|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3905 | HQ1003A | VNG2417 | NP0482A | Hut2313 | hla0545 | HVO_0003 | Hbo1488 | rrnAC2714 | Hmu3043 |
2847 | HQ1003A | 4152 | 2224 | 2670 | 2548 | 2393 | 2695 | 2738 | 2364 | 2653 |
2441 | VNG2417 | 2224 | 3003 | 2268 | 2345 | 2248 | 2226 | 2305 | 2287 | 2284 |
3186 | NP0482A | 2670 | 2268 | 4446 | 2767 | 2442 | 2869 | 2922 | 2453 | 2951 |
3138 | Hut2313 | 2548 | 2345 | 2767 | 4114 | 2430 | 2699 | 2775 | 2435 | 2879 |
2823 | hla0545 | 2393 | 2248 | 2442 | 2430 | 3539 | 2650 | 2661 | 2519 | 2606 |
3279 | HVO_0003 | 2695 | 2226 | 2869 | 2699 | 2650 | 4080 | 3122 | 2520 | 3010 |
3354 | Hbo1488 | 2738 | 2305 | 2922 | 2775 | 2661 | 3122 | 4148 | 2617 | 3036 |
2739 | rrnAC2714 | 2364 | 2287 | 2453 | 2435 | 2519 | 2520 | 2617 | 3045 | 2734 |
3358 | Hmu3043 | 2653 | 2284 | 2951 | 2879 | 2606 | 3010 | 3036 | 2734 | 4039 |
593 symbols consensus VPLETPARIVRELASRGYNADREAVTLLAGA-DPNTALARA-EAIPDDALRLTADDVR-A #oth 214132212233124211222111211214243345324423243331233322221152 HQ1003A M:S:LS::::SA::QH:::::::::::::::KY:::::EEVLDL:A::T::I::A:::PV VNG2417 -------------------------------:---------:----------------:- NP0482A M:Q:A::::A:::::H::T:::::I::::R:D:TA:::LV:V::T:::::K:::::::A: Hut2313 ::R:::::::N::::::::T:::::::::E:A:TEA:IE::I:::::::IK:SV::::D: hla0545 -------------------------------:MEGSS:DHV:----------------:- HVO_0003 :::::::::::T:VG:::::E::::::I::SD::GRT:::VV::A::::::I:::H::EV Hbo1488 ::::::T:::::::RH::::E::::::I:::A::E:T::::I:HAGA::F:V::A:::AV rrnAC2714 -------------------------------:---------:----------------:- Hmu3043 ::::::::L:S:::::::::E::::::::D:S:::V::D::L:T::E:T:V:S::H::T: consensus LDSG----------------S---P-PATSSDAAD-D-----------------P----- #oth 233411111111135332232453344646545544431333333333444443211111 HQ1003A I::T::::::::::::::::-PSD:SSI:EPANK:STRDNNAQDQSISDQKTEYL::::: VNG2417 ----::::::::::::::::-:::-:---------:-:::::::::::::::::-::::: NP0482A ::E:GPTARRDPISEGDDGA:PDD:ETT:::ASSGAVSDGSDAGEQAQEASQPE:VPDAA Hut2313 :ET::::::::::SGRSD:R:HNS:STSS::P:S:G:::::::::::::::::::::::: hla0545 ----::::::::::::::::-:::-::GSDR::EN:-::::::::::::::::::::::: HVO_0003 :A:A:::::::::PAAD::P:GTE:T:PAAA:::NAA::::::DADPAASAASD:::::: Hbo1488 :::::::::::::PNATDAPISASSTA::P::TTTT:ADALSESESASTDRSLD:::::: rrnAC2714 ----::::::::::::::::-:::-:---------:-:::::::::::::::::-::::: Hmu3043 :E:E:::::::::HDADGGR:GNETR::DTTNP::T:::::::::::::::::::::::: consensus ------------------------SSSTGTEPDEAADSGQSSPVETEGSSSA-S-----R #oth 111111111111111111111111433445554655444544343353465454222343 HQ1003A ::::::::::::::::::::::::P:QSNSPN:VTP:LDS:PEQT:GA:QPPQKAHTSTP VNG2417 ::::::::::::::::::::::::----------------------------:-:::::- NP0482A DDDPSPVETEDGSGGVGQSGRNEHP::SAA::AT::E::GEP::::::::E:ST:::RE: Hut2313 ::::::::::::::::::::::::LV:::D::P:PR:DADR:::::K:VH:GE:PPGTSS