| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 5335 | NP2070A | HQ1801A | hla1784 | HVO_2883 | Hbo2649 | VNG1508 | Hut0583 | rrnAC0969 | Hmu1676 |
| 3955 | NP2070A | 5368 | 3232 | 3362 | 3541 | 3543 | 3260 | 3307 | 3432 | 3452 |
| 3881 | HQ1801A | 3232 | 5434 | 3416 | 3620 | 3781 | 3067 | 3248 | 3275 | 3304 |
| 4190 | hla1784 | 3362 | 3416 | 5539 | 3868 | 3807 | 3274 | 3368 | 3462 | 3401 |
| 4387 | HVO_2883 | 3541 | 3620 | 3868 | 5323 | 4160 | 3307 | 3339 | 3548 | 3452 |
| 4354 | Hbo2649 | 3543 | 3781 | 3807 | 4160 | 5346 | 3277 | 3451 | 3542 | 3526 |
| 3808 | VNG1508 | 3260 | 3067 | 3274 | 3307 | 3277 | 5370 | 3214 | 3375 | 3462 |
| 3933 | Hut0583 | 3307 | 3248 | 3368 | 3339 | 3451 | 3214 | 5388 | 3677 | 3726 |
| 4141 | rrnAC0969 | 3432 | 3275 | 3462 | 3548 | 3542 | 3375 | 3677 | 5468 | 3999 |
| 4103 | Hmu1676 | 3452 | 3304 | 3401 | 3452 | 3526 | 3462 | 3726 | 3999 | 5372 |
767 symbols consensus MDPKRELTSVDLAALVTELNRYEGAKVDKAYLY-GDDLLRLKMRDFDRGRVELLIEVGDI #oth .13.1121.1.22..33..3413..221.2.1.12.111.11111211..2.122..125 NP2070A ::R::AM:::::::::G::RD:T::V:::::::::::FV::::::Y::::I::::::::P HQ1801A ::::Q::::::I:::::::R::T::::::T:R::::::::FR::::::::L:::::::TQ hla1784 ::Q::::S:I::::::::::::::::::::::::D:::::::L::::::::::M:::::: HVO_2883 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::L:::L:::E: Hbo2649 ::::::::::::S:::::::::::::::::::::::N::::R:::::::::::IL::::V VNG1508 :NQ:::V:::::V::TA:::E:A:::::::::::::::::::::::::::::::V:::ET Hut0583 ::R::::::::C:::AG::RAFV::YHE:S::::D:::::::LSGPNF::I::::::D:P rrnAC0969 ::H::::::::::::EG::AG:::::L::::::PE:::V:::L:::::::::F::::::V Hmu1676 ::H::::::::::::ER::GG:::::L:::::::E:::::::::::::::::::::::EN consensus KRAHVADPEHVPDAPGRPPNFAMMLRNRLSGADFAGVEQFEFDRILTFEFEREDENTTIV #oth ..2.224232.11..1...1..1.....23.13135.1.21....2314.2.3135.421 NP2070A ::::::V:::::::::::::::::::::IA::N:E::::YG:::::::R:::::QT:L:: HQ1801A ::I:T:::D::::::E:::::::::::::::::LVN:::::::::MILS:::GE:M:R:I hla1784 :::::::::N:A::::::::::K:::::M::::::::::Y::::::::::::::::::L: HVO_2883 ::::L:AQ:::::::::::::::::::::::::::::::Y::::::::T:::G::::K:: Hbo2649 ::::T:K::::::::::::::::::::::N:::::::::Y::::::::D:::G::D:E:: VNG1508 ::::::::T:::::::::::::K:::::::::::HA:R:HG:::::E:::R:::AD:::: Hut0583 ::V:TIT:DR::N::E:::::::::::::E::QLES::::::::::QLR:::S:DH:::I rrnAC0969 :::::::QS::::::::::D:::::::::::::LVR:::::::::IEL::D:::AS:::: Hmu1676 :::::V:AD:::::::::::::::::::I::GEL:D:R:::::::ME:::D:P:AS::V: consensus AELFGDGNVAVLDETGEVVDSLETVRLKSRTVAPGAQYEFPSARFNPLTVSYEAFARRMR #oth 1....1..2.1112531.131.2....21...1..32.11.22.23.2223233153514 NP2070A ::::::::I:::N:DH::I:C:D::::SA:::::::::GY:DE::S::DC::A:::AK:D HQ1801A