| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 4259 | HQ1097A | hla0888 | HVO_1867 | Hbo1741 | NP2270A | VNG2017 | Hmu2580 | rrnAC3173 | Hut2681 |
| 3052 | HQ1097A | 4287 | 2833 | 2996 | 3100 | 2562 | 2643 | 2592 | 2617 | 2578 |
| 3448 | hla0888 | 2833 | 4392 | 3347 | 3331 | 2797 | 2882 | 2851 | 2957 | 2822 |
| 3499 | HVO_1867 | 2996 | 3347 | 4316 | 3596 | 2831 | 2884 | 2892 | 2926 | 2755 |
| 3509 | Hbo1741 | 3100 | 3331 | 3596 | 4281 | 2881 | 2824 | 2892 | 2966 | 2839 |
| 3230 | NP2270A | 2562 | 2797 | 2831 | 2881 | 4238 | 2828 | 2804 | 3032 | 2939 |
| 3318 | VNG2017 | 2643 | 2882 | 2884 | 2824 | 2828 | 4270 | 3042 | 2989 | 2834 |
| 3354 | Hmu2580 | 2592 | 2851 | 2892 | 2892 | 2804 | 3042 | 4701 | 3160 | 2931 |
| 3480 | rrnAC3173 | 2617 | 2957 | 2926 | 2966 | 3032 | 2989 | 3160 | 4233 | 3156 |
| 3312 | Hut2681 | 2578 | 2822 | 2755 | 2839 | 2939 | 2834 | 2931 | 3156 | 4231 |
605 symbols consensus MSEDD------------DPYAADE------GGHRA-FWADAVADEIEARDPDEPIVIKGG #oth .45234454333222222432625321232576241...141..311221.31.111..1 HQ1097A :NN:TQTAETENA::::ESTDE::::::::PQTH:::::ATA:::::ET::TD::::::: hla0888 ::A::SPHILSEQARDT:GS:G:DDEGDDGK:F:::::::V::::::::::::::::::: HVO_1867 :TT::PSRG:::::::::AS:::ATDGDADAT:HG:::::E:::::::::::::V:V::: Hbo1741 :TN:SDSPD:::::::::APD:G:::::::TA:H::::::S:::D::::::::::::::: NP2270A ::---:::::::::::::L:DLGT:::::::EK:P::::::A:::V::::::::VT:::: VNG2017 :HP::::::::::::::::::D:-:::::::SG:L::::::A::RVLDG::E:::::::: Hmu2580 :::S:PGDDSTQQTTPR::::LGDHDGEGGPDD::V:::::::::::::E:S::V::::A rrnAC3173 :A:--:::::::::::::::EVGR:::::::VS:::::::S:::A::::::::::::::: Hut2681 :T::-::::::::::::N:::TI:::::::D:TAT:::::::::A::::::E:::::::: consensus VSPSGVPHLGNFNEIMRGYFVAEVLRERGHEVRQVFTSDDKDPLRKLPRKLADLDGNIVG #oth 1.....1.1.13..11...21.12..1.11..1....2..1.1..32.12..132111.2 HQ1097A ::::::A:::::::V::::YI:::::::::::::::::::R::::S::QR:::DT:E::: hla0888 ::::::A:::::::::::::::A:::::::::::::::::::::::I:::::NP::E::: HVO_1867 ::::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::A:::::: Hbo1741 ::::::A::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::AE::::: NP2270A ::::::::::H::::::::::::A:::::Y:::::::T::::R::::::::::::W:V:: VNG2017 I::::::::::M::::::::::A:::::::::::::::::R::::G::::::::::EV:A Hmu2580 I::::::::::V:::::::::::S:::::Y::Q::::T::R::::::::::::::::::D rrnAC3173 ::::::::I:H::::::::Y:::A::D::::::::::A::::R::AV::Q:::::W:V:: Hut2681 ::::::::I:HL:::V:::V::::::::D:::::::::::R:R:::I::Q::::EW:::: consensus LGEVDAGALGRNLGKPYTDIPDPFGCCDSYGAHFTALLAADADRLGVPVEMVSNTELYAD #oth ..2.1.....1...2...31.....132..11..25.1342.1222111141.1..2.33 HQ1097A ::D:::::::::::R::::::::::ESK::A::::K:::::::::DI:::II::::Y:QE hla0888 ::::::::::::::::::A::::::ER:::A:::A:::K::::::EI::::::::::::: HVO_1867 ::::::::::::::::::S::::::EAE::A:::A:::K::::::::::::I::::::DN Hbo1741 ::D:::::::::::::::E::::::EA:::A:::AD::K:::::::::::::::::::D: NP2270A ::::::::::::::R::::::::::::::::::::E::RRS:EAI:::IDL::::::::G VNG2017 ::D:N:::::Q:::A:::E:::::::::::::::SN:IQSS::::::D::::::::T::N Hmu2580 ::A:N:::::Q:::R::::V:::::::::::E::SN:I:DC:EL:::DI:I::T::::E: rrnAC3173 ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::QKS:ELV::D::F::::::::: Hut2681 ::::::::::::::::::S::::::::::::::::T:::RS:EL:D::IDV::::::::: consensus GDFEEVTRRVLENADRAREVLGEYQDKVDEEYVPFNPVCAECGKITETVTDVDLDAGTVE #oth .6.1432243.435141.1..331.41..31....314.33..22.111.21131131.4 HQ1097A :K:::SIKCI::DI:T:::::S:::S::::D::::::L:QN::::::::::I::::Q::T hla0888 :A:DD::::::SDL:GV::::SQ::::::G:::::::::G::::::::::S:::::E::: HVO_1867 :::DP:VEH::DH::T:::::::::S::::D::::::::::::::::::::I:::::::D Hbo1741 :T:DP:VE:::SDI:N::D:::K::R:::::::::::::E:::::::::::I::::K::: NP2270A :::DAAVEDA:A:R:T:::::S:F:::::D:::::F:Q:::::LL::::::I:::D:::G VNG2017 :G::::::YL::HVTA::D::::::::::::::::::I:EA:::V::::::::A:::::: Hmu2580 :S:::L::H::D:Q::::D::::::::::AD::::::I:G::::V:::::A::T:::::: rrnAC3173 :E::A:::::::R:::::D::A:::N:::DD::::L:Q:::::::::G::A::::::E:: Hut2681 :E::KL::H::R:Q:::::::KD::AS::D:::::QVE::S::IL:DGI:::EPAD:::A consensus YVCTDMTAGDQTIEGCGHEGTATFREGKLPWRFEWPAQWDVLGVDFEPFGKDHAEGSWPS #oth .4.3.121.142.1......3111.3......1...11.32.1..1.............. HQ1097A :H:::::::ERA::::::::V::::::::::::::::::QI:D::::::::::::::::: hla0888 ::::::DV::N:::::::::::::::::::::L:::G::::::::::::::::::::::: HVO_1867 :::::::V::N::D::::::::::::::::::::::G::Q:::::::::::::::::::: Hbo1741 :A:::::V::E::::::::::::::Q::::::::::G::Q:::::::::::::::::::: NP2270A :::S:VE:::DV::::::::R::::A:::::::::::::R:::::::::::::::::::: VNG2017 ::::::D::::::::::::::::L:::::::::::::::RT::::Y:::::::::::::: Hmu2580 :R::::E::::V:D:::::::::L:::::::::::::G:::::::::::::::::::::: rrnAC3173 :::E:VE::::::D:::::::::L:D:::::::::::::EI::::::::::::::::::: Hut2681 :E:R:V:V:EE:::::::::EVSL:::::::::::::::::::::::::::::::::::: consensus GKDIAENVLDIEPPVPMVYEWFTLNGEALSSSAGNIVTVAEVLELLEPAVLRYFFAKDPR #oth .311111.1333..2..1.....111121...3.11121613.311.12.31...412.2 HQ1097A :T::::::::TV::I::::::::V:D:S::::T::::::T:L:T::::::I:::::L::: hla0888 :V:V:R:::G:::::::::::::::::P:::::::::::S:L:D::::::::::::LH:K HVO_1867 :::::::::G:::::::::::::::::::::::::::::::M:D::::E:::::::LN:: Hbo1741 :::::::::T:::::::T:::::::::::::::::::::P:I::::::E:::::::LN:: NP2270A ::AVSRE:F:T:::::::::::::::D:::::::::I::D:::::::::::::::T:N:K VNG2017 :T::SR:::GD:::T:::::::::D::PF:::::HVIL:QD::A:::LP:V::::S:::: Hmu2580 :V::::::FE:D::::::::::::D::PF:::E:HV:M:HD:::::::::V::::S:::S rrnAC3173 :E:V:::::::Q::::::::::::D::P::::S::VI::D:::DI:::E:FK:::V:::: Hut2681 :V:V:R::FEV:::::::::::::D::::::::::V::A::::::V:::::::::C:::: consensus KARDFDIERLDQLVDDFDRFERAYFGEV--ADEDEREFAERAYPFVV------------- #oth 11..112321.11..2...3.14..23413431434221211..53.1222111111111 HQ1097A R:::L:L:N::::::::::::::::DG:::N::SIN::::Q:::Y::::::::::::::: hla0888 ::::L::::::::::R::::::::::::::D:::LTA::::::::::RRAD::::::::: HVO_1867 ::::L:LT::::::::::::::::::::::D::SLTR::::::::::::::::::::::: Hbo1741 ::::L:LS::::::::::::::::::D:::D::TLT:::::::::::::::::::::::: NP2270A :Q::::VSN::RF::E:::::AG:::DE:SVED:::AR:D::::M::::::::::::::: VNG2017 R::::S::H::::::E:::M::V::::AAD:S:::::R:A:V::LL:::::::::::::: Hmu2580 :::::S:::::::::::::T::L::::E:SGT:R:EALG:::::PS:RPTVADRFDDEFG rrnAC3173 :Q:::SV:NI:::::E::::::R::E:I:E:S::DA:L::::::M::::::::::::::: Hut2681 :Q:::S:AH::::::E:::L:AV:::RQ:D:::ED::R:::V::IA:::::::::::::: consensus ---------------------DE-PREDRVRIPYTFAAVLGMTDDPALREQMARREGHIP #oth 111111111111111111111131343311.2.1........21.3421443.131.123 HQ1097A :::::::::::::::::::::EN:IDSE:::L:::::::::::::RS:QIE:::N::::D hla0888 ::::::::::::::::::::::P::T:KP::L::::::::::V::::F::RL::D::::: HVO_1867 ::::::::::::::::::::::::V::::::L:::::::::::::EN::VK:::N::FFD Hbo1741 ::::::::::::::::::::::::V::::::F:::::::::::::REV:I::::N::::I NP2270A :::::::::::::::::::::::L:ERQP::::::::::::::::RD::L:::Q:S:::: VNG2017 ::::::::::::::::::::::D:IDA::::::F:::::::::E:S::::EI:::::::: Hmu2580 EGSWRSVANDRTARETVDELLED:TYA:::::::::::::::F:::E::TDV::K:::LA rrnAC3173 ::::::::::::::::::::::D::::Q:I:::::::::::::::::::::I::K::::: Hut2681 :::::::::::::::::::::::::::E:I::::::::::::::::::::EI:::::::: consensus DDAPEWAVEEALERVERARAWAERTDNEFNYRLQ-AELPEVDFDD--ATAAALDELADFV #oth 2113223125.14.112.24..3212.311.3.31323.251113112121...2..212 HQ1097A AET:::::TD::N:I:K::I::::M::TY::Q:::ETQ:AI:I:PTSD::K:::T::EV: hla0888 :::SDET::A::A:::K::N:::::A::YD:::::T:::DA::::::DV:::::D::E:: HVO_1867 E:T:DEV:::::G::::::R:::KM::QY::::::VD:::F::EP:::VE:::::::::: Hbo1741 ::T:::::::::::::K:::::::M::AY::::::V:M::T::::::DVV::::D::::: NP2270A :::TDDQI:R::::::K:::::V::::::::::A:ET::A::::A::E:::::::::A:: VNG2017 A::DADT:AD::T::::::E::R::N:::::::AR::I:AH::::::::::::::::A:L Hmu2580 ::T::::::T:M:::DL:SE::R::::::::E:ER:T:::A:::E::::E:::::::::: rrnAC3173 :::::::::Q::A:::::QE::SL:N:::::E:KR::I:::S:::::::::::::::::I Hut2681 E::::::::::::::D::::::R::::A:::D:KRE:M:D::::A::E::::::D::::: consensus -AEGHDGEAIQGEIYETARRHDIDVGDFFAAGYRLFFDETQGPRLGPFLAKLDREFVVER #oth 23333.1.21.31.113.222.222121.31..1.111442..2..4122311321..5. HQ1097A ::::S:::E::EA:FDI::DY::P::E::EV::Q:::NQSA:::::K::GE::A::::Q: hla0888 ::A::::::::A:::::::A::VE:S::::::::::::D:::::::E::GE:E:DY::A: HVO_1867 :EKN:::::::::::::::::::EM:::::::::::::AE::::::G::GE:E:D:::T: Hbo1741 :DA:::::E::::::::::::::E:S:L:G::::::::QP::::::E::GD:::T:::K: NP2270A ET:SP:D:TL::::::::K:N:V::::L:S::::::L::SE::::::L:SAM:ET::::: VNG2017 DD:DP::::L::::::A:K:::::I:A::::::::::::D:::K::::::::::::::T: Hmu2580 ::::::::T:::::::::K:::VPI::::S:::::L::::E::Q::::V::::::::::: rrnAC3173 :::::::::::S::::::K:N:::ISE::S:::::L::D:E::Q::T:I::::::::::: Hut2681 ::T:A::::::A::::L:EAY:L::S:::::::::L::L:E::K:::::::::Q::::G: consensus LRREG #oth 1..14 HQ1097A ::::: hla0888 ::::A HVO_1867 ::::D Hbo1741 ::::E NP2270A ::::: VNG2017 ::::: Hmu2580 F::NR rrnAC3173 F::NE Hut2681 ::::R