|
Pairwise sequence scores | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3077 | HVO_2885 | hla0316 | pNG7331 | VNG6308 | HVO_1586 | hla0423 |
2485 | HVO_2885 | 3103 | 2489 | 2542 | 1708 | 1705 | 1762 |
2478 | hla0316 | 2489 | 3031 | 2504 | 1628 | 1802 | 1743 |
2437 | pNG7331 | 2542 | 2504 | 3129 | 1633 | 1780 | 1708 |
2049 | VNG6308 | 1708 | 1628 | 1633 | 3599 | 2043 | 2054 |
2199 | HVO_1586 | 1705 | 1802 | 1780 | 2043 | 3137 | 2269 |
2169 | hla0423 | 1762 | 1743 | 1708 | 2054 | 2269 | 3142 |
504 symbols consensus MAQF-------------------------------------------------------- #oth .33321111111111111111111111111111111111111111111111111111111 HVO_2885 :FGT:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0316 ::S::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: pNG7331 :I:P:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: VNG6308 ::R:SGISKQELYSWEFKRVLSSRRSHSECDENATDTKQSSCVFETTPAYGIVSFTASIS HVO_1586 :S:SG::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: hla0423 :SST:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus --------IRSLWRRYRSVPIIYRIAVAFVLGSLAGLVFGEPAAVLKPLGDLFVRLLNML #oth 111111113333.42...12111..2...11.133.221.2211214.2.2..21..2.1 HVO_2885 ::::::::V:TV:DE:::::L::::F::::A::A::IL:::RM::VS:::E::I:::::: hla0316 :::::::::G::::::::::L::::::::L::::::A::::RMT:V::F::::L:::::: pNG7331 ::::::::::T::S::::I:L:W::F::::::AG::I::::QM::VR:V::::L:::::: VNG6308 ECCAMLNRL:DA:AA::::A:::::::::::::VC::AV:A:::Q:E:::T::::::K:I HVO_1586 :::::::::V:::N:::::G:V:::G::::::::V:::V::::TA:::V::::::::K:: hla0423 ::::::::TMRS:::::::::V:::G:::::::VF:::V:Q::TA:Q:::::::N::S:: consensus IIPIIVFTLLMGIRQLSPAKLGKIGGATVGLYALTTAFAGAIGLAVANLLQPG-RGLE-- #oth 21.11.....2.2.1...241.11.13112..12.114.231..212.224..1211.11 HVO_2885 ::::::::::S::::::::Q::::::S::::::V::TI::L:::::::I:::::::V::: hla0316 AV::::::::T:::::::::::R::::::::::V::T:::L:::::::::R:::::V::: pNG7331 V:::::::::T:::::::::::::::::::::::::TL::I:::::::V::::::::::: VNG6308 :::VV:::::::A:::::TRI:::::EVIA::LG:::V:I::::LAG::IN:::V::::: HVO_1586 :V::V:::::::V:::::SS::RV:AQV:::::::S:::V::::G:S::VS::S::::EL hla0423 :V::V:::::::A:R:::SN::::::QV:V:::::S:A:VGF::L::::ID:::AN:::: consensus FADAEAQSAAAPDLTEVVLGIVPNNPVGAMAEGNLLATIFFVIVFGIALTYVRARQD--- #oth 23111121321.1232.2111..3..12.1.3.22.1.1..1121.12112233332133 HVO_2885 :L::::R:Q:P:S::D:L:::::S:::T:L::::::::V::::T:::::::::::::::: hla0316 :TGG::::Q:P:S::::::::::::::A::::::::::V:::::::::::::::QKP::: pNG7331 :GGG::::K:P:S:LD:::::::::::A:L::::::::V::::::::::::::::::::: VNG6308 V:::AVETTQ::::GT:LMNV::T::I::::N:DV:P::::T:AL::SFAILQDEFEPGT HVO_1586 