|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 6183 | NP0336A | Hut2188 | rrnAC2704 | Hmu3059 | VNG2356 | HQ1020A | hla0740 | HVO_3010 | Hbo1501 |
4681 | NP0336A | 6221 | 4089 | 4125 | 4072 | 3918 | 3838 | 4057 | 4135 | 4177 |
4692 | Hut2188 | 4089 | 6200 | 4462 | 4375 | 3797 | 3872 | 3998 | 4073 | 4149 |
4723 | rrnAC2704 | 4125 | 4462 | 6295 | 4642 | 3759 | 3820 | 4077 | 4140 | 4256 |
4681 | Hmu3059 | 4072 | 4375 | 4642 | 6337 | 3880 | 3847 | 3979 | 4006 | 4067 |
4410 | VNG2356 | 3918 | 3797 | 3759 | 3880 | 5817 | 3931 | 4108 | 4113 | 4113 |
4536 | HQ1020A | 3838 | 3872 | 3820 | 3847 | 3931 | 6237 | 4098 | 4326 | 4401 |
4926 | hla0740 | 4057 | 3998 | 4077 | 3979 | 4108 | 4098 | 6199 | 4427 | 4613 |
5082 | HVO_3010 | 4135 | 4073 | 4140 | 4006 | 4113 | 4326 | 4427 | 6318 | 5036 |
5151 | Hbo1501 | 4177 | 4149 | 4256 | 4067 | 4113 | 4401 | 4613 | 5036 | 6191 |
878 symbols consensus MAAADA-----AAYVDHPLLAPGFLERRRYQIQLADTARDDHTLVCLPTGLGKTTVSLLV #oth 12323231111833112.114332114.3..33..41.3541............1..... NP0336A ::T:AED::::TE:IEG::::E:L::K::::LK::E::AE::::::::::::::A::::: Hut2188 :::T::S::::EESI:R:::E::V::N:G:::::::A:AA:::::::::::::::::::: rrnAC2704 ::TT::G::::GEH:ER::VT:E:::N::::TE::E::SG:::::::::::::::::::: Hmu3059 ::QS::DPGSTDGH:::::VT::L::Q::::RE:::::LA:::::::::::::::::::: VNG2356 --MSEE:::::MG:::::M::D:VI:A:Q::L:::AA::QG::::::::::::::::::: HQ1020A :::T:D:::::S::::::::VSS:I:Q:L::::::G:::KTD:::::::::::::::::: hla0740 --M:TE::::::TGI:R:::VDD::Q:::::L::::A:A:E::::::::::::::::::: HVO_3010 :S:SED:::::V::::::::::S:I:::L:::R::G::::G::::::::::::::::::: Hbo1501 :::::D:::::P:H::::::S:S:I:::L:::R::SA:::A::::::::::::::::::: consensus TAERL-HDVGGKALLLAPTKPLVQQHADFYREALTIPDDEIVVFTGEVRPDDRAALWDDA #oth ..3.114331111.2........2..13...1..422.111.....212.11.221.41. NP0336A ::::::A:R::::::::::::::::::A:::::::LA:::V:::::A::::::::::E:: Hut2188 :::::::A::::S:::::::::::::::::::::::D:E::::::::::::::::::::: rrnAC2704 ::::::NA::::S:M::::::::::::E::::::ELD:EDV::::::::::::::::::: Hmu3059 ::::I:Q:AQW:S::::::::::::::E::::::QV::::::::::::::AK:SD::E:: VNG2356 ::Y::AD:A::T:::::::::::E:::G::::::A::::DV::::::T:::::R:A:T:: HQ1020A ::T:::NSI::T::F::::::::R::IE:::N::::::ED::::::::S::::::::::: hla0740 :::::::E::::::F:::::::::::::::::::S:::::::::::D:K::::::::N:: HVO_3010 ::Q:::::::::S:F::::::::::::::::::::V::::::::::D:::::::E::QE: Hbo1501 :::::::E::::::F:::::::::::::::::::E:::::::::::D::::::::::::: consensus RVVIATPQVVENDLVGNRISLRDVTHCTFDECHRATGDYAYVYIAERYHADAANPLVTGM #oth 31.2.....1....2.2.11144.1.1.1.....11.1.1.2.1.1...21144.1..1. NP0336A S::C::::::::::::::V:::P:::L:V::::::::::::N:::::::E:::K::::A: Hut2188 T:::::::::::::L:S::D:SP::::::::::::S:E:P:T:::::::E:SDD:::::: rrnAC2704 :I:::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::N:::D::::::E::::::: Hmu3059 :::::::::::::::::::::AN::::::::::::::::::N:::::::E::SD::::A: VNG2356 :::V::::::::::::G::DMD::V::::::::::::::::T:V:::::::::A::::A: HQ1020A Q::::::::I::::I::::::NS:::L::::::::::E:::::::::::D::T::R:::: hla0740 :I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D:::::: HVO_3010 QI:::::::I::::I:::::::::::L::::::::S::::::::::::::A:E::::::: Hbo1501 :I::::::::::::I:::::::E:::L:::::::G:::::::::::::::::ER:::::: consensus SASPGGDEEEILTVCENLGLREVEVMTEEDADVAEYTHDTDVEWERIELPEEVIEIRDAL #oth .....21213.32..2.1.233.1...13....411.13.213.2212..141231..12 NP0336A :::::::K:::::::D:::::::A::::A::::D::::H:::::::V::::A::D:::N: Hut2188 :::::D:::A::G::D:::I:::::::S:::::EA:::N:S:N:::V::::P:::::::: rrnAC2704 :::::D:::A::E:::::::SD:A::::N:::::::::::S:D:K::::::V:V:::::I Hmu3059 :::::::::::::::::::::::A::::D::::::H::::EL::K::::::T:::::::I VNG2356 ::::::T:A::R:::::::VGN::::::D::::G:H::::::Q:::VT::::IL:V:::I HQ1020A :::::S:K:G:V:::N:I:VSA::::::D::::::::YT:::::KH::::D:I:Q::::: hla0740 :::::::T:::E::::::::SN:::::::::::D::::::::Q::QVT::D:::A::::: HVO_3010 :::::::::A::E::::::IVD:::::::::::S::::::::::N::Q::D:IL:::::: Hbo1501 :::::::K:S::E:::::::V::::::::::::D:::Y:::::::::Q::D:ILA::::V consensus NEVITDRLEKLKELGVTNSTSPDVSQRQLNQIRAKLQELMDNDQSEGYKGMSTHAEVMKL #oth 11.151.141.121..14313113.1231251113.341112.3.2..3...31..11.. NP0336A :::::E::T::::::::T::D:NM::S:::A::::::::IN::D:S::::::A:::I::: Hut2188 QD::H::MTQ:::::::S::QA:::E:EIRK:Q:::R:::::::::::Q:::LL:::R:: rrnAC2704 ::::K:::SQ::::::::KS:A:I:E:EIQ::QGQ:RD::N:::::::Q:::LL::IR:: Hmu3059 :::VS:::AQ:::::::ST:Q::::E:EIQK:QG::S:::::::::::S:::LL:::R:: VNG2356 :D::E:::A::R:I:::KAS:::I::KD::E:::R::Q:I:D:D:D::Q:::V::::::: HQ1020A :D::R:::QQ::S:::ADT:Q:::::K::::M:G:::K:I:A:N:D::A::::::::::: hla0740 ::::::::::::S:::::K::::L:::D::EM:G::KKM::::::D:::::::::::::: HVO_3010 ::::::::::::Q::::K::K::I::KK::RM::E::R::NA:K:::::::::::::::: Hbo1501 ::::K:::::::S:::::T:::::::K:::GM::E::K::N::::::::::::::::::: consensus RRAVELVETQSVESVRRYFERQREAARSSGASKASQRLVSEPKVREAMRKAESFDGLHPK #oth 11.1111......11...1..1111.311.....1..2112.3.331112.241311... NP0336A ::::::::::::::::::::::::D:K::::::::::F::::R:QA:::::TA::D:::: Hut2188 :T::TYA:::::::L:::L::L::::::::::::D:::I:A::::::R::::D:ED:::: rrnAC2704 :T::TY::::::::L::::::LK:::::::::::D::::::::::::::::::YND:::: Hmu3059 :T::TYA::::::AL:::::::K:::::::::::D:::::D:T:M:::::::N:TD:::: VNG2356 K::::::::::::::::::::::N::NTA:::::::::::::A:KR:::T:RE::::::: HQ1020A :::::::::::::::::::::::N::Q:::::::::::IA:::::QS:QL::::::T::: hla0740 :::T:::::::::::::::::::::::::::::::::M:AD:::::::::::A::::::: HVO_3010 :::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::A:::::::::::::::::::: Hbo1501 :::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::A:::::::::::::::::::: consensus FRRTRILLAETLGIENGERVIVFTESRDTAEALTDFLSEHFDTRRFVGQGDTDGSDGMTQ #oth .121.111.1....33.1.1.2.........2.12..131.3221....2.321.1..1. NP0336A :::::::::Q:::::G:::::::::::::::S::A::G:::E:::::::::K:::::::: Hut2188 :::::MQI::::::HD:::::::::::::::T:::::G:::SVEK::::S:::::::::: rrnAC2704 ::Q::M:::::::::::::::::::::::::T:V::::D::T:QK::::S:::::E:::: Hmu3059 :::::M:::::::::::::::::::::::::T::::::D::E:EK::::S::E::E:::: VNG2356 ::QA:M:::::::::D:D::::::::::::::::A::G:::::::::::::A:::::::: HQ1020A :S:::::::Q:::::G:::::I::::::::::::E:::AS::VQ:::::N::GR:E:::: hla0740 :SKA::::::::::NE:::A:L:::::::::::VE:::TS::V:K::::::KE:::::S: HVO_3010 ::K:::::::::::Q:::::::::::::::::::E::::S:SV::::::::RE::::::: Hbo1501 :SQ::::::Q::::QD:::::::::::::::::::::::S::A::::::::KE::::::: consensus TEQQETLDAFRNGEFEVLVSTSVAEEGLDVPEVDLVLFYEPVPTAIRSIQRKGRTGRQAE #oth 31.211.33.12.1....1............1....1.1....11..11........122 NP0336A :::K:::::::S:::::::::::::::::::D:::::::::::KG::::::::::::ASD Hut2188 :::::::E:::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T: rrnAC2704 :Q::::::R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::::::::: Hmu3059 :Q::::::R::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T: VNG2356 :::R:::AE::::D::::::::::::::::::::::::F:::::::::V:::::::::TA HQ1020A R:::KA:T:::S::::::I:::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::T: hla0740 KQ::::::E:KA:D::::::::::::::::::::::C::::::::::::::::::::::: HVO_3010 N:::::::K:::::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::::::::::D Hbo1501 K:::::::E:::::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::::::::::: consensus GRVVVLLAEDTRDEAYFWISRRREKRMESELRDLKGVADDIEAEL--DDAQAGLDAFAG- #oth .2.1..2..1.....1..21.22113.441.34..453122.35211355.631441544 NP0336A :::::::::::::::F::M::NE:::::E:::K::SIEGE::::I::--:::D:GS::EA Hut2188 :A::::I:::::::::::KA:QD:::::D:::T::DM:G:::SH:::-RE:M::EGY--: rrnAC2704 ::::::::::::::::::KA:NDQ:::KR::NE::S::GEL::R:::--D:T:::EYEDT Hmu3059 ::::::::::::::::::K::QD:Q:::D:::T:::::GQL:SK:::GGE:T:V:EYDDG VNG2356 ::::::::::::::::::::::::QE:TE::QS:::R::EL:T::GG:G::QA::E:--: HQ1020A :::::::::::::::::::::::Q:K::::::S::QSV::::SSI::ISP:EE:TTYNHD hla0740 :K::::M::::::::F:::::::::K:A:Q:AE::EAT::::ETV::::G:::::::::: HVO_3010 :::::::::::::::::::::::::T:QN:::::::A:::L:::::::PS:RD:S::::D Hbo1501 :::I::M::N:::::::::::::::E:K:::::::::::EV:E::::::S:K:::::S:G consensus -------GEAGADTADEAGGAATDGDGGGAS-DADSADDSDSAAG-DAAADGDSDDQDGL #oth 555444333543568544655457454436445555465456454655633665444316 NP0336A PPEGSEES:HT:EDEA:S:E:EPPDS:::E:N:GNQ:ET:GDT:-:EV:P:T::NGG:AA Hut2188 ::::::::::S::SD:T:A:ND:ADSA:ETTD:PAD:::D:EQ:VQG::D:AED:G:T:: rrnAC2704 TGTASS::TGDGE:TRQS::STGN:R:S::NKS:EDD:G::GQ::L::F::DR:EAA:AD Hmu3059 QTDRERGE:P:G:GL:GDE:TTSS:N:::P::::ERQPSEA:NT:ERSE:::QTA:G::Q VNG2356 ::::::::D:E:-------------------:-------------:-----------A:E HQ1020A SS:::::T:TD:KAS::DTDVE::S------::S::DS::::NISKQKI::SAK:S:S:I hla0740 ::::::::S::N::KP::DNS:A:S:D::DDDNT:AGLTDFA:EAR:GD:::EDN:D::G HVO_3010 DASSA:::S::SS:RN:GVDV:SE::AN:::AT:S::SNGRT:T-:--::AT:::G:S:: Hbo1501 DSAGTDD::SSGAI:NGGTA:::TETPDASTAE:::GT:GGT:S:T::TDTNSN:::A:: consensus ADFAPGDEDAARADDEDEAAGEDGD------------------D-GTVATAGVD-DDETV #oth 353443234536433363575745311112222212233334244333221451352141 NP0336A EPAEDA:RQVGLT:FAA::D:T:T:::::::::::::::::::EA::::::AP-:EG::: Hut2188 DA:::::D::TESPT:QTDPEP:EE::::::::::::::::::-::::::::--:GE:A: rrnAC2704 :GA:E::SE::SV:EG:TGTADG:E::::::::::::STGTAD:E:::::::R:DE:DP: Hmu3059 :GLDAFAD:G:TGA::::T::VPDE::::::::::::::::::TK:STPEPHA::G:::: VNG2356 EPA::AP::VSDGE:TEGV------::::::::::::::::::-:----A:R::GAG:A: HQ1020A T::::S:SELSNTET:T::QSAETA::::SEEVYSTDIETNTAVSESPP:PD::ISED:I hla0740 DESDG:::SEGDS::AG:VEASE::::::::::::::::::SD:A:V::::::-:-::G: HVO_3010 :::G:S::AL:::::G:DSH:::A:PADSGDDPASDAEGDEVD:SA:::A::T:::ED:: Hbo1501 DS:SAS::EI::::E:S:::V::::::::::::::::::::::-::::::::R-::::V: consensus EIVVDQRELDSTIARDLSTRDGIETRLETLAVGDYVLSDRVAVERKSVSDFLDTLTGGDR #oth 11.2......131213..3.1233.1....1.....1....1....233..21112112. NP0336A :::A:::::::H::::::M:::V::::::::::::::::::V::::A:E:::E::V:::: Hut2188 :V:I::::::AS:G::::R:::F:::::::D::::::::::V::::TI:::::::::::: rrnAC2704 :::A:::::::N:::::::::::::::::::::::::::::V::::T:A::M:::::::: Hmu3059 A::A::::::::::::::::E:VQ:E:::::::::::::::V::::T::::::::::::: VNG2356 :V:::::::::::::E::K:::V:::::::::::::V::::::::::H:::M:::L:SE: HQ1020A ::::::::::::VP:S:::::A:Q:::::::::::::::::::::::AT::::::LD:N: hla0740 :V::::::::::::K:::::::LV:::::::::::::::::::::::AA::V:SMLDS:: HVO_3010 :::::::::::N:::T::K:EDLT:::::::::::::::::::::::::::::::::::: Hbo1501 :::::::::::N::K::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus SMFEQVGDLARAYARPVLIIEGE--GLYEERNVHPNAIRGALASLAVDFGASVLRTEDED #oth .2...32223.4.3..2212..4123.133.11113.111.21.11..123.113.5123 NP0336A :::::::AA::H:G:::V:::::::::::R:::::::::::V::::::::::::::T:T: Hut2188 ::::::K:D::Y:D:::V:L::D::::::::::::::::::::::::::::::::::::G rrnAC2704 ::::::::AT:N:G:::V:::::::D:FGA::::HK::Q:::::::::::::::::S::: Hmu3059 ::::::::AT:H:::::VV:::G::D::G:::::HK::Q::::::S::::::::Q:A::E VNG2356 :I:::AKE:::Q:T::::VV::D:GD::A::::::::V:S:M::::::W:L::MH:NG:G HQ1020A :L:::T:::V:::G:::::L:::LTT::T:::ID:S::Q::::::::::DI:I:Q:R:DS hla0740 :::::::E:S:::::::MVV::T::N::GQ:DID:::::::::::::::DV::::::G:S HVO_3010 :I:::IA::T:H::::L:V:::R:::::::::I::G::::::S:V::::NV:::F::::: Hbo1501 :L:::I:::S::::::I::L:::::::F::::I::G:::::::::::::DV:::Q:R::: consensus DTADLLETIATREQETRDREVSVHGEKSAKTLAEQQEYVVSSIADVGPVTARTLLEHFGS #oth 1.111121..4...1341.31.1..1.43..25.1.1...111111...1.12..14..1 NP0336A E::::::V::::::::D::S:::::::GG:::::K::::::AV:E:::::::A::::::: Hut2188 E:::::A:::::::::D:::I::::::GS:::P:::A:::A::::::::I:::::::::: rrnAC2704 E::::::V::G:::::A::::::::::QS:::P:::::::AA::E:::::::::::S::: Hmu3059 E:::::::::R::::ES::::::::::Q::::G:::::::A:V:E:::::::A::::::: VNG2356 ::TEMI::::E:::T:N::A::A::::A:::QG::::::::::T::::::::S::DT::: HQ1020A ::::M:::::::::TS:::SI:::::::::::Q::::::::::::I:::::QS::DA::T hla0740 ::TE::A:::K::::::::::::::::T:::R:::::::::::::I:::::::::::::T HVO_3010 :::E::A:::::::TD:E:T:::::G::::::D::::::::A:::I::::::::::A::: Hbo1501 :::E::L:::::::TE:E:S:::::G::T:::S::::::::A:::I::::::S:::E::T consensus VEAVMTADEDDLLEVDGVGAVTAERIRDVVGSEYE--- #oth .1...1.5112.4212.1.5...2.1.2.211314421 NP0336A :::::S:::EA:QA:::::D:::::::::T:TT:ADSS Hut2188 :Q:::::N:::::D:::::E:::::::E:::::::G:: rrnAC2704 ::::::::K::::::S:I:D:::D:::E:IA:D::P:: Hmu3059 ::::::::::E:MD:::::E:::::F:::::::F:Q:: VNG2356 :::::::S::E:TAA::::::::::::G:::T::QPE: HQ1020A :::::::G::::TA:::::::::A::::::::N:S::: hla0740 :::::::P:::::::::::P:::::::E:::::::::: HVO_3010 :::::::N:E::K::R:::Q:::::::E::::::R::: Hbo1501 :::::::R:E:::::S:I:S:::::::::I::::::::