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[L] (MPH1) COG1111 ERCC4-like helicases
9 genomes BUD0269 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG2356

rrnAC2704

HVO_3010

Hbo1501

Hmu3059

Hut2188

hla0740

NP0336A

HQ1020A

Pairwise sequence scores
Consensus score6183 NP0336A Hut2188 rrnAC2704 Hmu3059 VNG2356 HQ1020A hla0740 HVO_3010 Hbo1501
4681NP0336A 6221 4089 4125 4072 3918 3838 4057 4135 4177
4692Hut2188 4089 6200 4462 4375 3797 3872 3998 4073 4149
4723rrnAC2704 4125 4462 6295 4642 3759 3820 4077 4140 4256
4681Hmu3059 4072 4375 4642 6337 3880 3847 3979 4006 4067
4410VNG2356 3918 3797 3759 3880 5817 3931 4108 4113 4113
4536HQ1020A 3838 3872 3820 3847 3931 6237 4098 4326 4401
4926hla0740 4057 3998 4077 3979 4108 4098 6199 4427 4613
5082HVO_3010 4135 4073 4140 4006 4113 4326 4427 6318 5036
5151Hbo1501 4177 4149 4256 4067 4113 4401 4613 5036 6191

878 symbols
consensus       MAAADA-----AAYVDHPLLAPGFLERRRYQIQLADTARDDHTLVCLPTGLGKTTVSLLV
#oth            12323231111833112.114332114.3..33..41.3541............1.....
NP0336A         ::T:AED::::TE:IEG::::E:L::K::::LK::E::AE::::::::::::::A:::::
Hut2188         :::T::S::::EESI:R:::E::V::N:G:::::::A:AA::::::::::::::::::::
rrnAC2704       ::TT::G::::GEH:ER::VT:E:::N::::TE::E::SG::::::::::::::::::::
Hmu3059         ::QS::DPGSTDGH:::::VT::L::Q::::RE:::::LA::::::::::::::::::::
VNG2356         --MSEE:::::MG:::::M::D:VI:A:Q::L:::AA::QG:::::::::::::::::::
HQ1020A         :::T:D:::::S::::::::VSS:I:Q:L::::::G:::KTD::::::::::::::::::
hla0740         --M:TE::::::TGI:R:::VDD::Q:::::L::::A:A:E:::::::::::::::::::
HVO_3010        :S:SED:::::V::::::::::S:I:::L:::R::G::::G:::::::::::::::::::
Hbo1501         :::::D:::::P:H::::::S:S:I:::L:::R::SA:::A:::::::::::::::::::

consensus       TAERL-HDVGGKALLLAPTKPLVQQHADFYREALTIPDDEIVVFTGEVRPDDRAALWDDA
#oth            ..3.114331111.2........2..13...1..422.111.....212.11.221.41.
NP0336A         ::::::A:R::::::::::::::::::A:::::::LA:::V:::::A::::::::::E::
Hut2188         :::::::A::::S:::::::::::::::::::::::D:E:::::::::::::::::::::
rrnAC2704       ::::::NA::::S:M::::::::::::E::::::ELD:EDV:::::::::::::::::::
Hmu3059         ::::I:Q:AQW:S::::::::::::::E::::::QV::::::::::::::AK:SD::E::
VNG2356         ::Y::AD:A::T:::::::::::E:::G::::::A::::DV::::::T:::::R:A:T::
HQ1020A         ::T:::NSI::T::F::::::::R::IE:::N::::::ED::::::::S:::::::::::
hla0740         :::::::E::::::F:::::::::::::::::::S:::::::::::D:K::::::::N::
HVO_3010        ::Q:::::::::S:F::::::::::::::::::::V::::::::::D:::::::E::QE:
Hbo1501         :::::::E::::::F:::::::::::::::::::E:::::::::::D:::::::::::::

consensus       RVVIATPQVVENDLVGNRISLRDVTHCTFDECHRATGDYAYVYIAERYHADAANPLVTGM
#oth            31.2.....1....2.2.11144.1.1.1.....11.1.1.2.1.1...21144.1..1.
NP0336A         S::C::::::::::::::V:::P:::L:V::::::::::::N:::::::E:::K::::A:
Hut2188         T:::::::::::::L:S::D:SP::::::::::::S:E:P:T:::::::E:SDD::::::
rrnAC2704       :I:::::::::::::::::::A:::::::::::::::::::N:::D::::::E:::::::
Hmu3059         :::::::::::::::::::::AN::::::::::::::::::N:::::::E::SD::::A:
VNG2356         :::V::::::::::::G::DMD::V::::::::::::::::T:V:::::::::A::::A:
HQ1020A         Q::::::::I::::I::::::NS:::L::::::::::E:::::::::::D::T::R::::
hla0740         :I:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D::::::
HVO_3010        QI:::::::I::::I:::::::::::L::::::::S::::::::::::::A:E:::::::
Hbo1501         :I::::::::::::I:::::::E:::L:::::::G:::::::::::::::::ER::::::

consensus       SASPGGDEEEILTVCENLGLREVEVMTEEDADVAEYTHDTDVEWERIELPEEVIEIRDAL
#oth            .....21213.32..2.1.233.1...13....411.13.213.2212..141231..12
NP0336A         :::::::K:::::::D:::::::A::::A::::D::::H:::::::V::::A::D:::N:
Hut2188         :::::D:::A::G::D:::I:::::::S:::::EA:::N:S:N:::V::::P::::::::
rrnAC2704       :::::D:::A::E:::::::SD:A::::N:::::::::::S:D:K::::::V:V:::::I
Hmu3059         :::::::::::::::::::::::A::::D::::::H::::EL::K::::::T:::::::I
VNG2356         ::::::T:A::R:::::::VGN::::::D::::G:H::::::Q:::VT::::IL:V:::I
HQ1020A         :::::S:K:G:V:::N:I:VSA::::::D::::::::YT:::::KH::::D:I:Q:::::
hla0740         :::::::T:::E::::::::SN:::::::::::D::::::::Q::QVT::D:::A:::::
HVO_3010        :::::::::A::E::::::IVD:::::::::::S::::::::::N::Q::D:IL::::::
Hbo1501         :::::::K:S::E:::::::V::::::::::::D:::Y:::::::::Q::D:ILA::::V

consensus       NEVITDRLEKLKELGVTNSTSPDVSQRQLNQIRAKLQELMDNDQSEGYKGMSTHAEVMKL
#oth            11.151.141.121..14313113.1231251113.341112.3.2..3...31..11..
NP0336A         :::::E::T::::::::T::D:NM::S:::A::::::::IN::D:S::::::A:::I:::
Hut2188         QD::H::MTQ:::::::S::QA:::E:EIRK:Q:::R:::::::::::Q:::LL:::R::
rrnAC2704       ::::K:::SQ::::::::KS:A:I:E:EIQ::QGQ:RD::N:::::::Q:::LL::IR::
Hmu3059         :::VS:::AQ:::::::ST:Q::::E:EIQK:QG::S:::::::::::S:::LL:::R::
VNG2356         :D::E:::A::R:I:::KAS:::I::KD::E:::R::Q:I:D:D:D::Q:::V:::::::
HQ1020A         :D::R:::QQ::S:::ADT:Q:::::K::::M:G:::K:I:A:N:D::A:::::::::::
hla0740         ::::::::::::S:::::K::::L:::D::EM:G::KKM::::::D::::::::::::::
HVO_3010        ::::::::::::Q::::K::K::I::KK::RM::E::R::NA:K::::::::::::::::
Hbo1501         ::::K:::::::S:::::T:::::::K:::GM::E::K::N:::::::::::::::::::