L:G::::::E:::AV::::NV::T:::::::D:GV:P:::::V:::LG::LAWEET::DE hla0423 LG:::::T:E:::IV::I:::::Q::I::::S:DI:P:::::::::L::AL:EQST::SA consensus DLAEGVDSVFDAAEAGAEAMFVVVRGVLEYGVIGVFALMASGIGTAGVDAISPLAELILA #oth 423432232142122.2..1121.1.11.1..2.1.....421.11.112121113.121 HVO_2885 ::::T:::I:A:F:V:T::L::I:::::::::V:I::::::::::E:IGVF:S:G::V:: hla0316 E::GR::G::G:FKI:::::::::::::::::::::::::V::::E::GVF:S:GA:V:: pNG7331 A:::S:::::E:F:V:::::::I::::::F::L::::::::::::E:IGLF:S:G::V:: VNG6308 PVHD:AQA::KI::::S::::N::W::M::::::::::::TTF:E::::::L:F:K::G: HVO_1586 QVKR:IETF::L:D::::::YK::W:AM:F::L:::::::NVF::::::::L:F:L::GT hla0423 :IRN::E:FY:L:::::::::K::W::M::::::::::::AVF:E::::::V:F:L::VT consensus VAIAVVAHIGFTYLFLLMRGVAGVSPVAFLAGAKDAMVTALAIRSSSGTLPVTMANADEN #oth 232.213..2311.2322422233..21..3.111.12..111...........51.111 HVO_2885 ::V::::::VI:::::::GL:MN:::::::::::::::::F:T:::::::::::Q::E:D hla0316 :GV:::V::A:::::V:::V::::::::::R::::::L::F:T:::::::::::T::E:D pNG7331 :T::IGI:::::::V:::SVI:D:::I:::S:::::::::F:T:::::::::::R::::D VNG6308 L:L:::L:::V::::VIQW:LLRE::R:::::::E::::::S::::::::::::N::::: HVO_1586 MLL:A:V:::LV::GTFVV::::R::::::S::R:::::::S::::::::::::SD:::: hla0423 L::::::::AVVH:GIIV:LL::Q::IG::T:GR::LI:::S::::::::::::::::N: consensus LRIDERVYSFALPLGATANMDGAAIRQAVAAIFAANLVGQPLSLAEQFLVLLVAVLASIG #oth 13.2.21.1.2..1...1....1.21.11112....3..13.3131.33.231.1.1.1. HVO_2885 :::::::::::::V::::::::::::::ITVV::::V:::::V:S::V::::::::I::: hla0316 :::E:::::::::V::::::::::::::ITVM::::A:::::A:T::::::V::::I::: pNG7331 :Q:A::::::T::V:::::::::::::::TVM::::V:::::V:T::IF::I::::I::: VNG6308 FG:::E::::S::::::I::::T:MY:G::::::::::::T:T::::AT:IVT:L:::V: HVO_1586 :G:E::I:G:T::::::I::::T:MY:G::::::::I::VN:::VD::A:VA:::::::: hla0423 FH:::G::::S::::::I::::T:LY:G:::::::::::VQ::I:::VT:V:::::::V: consensus TAGVPGAGLIMLTLVLTQLGLPLEVVGFVAGVDPILDRIATMNNVTGDLAVTTVVAKWND #oth 1.....2.11...11.1.1....11..2........1.21..2.11.....212.12..1 HVO_2885 :::::::::V:::V::::V:::::::::::::::::G::::::::::::::SS::::::: hla0316 :::::::::V:::V::S:V::::A::::::::::::G::::::::::::::A:::G:::: pNG7331 ::::::::IV:::VI:::V:::::::::::::::::G::::::::::::::S:::G:::: VNG6308 ::::::S::::::::::::::::::::M::::::::::LR:::::::::::::L::D::: HVO_1586 ::::::S:::::::::::::::::I::L:::::::::::R::V:::::::::::::T::: hla0423 A:::::T:::::::::::::::::::::::::::::::MR::T:IS:::::::I:::::G consensus AVDFGDGVWAR-ADGV---VSD-D #oth 22.13421.423531344423321 HVO_2885 ::::D::::::S:::LRDI::SA: hla0316 ::::::::::::----:::---:- pNG7331 GL:R:E:::S:NLS::AEF:PGD: VNG6308 RI:RENT::E:TD:--:::---:- HVO_1586 ::::TADA:--:N:::GAAL:::- hla0423 ::::TQ:A:VG:EH:DSGV:A:D: