Home |  Text search
[C] (Ndh) COG1252 NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit
9 genomes BUD0131 10 proteins
a Hsa
Halobacterium
sp. NRC-1
b Hma
Haloarcula
marismortui
f Hvo
Haloferax
volcanii
g Hbo
Halogeometricum
borinquense
h Hmu
Halomicrobium
mukohataei
i Hut
Halorhabdus
utahensis
j Hla
Halorubrum
lacusprofundi
q Nph
Natronomonas
pharaonis
x Hwa
Haloquadratum
walsbyi

VNG0891

rrnAC0450

rrnAC1301

HVO_1578

Hbo3465

Hmu1123

Hut0428

hla2392

NP3508A

HQ2648A

Pairwise sequence scores
Consensus score2935 VNG0891 Hut0428 NP3508A rrnAC0450 rrnAC1301 Hmu1123 hla2392 HQ2648A HVO_1578 Hbo3465
1987VNG0891 2926 1627 1668 1796 1789 1783 1745 1585 1770 1745
1956Hut0428 1627 2895 1808 1812 1814 1784 1698 1666 1615 1721
2259NP3508A 1668 1808 2918 2088 2081 2124 1898 1777 1832 1883
2424rrnAC0450 1796 1812 2088 2963 2942 2257 1938 1785 1862 1980
2412rrnAC1301 1789 1814 2081 2942 2958 2249 1933 1780 1854 1972
2381Hmu1123 1783 1784 2124 2257 2249 2965 1937 1868 1923 1951
2255hla2392 1745 1698 1898 1938 1933 1937 2936 2004 2107 2096
2118HQ2648A 1585 1666 1777 1785 1780 1868 2004 2994 2105 2254
2245HVO_1578 1770 1615 1832 1862 1854 1923 2107 2105 3011 2307
2308Hbo3465 1745 1721 1883 1980 1972 1951 2096 2254 2307 2978

401 symbols
consensus       MTTQVVVLGSGYAGAGAIKSLEDEL-GP-DADLTWISETDYHLVLHEVHRCIRDPSVQEK
#oth            .124...1.1....1..1441.2112.5222221.111411......2..2..2.42313
VNG0891         :::R:::::A::::::::AG::S::::::::E:V:VAD:::::::::A::V::::G::::
Hut0428         ::ES::::::::::::::QR::S::::D:R:::::V:DQP:::::::::::::::::K:H
NP3508A         ::DD::::::::::T:::N:::S::D:-:E::I::::DV:H::::::S:::::::DI:::
rrnAC0450       ::EN::::::::::::::::F::::D:QT:V:V::::::::::::::S:::::::::::N
rrnAC1301       ::EN::::::::::::::::F::::D:QT:V:V::::::::::::::S:::::::::::N
Hmu1123         ::DN:::::A:::::::::::::::N:-:E::I::::D:::::::::S:::::::T::::
hla2392         :S:::::V:::::::::V:AF:::V::EGE::::::::H:::::::::::A::N:A:A::
HQ2648A         :S:::::V:A::::T::VNR:::K:::S:ETE::::::H::::::::::::::::::ES:
HVO_1578        :S:::::::::::::::VTT::E::::::::Q:::VA:H::::::::::::::::::ESS
Hbo3465         :S::::::::::::T::V:R::E::::::::E:::V::N::::::::::::::E::AESN

