ::::::::VLLL:V:A::::::::G:::::::E:::V:::A::EE NP2874A ::::K::::::D::::::::::::::AA::S::A:T:::E:::::D:::::L:GRPV::: Hut0586 ::::T::::::G:::::::N:::L:::A::::E:::::FE:::::D:SK::::-T::EST rrnAC0979 ::::K:T:T::DN::::E:::::::::A::::R:::::F:::N:::::S::::DIDV:G: Hmu1670 Q:::K:::N::EN::::::::::::::A::::R:::::F::::::::::::::D::::EL consensus VADEVDALVSPSADGADAA---------STGALAANLAAAVNDDVRDDLAHLPAVSYWDE #oth 36353.23131742253564222211112331121412231233124125.....11.43 VNG1511 --AGM:V::::T:A:EQPV:::::::::N::::G:Q:::VI:::::E::::::::A::TD hla1641 TREA::T::::EI::V::DL:::::::::::::V:S::S::::E::T::R::::::::A: HQ1797A ILT:::TV:::LTESN:SLTAVPI::::::::VG:::::TI:SEITAE:E:::::::::Q HVO_2889 ::A:::V::N:ARE::::RDL::::::::V::::ST:SV:::::::::VS::::::::EN Hbo2657 :E:VA::V:N:GLA:T:::DL::::::::::::G:::::::DSG::E:I:::::::::ED NP2874A :D::I::P:T--:::R---:::::::::TSATV::AV:::::G:::A::E:::::::::: Hut0586 IV:T:::ALA:K::ATSV:IADGTTRGPTAS::::TVG:H:EE:::P:::::::::::G: rrnAC0979 :V:T:::V::::::AVSET:::::::::TST:::::V::H::E::::::Q::::::F:ED Hmu1670 I::S::T:::::LA::SPT:::::::::TAT:::::V::H::EH:Q:::V::::::F::: consensus T--PAAYVDLAAEAGYDADAVRELREAVALEAYYQSYEDKRELITDLLFG---------- #oth 411.56.422.44111.4342421.1.1....2....1...1.13..1121111111212 VNG1511 L::::::A::::D:S::S::REA::D::::::F:::::::::::A:::W::::::::::: hla1641 ::::DR::E::RD:::::ER:A:::::::::::::::Q:::::VA::::E:::::::::: HQ1797A :QA:SV:::R::A:::::TQT::::::I:::::::::Q:::::::::::E:::::::::: HVO_2889 C:::QQ:L:::ESH:F:V:R:::::::::::::::::Q::::::A::::D:::::::::: Hbo2657 :::::E::E::E:::::::RT::::::I:::::::::::::::::::::DDGVSPGAQRA NP2874A ::::TV:T:::TG::F:EET:EQ::::I::::F::::::::Q::I::::::::::::::: Hut0586 V:::E::AAA:::::::GT::S:I:::::::::::::::::::V:::::::::::::GRE rrnAC0979 I:::EP:I:A:SG::::ET::S::::::::::H::::::::::::::V:::::::::::: Hmu1670 :::::S:L:A:::::::EAS:T:::D::::::::::::::::::K::::::::::::::: consensus ----DDGGLAGHVSEQFREKLDAEVETAQANLDRREVDGVTVAVLDTDAYTHRYDFPPTS #oth 33233442..32111..141124123..3312342542344342..41211.211...46 VNG1511 :::DA:DD::D:IAT:::DR:AT:LS::EPH:ST:HH:::AFET::VG::::Q:::::VD hla1641 :::::S:N::A::::::::::ET:IK::TE:VVTEA::::EF::::::G::::::::::P HQ1797A ::::::::::::::::::L:::::::::E:::ETYRA:N:E:VK::A:::S::F:::::A HVO_2889 ::::A:E:::::::::::I::ED:I:::::::E::::GAISA::::S:::S::F:::::G Hbo2657 GGDAVE:N::A:IA::::I::::::::::::I:V::EA::::::::A::::::F:::::: NP2874A ::::EQT:::AQ:::::DT::E::L:::TT:::E:T:::YD:T:::::::::T::::::R Hut0586 TTDA:VR:::S:::::::::::VA:::::E:::::S:GDE:IG:::I:RF::T:::::AT rrnAC0979 DDEE:V::::::IA::::::V:E::S::R::::H:T::::DI:::::::F::Q:E:::E: Hmu1670 DDED:VT::::N:A:::::::AT::D::T::IE:E:IG:T:::::::::F::::::::ST consensus LLLDELHRRARSGD--ATVGVGTDELFVRATDDLDVRAVADAA-AEAVPEAGVTARGARE #oth 1.213.3.252444421312533.2131124532122221343142422412143424.3 VNG1511 ::::A:::::D:T:::VLL:A:E:A:R::SD:AV::H::V::IDDDLTTT:::::::::D hla1641 ::::D::::NAN:EAY::::I:M:::YL:T:A:VS::D::ERT:::LA:G:D::TA:L:: HQ1797A ::SET:::QT::ESS:V::VYS::::::H::T:::I::::S:::GNT:::G::::V:V:Q HVO_2889 ::V::::::T:E::AFV::AL:M:::YL:::G:::L:::VES::::KA:A::LA:A:I:: Hbo2657 ::V::::::N:E::EYV::ATS:::::::T:::V:I::I:E:::RD::::G::::VAV:D NP2874A ::::::S::LDAD-:::V:::A::::HL::A::I:IS::::TV::::::N:::SDP:::: Hut0586 ::::::Y::SDDLT:::I:::DE:::H::SGHE::::ELV::::D:T:EG:DLEPLST:S rrnAC0979 ::::::::DV:DESD::VL:IS::TMY:::NG:::LHELVNEV:S:R:::G::AT:SV:: Hmu1670 I:::::F:Q:D::TD::L:::AD:T:::::DQTV::HDL:::I:D::A:::A:RT:S::: consensus GRIEFLAGERDAVLDAVVDAVAEQF----- #oth 43211.2.3.33131.21214223332111 VNG1511 ::::::::::::::::::::I:A:LA:::: hla1641 :K::::S::::::E::I:A::::A:::::: HQ1797A N:V:::::A:ES:V::::::AVA:INN::: HVO_2889 ::::::T:A::EA:E::L::A::::::::: Hbo2657 N:::::S:A::E:V::::T:TVD::::::: NP2874A PKL:::::K::::I::::::::::VTAPSA Hut0586 H:::::::Q:ST:V:::L::IVDSV::::: rrnAC0979 :T:RY:::::P:::::TL:VL:DEL::::: Hmu1670 QS:R::S::::::I::TLAV:G::::::::