consensus       RRAVELVETQSVESVRRYFERQREAARSSGASKASQRLVSEPKVREAMRKAESFDGLHPK
#oth            11.1111......11...1..1111.311.....1..2112.3.331112.241311...
NP0336A         ::::::::::::::::::::::::D:K::::::::::F::::R:QA:::::TA::D::::
Hut2188         :T::TYA:::::::L:::L::L::::::::::::D:::I:A::::::R::::D:ED::::
rrnAC2704       :T::TY::::::::L::::::LK:::::::::::D::::::::::::::::::YND::::
Hmu3059         :T::TYA::::::AL:::::::K:::::::::::D:::::D:T:M:::::::N:TD::::
VNG2356         K::::::::::::::::::::::N::NTA:::::::::::::A:KR:::T:RE:::::::
HQ1020A         :::::::::::::::::::::::N::Q:::::::::::IA:::::QS:QL::::::T:::
hla0740         :::T:::::::::::::::::::::::::::::::::M:AD:::::::::::A:::::::
HVO_3010        :::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::A::::::::::::::::::::
Hbo1501         :::::::::::::::::::::::N:::::::::::::::A::::::::::::::::::::

consensus       FRRTRILLAETLGIENGERVIVFTESRDTAEALTDFLSEHFDTRRFVGQGDTDGSDGMTQ
#oth            .121.111.1....33.1.1.2.........2.12..131.3221....2.321.1..1.
NP0336A         :::::::::Q:::::G:::::::::::::::S::A::G:::E:::::::::K::::::::
Hut2188         :::::MQI::::::HD:::::::::::::::T:::::G:::SVEK::::S::::::::::
rrnAC2704       ::Q::M:::::::::::::::::::::::::T:V::::D::T:QK::::S:::::E::::
Hmu3059         :::::M:::::::::::::::::::::::::T::::::D::E:EK::::S::E::E::::
VNG2356         ::QA:M:::::::::D:D::::::::::::::::A::G:::::::::::::A::::::::
HQ1020A         :S:::::::Q:::::G:::::I::::::::::::E:::AS::VQ:::::N::GR:E::::
hla0740         :SKA::::::::::NE:::A:L:::::::::::VE:::TS::V:K::::::KE:::::S:
HVO_3010        ::K:::::::::::Q:::::::::::::::::::E::::S:SV::::::::RE:::::::
Hbo1501         :SQ::::::Q::::QD:::::::::::::::::::::::S::A::::::::KE:::::::

consensus       TEQQETLDAFRNGEFEVLVSTSVAEEGLDVPEVDLVLFYEPVPTAIRSIQRKGRTGRQAE
#oth            31.211.33.12.1....1............1....1.1....11..11........122
NP0336A         :::K:::::::S:::::::::::::::::::D:::::::::::KG::::::::::::ASD
Hut2188         :::::::E:::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:
rrnAC2704       :Q::::::R::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A::::::::::::
Hmu3059         :Q::::::R::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T:
VNG2356         :::R:::AE::::D::::::::::::::::::::::::F:::::::::V:::::::::TA
HQ1020A         R:::KA:T:::S::::::I:::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::T:
hla0740         KQ::::::E:KA:D::::::::::::::::::::::C:::::::::::::::::::::::
HVO_3010        N:::::::K:::::::::::::::::::::::::::::F::::::::::::::::::::D
Hbo1501         K:::::::E:::::::::::::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::::

consensus       GRVVVLLAEDTRDEAYFWISRRREKRMESELRDLKGVADDIEAEL--DDAQAGLDAFAG-
#oth            .2.1..2..1.....1..21.22113.441.34..453122.35211355.631441544
NP0336A         :::::::::::::::F::M::NE:::::E:::K::SIEGE::::I::--:::D:GS::EA
Hut2188         :A::::I:::::::::::KA:QD:::::D:::T::DM:G:::SH:::-RE:M::EGY--:
rrnAC2704       ::::::::::::::::::KA:NDQ:::KR::NE::S::GEL::R:::--D:T:::EYEDT
Hmu3059         ::::::::::::::::::K::QD:Q:::D:::T:::::GQL:SK:::GGE:T:V:EYDDG
VNG2356         ::::::::::::::::::::::::QE:TE::QS:::R::EL:T::GG:G::QA::E:--:
HQ1020A         :::::::::::::::::::::::Q:K::::::S::QSV::::SSI::ISP:EE:TTYNHD
hla0740         :K::::M::::::::F:::::::::K:A:Q:AE::EAT::::ETV::::G::::::::::
HVO_3010        :::::::::::::::::::::::::T:QN:::::::A:::L:::::::PS:RD:S::::D
Hbo1501         :::I::M::N:::::::::::::::E:K:::::::::::EV:E::::::S:K:::::S:G

consensus       -------GEAGADTADEAGGAATDGDGGGAS-DADSADDSDSAAG-DAAADGDSDDQDGL
#oth            555444333543568544655457454436445555465456454655633665444316
NP0336A         PPEGSEES:HT:EDEA:S:E:EPPDS:::E:N:GNQ:ET:GDT:-:EV:P:T::NGG:AA
Hut2188         ::::::::::S::SD:T:A:ND:ADSA:ETTD:PAD:::D:EQ:VQG::D:AED:G:T::
rrnAC2704       TGTASS::TGDGE:TRQS::STGN:R:S::NKS:EDD:G::GQ::L::F::DR:EAA:AD
Hmu3059         QTDRERGE:P:G:GL:GDE:TTSS:N:::P::::ERQPSEA:NT:ERSE:::QTA:G::Q
VNG2356         ::::::::D:E:-------------------:-------------:-----------A:E
HQ1020A         SS:::::T:TD:KAS::DTDVE::S------::S::DS::::NISKQKI::SAK:S:S:I
hla0740         ::::::::S::N::KP::DNS:A:S:D::DDDNT:AGLTDFA:EAR:GD:::EDN:D::G
HVO_3010        DASSA:::S::SS:RN:GVDV:SE::AN:::AT:S::SNGRT:T-:--::AT:::G:S::
Hbo1501         DSAGTDD::SSGAI:NGGTA:::TETPDASTAE:::GT:GGT:S:T::TDTNSN:::A::

consensus       ADFAPGDEDAARADDEDEAAGEDGD------------------D-GTVATAGVD-DDETV
#oth            353443234536433363575745311112222212233334244333221451352141
NP0336A         EPAEDA:RQVGLT:FAA::D:T:T:::::::::::::::::::EA::::::AP-:EG:::
Hut2188         DA:::::D::TESPT:QTDPEP:EE::::::::::::::::::-::::::::--:GE:A:
rrnAC2704       :GA:E::SE::SV:EG:TGTADG:E::::::::::::STGTAD:E:::::::R:DE:DP:
Hmu3059         :GLDAFAD:G:TGA::::T::VPDE::::::::::::::::::TK:STPEPHA::G::::
VNG2356         EPA::AP::VSDGE:TEGV------::::::::::::::::::-:----A:R::GAG:A:
HQ1020A         T::::S:SELSNTET:T::QSAETA::::SEEVYSTDIETNTAVSESPP:PD::ISED:I
hla0740         DESDG:::SEGDS::AG:VEASE::::::::::::::::::SD:A:V::::::-:-::G:
HVO_3010        :::G:S::AL:::::G:DSH:::A:PADSGDDPASDAEGDEVD:SA:::A::T:::ED::
Hbo1501         DS:SAS::EI::::E:S:::V::::::::::::::::::::::-::::::::R-::::V:

consensus       EIVVDQRELDSTIARDLSTRDGIETRLETLAVGDYVLSDRVAVERKSVSDFLDTLTGGDR
#oth            11.2......131213..3.1233.1....1.....1....1....233..21112112.
NP0336A         :::A:::::::H::::::M:::V::::::::::::::::::V::::A:E:::E::V::::
Hut2188         :V:I::::::AS:G::::R:::F:::::::D::::::::::V::::TI::::::::::::
rrnAC2704       :::A:::::::N:::::::::::::::::::::::::::::V::::T:A::M::::::::
Hmu3059         A::A::::::::::::::::E:VQ:E:::::::::::::::V::::T:::::::::::::
VNG2356         :V:::::::::::::E::K:::V:::::::::::::V::::::::::H:::M:::L:SE:
HQ1020A         ::::::::::::VP:S:::::A:Q:::::::::::::::::::::::AT::::::LD:N:
hla0740         :V::::::::::::K:::::::LV:::::::::::::::::::::::AA::V:SMLDS::
HVO_3010        :::::::::::N:::T::K:EDLT::::::::::::::::::::::::::::::::::::
Hbo1501         :::::::::::N::K:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

consensus       SMFEQVGDLARAYARPVLIIEGE--GLYEERNVHPNAIRGALASLAVDFGASVLRTEDED
#oth            .2...32223.4.3..2212..4123.133.11113.111.21.11..123.113.5123
NP0336A         :::::::AA::H:G:::V:::::::::::R:::::::::::V::::::::::::::T:T:
Hut2188         ::::::K:D::Y:D:::V:L::D::::::::::::::::::::::::::::::::::::G
rrnAC2704       ::::::::AT:N:G:::V:::::::D:FGA::::HK::Q:::::::::::::::::S:::
Hmu3059         ::::::::AT:H:::::VV:::G::D::G:::::HK::Q::::::S::::::::Q:A::E
VNG2356         :I:::AKE:::Q:T::::VV::D:GD::A::::::::V:S:M::::::W:L::MH:NG:G
HQ1020A         :L:::T:::V:::G:::::L:::LTT::T:::ID:S::Q::::::::::DI:I:Q:R:DS
hla0740         :::::::E:S:::::::MVV::T::N::GQ:DID:::::::::::::::DV::::::G:S
HVO_3010        :I:::IA::T:H::::L:V:::R:::::::::I::G::::::S:V::::NV:::F:::::
Hbo1501         :L:::I:::S::::::I::L:::::::F::::I::G:::::::::::::DV:::Q:R:::

consensus       DTADLLETIATREQETRDREVSVHGEKSAKTLAEQQEYVVSSIADVGPVTARTLLEHFGS
#oth            1.111121..4...1341.31.1..1.43..25.1.1...111111...1.12..14..1
NP0336A         E::::::V::::::::D::S:::::::GG:::::K::::::AV:E:::::::A:::::::
Hut2188         E:::::A:::::::::D:::I::::::GS:::P:::A:::A::::::::I::::::::::
rrnAC2704       E::::::V::G:::::A::::::::::QS:::P:::::::AA::E:::::::::::S:::
Hmu3059         E:::::::::R::::ES::::::::::Q::::G:::::::A:V:E:::::::A:::::::
VNG2356         ::TEMI::::E:::T:N::A::A::::A:::QG::::::::::T::::::::S::DT:::
HQ1020A         ::::M:::::::::TS:::SI:::::::::::Q::::::::::::I:::::QS::DA::T
hla0740         ::TE::A:::K::::::::::::::::T:::R:::::::::::::I:::::::::::::T
HVO_3010        :::E::A:::::::TD:E:T:::::G::::::D::::::::A:::I::::::::::A:::
Hbo1501         :::E::L:::::::TE:E:S:::::G::T:::S::::::::A:::I::::::S:::E::T

consensus       VEAVMTADEDDLLEVDGVGAVTAERIRDVVGSEYE---
#oth            .1...1.5112.4212.1.5...2.1.2.211314421
NP0336A         :::::S:::EA:QA:::::D:::::::::T:TT:ADSS
Hut2188         :Q:::::N:::::D:::::E:::::::E:::::::G::
rrnAC2704       ::::::::K::::::S:I:D:::D:::E:IA:D::P::
Hmu3059         ::::::::::E:MD:::::E:::::F:::::::F:Q::
VNG2356         :::::::S::E:TAA::::::::::::G:::T::QPE:
HQ1020A         :::::::G::::TA:::::::::A::::::::N:S:::
hla0740         :::::::P:::::::::::P:::::::E::::::::::
HVO_3010        :::::::N:E::K::R:::Q:::::::E::::::R:::
Hbo1501         :::::::R:E:::::S:I:S:::::::::I::::::::