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[KL] (DinG) COG1199 Rad3-related DNA helicases
9 genomes BUD0082 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG1383

rrnAC0680

HVO_1351

Hbo0197

Hbo3298

Hmu0888

Hut0122

hla2502

NP0960A

HQ1981A

Pairwise sequence scores
Consensus score6052 NP0960A hla2502 HVO_1351 Hbo0197 VNG1383 Hut0122 rrnAC0680 Hmu0888 Hbo3298 HQ1981A
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3916VNG1383 2478 2406 2565 2545 6228 3835 3883 3859 1835 1772
3958Hut0122 2432 2384 2578 2545 3835 6256 4291 4125 1764 1576
4055rrnAC0680 2435 2381 2601 2461 3883 4291 6346 4703 1795 1660
4024Hmu0888 2389 2338 2485 2504 3859 4125 4703 6290 1787 1660
2460Hbo3298 1912 1783 1864 1793 1835 1764 1795 1787 8412 3040
2091HQ1981A 1565 1499 1508 1522 1772 1576 1660 1660 3040 6838

1136 symbols
consensus       ------------------------------------------------MGDAAVSD-AP-
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NP0960A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::MSLGEAASPPFVSS::D
hla2502         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::VT::P---:-::
HVO_1351        :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::AV:TGPQSVT:
Hbo0197         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TT::GVKSVN:
VNG1383         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::D---:E::
Hut0122         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::TREET:::T:
rrnAC0680       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::P:STGTES:
Hmu0888         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::S::DG:RG:
Hbo3298         MPPSDDQNTGDSPHVPPWISDGETADPDIINVDSKHDSTESPDSLTRGV:PVT:::LDRT
HQ1981A         :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::CTDT:::IDAG

consensus       WREYFGHDEPYDDQADAIEAAIEAAEDDGFLAMEGACGTGKTMAALTAGIHLVRDPDS--
#oth            .444.22453.43.31112311322644.1224..1......11.2.1123221243312
NP0960A         ::PI::::D:::::R:G::T:::T:A::::::L::::::::::L::::::::::::::::
hla2502         :TDL:::A:::PE:::G:D:::D::::G::::L::::::::::L:::::LDR::::::::
HVO_1351        :Q:V:::P:A:PE:::G::T::QT:R::::AVV::::::::::L::::::D:::::::::
Hbo0197         :QAV:::P:::PE:::G:::::D::::::::VV::::::::::L::::::DR::::::::
VNG1383         :::F::FEA:::Q:::::G:::::GDS::::::::P:::::::::::::A::::NT:-::
Hut0122         :Q:L::FGQ:::::::::::::A:GRRQ:::::::P:::::::::::::AT:::E-:-::
rrnAC0680       ::T:::F::::EN::::V:R::::GKAR:::::::P:::::::::::::AT::::T:-::
Hmu0888         :E:::AF::::AN:G::::R::::G:AR:Y:::::P:::::::::::::AQ:L-:AG-::
Hbo3298         :AP::RY:SV:Q::I::VDTFL:LLSEN:YYVF:::::::::L::V:G:::AI::QSTLT
HQ1981A         :TP::RY:TI:A::RA:::SFLDTLGEQ:YYLK:::::::::L::I::S::AI:N:KQLN

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NP0960A         :::::::::::SF:::::L:S::::::::E::I::::GN::DDWH:::A::::::A:V::
hla2502         ::::::::::::F:::::L:S::::::::ET::E:::GD::DGYD::::::::::A:V::
HVO_1351        ::::::::::::::::::L:S::::::::E:::::::EN::TDWT::::::::::S:V::
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VNG1383         :::::::::::S::::L:::::::::E::::::::M::::DD::::LD:VA:::::::::
Hut0122         :::::::::::E::::L::::::::R::::::::QL::::D:::::LA:IA:::::::::
rrnAC0680       :::::::::::L:::MV:::::::::Q:::D:::AL:::ID:::::FD:IS:::::::::
Hmu0888         :::::::::::H:::IV:::::::::Q:::T:::AM::::D:::::LN:IS:::::::::
Hbo3298         KTLDNVSGDFP::S:L:::::L::::H:::REMKG:::S:::AKA:::TVVIR:RT:MM:
HQ1981A         DR:SPTNASAPE:D::IA:::::K::Q::I:E::G:::T::AETD:IQTVV:R:QA:MMA

