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[L] (-) COG1107 Archaea-specific RecJ-like exonuclease, contains DnaJ-type Zn finger domain
9 genomes BUD0264 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1511

rrnAC0979

HVO_2889

Hbo2657

Hmu1670

Hut0586

hla1641

NP2874A

HQ1797A

Pairwise sequence scores
Consensus score5267 VNG1511 hla1641 HQ1797A HVO_2889 Hbo2657 NP2874A Hut0586 rrnAC0979 Hmu1670
3354VNG1511 5174 2615 2535 2575 2565 2673 2505 2550 2719
3593hla1641 2615 5411 2825 3091 3040 2747 2674 2690 2816
3489HQ1797A 2535 2825 5667 3122 3346 2636 2462 2656 2605
3694HVO_2889 2575 3091 3122 5449 3475 2741 2592 2699 2703
3659Hbo2657 2565 3040 3346 3475 5239 2800 2599 2642 2741
3536NP2874A 2673 2747 2636 2741 2800 5178 2812 2887 2990
3415Hut0586 2505 2674 2462 2592 2599 2812 5439 3077 3024
3540rrnAC0979 2550 2690 2656 2699 2642 2887 3077 5410 3470
3692Hmu1670 2719 2816 2605 2703 2741 2990 3024 3470 5470

810 symbols
consensus       --MGSCIICGTSVD--GHICD--THEEDVLFEFRGDSPDQLTPGRYYRGTVDGFAEFGVF
#oth            111231121142321113211114.2..12.1.1.24151.232.1.2.3...1.1....
VNG1511         MQ:AT::V::S:T:::::::A::::::::V:D:::::::::::::F::::::::::::::
hla1641         ::::::::::VDI:GG:R:::::P:Q:::V:D::::::K::V:N:F:::V:::Y::::::
HQ1797A         ::------------::---M:WI::D:::W:D::::::Q:::A::::::::::::D::::
HVO_2889        ::------------::---M:WI::::::W:::::N::H::V:::F:::::::Y:D::::
Hbo2657         ::------------::---M:WI::D:::W::::::::H::::::::K:E::::::::::
NP2874A         ::::N:::::::T::::LV::::V:Q:::::::T:NE:S::::::F:K:::::Y::::::
Hut0586         :::::::::::::E:::::::::I::::AV:::::ST::E::::::::::::::::::::
rrnAC0979       ::::::::::K::E:::R:::::L::::A::::::SRA:::SVD:::::S::::::::::
Hmu1670         :::::::::::::::::::::::L::::::::::::H:N:::TN:::S:S::::::::::

consensus       VDIGDGVTGLLHRSELDRRLESLDWEPGDTVFVQVKNVRDNGNIDLGWSIRQSDREFRGV
#oth            112244......1.1113.211.3.241.2.2.2.2211...11..31...12421...5
VNG1511         ::V:GT:::::::::VPG:VD::A:DV::D:::::TD:H::::::::::::E:M:D:::E
hla1641         I:LSP:::::::::::::::D::G:::::E::::::G:::::::::A:::::A:::::::
HQ1797A         I:LAS::::::::::::::::T::::SD:::::::::::::::::::::::::QS::::S
HVO_2889        ::LASN:::::::::::::::::::::::E::::::::::::::::::::::::S::::A
Hbo2657         ::LAS:::::::::::::::::::::A::::::::::I:::::::::::::::E:::::S
NP2874A         IN::-N::::::::K::Q:I:::::DE::E:S:::N::::::D:::DS::::TAD::::M
Hut0586         :::::S::::::E::::S:::::S:Q:::::Y:R:T:::::::V::S:::::A:D:::::
rrnAC0979       :::::S:::::::::::Q::D::::DS::::Y:::::::::::V:::::::::E::::::
Hmu1670         :::::R:::::::::::Q::D::::::::::::K::::::::::::::::::AE:::::T