V::::::::::V:SA:::IQ:::::::::::::::::::::DS:V:::Q:T:DR:ISL:N hla1784 :::::Q::::A::::::::G::Q::::::::::::::::Y:AS:L:::D::LGG:K:H:: HVO_2883 V::::Q::I::::::::::R:::::::::::::::S:::Y:AS:LD:::::RD:LG:N:E Hbo2649 V::::Q:::::::::::::R::::::::::::::::::::::S:LH:F:::::G:K:::E VNG1508 ::::::::I::::PQR::::::D::::Q:::::::RD:G::D::V:::DL::::::EQ:: Hut0583 ::::::::L::::::DT:I::::::::Q::::T::S::::::::::::::E::T:VE::: rrnAC0969 ::::::::::::::Y:::I:C::::::::::::::TP::::::::::M::D:DG:VA:IK Hmu1676 ::::::::::::::H:::::C::::::::::::::S::::::::::::::D::T:LE::: consensus ESDTDVVRTLATQLNFGGLYAEELCTRAGVEKTTAIDDATDDDYEALYDAIEDLGERLRS #oth 2..2.2.......1.1....1..2.3...1212441423414422212323543543242 NP2070A :::S:L:::::::::::::::::::R::::::::D::E:::::::::FG:L:R:R:PILE HQ1801A :::::I:::::::::L:::::::V:A:::ID:::Q:TNTS:KI:R:I:T:L:S::TQ:Q: hla1784 :::S:::::::::::L:::::::V::::::::E:P:::V:::QLR::HE:L:RI:::::: HVO_2883 Q::::::::::::::L:::::::::::::::::LD:A:::::::DDI::::V::R:QV:A Hbo2649 D::::::::::::V:L:::::::F:::::::::ME:S::G:EE:R:I::::QTFHD::K: VNG1508 D::::L:::::::::::::::::::S::::::::PVA::PESTL:::F::S:T:LGNISA Hut0583 Q::A::::::::::::::::G::::S::::PYNQ::GET::AEF::::::VN::ST:::E rrnAC0969 :::A:L::::::::::::::G::::::::IDYNV:V::LDES:F:R::EL:DEM:T:::E Hmu1676 Q::A::::::::::::::::G::::::::IPYNQ::G:TDEAEF:R::EV:A::KA:::: consensus GDLDPRVYYE---------------DEDGRVVDVTPFPLEEHE--GLDSEAFDSFNDALD #oth .231.11.414332331111111222424521.1..31.6.2533334443123.14.21 NP2070A :RT:::L:ED:::::::::::::::--::Q:::A::L:::::TAE:Y:AT::EH::G:I: HQ1801A ::FE::L:TD:::::::::::::::--:DA:I:A:::::::RKQQN::VTTY::::G::: hla1784 ::V:::::E:ELSDDE:::::::AE:R:P::::::::::S:::::::P:VG:::::A:V: HVO_2883 :EF:::L:LD:::::::::::::::-D::E:::::::::R::QNA:::E::Y:T:::::: Hbo2649 ::F:::::T::::::::::::::::--::N:::A:::::K:::AE::N::SY:T::E::: VNG1508 :::::Q::::PTDDE::::::::::::Q:AR:::::IA:D:RA::D:P:D::E::::::: Hut0583 ::::::L:F:T::::::::::::::::QETP:::::V::V:Y:::DTPG:S::::::::E rrnAC0969 ::V:::::::TLDDGDGAGNGESGD:P:R:RI::::I::A:Y:::E:Y::S:TE::P::: Hmu1676 ::::::::::YEEIEG:::::::::E:IE:R:::::I::::YD::DVE:R::ET:TE::: consensus EYFFRLDREADEE-----EAGSDRPDFEAEIEKQQRIIEQQEGAIEDFEQQAEAEREKAE #oth 3..542244444252211253541...131.2.32..12..12..121.42.13.121.. NP2070A A::H::QA::ET:T::::DT:D:K::::S::A:FE::::::Q::::EY:K:::V:QQ::: HQ1801A V::REV::NPAA:::::::S:QT::::A:::A:K:::::::::::D::::R:::::SR:: hla1784 :::Y::::DGS::GEAPAD:SPS:::::E::G::E::V:::Q::::G::E:::::::R:: HVO_2883 :::::::LT:::Q:::::::T:::::::EQ:A::::::D:::::::G:::::QD:::R:: Hbo2649 ::::AF::S:ED:PEE:::P::N::::::::::KK:::::::::::G::::::R:::R:: VNG1508 D::TN::TSE::DS::::GETV::::::N:::::::::::::Q::::::A:::::::::: Hut0583 A::LG:EQ:P:::::::::T::N:::::::::::K:::Q::::::::::ED::::::::: rrnAC0969 