consensus       YGREDVFP-DDAGVHDRCEDLRERTRGLVE--DDGDTDADALADAA--------D--WWD
#oth            15324842212541312223..25.15124114325434763445314445355235144
NP0960A         :NLAGAGGI::TN:YE:::G::::::::--::T:EA:T:GS::QQ:::::::::-::-RS
hla2502         :A::NRGGI:REN:YE:::G::::::N::G:::G:A:TTSN:VSE:::::::::-::-QS
HVO_1351        :S::GCGGI:::T:Y::::A::D::::::G:::G:R:S:E:::KD:::::::::-::-RE
Hbo0197         :S::N:AGI::TT:Y::::G::::::N::G:::G:L:STGK:VKE:::::::::-::-RA
VNG1383         :E:::K:::::::::E:::::::S:A::::GD:G:EF:GQDAR:LTELPAAETP:EP:::
Hut0122         :::::::::P::S::::::E:::N:AD:::::S::SS:DRPV:::V:IRPR::N:DI:::
rrnAC0680       ::::SQ:::::V:T:::::::::A:AR::::::::RS:GA:V:::::IAGE:AD:DQ:::
Hmu0888         :::::I:::::SS::::::::::N:AR:::::AE::GTDH:P:S:::VEAELGD:EQ:::
Hbo3298         :AYV:FP:F:RH::GEKMD::::M::K:IK::F:S:IPL:WPG:MS:PPDFSKV:YN:EE
HQ1981A         IRNAEL--:PKTDTQEATQ:::AT::EVIR::FNS:IPL:WPDNLS:PPAYSMAEYD:ST

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NP0960A         Q:V::G:S:GEA::::::::::::::::-::------S:::A::E::::P::M:A:G:AD
hla2502         Q:V::L:SGNRG:::::::::::::::GSATGDSSAA:::SVD:D::::::DTE:FEG::
HVO_1351        Q::::L:TGSTA::::::::::::::::-::---A:::::::::D::::PTSM::YE:::
Hbo0197         A::::L:TGSSG::::::::::::::::-::---G::T::::::E::::L::TT:YE:::
VNG1383         :AA:RAL:RS:::::::::::::::::::DAS:::SQTP:R:::TDA::V:H::T::EDM
Hut0122         ::::S:L:K:::::::::::::::::PGGVG::AVA-GT:T:::TES:::RT::T:::EI
rrnAC0680       :RK:Q:L:::::::::::::::::::PD:VE:S:::D:T:Q::::AS:::QA::T::ESM
Hmu0888         ::IAS:L:::::::::::::::::::PD:RD::R::EGT:G::::DS::::S::A::ESI
Hbo3298         ASLTAE:HRERFRYDPVRAEAVTRIVKDMDPRGDESF:R:TVN:VE:::PDLV:HTN:VV
HQ1981A         :SE:AVQ:QENHQYDPNRAEAIRHIVAQLEPRD:ESNAQ:CID:IE:::PQHV:HTSEIV

consensus       --G-DP------------PEYCPFYADFLA-LREDGSPIE---FDVGDHGVVTTEDLLPA
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NP0960A         ::-:--::::::::::::V:F:::::G::DD:P:::D:::AVP::PT:R:LIE:D::VEL
hla2502         ::-:--::::::::::::T:F:::::G::DD:P:::D:A:AVP:::TEL:H:GPTE:VRL
HVO_1351        ::-:--::::::::::::V:::::::N:::D:P:::D:::AVP::FD:K:LIG::::VSL
Hbo0197         ::-:--::::::::::::T:::::::T::DD:P:::D:::AVP:::TEL:L:D::E:VRL
VNG1383         AD:::::::::::::::::LM:::E::WYG:-:DK:::VG::::ET:Q:N:::SA:V:::
Hut0122         G::E:::::::::::::::L::::E::WF::-:NK::::G::::AA:EDS:::AAEY::G
rrnAC0680       AE:S:::::::::::::::L::::E::WY::-:NK:::VD::::SA::EH:::MD:Y:::
Hmu0888         AD:D:::::::::::::::L::::E::WY::-:NT::::D::::G::E:N:::A:EY:::
Hbo3298         DTDVLQRRGTGQLSVGLQGKFD::::GAFM:--:::L:FD::::HHA::H:FDQ:T:FQT
HQ1981A         DSTRLD:SNYNQLPSDLQGRFD::::AT::G:Q:--:IV:::::ADAPSH:IDKQT:FE:

consensus       AAERGTCPHRVMGALLPHAEVVVGNYNHLFDPQTRG-LTG---ALLDESTFVIVDEAHRL
#oth            3244.3...23144225512122...1.11..51253124212523134.2122..1.21
NP0960A         S:S::S:::S:::::::NV:IL::::Y:A:::T:VEAF:::::G:I::E::::C::::M:
hla2502         ::GH:::::SI::::V:EV:::I:::Y:A:::V:T:TF:::::::::N::::VC::::M:
HVO_1351        ::GA:S:::S::::::::V:::::::Y:A:::T:V:TF:::::::V:D:::::C::::M:
Hbo0197         S:GY:::::S::::V:::V:::::::Y:A:::T:V:SF:::::::A:D::::VC::::M:
VNG1383         GVDH:::::::QQV::D::::::::::::::::::::::D:::H:I:D::::V:::::::
Hut0122         :V::::::::A:QT:VGA:A::I:::::::::AS:A::IE:::PI:::R:::::::::::
rrnAC0680       :T::::::::::SVM:NE:D:I::::::::::GS:P::LS:::DV::NQ:L:::::::::
Hmu0888         SV:Y::::::A:SV::EA:D::I::::::::::::P::LA:::SI:::D:::V:::::::
Hbo3298         ::S::I:::EA:AM:AGR::::L:::Y::::::::L:::DDKIG:::SE:I:A:::G:QI
HQ1981A         TVAS:C:::EL:CI:AQQ:D:II::::::L::E::Y:::DRKLG::N:R:IA:I::::Q:

consensus       EERVRDLLSDRVGRQTLRDARNDLTRLIQ----------RAGQSTDD-------AELVRG
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NP0960A         :P:::::VG:S:SDRA:A::AGE:S:V:E::::TVAAVEE::::AEHGPEARAR::T::Q
hla2502         :P:::::V::A:ADAS::::E:E:::VV::::::PLSFET::AES:::::::::::::::
HVO_1351        :P:::::V:VG::DR:::::ESEF::V:::::::PVKFDD::K::V:::::::::D::::
Hbo0197         :P:::E:V::G::DA:::::E:E:::V:::::::PVEFDDS:KG:E::::::::::::::
VNG1383         :::::::::::L::H::TR::::CRT:LT::::::::::::N::REN:::::::RQQ:TD
Hut0122         :G:::::::::L::::IVQ::::CHQ:RS::::::::::M:R::P:H:::::::KRE::A
rrnAC0680       :::::::::::L:::SIVQ::::C:T:::::::::::::::Q::A:H:::::::KAQ::E
Hmu0888         :::::::::::::::::TQ:::::NF:L:::::::::::::R:TD:H:::::::RQQ:EE
Hbo3298         ::::::M::MSLDIY::DR:I::IEITRNYAVGDLAKTPTPNLN:S:ARLAESL:DSALD
HQ1981A         :::S::N::TS:DLY::MK::::VRIAR:YASGSIVDSPTPNLPRE:::::::::::AQK

consensus       ELED------ADVPLDELEEARDFLDDLRDWL-----DDRVTAYLD---REA-EGWRAD-
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HVO_1351        ::QE:::::::::T:R::::T:::IR:::EE:::::::R::::H:::::::Y:G::::::
Hbo0197         :::::::::::::M:R::K:T:::VR:V:EE:::::::R:::::::::::TM:PD:::::
VNG1383         H:AS::::::H:CS::AV:AMVG::::VLE:::::::::::AR::A:::A--:::FDP:R
Hut0122         H:GS::::::Q::::EAVDR::::Y:::L:::::::::::IA:H:::::D:VGRS:::::
rrnAC0680       V:SA::::::RE::::AVDQ::K:Y:::VR::::::::N:IESF:::::A:H::::::::
Hmu0888         V:AA::::::RE:::AAV:Q:QQLY::VL::::::::::::RT::::::G:F:::::T::
Hbo3298         TVGN::::::YS:TPED:A:VEQL:RFAKQK:TVYGS:AVSER:Q:ISWQD:V:R:G:::
HQ1981A         IV::GAKLRTSGIEVE::RAVEKL:NIAKQR::::::I:ASETIDA:::VGLIHRFGQE:

consensus       PSEL--RDDEIPLRDPEEPE-PDELTE-WAEREGYDGRLWRRAEAVGAAVERVLDSL---
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NP0960A         LPD:::D:::L::::::T:::T::::R::::EN:F:E:::V:::::C::AAT::NT::::
hla2502         MR::::D:::V::::::::G:E::I:A:::K::::GD:V:A:::Q:::V:K:::::::::
HVO_1351        :T::::D:E:L::::::::G:V:::::::::ER:H:EGT:V::::T:S::A:I:::V:::
Hbo0197         LTR:::E::::::::::::A:T:::::::::S::::EGA:V:::T:::VAA:I:N:A:::
VNG1383         :GS:PE::H::::::::SEQ:::A::Q::::QH:HT:DA::SLA:T:T::QAI::DD:::
Hut0122         DAA:PEH:L:::::::D:::::::::R::::QA::::D:F:QLDTI:L:::DASEE::::
rrnAC0680       ::S:PEH:R:::::::DTV::Q::::::::::K::E:S:::SLSK::::::DAI:Q::::
Hmu0888         :DQ:PQ::H::::::::TV::::A:::::::::::::G:::SLPKI:::::EAI:T::::
Hbo3298         :I:N::-----A:S:::C:DES::FLTDAIAEDDF:T:SFFKVYPAMLGTKF:FEA:EEA
HQ1981A         D::AQS:EIK-S:V::NNLNWG:Q::RDLERD:SISMSVMQG::RIMSRL:K:FTAFTEH

consensus       GE-DRTPAAPAVGRTLARWAERDHATFFREIELERTPDETAPAE--SWRRAYTAGLALFN
#oth            254313223431.45364.34521463211131234342563741231444111626321
NP0960A         D:D:KRR::::::::::::RRC::TDY::A:D::::W:D:R:::::::::::::SYT:H:
hla2502         E:E:KQR:::G:::::NA:YREG:DD:::A:D::::W:::::PD::::::::N:S:::Y:
HVO_1351        E:D:KRR::::A::A:ST::YA::EKH:::::::::W::ME:P:::::::::N:R:SVH:
Hbo0197         EDE:KRR:::::::M::N::RT::TS:::::::D::W::::REN::::::::N:H:::H:
VNG1383         :-:::SAV:GP::V::Q::W::::::Y:::V:::HV:K:SGR:G:AA:AES::PA:VM::
Hut0122         :V:G:::VVG:A:VIMR::W:H::::T::::::DHS:RDDQRI:::G::AT:::::T::D
rrnAC0680       :L:T:Q:VCA:::VLAGQ:W:::::::L::::::HS:NHGQTLD:ADYQAV::P::LCY:
Hmu0888         :L:S:::VCA:::TIAGQ:W:::::G:L::::::HA:ADERHVD:ADYEV::::::LCY:
Hbo3298         :IH::::QGVE::KFFK:::AEGTVEYH::VV:DDRRK::I:T:FPD:VK:W:PKFQ:::
HQ1981A         :ILS:::QGQE::AFFQQ::QAP::VYHP:VRVIPSQK:SF:DQFPA:VEHW:PE:R:::