consensus       LIHDPDGDHDGLPEEEDEDD-------------------------------DAAAEPDDG
#oth            212115435464234733354322222343221111111111111111111668641344
VNG1511         :V:::AN:S:AALPAD::A:SD:::::::::::::::::::::::::::::----TT:::
hla1641         :VQ:--::TEH::::GG:E-:::::::SDA:::::::::::::::::::::E:D::::EL
HQ1797A         E::::T:AN::E:VGSET::NTDAELTTEATATPSVSRGGSDADAATVKRTP::TSTE:T
HVO_2889        R:::::::A::Q:V:Q:AESGGPTTVKTRPKT:::::::::::::::::::GKTTK:AGV
Hbo2657         R::::N:ED::K:V::SD:S:::::::SSA:::::::::::::::::::::PVKKK:K:V
NP2874A         :VQT:::E:--::DAA:D:EAD:::::ADE:::::::::::::::::::::QTGGS:ESS
Hut0586         ::D:::E::EL::::T::PI::::::::::::::::::::::::::::::::EQST::ES
rrnAC0979       :VD::EIG:SV:L:N::DEV::::::::::::::::::::::::::::::::EE:A:EST
Hmu1670         ::D::EF:TAR:ADDVE::ESG:::::::::::::::::::::::::::::NGRE::AT:

consensus       DT--TDDERDADSQ-------D-D------A-E---TGGDAAAADEAERAEDADDTAEAA
#oth            334333525354543233333363454554353445454564853554734642545345
VNG1511         :::::::S:::ETA:::::::-:-::::::-:-:::--------:GGK:VS:::A:T:R:
hla1641         :V::A:::TADA:D::::::::ESADVDEA:EPDEGD:DVS:E:::VAK:DE:::EGG:D
HQ1797A         S:AS::ETIS::TDQETPGESANTEAGITA:ETETK:ETVSVS:ENTST:TN:AS:QSPS
HVO_2889        S:SSEQT:S:::AEPEPEPKPES:AGDEDR:PTAGDVVD:I::NG:S:QEA::EPES:PE
Hbo2657         S:::KSR::NGE:::::::::-:-::::::-:-:::----TTN::DGAV::SDA::QD::
NP2874A         :DGP:TQ:PSV:E::::::::-:-::::::-:-::::::NPSDPEL::M:TES:EDD:::
Hut0586         PESTESEST:SKQT::::::::ATTTGAVRTR:DSQ:::G:VGLE:S:S:SA::ES:S:G
rrnAC0979       ADES:SQSD:ES:A::::::::D:SGASQPDS:SSTSA:AVSR:SDDD:V:GTASVGGND
Hmu1670         :D::A:S:PS::D:TAEATTT:T:SSADDQTA:ATT:DA:::KVSQ:DDS:RVERS:SVV

consensus       SDAEEAEADEDDDEA----------DAEA-------ELTDERERVAIDSLDDRVGDAVRI
#oth            354445444432425111111111136452124445364335361523414132123222
VNG1511         A::SFEFSGA:::DT:::::::::::H:T:::::::--------:RV:A:::H:D:::TV
hla1641         ETD:GD:S:A:EG:N::::::::::ESG:DESAEDDD:D::::::E:GT:T:A::::A::
HQ1797A         :TTQGIDV:D:::DELSNQSPPVSDSPQKTESEALN::A:D::P:S::::S::::SD:Q:
HVO_2889        ::S:SK:DA:S:::Q::::::::::EV:T:::DADA:SA::A:::TLA:I::::::VI:V
Hbo2657         AET:S:::ETAEA:T::::::::::PTHE:::::AEAE::RF:L:S:EN:S:::::::::
NP2874A         AE::::::GDV:A:S:::::::::::IDR:::::::--------::VET:R:::::V::L
Hut0586         :ADV:GT::::VEDE::::::::::P:::::::::::R:P:PPS:DVGD:EGWI::T:::
rrnAC0979       :GSNT:VMT:S:E:::::::::::::::S:EASQSD:T:::PVAA::GD:::H::AD::L
Hmu1670         GQGSTGT:ES::TS::::::::::::::S:::DDAVDQQRDHPV::V:::::HE::D::L