consensus       ITIPVDEIKSPSTEFVQGRVEDIDTDERVVELADG-DTVEYDYLLVGIGSQTAFFGIEGL
#oth            1111141..43315.24231331.1231415322213313..1.1122..5..112.1.1
VNG0891         :::::ED:::RT:::IEDS:T:::::::S:S::::::D:A::::V:::::E::TY::::M
Hut0428         V::::::::::::T:IE::::T::VEH:T:GF::::ESIA::H:::A::::::::R:D::
NP3508A         ::FD:T:::::::R:::::::::::::::IT:D:D:S::::::::::::::::::::D::
rrnAC0450       :A:::H:::Q:::S:I:DE:VG::::AQE:D:::S::::::::::::L::::::::::::
rrnAC1301       :A:::H:::Q:::S:I:DE:VG::::AQE:A:::S::::::::::::L::::::::::::
Hmu1123         V::::GD:::RQ:D:::AS:A::::E::::::D:D:S:::::::::A:::::::::::::
hla2392         :::::::::::ESN::R:::V:V::N:Q:::TD:::T::D:::::L:V::T:::::::::
HQ2648A         VA::I:D::TSE:D:HT:::TNV:VND:T::IDN:EE::G:::::LA:::G:::YN:D::
HVO_1578        ::::::D::DD:::::K::AT:V:V:::A:::EG:::::D::::::A:::S:::::::::
Hbo3465         VA::I::::E:Q::::K:H::N::VED:::::E::::-::::::::CL::A:::Y:::::

consensus       EEHAHTLKSLDDALEIHDAVAEAARDASRNDPAQVVVGGAGLSGIQTAGEIAEYRDEHRA
#oth            3.3212..2.2..32..341541.51.134..14111....11.1.2.1.1.21.1432.
VNG0891         A::PL::::::::M:::EQ:R:::Q::T:D:::N::I:::::::::S:::V::F::R:N:
Hut0428         ::N:L:::::::::A:::::ESE:D::TMA:::R:::::::QT:V:V:::V:A::A:MS:
NP3508A         :::SL:::T::::::::E::S::::E:::::::::I::::::::::S:::::::::SN::
rrnAC0450       K:::L:::::::::::::K:QQ:::E::T:::::::I:::::::::::::V::F::::N:
rrnAC1301       K:::L:::::::::::::KIQQ:::E::T:::::::I:::::::::::::V::F::::N:
Hmu1123         A:Y:::::::::::N::::I:S:::::TQ:::::I::::::::::::::::::::::R::
hla2392         ::N::Q::::A::KA::ED:RS::AE:T:S::VE:I::::::::::::::::::::K:::
HQ2648A         :::::E::G:N::RA::SD::T::KE:TQE:::::I::::::::::::::::::::::::
HVO_1578        ::F::Q::G::::R:::QEIK:::A::::D::::::I:::::::::::A:V:::::TN::
Hbo3465         Q:FS:E:::::::R:::SDIKA::E::::D:::K:I::::::::::::::::G:::::::

consensus       PIDIHLVEGLDEVFPGNDPELQGALRKRLEAADVNILTGEFISEVDEDTVYIG-----DE
#oth            .3113...112312.231233.211.5111232151411211231121312311221224
VNG0891         :::VT:::A:P:I::PG:S:I:::::H:::D:G:T:::DDP:TAAS::AIEFD:::::ER
Hut0428         :::VV:::::ES:L::ANSAF:S:I:D::DKRS:DVQ::N:V:S::D:A::FD::::::G
NP3508A         :LE::::::::N:::N:::VV:AK:::L::DK::Q:H:::::G:::D::::V::::::::
rrnAC0450       :::::::::::Q:L:NS:::::::::::::::::::KC::::G::::E::::::::::::
rrnAC1301       :::::::::::Q:L:NS:::::::::::::::::::KC::::G::::E::::::::::::
Hmu1123         :LE::::::::::M:NG:::::::I::::::::I::MC::::G::::::::V::::::E:
hla2392         :V::K::::::::::::::Q::::::Q:::D::IE::::D:::KA:::A::F:GGEDEEP
HQ2648A         :ME:T:::::::::::::T:::::::E::::R::R:::::::::::SEM::V:GNDDN:A
HVO_1578        ::::K::::M::I:::::::::::::R:V:DL:ID::::D:::K:::E::F::GGEDEAP
Hbo3465         ::::T::::::::::::::::::::::::::R::E::::D:::K:::EN::L:GGEDE:P

consensus       EELDYDVLVWTGGITGQDEMEDVELDKDERSNRVHAESDFQTSDERVFAIGDCALIDQGG
#oth            43.4..212....1..3523521433212222.35255211121111..2..31112.15
VNG0891         DS:::::F:::::V::PS:LS:::M:AEH--::LQ:S:TL:AD::::::V:::SM:S::N
Hut0428         RD:A:::::::::::::RA::::RVT::HK:::LKTTTT:::D::::::L::A::V::P:
NP3508A         K:::::::L:::::::::AA:TANV:::D::::IE:A:N:::::::::::::A:::::PD
rrnAC0450       D:::::::::::::::R:C:Q::D::::::NH:::::GN:::E::H::::::S:::::P:
rrnAC1301       D::E::::::::::::R:C:Q::D::::::NH:::::GN:::E::H::::::S:::::P:
Hmu1123         T:::::E:I:::::::R:AVR::::::::::H:IDS:R::::::D:::::::::::::P:
hla2392         :::S::::I::::::::P:L:N::VE::::::::::G:::T:::D:::::::T::VE::D
HQ2648A         :K:P::T:::::::::HN:VT::GIN::D::Q::F:DA:::::N::I::V::T:::E::S
HVO_1578        :::::::::::::::::P:AS::::EQ::::H:FF::E::::::D::::V:::::VE::P
Hbo3465         ::::::::I::::::::E:VA:ADIE:::::::IFTDA::::::::::::::S:::E::T

consensus       -DDPAPPTAQAAWQAAEVAGENLARAIRGQPLKTWTHEDKGTVVSVGDDAVAHDV----I
#oth            1131...1.....1..1.111.2..33314..43.22412..11.1.33.1.13.34326
VNG0891         :::V::::::::::::D:VAR:V:::ME:R::E:::Y::Q::L::::ET:I::::EMSG:
Hut0428         :E:::::N::::::::D::A::I::S::::::TE:RY:N:::::::::E:::T::LY::-
NP3508A         Q:N:::::::::::::::::::I::E::::::TE:EY:::::LI:::GK::::N:::::K
rrnAC0450       ::Q:::::::::::::::::::::::V::::::::::K:::::::::EK::::::::::V
rrnAC1301       ::Q:::::::::::::::::::::::V::::::::::K:::::::::EK::::::::::V
Hmu1123         ::::::::::::::::::::R:::::V:::::D:::YD:M::::::::K::::::EYMG:
hla2392         :::V::::::::::::::::::::::A::A::QS:E:T:::::::::E:::::::::::M
HQ2648A         :ESV::::::::::::::::::V::::NEE::Q::R:D:::::::::::::::G:KFPVF
HVO_1578        ::NV:::::::::D::D:::::I::::A:K:::R::FT:::::I:I:H:::::G:KFPVF
Hbo3465         ::SV::::::::::::::::::V::TV::::::::::N:::::::I:::::::A:KLPGL

consensus       G-LPINTFGGPPAKLLKKGIAARWIADVTSTGRAAKAWPDM
#oth            425.141.2143.24...42.12..32223532142.1431
VNG0891         A:A::R:::NM:::V::::A::::::KI::WS::M:::DAL
Hut0428         -:S::E::N:LG:E::::V:::::::::S:FS::FS:::N:
NP3508A         ::::VD:::::A::A:::TV::::::K::GFSD::::F:::
rrnAC0450       N:M::E::::M:::::::A::::::N:M:GV::::::::::
rrnAC1301       N:M::E::::M:::::::A::::::N:M:GV::::::::::
Hmu1123         S:V:VD::::FL:EN:::A:::K::RR:ST:::::::::::
hla2392         ::M::K::::T:::::::S::V::::KIS::::GVS:FG::
HQ2648A         :K::::V:A::A:RT:::::::::::::A::RH:LE::ES:
HVO_1578        :EF:V:V::::L:RT:::::::N:::::::PK::LS::N:L
Hbo3465         :K::::V::::A:RA:::::::K::S:::DAR::VE::DSL