consensus       CLPADALREVLGELGGGVLMSATLEPLDVFREVSGLDALEADG----D----D-------
#oth            .3.43213431422.1.1......2.41113224.1363357333352523424222222
NP0960A         :::::EIG:R:AAF::::::::::::::::A::T::RH::READ:::-::::-:::::::
hla2502         :::SEPIGDR:A:F::::::::::::M::::::T:::H::QR:::::-::::-:::::::
HVO_1351        :V:GE:IA:R::DF::::::::::::I::::R:T:::::AD::::::-::::-:::::::
Hbo0197         :::G::IA:Q:::F::::::::::::::::::::::N::::::::::-::::-:::::::
VNG1383         :M::R::::T:S:V:::::::::::::::::::A:::R:A:GA:::G:S::::P::::::
Hut0122         ::::E::ARTFEDV::::::::::::::::TR:::::T::EWD:::D:RDEH:G::::::
rrnAC0680       :M::T:::N:FDD::::I::::::::::::TR:::::SMAET:STAP:EQSG:G::::::
Hmu0888         :M:ST:::N:FDD:::::::::::::::::QH::::SF:RDG::::P:R::::P::::::
Hbo3298         :I:R:E:QA:F:::::::::::::Q:EE:YT:AV:INDIPFPTEDEE:DDAEETDVVTKP
HQ1981A         :I:KRE::R:FS:::S:I::::::R:KEP:::SI:I::VPQL:ELDTKVQSTEDEMTLRM

consensus       -------------RPVVERTYGLRFPEENRASFAVDAPKFTARNRGDP-T----GEE-NP
#oth            2221222221211.11444312.5.133..2.431.321..45...41423211244222
NP0960A         :::::::::::::::::::::::E:::A:::::::::::::YE::::::-:::::D::T:
hla2502         :::::::::::::::::::::::S::P::::::::::::::HQ:::A::-:::::::::D
HVO_1351        ::::::::::::::::A:::F::G:::S::::::::V::::HS:::P::-:::::::::E
Hbo0197         :::::::::::::::::::::::G::::::::::::V::::YE:::A::-::::::D::E
VNG1383         :::::::::::::::::::R:D:::::S:::::L:::TP:::H:::::EP:::::TD:::
Hut0122         ::::::::::::::::LT:S:::S::PA::::WI:::TP:::::::::A:MEPL:T:W::
rrnAC0680       ::::::::::::::::RST::D:P::P:::::YL:::TP:::::::::G:MRPL:DNW::
Hmu0888         ::::::::::::::F:TAA::::T::AD::::YL::CRP:::::::::E:MRPL::AW::
Hbo3298         SAGTSHDNSDI::::TAFEQ:P::::Q:::V:LIA:L::::N::::KRT:D:::PRQMK:
HQ1981A         NGITDEMTEDVET::TTFDRFP:::SP:::L:VV::L::::KA:::ERE:N:::HQAMTD

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#oth            2.521452434331262..11122.1.2..3.1344.534432.4221.2113361.241
NP0960A         ::Q:H:R:I:Q:::AA::::::CL:S::::::::SV:SAL-:::E:::::ATD:V:::::
hla2502         ::L:HL::TV::::SRE:::::GT:S:A::T:M:ES:SKRL::::::L::::G:R:::S:
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HQ1981A         I:EQ::EVIAQ::::TE::I:I:::S:S::A::HE::RTLSIE:RCF::K::TA:E:DM:

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#oth            155.142331122..3...1.....12.21.321321.1.13133122311.43..3231
NP0960A         :QS::E::P:::::::::::::::::R::R::::I:C:::I:::A::Q::::RT::::::
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VNG1383         :AT::::D:::::::T::::::::::::A::G:CL::::::V:V::::I:::R:::AD::
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HQ1981A         LSK::ESGDAI:C::::::I:::::F::E::HTCLS:::::APPS:-EMD::EI::Q::I

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NP0960A         :-::::::::::::::::-:::K:::S:::::K::::V::::::P::C:::V:C:E::::
hla2502         E-::::::::::::::::-S:::T::::::::K::::V::::::T::H:::V:L::::::
HVO_1351        :-::::::::::::::::-::::T::::::::K:::::::::::T::::::VF:::::::
Hbo0197         :NVPASDSSGSPRGASASR::::A::::::::K:::T:::::::SE:::I::::::::::
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Hut0122         :::::::::::::::::::HA::::::I:::::::::::::::::E::::::::G:::TP
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HQ1981A         T:::::::::::::::::TG:Q:A:RLI:ST::V::SV::::::VN:T:::I:A:E::GT

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NP0960A         ES:D:::DL:G:A:::::Q::GS:M:D:A:EQ::D::A::::::::::::::::::::::
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NP0960A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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HQ1981A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::

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Hbo3298         ENEIIPIVREHTVDEESGTEYIQLNFAKELSVSGWTKVDAEIVHTQIEPIAKRARK
HQ1981A         ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::