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[L] (-) COG1112 Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits
9 genomes BUD0201 9 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1501

rrnAC0954

HVO_2767

Hbo2503

Hmu1756

Hut1148

hla1569

NP2944A

HQ2930A

Pairwise sequence scores
Consensus score6683 HQ2930A VNG1501 NP2944A hla1569 HVO_2767 Hbo2503 Hut1148 rrnAC0954 Hmu1756
4880HQ2930A 7081 3957 4341 4345 4516 4572 4229 4170 4264
4688VNG1501 3957 6205 4187 4306 4187 4249 4169 4024 4110
5232NP2944A 4341 4187 6666 4596 4733 4744 4514 4646 4620
5483hla1569 4345 4306 4596 6821 5128 5050 4556 4435 4537
5633HVO_2767 4516 4187 4733 5128 6662 5308 4714 4700 4710
5519Hbo2503 4572 4249 4744 5050 5308 7020 4721 4559 4723
5327Hut1148 4229 4169 4514 4556 4714 4721 6790 4821 5095
5215rrnAC0954 4170 4024 4646 4435 4700 4559 4821 6837 5354
5392Hmu1756 4264 4110 4620 4537 4710 4723 5095 5354 6970

1060 symbols
consensus       --------------------------------VNLRGPILEVGDERTVETQYGERDLAEV
#oth            111111111111111111111111111112333331143342423341414314251512
HQ2930A         ::::::::::::::::::::::::::::::::MRI::Q:IRID:::E:T:DQ:S:T:V::
VNG1501         ::::::::::::::::::::::::::::::::----------------------------
NP2944A         ::::::::::::::::::::::::::::::::M:V:::V:::D:PKS:::SH:TSQ::::
hla1569         :::::::::::::::::::::::::::::MTA::V:::::S::ET:::S:S::D:E:R:L
HVO_2767        ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::LV:::EP:D:::K::::S::::
Hbo2503         LTQTTLEGVGGNVSVIDNRDRQRFSPRHGPVG:::::R:V::S:::E::::::T:S::::
Hut1148         :::::::::::::::::::::::::::::::::H::::V:D:SETK::S::::::::S::
rrnAC0954       :::::::::::::::::::::::::::::MSVDRV::VVVDIEEPK::N:::::S::C::
Hmu1756         ::::::::::::::::::::::::::::::::---------::::Q::N:::::S::C::

consensus       TIRP---DRGAGDP----------------VTVTLWGKWTETAEHAEPGMELLVTDAEER
#oth            4312111322434322222222222221223321111212234553242.2211213222
HQ2930A         :L:I::::DLPANEAAELDIPDSSLIEDPIR:L::::D:A::MTY:::E::::::NVDLD
VNG1501         ----:::-------::::::::::::::::-------------------:::A:H::T:D
NP2944A         V::::::E:::AS:::::::::::::::::T:::::::::::V:YLAV:::::A::LD::
hla1569         R::::::::::::A:::::::::::::::::D:::::::::::::::::::::::::::D
HVO_2767        :L:::::E::T:E:::::::::::::::::::::::::::HA::::::::DI:::::::S
Hbo2503         S:::GAAGD:PI:AVGDGSADTTDADGDAL:R::::::::H::DL:::::D::::::::S
Hut1148         :::::::ED:RA:::::::::::::::::::::::::::::::SVL:A::DVA:Y:::::
rrnAC0954       ::::::::::::E:::::::::::::::::T::::::::::N:AAI:T:::IA:YNPD::
Hmu1756         :V::::::D:R:E:::::::::::::::::::::::::::::GAVL::::SVA:Y:::P:

consensus       EYRGETQYSTGGDSWVVVEPDFLVDVTDIRSWVQCPRMYYLNKLSGIPLAYPVVKGTIVH
#oth            2241233121242262111.2.2....11.21...1.1...1..2.3122..12...1..
HQ2930A         ::::DPR:::TS::Y:IL::S:I::::::::::::::::::::::::::K::::::::::
VNG1501         ----GAG:A:AAS:::::::E:V::::::::F:::::L::::::::L::K:::T::::::
NP2944A         TFD:D:::::T:E:A:::::::::::::::G:::::::::::::T:L::K:::L:::V::
hla1569         :FG:::G:A:T::::::L:::::::::G:::::::::::::::::::::N:::::::V::
HVO_2767        ::::::T::::SE:F:::::::::::::V::::::S:::::::::::::N::::::::::
Hbo2503         :::::PT:::AKE:Y::L:::::::::::::::::::::::::::::::N::::::::::
Hut1148         :::::::FT::E:TM:::::::I:::::V:::::::::::::::::T:::::::::::::
rrnAC0954       ::Q::Q:::V:::ATL::Q:::::::::::A::::::::::R::D:AEH:::L::::V::
Hmu1756         :::::::::V:S:ARI::::::::::::V:::::::::::::::::T:Q:::::::::::

consensus       EVFGDLLRGRDLEDSIAERVDEAGLELGLLGRDADEVADDVRDNAAAIEGWLQQGTLTD-
#oth            1........111341134212221.21....23332.2411121.3..1...3..31131
HQ2930A         ::::::::::::SS::DD:::::::::::::::::A:REE::Q::T::::::D::::GP:
VNG1501         :::::::::::::A:V:Q::::::::::::::SRA::EA::::::S:::::::::R::::
NP2944A         :::::::::::::S::ES::A::A:DI::::ET::A::::::Q:::::Q::::::RFG-:
hla1569         :::::::::ME::::VVD::E::::::::::YEPE::::E::R:::::::::S:::::::
HVO_2767        D:::::::::::DS::D::I::R:::::::::EV:::::E::R:::::::::S::V::::
Hbo2503         ::::::::::::D:A:E:::A::::Q:::::Y::T::E:E::R:::::::::A:::::E:
Hut1148         :::::::::::V::AV::::E:V:::::::::::ET:RQ:AL:H:S:::::::::H:::G
rrnAC0954       ::::::::::::DTA:E:Q::A:::DI:::::E:::::G::::H:S::Q:::::::::E:
Hmu1756         :::::::::::VAEAV:AH:ED:::D::::::::::::A::::H:E::::::::::::E:

consensus       --------EDEWRSEQTLISPRFGIKGRADALRRGMPVELKTGKNTKREPRFQDKIQAAA
#oth            11111112112....3..1.311.2...1..2...3.........1312...1..1..12
HQ2930A         :::::::S::T::::::::::T:::::::::::::I::::::::::DHD:::::::::::
VNG1501         :::::::::::::::Y::V:E:::::::C::I::::::::::::::N:::::H::V:::C
NP2944A         ::::::::::S:::::::::E::::::::::V:::::::::::::L::S::::::V:::C
hla1569         ::::::::::T::::F:::::T::L::::::::::T::::::::::::::::H::::::C
HVO_2767        :::::::::::::::Y:::::T:::::::::::::S:::::::::LN:D::::::::::S
Hbo2503         :::::::::::::::Y:::::T:::::::::::::::::::::::L::D:::::::::::
Hut1148         GQTTFGPT:G::::::::::Q:Y:L::::::V::::::::::::::N:::::::::::::
rrnAC0954       ::::::::T::::::M::::E:::M::::::V::::::::::::::::::::::::::T:
Hmu1756         :::::::::::::::M::::S:Y::::::::V::::::::::::::R::::::::::::C

consensus       YALILGERG--------VPPDTGTLLYTKNAAVDRNEESGDLSPAKEFSIGRGLLEFVVR
#oth            .1.3.42231111111352211........2111.3.12.1.1...1..125.1.31.1.
HQ2930A         :::::VN::::::::::IDVN:::::::::T:::::::T:::::::D:::AP:::K::::
VNG1501         :::M:D:H:::::::::::A:::::::::::::::S:A:::::::::::::::F::::::
NP2944A         :G:L:ADDI:::::::AD::::::::::::S:L::S:::::::::::::::P:F:KY:L:
hla1569         :::M:E::::::::::::D::I::::::::T:L:::::::N:A::::::V:Q:::Q::::
HVO_2767        :::::E:::::::::::F:V::::::::::TTL::T::::::::::D:::::::::::::
Hbo2503         :::V:D:::::::::::::AN:::::::::T:LE:H:::::::::::::::N::::::::
Hut1148         :::::::H::::::::EE::N::::::::::::E:T::G::::::::::::S::::::L:
rrnAC0954       :::M::::AAGAGSAVDAA::::::::::::::::::::::::::::::::S:::NY:::
Hmu1756         :::L::::R:::::::EEA::::::::::::::E:T::::::::::::::ND:::N::::

consensus       TRNEIAAMEHDM--------SVPTGYEADAKCEYCFEQDTCMVVSGRLDQESKAGQVGTP
#oth            3..21..2.4351111111142...1.1112.2....1...11.1..........52.52
HQ2930A         K::::::::::::::::::::I::::::::I::::::::::R::A:::::::::::::QT
VNG1501         E::HL::L:ASD::::::::GP::::::::::D::::::::::::::::::::::RI:D:
NP2944A         V::::::A:Y:::::::::::::::F::::N:D:::::::::::::::::::::::L:E:
hla1569         E::AL::::WRALNDRGERPT:::::::::::Q::::::::::::::::::::::S::::
HVO_2767        :::::::::::V:::::::::::::::VNS:::::::K:::::::::::::::::A::K:
Hbo2503         :::::::::F:T::::::::A::::F::::N::::::::::::::::::::::::KI:K:
Hut1148         ::::::::::G:::::::::D:::::::::::::::::::::A:::::::::::::::::
rrnAC0954       :::A:::::Y:S::::::::G:::::::N:::::::::::::A::::::::::::T::RA
Hmu1756         :::::::::Y:A::::::::::::::::::::::::::::::A::::::::::::::::A

consensus       VPEDEREYFDRFYRAIEAERRAVHAEYRKLWEQSPEERADDDRALIDLEPTGQRELDDGR
#oth            2.33.12.1123.4.2.2..123.3..1...3.3231..31...112.3.4332322222
HQ2930A         L:A:::::LE:::H:::R::::::D::::::T:::S:::S::::::N:T:A:ATQ::T::
VNG1501         ::AE::A:::EL:D::::::G:I:D::::::::::D:::A::::VVG:S:AE:T::P:::
NP2944A         L::P::A::E:L:::::E:::E::::::::::::AA:::::::::V::D:L:REP::G::
hla1569         ::NE::D::::::V:L:E:::ET::::::::::T:::::A::::::::::VS:T:I::A:
HVO_2767        ::::::D::::::::V:E:::S::K::::::D::A:::::::::::G:::I::T:RP::T
Hbo2503         L::::::::::I:::::E:::ET:::::::::::AA::::::::::G:::LD:::IEGQ:
Hut1148         I::::::::EAN::::::::::A:R::A:::R:DK::::E:::::::::::::::::::S
rrnAC0954       ::DE:LD::E:::T:V:::::S::R::A:::::T::::::N:::::G:::::R::::G::
Hmu1756         I::Q::::::::::::::::::::R::A:::D:R::Q:::::::::::::::E:R::G::

consensus       WELRARRTGDAVSKIREGDVALASDGDPVTGHAELARVERLGDE----------------
#oth            .212.34223.2..1.2.132.111.2.25.62.221144.2521111111111111111
HQ2930A         ::I::I:DD:::::L:N::I::G:N:N:I::QS:VC:IQT:DVD::::::::::::::::
VNG1501         :R:T:T:P:S:A:::::::RV::::::::A:R::M::::::DAD::::::::::::::::
NP2944A         :A:S::::S::::::::::RV:::::H:TQ:T::::T:RH:D::::::::::::::::::
hla1569         ::::::KP::::::L:::::::::::::::::G::G:ITA:SED::::::::::::::::
HVO_2767        :::::KQ:D:::::L:A:::::::::H::E:::::::IVE::::::::::::::::::::
Hbo2503         :::T:KKPDG::::L:::::C:::N::::G:::::C:IRE:::R::::::::::::::::
Hut1148         :::::KA::-:T::::::::V::N::::IE:E::::::Q::SA:::::::::::::::::
rrnAC0954       :::::TG::-::::::::NLV::::::::::N::::::::::N:::::::::::::::::
Hmu1756         ::::::G::-:::::::::I::::::::ID:D::::::::::S:TREERSDEGVSETRAG

consensus       ---------------------------------IVVTADEPVELRRLDVYPSELSVDRML
#oth            11111211111121221111111111123332311.21..134.2.1......1211.31
HQ2930A         :::::::::::::::::::::::::::DDGDGT:::::::KIT:K::::::::IG:::::
VNG1501         ::::::::::::::::::::::::::::::::RVE::T::::S:C:::::::::::::::
NP2944A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::V::::F::::I:::::::G:::Q:
hla1569         ::::::::::::::::::::::::::::::::EV::ET:::::::::::::::I::::S:
HVO_2767        :::::::::::::::::::::::::::::::::V:::T::::P:::::::::::T:::L:
Hbo2503         :::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::I::S:::
Hut1148         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::T::::
rrnAC0954       ::::APRA:::SDSGNG::::::::::NAVNEE::::::::LD:::::::::::TT::LQ
Hmu1756         AKRHASRADEHSESADGASGETASSGDDSTRGE::::T:::::::::::::::IGT::::