D:::NFQ::EEV::::::GGETQ:::::::::::::::Q:::Q::::::AD::V:::::: Hmu1676 :::YEVE::DTA:EIA::D::V::::::S::::YE:::Q::QS::::::SD::::::::: consensus LLYANYDLVDEVLSTVQGAREEDVPWDEIEATFEEGAERGIPAAEAVVDVDGAEGTVTID #oth 1..13.1..122211116..43322.12.24113311221122.1113311222111134 NP2070A :::G:::::::IC::::S::::G:::::::T::::::::::D::A:::G::A:::::::: HQ1801A ::::::E::N:IIE:I:T::A::TS::::RE::AM::::::D::A:::S:::::AM:::E hla1784 ::::E::::::::::::E:::AE::::::AE:LDA:::Q::::::T::::::G:::::VE HVO_2883 ::::::::::D:::::R:::::G::::D:A::L:::::Q:::E::::TN::::N::::V: Hbo2649 ::::::E:::::::::RS::D:S::::::RQ:L:D::::::::::::::::::::::::E VNG1508 S::GH:::::GL::A:RQ:::AGHG:QQ:AD::DDA:GD-V:G:::F:G:NESA:MIRAR Hut0583 :::::::::::::::::D::AAET::::::::LSA:KDQ::::::::R::::S:::::VQ rrnAC0969 ::::::::::D::::::A::QD::S::D:::K:D:::D:::A::::::SL::S:::::L: Hmu1676 ::::R::::::I:::I::::TQ:T::::::::::::K:Q::A:::::EGL::S:::::LS consensus I----------DDTRVTLDADMGVEKNADRLYQEAKRIEEKKEGALAAIENTREDLEAVK #oth 1111111111112531322233...1...21.21...111..1..42..22..12.32.1 NP2070A L::::::::::::KEID::PT::::::::::::::::VRG:::::Q::::D::::::D:: HQ1801A :::::::::::::M::PVNV:V:::::::QR:T:::::::::::::T:::::::E:N::: hla1784 LRGGDGEDDDGET::IE:::SA:::V:::::::::::::G:::::ME::KS::AE::::: HVO_2883 L::::::::::::AT::::VS:::::::::::T:::::::::::::::::D:::E:A::: Hbo2649 ::::::::::::G::IEVEV::::::::::::K::::V:G:::::M::::D:::E:AE:: VNG1508 :::::::::::::HT::::PSA::::::::::T:::::::::A::R:::::::A::D::: Hut0583 :::::::::::::HHIE::::T:::::::::::::::::G::A::EE::A::::Q::::: rrnAC0969 ::::::::::::G::::V::FT:::::::E::K::::::::::::::::::::::::::: Hmu1676 :::::::::::::V:::I::T::::::::Q:::A:::::::::::Q::::D::::::::E consensus QRRDEWEA----------DD-DDEDD----DEDDEDE------------------DTDWL #oth 4.133.12111111111132243252111145433631111111111111111113421. NP2070A E::RQ::::::::::::::::-:::::::::A:E:SP:::::::::::::::::::R:Y: HQ1801A ::::A:DR::::::::::E:AKPDTE:::::NA:NT:TVTDKVNTGTEPSRMGPT:DE:: hla1784 E:KA::::KEAAADETAG:GA::GEE::::E::G:EY::::::::::::::::::Q:::: HVO_2883 K:::::::::::::::::::G:EDE::::::::E:P:::::::::::::::::::E:::: Hbo2649 A:::A::E:::::::::::::-ED::::::E:PE:P::::::::::::::::::::I::: VNG1508 ::::::::::::::::::--:EP:SE::::H:::A:D::::::::::::::::::EVA:: Hut0583 :::EA:::::::::::::S:G::GG:GSGETHE:DQ::::::::::::::::::::V::: rrnAC0969 E::E::::::::::::::::GE::A:::::NDEA:::::::::::::::::::::P:::: Hmu1676 R::EN:::::::::::::E::TT:TQ::::EQTA:AD:::::::::::::::::::V::: consensus SRSSIPIRSQEDWYERFRWFHTSDGFLVIGGRNADQNEELVKKYLDKHDRFFHTQAHGGP #oth 225.1.325616.111....3..311..1...1.11..21.1..1433.2...21...1. NP2070A :MA:V:V:YD:K:::Q::::R:::D:::::::D:::::A:::::M:PS:::::A:::::: HQ1801A :MT:::LQKND::::Q:::::::T:Y::V:::::::::T::::::N::::::::E::::: hla1784 :::::::::PD:::D:::::Y::T:Y::::::::::::::::::MG:::::::::::::: HVO_2883 ALD:V:VK:T:H:F:::::::::T:Y::V:::::::::::::::MS:::::::::::::: Hbo2649 ::::::LKTE:Q:::Q:::::::::Y:::::::::::::I:::::N:::L:::::::::: VNG1508 ::::::::H::Q::::::::R::E::::::::D:G:::::::::M:RY:::::S:::::: Hut0583 T:E:::::TS:E::::::::T:::::::::::::::::::::::::RG:L::::::::A: rrnAC0969 :MQ:::T::T:R:::Q::::::::::::::::D::D:::::Q:::EGG:K:::A:::::: Hmu1676 ::A:::V:R::P::D:::::R::N::::::::::::::::::::::RG:K:::A:::::: consensus VTVLKATGPSE-PARDVDFPEETLREAAQFAVSYSSVWKDGRYAGDAYMVDPDQVSKTPE #oth 2.21.121.1.1125312323423211.2..111.13..1.1211.1.3.4.1..1.... NP2070A ::I::::A:D:::::E::I:DTSK:::::::::::::::::KFE::V:E::::::::::: HQ1801A I:I:::S:::::::EPIELTA::R::V::::I::::I::E::::D:::V:T::::::::: hla1784 ::L:::A:::::S:DP:::S::::::V:::::::::D:::::G:::::::E::::::::: HVO_2883 ::L:::::::::::QA:::S::::::::::::::::I::E::F:D:::::E:S::::::: Hbo2649 :::V::::::::::QE:E::DS:K::::::::::::I::E::::D:::::T::::::::: VNG1508 I::::TSA:::::SN:IEV::RDA:Q::R:::AC::::::::G:::::::S::::::::: Hut0583 A:I::::::::A:PD:ISI::SSRE::::::I:::TL::E:K::::V:C:G::::T:::: rrnAC0969 :::::::::::::SKE:E::QSS:DQ:::::::::::::::KF:::V::::::::::::: Hmu1676 ::::::::::::SS::::I:DQDK::::T:::A::::::::K:::::::::::::::::: consensus SGEYIEKGSFVIRGDRTYFRDVPAGVAVGIQCEDETRVIGGPPSAIEDRVETSIELEPGR #oth ....1...1.11....2.221343421..13.224.211...221144312142423..2 NP2070A ::::::::G:::::::N:Y::MQV::::::K::PD::::::::::::PVA:::VR:Q::Q HQ1801A ::::::::::::::::::I:::A:EI::::::A:::Q:::::::::A:::P:MVQVR::: hla1784 :::::::::::::::::::E:::CRI:::V:::PV:QA::::::::V:::A::VT::::M HVO_2883 :::::::::::V::::E::E::::K:::::::::::::::::::T::T:A::TLT:T::Q Hbo2649 ::::::::::::::::::::::E:K:L::V:::G::::L:::::::::H::AAVS:Q::: VNG1508 ::::L:::G:AV:::::::::LSTEW::::T::PN:::L:::TD::REQ:::R::I:::: Hut0583 ::::L:::::A:::::::YD:T:V::::::T::P::::::::::::DGQA::T::V:::: rrnAC0969 ::::L:::G:AV:::::::EGT::::::::T:D::::::::::A:::GQAA:::TV:::Q Hmu1676 ::::L:::G:A::::::::::LEVD:::::S:::W:G:L:::R::V::::A::::I:::Q consensus YAQNDAAKRLYREFRERFADESFVRKVASPDQIQEFLPPGGSRIVEE #oth 1..1.1.124..21121.3.41....1..1141.113.1...23213 NP2070A F::::I::::::T:::::N:T:::::I::A:R::::C:::::ER::- HQ1801A ::::::::LA:::::N::::::::::I::::K::::::::::DL:D: hla1784 :::::::MMV:::LKG::::Q::::::::A::L:::I:A:::D::D- HVO_2883 ::::::::LC::RL::::::K:::::I:::::::::::::::D::D: Hbo2649 ::::::::MV::R:::M:E:Q::::::::::K::::::::::ELLDN VNG1508 :::G:::::I::::::::T:::::::::::GE::KYM:::::::::: Hut0583 :::::I::::::::KG::::DT:::::::::L::::::A::::M::: rrnAC0969 :::::I::::::::K::::::T:::::::::::::::::::::MT:D Hmu1676 :::::I::::::::K:::E::::::::::::L:::::::::::M::-