consensus       EGEIVSVRQTSGPTVFELRDETGTVDCAAFVEAGVRAYPEVEEGDIVRLDGEVERRRGEL
#oth            2.11243...1...1..23.1114112.....1......21253131213.2.141.112
VNG1511         ::::TAA:::::::::::T::::A::A:::::::::::::I:P:AV:Q:T:T::::::D:
hla1641         D::V::::::G::::::VL::::V::V:::::P::::::DI:I::A::I:::::SH::DV
HQ1797A         :::::EA:::G::::::::::S:::E:::::::::::::D:GD::::::N:::::::::I
HVO_2889        ::::A:::::G:::::::::::AIA:::::::::::::::::V::Y::I:::::::::::
Hbo2657         :::V::T:::G:::I::I:::::V:::::::::::::::::G:S::::::::::V::D::
NP2874A         ::VVA::::::::::::::::::I::::::::::::::::I:TD:V:::::::RL::D:I
Hut0586         T::::DA:::::::::::::G::S:::::::::::::::S::::AV:EI::::RE:::::
rrnAC0979       :::V:GI:::::::::::Q::::::::::::::::::::::::D:YI::S:D:RE:::::
Hmu1670         :::::D:::::::::::::::::::::::::::::::::DIV:E:::::::D:R:::::I

consensus       QVETEELVALEGDEAETVEQRLADALDDRARPDTVDPLA-ADDAVAALSDDLVDAATAIR
#oth            .1.12313512323123.45123212431.1.24443.114142221343423111231.
VNG1511         :::::AVTE:T::R:DE:RN:MDA::::::A:A:TAL::PD::::::VH::I::::::V:
hla1641         :::S:A::L:::E:::::RR:::E::TAE:::EGLQ::::G:ET::E:A:G:L:::E:::
HQ1797A         ::::N::TP:::AA:::::N::V:::TAE:::E:ATV:::T::PLS:::SQF::::::::
HVO_2889        :I:::::TI:D::::D::A:::::::S:E::::A:A:::::HEP:::VGKS:L:::E:::
Hbo2657         ::::::::::::E::DA:V:::D::MAA:::::S:E:::::HAP:E:VTEQ:R:::ETV:
NP2874A         ::::DS:::::D:AR:D::S:MDA:IEN::::ES:E::::D::::S:IT::IA::::E::
Hut0586         :::::::ELFDE:KR:A:LEEIEAT:SE:::::EI:::V:::E::::E:ESIR:VVGE::
rrnAC0979       :::::D:DV::AE:R:E:::::::::::E:::::A:::::E:T:::::::E::E:::Q::
Hmu1670         :::::A::::DDE:RQ::VD:M::::::::::AA::A:::E:PTIE::A:::::::::::

consensus       RAVLESRPVVVRHPATADGYVAGAAIERAVLPLIREEHARADAEYHYFDRRPLEDGVYGM
#oth            1.1122..11...42.21..11.3.2...3..113121424..3..121...11232.22
VNG1511         :::IDA:::I::::T:VE:::::T:::::L:::::D::::E::::::V:::::D:AF:TI
hla1641         ::::::::I::::::::::::::::V:::::::::::::KS:::::::T::::D:P::::
HQ1797A         ::::::::I::::A:::::::::::::::::::VK:::::::::::F:T::::D:P::::
HVO_2889        ::::::::I::::T:::::::::::V::::::::::::P:D:::::::T:::::EA::::
Hbo2657         ::I:::::I::::::::::::::::V::::::R:::::E:::::::::T::::D:PI:::
NP2874A         :::::::::::::D::T::::::::::::::::::D:YES:::V::::::::::::::D:
Hut0586         :::::D:::I:::S::T::::G:::::::::::V:DR:D:R::::::I::::I:GD:::L
rrnAC0979       K:::TD:::I:::AN:::::L::S:L:::A:::VT:Q:R::::K::::::::I:G:::D:
Hmu1670         :::ITD:::I:::S:::::::::V:L:::T:::VAD::R::::Q::::::::::G:::D:

consensus       DDATNDVTRMLQDRERHDEKLPLFVFVGAGGTAESLDGLDLLDVYGAPRVVIDAAVADDA
#oth            12..3.2.4..3223..1.21..211212.2.42.2.122..31.1244..2.3542143
VNG1511         ::::G:::S::EAAH:::::H:::::::T:S:T::T:A:::::I:D:DT::V:GGY::::
hla1641         :A::::A:::::::D::::Q::::LL::T:S:T::A::I:::S:::VNA::V::E:::PE
HQ1797A         :T::::::Q::::N:::::::::V:L::V:::VD::::IE::G::D::::::::GDL:E:
HVO_2889        :A:::::::::E::D::::::::VLLL:::S::::::::G::G:::SE:::V:::P:::E
Hbo2657         :A:::::::::::NQ::::::::VLLL:V:A::::::::G:::::::E:::V:::A::EE
NP2874A         ::::K::::::D::::::::::::::AA::S::A:T:::E:::::D:::::L:GRPV:::
Hut0586         ::::T::::::G:::::::N:::L:::A::::E:::::FE:::::D:SK::::-T::EST
rrnAC0979       ::::K:T:T::DN::::E:::::::::A::::R:::::F:::N:::::S::::DIDV:G:
Hmu1670         Q:::K:::N::EN::::::::::::::A::::R:::::F::::::::::::::D::::EL

consensus       VADEVDALVSPSADGADAA---------STGALAANLAAAVNDDVRDDLAHLPAVSYWDE
#oth            36353.23131742253564222211112331121412231233124125.....11.43
VNG1511         --AGM:V::::T:A:EQPV:::::::::N::::G:Q:::VI:::::E::::::::A::TD
hla1641         TREA::T::::EI::V::DL:::::::::::::V:S::S::::E::T::R::::::::A:
HQ1797A         ILT:::TV:::LTESN:SLTAVPI::::::::VG:::::TI:SEITAE:E:::::::::Q
HVO_2889        ::A:::V::N:ARE::::RDL::::::::V::::ST:SV:::::::::VS::::::::EN
Hbo2657         :E:VA::V:N:GLA:T:::DL::::::::::::G:::::::DSG::E:I:::::::::ED
NP2874A         :D::I::P:T--:::R---:::::::::TSATV::AV:::::G:::A::E::::::::::
Hut0586         IV:T:::ALA:K::ATSV:IADGTTRGPTAS::::TVG:H:EE:::P:::::::::::G:
rrnAC0979       :V:T:::V::::::AVSET:::::::::TST:::::V::H::E::::::Q::::::F:ED
Hmu1670         I::S::T:::::LA::SPT:::::::::TAT:::::V::H::EH:Q:::V::::::F:::

consensus       T--PAAYVDLAAEAGYDADAVRELREAVALEAYYQSYEDKRELITDLLFG----------
#oth            411.56.422.44111.4342421.1.1....2....1...1.13..1121111111212
VNG1511         L::::::A::::D:S::S::REA::D::::::F:::::::::::A:::W:::::::::::
hla1641         ::::DR::E::RD:::::ER:A:::::::::::::::Q:::::VA::::E::::::::::
HQ1797A         :QA:SV:::R::A:::::TQT::::::I:::::::::Q:::::::::::E::::::::::
HVO_2889        C:::QQ:L:::ESH:F:V:R:::::::::::::::::Q::::::A::::D::::::::::
Hbo2657         :::::E::E::E:::::::RT::::::I:::::::::::::::::::::DDGVSPGAQRA
NP2874A         ::::TV:T:::TG::F:EET:EQ::::I::::F::::::::Q::I:::::::::::::::
Hut0586         V:::E::AAA:::::::GT::S:I:::::::::::::::::::V:::::::::::::GRE
rrnAC0979       I:::EP:I:A:SG::::ET::S::::::::::H::::::::::::::V::::::::::::
Hmu1670         :::::S:L:A:::::::EAS:T:::D::::::::::::::::::K:::::::::::::::

consensus       ----DDGGLAGHVSEQFREKLDAEVETAQANLDRREVDGVTVAVLDTDAYTHRYDFPPTS
#oth            33233442..32111..141124123..3312342542344342..41211.211...46
VNG1511         :::DA:DD::D:IAT:::DR:AT:LS::EPH:ST:HH:::AFET::VG::::Q:::::VD
hla1641         :::::S:N::A::::::::::ET:IK::TE:VVTEA::::EF::::::G::::::::::P
HQ1797A         ::::::::::::::::::L:::::::::E:::ETYRA:N:E:VK::A:::S::F:::::A
HVO_2889        ::::A:E:::::::::::I::ED:I:::::::E::::GAISA::::S:::S::F:::::G
Hbo2657         GGDAVE:N::A:IA::::I::::::::::::I:V::EA::::::::A::::::F::::::
NP2874A         ::::EQT:::AQ:::::DT::E::L:::TT:::E:T:::YD:T:::::::::T::::::R
Hut0586         TTDA:VR:::S:::::::::::VA:::::E:::::S:GDE:IG:::I:RF::T:::::AT
rrnAC0979       DDEE:V::::::IA::::::V:E::S::R::::H:T::::DI:::::::F::Q:E:::E:
Hmu1670         DDED:VT::::N:A:::::::AT::D::T::IE:E:IG:T:::::::::F::::::::ST

consensus       LLLDELHRRARSGD--ATVGVGTDELFVRATDDLDVRAVADAA-AEAVPEAGVTARGARE
#oth            1.213.3.252444421312533.2131124532122221343142422412143424.3
VNG1511         ::::A:::::D:T:::VLL:A:E:A:R::SD:AV::H::V::IDDDLTTT:::::::::D
hla1641         ::::D::::NAN:EAY::::I:M:::YL:T:A:VS::D::ERT:::LA:G:D::TA:L::
HQ1797A         ::SET:::QT::ESS:V::VYS::::::H::T:::I::::S:::GNT:::G::::V:V:Q
HVO_2889        ::V::::::T:E::AFV::AL:M:::YL:::G:::L:::VES::::KA:A::LA:A:I::
Hbo2657         ::V::::::N:E::EYV::ATS:::::::T:::V:I::I:E:::RD::::G::::VAV:D
NP2874A         ::::::S::LDAD-:::V:::A::::HL::A::I:IS::::TV::::::N:::SDP::::
Hut0586         ::::::Y::SDDLT:::I:::DE:::H::SGHE::::ELV::::D:T:EG:DLEPLST:S
rrnAC0979       ::::::::DV:DESD::VL:IS::TMY:::NG:::LHELVNEV:S:R:::G::AT:SV::
Hmu1670         I:::::F:Q:D::TD::L:::AD:T:::::DQTV::HDL:::I:D::A:::A:RT:S:::

consensus       GRIEFLAGERDAVLDAVVDAVAEQF-----
#oth            43211.2.3.33131.21214223332111
VNG1511         ::::::::::::::::::::I:A:LA::::
hla1641         :K::::S::::::E::I:A::::A::::::
HQ1797A         N:V:::::A:ES:V::::::AVA:INN:::
HVO_2889        ::::::T:A::EA:E::L::A:::::::::
Hbo2657         N:::::S:A::E:V::::T:TVD:::::::
NP2874A         PKL:::::K::::I::::::::::VTAPSA
Hut0586         H:::::::Q:ST:V:::L::IVDSV:::::
rrnAC0979       :T:RY:::::P:::::TL:VL:DEL:::::
Hmu1670         QS:R::S::::::I::TLAV:G::::::::