hla0545 ::::::::::::::::::::::::ETDID::I:RDS::NAD:S:DRSPDR:PD:::::TS HVO_0003 :::::::::::::::::::::::::V:AA:SH:N::HTD::A:A:AQ:TPGG:-:::::: Hbo1488 :::::::::::::::::::::::::::::ETKA:TTT::::::P::G::N:SSG:::::: rrnAC2714 ::::::::::::::::::::::::----------------------------:-:::::- Hmu3043 :::::::::::::::::::::::::V::::G:TSST:::G:T::::::::T:R:::::V: consensus NTDPSLRSLEIANDMTGQSTGTGEYDDFVAVFRDRYEKLSKQLRGRVNHRPTNAIESMPG #oth 643345334325212..2.....1.4..131.1...11.145.11.....115.24412. HQ1003A E:NQ:VN:FD:NG:I::R:::::S:::::S:::::::R::SH::S:::::::Q::G::S: VNG2417 --------------:::A:::::::Q:::S::::::DR:AA:::::::::::S:LA:::: NP0482A :::Q:::D:D:G:::::R::::::::::::T::::::R:::T:K::::::NAS:L:AS:: Hut2313 R:GRNPDEPS::G:V::R:::::::E::L:::::::::::G:::::::::::::V::::: hla0545 HH::DI:E::VG:::::::::::::S:::RT::::::R:::V:::::::::AE::AE::: HVO_0003 :V::A::::::::::::::::::::::::K:::::::::::L:::::::::AK::SN:S: Hbo1488 QS:::::::S:T:::::::::::::G:::K::K:::::::R::::::::::AE::Q:::: rrnAC2714 --------------:::::::::::S:::::::::::::AGK::::::::::D:::N:G: Hmu3043 SS::DQ::I:VH:::::::::::::S:::S::::::::::::::::::::::::L:R:S: consensus GSDAAIVGMVNDIRSTASGHWLIELEDTTGTFPCLVMKDRDIADLVDELLMDEVIAVEGT #oth 1311121.1.3.1...21...211....1.1..2111..154123.32113..12.13.. HQ1003A ET:T::I:L:::::::KN:::IV:::::::::::::::::SF::V:N:::F::C::I::: VNG2417 ::::::::::::::::T::::RV:::::N:V::V::L::::VS::::D::L::::::S:: NP0482A :GE:EM::::S:::::::::::::::::::V:::MIL::::::G::::::Y:::V::::: Hut2313 ::E:::::::A::::::N:::::D:::::::::A:::::::M::V:ED::F::::::::: hla0545 :::::MI:L:::V:::K:::::V::::::::::A:I:::KGL::::::IM:::CL:I::: HVO_0003 :E::ELI:L:D:V:::K::::I:D:::::::::::::::K:::GY::::::::C:::Q:: Hbo1488 :::::M::L:::::::::::::::::::::::::::::::KF:SA::::::::C:::::: rrnAC2714 :::::LI:::S:::::::::::V:::::N:::::::::::P:::::QQ:::::::::::: Hmu3043 :EE:::::::S:::::::::::::::::N:::::::::::A:::::Q:::Y::::::D:: consensus LADDGGILFVDSLHFPDVPRTHRPSTADRHVQAALISDVHVGSQEFMADAWHRFADWLHT #oth .11.23.1.111211.11.1226221...4.2......1....1..331..41.12.... HQ1003A :SG::E:::ANDI::::I:HN:T:N:::::::::::::I:::::::VY:::E:::A:::: VNG2417 :::::T:::A:DIY::E::::YS::::::S::::::::::::::::A::::RS::::::: NP0482A :S:::S:M:::D:Y::::::::E::::::::E:::::::::::::::::::E:::A:::: Hut2313 :::::::::A::I::::::::FE::::::A:S::::::::::::::D::::N:::E:::: hla0545 ::::S::::A:::::::::::::TGA::::::::::::I::::D:::V:::SS:T::::: HVO_0003 :SG:A:::::::M:::::::S::SN::::D:::::::::::::::::::::N:::::::: Hbo1488 ::::S::M::::M:W:::::::K:N:::::::::::::::::::::::G::::::::::: rrnAC2714 ::::A::::::::Y::::::::N::::::::::::::::::::::::E::::::T::::: Hmu3043 :::::::::::::::::I::::D::::::P:::::::::::::::::::::::::::::: consensus PEAERVEYLLIAGDMVEGVGVYPDQDEELDIVDIYDQYEAFSEHLKEVPGDIEIVMIPGN #oth 21.251..1.1.........1..3..2..111..12..13.1.2..21.1.3..21.... HQ1003A D::DAI::::::::::::::::::::D::::::::A:::T:A::::S:::::::LL:::: VNG2417 :A::S::::::::::::::::::G:::::::::::::::T:A::::D::::M:::::::: NP0482A D::ANI::::::::::::::::::::::::::::F::::Q:::R::S::::::::::::: Hut2313 :::D::::::L::::::::::::::::::::::::::::::A::::D::::M:::::::: hla0545 ::::P:::::L::::::::::::::::::E:::::::::::A:Y:::::A:T:::::::: HVO_0003 E::A:I:::::::::::::::::N::::::VI:::E::::::::::S::::L:::::::: Hbo1488 DA::H:::I::::::::::::::N:::::::::::::::Q:::Y:::::::::::::::: rrnAC2714 ::::H:::::::::::::::I::E::K::::I::::::R::::Y:::::A:M::R::::: Hmu3043 E::AN:::::L:::::::::::::::D:::V::::E:::R:::Y:::I::::::R::::: consensus HDAVRLAEPQPGFDEELRSIMSAHDARITSNPSTVTVEGVNVLMYHGVSLDEVIAELPDE #oth ...........1.11.1.1..31...2141..14..21..41.1............2.33 HQ1003A ::::::::::::::D:::::::::::::SG:::F::I:::QI::::::::::::::::SP VNG2417 :::::::::::A:::::::::R::::::::::::::ID::S::L::::::::::::H:SD NP0482A :::::::::::::::::::::T::::Q:A:::AV::L:::S:::::::::::::::M::A Hut2313 :::::::::::A::::::::::::::T::G::::::::::DI::::::::::::::::E: hla0545 :::::::::::::ND:I::::DV:::Q:V:::A:::::::D:::::::::::::::::E: HVO_0003 ::::::::::::::D:::D::::::::::::::M::L:::::::::::::::::::::AD Hbo1488 ::::::::::::::::::D:::V:::::::::::::::::::::::::::::::::::S: rrnAC2714 ::::::::::::::::::D:::::::QVH::::L::::::T::::::::::::::::::: Hmu3043 :::::::::::A::::::D::T::::QVH:::AL::I:::T::::::::::::::::::: consensus KASYDEPHKAMYQLLKKRHVAPQFGGHTRLAPEERDYLVMEEVPDVFHTGHVHKLGWGKY #oth 412.12.23..31......1..11.11..2...34.1.21221..1..........2.41 HQ1003A ::N::::::::::::::::I:::::ER::::::DS:::IID:I::::::::::::::::: VNG2417 DVT::D:QN::EL:::::::::P:::R::::::AE:H:AIDT::::::::::::::V:IH NP0482A :::::D::L::F:::::::::::::::::::::QQ:::::D::::I::::::::::::Q: Hut2313 H::::H:DR::A:::::::I:::::::::I:::::::::::D:::I::::::::::Y:S: hla0545 :::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::I:D:::::::::::::::::: HVO_0003 ::::::::::::::::::::::::::::::::::L::::::D:::I:::::::::::::: Hbo1488 S::::::::::::::::::::::Y::::::::::Q:::::K::::I:::::::::::::: rrnAC2714 E:::E:::R::::::::::::::Y:::::::::D::::::::::::::::::::::::E: Hmu3043 :::::::::::::::::::::::Y:::::::::D:::::::::::::::::::::::::: consensus HNVLAVNSGCWQAQTDFQKSVNIDPDAGYAPILDLDTLD-------MTVRKFS #oth 11.222..1...2..3..2....2..212..121.12.211111112.111.4 HQ1003A :D:::::::::::::A::R:::::::V:::::I:::::E:::::::::::::L VNG2417 :::RL:::::::H::A::E::::S::VAT:::::::::::::::::I::H::: NP0482A R:::::::::::::::::::::::::::F::VV::GS::::::::::::H::: Hut2313 ::::TI::A:::E::S::E:::::::V:::::VH::K::QRDASDFL:I:S:G hla0545 :::::::::::::::::::::::N::S:::::::::::::::::::::::::A HVO_0003 ::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::N:::::::::::::: Hbo1488 ::::::::::::::::::::::::::::::::V:::::::::::::::::::: rrnAC2714 :::V:L:::::::::E::::::::::::F:::::::::E:::::::::::::: Hmu3043 :::::I::::::::::::::::::::::F:::::::::::::::::::::::V