consensus       TALHDAVLKGDPDRKDVLFGRREPAFRD-------ADETFIDNNDAQNEAVRLAVDAEDF
#oth            1.21.12.4224421111.2123.6.55221111155333121.31.13..41.13.1.3
HQ2930A         :::D:FI:R::DTQ:A:F:N::::T:SNR::::::::::Y:PS:::::R::KR::N::::
VNG1501         :::::::::S:QR:T:L::D:AS:R:EG:::::::G:HDL:P::::::A::NR:LN::::
NP2944A         ::::::::R:::::::::::::::S:VG:::::::DHRPI::::ES:::::NR:LA::::
hla1569         ::::::I:::SEA:::::::::::E:::AADRPAD:P:AY::::AS:::::S:::::::G
HVO_2767        ::::::::::S:::::::::::D:D:S:RS::::::GR:::::::::DD::::::::D:L
Hbo2503         ::V:::L::::S::::::::::D:::TER::::::SEA:Y:::::::::::K::::::::
Hut1148         ::I:::L:QQS::E:A::::GQA:::E::::::::VA:::VE::P::DR:::R::G::::
rrnAC0954       N:::::::LQS:EQ::::::::::K:NP:::::::VE::::::::::::::Q:::G::::
Hmu1756         ::::::L:TQP:EQ:::::D:::::::S:::::::I:::::::::::::::::::G:D:C

consensus       ALIHGPPGTGKTYTIARLVRALVARGDRVLLSAFTNRAVDNALEALRDQGF----EDIVR
#oth            ..1.........1.1.232311.12.2...1..........222.12311311113321.
HQ2930A         ::::::::::::::::Q:LSV::::::::::::::::::::::T:V::PDVDVSD:S:::
VNG1501         ::V:::::::::::::T::Q:F::::::::V::::::::::::D:::Q::H:::::::::
NP2944A         ::::::::::::::L:QT:Q::::::::::::::::::::::I:::EA:::::::T:VL:
hla1569         :::::::::::::::::TI::::EE:N::::::::::::::::::::::::::::DEVL:
HVO_2767        ::::::::::::H::::TI::::ED:N:::::::::::::::::::::::::::::N:::
Hbo2503         ::V::::::::::::::I::::::D:N::::::::::::::::::::::::::::A:A::
Hut1148         ::::::::::::::L:T::D:::E::E:::::::::::::::V:::LE::V::::::V::
rrnAC0954       ::V:::::::::::L::M:::::::::::::::::::::::L::::EE::Y::::T::::
Hmu1756         ::V:::::::::::L::I:::::::::::::::::::::::CI:::EE:::::::T::::

consensus       VGTESGVRDDMQDYRLDRSGDPNARAAALRDAPVVAATTATCGSRVLREQSFDVALVDEA
#oth            3.113.1121114321443.2.423142132.2......12..11322223..1121...
HQ2930A         :::NA:ID:S:::IK::DT:S:A:C:T:VQS:S:::::::::::::M::::::::VI:::
VNG1501         ::::T:::A::::L::::::::GE::::::S::::::::::::::I:::LE:::V:::::
NP2944A         W:S:::::::::S::F::T:::RE::::::::Q:::::::A::::A:KQ:Q::::VI:::
hla1569         ::S:T::::::::V::VQR:::::K::E::::::::::::A::::::::CE:::::::::
HVO_2767        ::::::::E::::V::S:::::::L:::::N:::::::::S:::::M::::::A::::::
Hbo2503         ::::N:I:E::::LH:KTT::::D:V:E:T:::::::::SS:::::M:::::::::::::
Hut1148         M:::T:::E:LKHV:::PA:N:D:::DE:T:::::::::::::::IM:::D::::VI:::
rrnAC0954       ::::::::::::K:::ET::::GEC:SR:QS:Q::::::::::GST:QT:E::::V::::
Hmu1756         L:::::::E:::Q:::ETA:::DDCVGR:E::S:::::::S:::::AKT::::::I::::

consensus       SQLTEPGTLAAINRADRFVLVGDHEQLPPVVRAEND---------LQTSLFERLIEAYPD
#oth            1.1...2121.22112.1......2......11232111111112.13...11.113211
HQ2930A         ::::::N::::VAL:::V::::::Q::::::::DT:::::::::::::::::::::TH:E
VNG1501         ::::::D:::::::GA::::::::::::::::SGGR::::::::::SK::::::H:T::E
NP2944A         G:::::::FL:T::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::DD:::
hla1569         ::::::::H::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q::::E:::
HVO_2767        ::I::::::::V:L::::::::::K::::::::::::::::::::::::::Q::::T:::
Hbo2503         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:::::::D:A:E
Hut1148         G::::::A:::VA::E::::::::::::::::::D:IADRDATAD:SQ:::::::D:HS:
rrnAC0954       G::::::::::TTL::::::::::Q::::::QS:DE::::::::T:S::::::::D:H::
Hmu1756         G::::::::::TTL::::::::::Q::::::QS:DE::::::::T:SR::::::::::::

consensus       ASVMLDRQYRMSQRIQAFASREFYDGQLRPATGEVAAQRLADL-----------------
#oth            .2.1..1....1.2..111.21....2....2421.3.224.111111111111111111
HQ2930A         :::L:::::::A::::::S:QK::::E:::::RT::T::P:::LDETPTGPATDGGDGYR
VNG1501         ::::::Q:::::::::::S::::::::::::SS:::G:::T:V:::::::::::::::::
NP2944A         :A::::::::::::::Y::::::::::::::NA:::S:::::::::::::::::::::::
hla1569         ::::::::::::::::::::A:::::A:::::P:::G:T:R:::::::::::::::::::
HVO_2767        ::::::::::::::::::::::::::A::::::A::::H:R:::::::::::::::::::
Hbo2503         ::::::::::::::::::S:A:::::A:::::::::::::S:::::::::::::::::::
Hut1148         :G:L:::::::A:::::YS:::::::::::::::I:G:T:::::::::::::::::::::
rrnAC0954       :G:::::::::A:H::::::::::::::::::::::::::D:::::::::::::::::::
Hmu1756         :::L:::::::A:Q:::::::::::::::::::::::::I::::::::::::::::::::

consensus       ------------DGVDPAALPEALRDGVAFVDPDGSRDGNTNPTEADRVADIVAAYLAAG
#oth            111111111111111344411451314.5.4.23.441112124..311.23142143..
HQ2930A         QQKQQRLDAHQD:QTQTHT::AH:::P:V:I::::T::::::L:::::I::::TT:IN::
VNG1501         ::::::::::::-::::GG---:VHG::T:Y:VP:TD:AHVD:A:::::::V:T::VD::
NP2944A         ::::::::::::::::VST::S::::A:S::::G::A::::::::::::::::S:::D::
hla1569         ::::::::::::-:::::D::DG:AG::D:D::::T::::R:VR::E:::E::D::V:::
HVO_2767        ::::::::::::-:::T:D::AE:A:Q::::::::R:V::::::::::::EV::::E:::
Hbo2503         ::::::::::::-:::ES::::P:::P:::I::N:::V:::::V::E:::EL:ETFV:::
Hut1148         :::::::::::::::::::::DH:GGR:T:L::::QAV:::::D::AA::QT:ES::D::
rrnAC0954       :::::::::::::::AT:S:::::::R:::::SG::QV::::::::::I:E:L:S:RS::
Hmu1756         :::::::::::::::TLD::::T:::::N::::::HV::::::A::RA:::V:D::::::

consensus       VDPDDIGVIAPFRAQVAEIGRRTP--VTVDTVDRFQGSSKEVIVVSFVATGSLDGPIFED
#oth            222421.....1.....11221333111..........1..1121.1..223.22.1...
HQ2930A         I::S:::::::::::::A:SQ::S::::::::::::::A::I:II:::::N::EE:::::
VNG1501         L::GE:::::::::::::::::::AG:A:::::::::::::::::::::R:T:E::::::
NP2944A         ::::::::::::::::::LS::IDE::::::::::::::::::I:::::::E:SS:::::
hla1569         :::::::::::::::::::::::A::::::::::::::::::::::L::::D::::::::
HVO_2767        ::A::::::::::::::::S:::D::A::::::::::::::::::::::::E::::L:::
Hbo2503         :E::::::::::::::::::K::D::::::::::::::::::VI:::::S:T::::::::
Hut1148         :::G:V:::::Y::::::::Q:V:DG::::::::::::::::VL::::::::::::::::
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