|
Pairwise sequence scores | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 3201 | NP5182A | VNG0351 | rrnAC3318 | Hmu0670 | Hut2679 | HQ1226A | hla0230 | HVO_0734 | Hbo0800 |
2370 | NP5182A | 3302 | 2136 | 2089 | 2142 | 2138 | 1908 | 2042 | 2109 | 2058 |
2388 | VNG0351 | 2136 | 3295 | 2146 | 2179 | 2199 | 1811 | 2103 | 2077 | 2072 |
2545 | rrnAC3318 | 2089 | 2146 | 3306 | 2632 | 2517 | 1910 | 2268 | 2187 | 2159 |
2594 | Hmu0670 | 2142 | 2179 | 2632 | 3302 | 2680 | 1903 | 2194 | 2241 | 2190 |
2573 | Hut2679 | 2138 | 2199 | 2517 | 2680 | 3280 | 1860 | 2193 | 2197 | 2158 |
2240 | HQ1226A | 1908 | 1811 | 1910 | 1903 | 1860 | 3251 | 2098 | 2259 | 2296 |
2594 | hla0230 | 2042 | 2103 | 2268 | 2194 | 2193 | 2098 | 3319 | 2450 | 2504 |
2649 | HVO_0734 | 2109 | 2077 | 2187 | 2241 | 2197 | 2259 | 2450 | 3220 | 2663 |
2625 | Hbo0800 | 2058 | 2072 | 2159 | 2190 | 2158 | 2296 | 2504 | 2663 | 3240 |
470 symbols consensus -------MRLDEYID-IERD-ERAERRRLAEEKSYAILDHLEDFERRFEETVQGDSLFGS #oth 111111112.111212234212324212..3111.3122222232422222121.212.2 NP5182A :::::::::::::V:D::Q::DSVAL:K::::::::VTEYID:ART::D::LTD:T:V:: VNG0351 MATLRSGVH::::::DLQP:S:HQR:QQ::A::::E:::FVA:V:QGVT:AL:::T:V:A rrnAC3318 ::::::::Q:::F:EGF:E:::A:Q:::::A::::::T:::::L:QQ::AA::::::::: Hmu0670 ::::::::::::F:EGFD::::A::::::::::::E:TN::::V::Q::::::::A:::: Hut2679 ::::::::::ED::EGF:::::A::K:::::::::::T:::::V::QL:::L:::A:::: HQ1226A :::::::::::::V::::QN:K::K:::::KNR::D:VEY:D::QD:::S:::::::Y:G hla0230 ::::::::::::F:E:F:A:::::::::::A::D:G:::::DS:::::::H:SD:AVV:: HVO_0734 :::::::::::::M:::::::::::::::::::::G::::::T:QD:::::::::::Y:G Hbo0800 :::::::::::::M:::AAES:::K:::::Q::::D::E:::::QN:::::::::::::: consensus TAPSIFVGRSNYPNVSTGVLSPVGHDADAAQFATSGAWYDEGLSIDDVFQRRTGLLNSTR #oth 11.11...2.3..2..2.2.1.12524223712.125..43131.41.121.1111..32 NP5182A ::::V:::::S:::::A:::A:::DEN::EAY::T:E::QQ:F::::::E:::::::::: VNG0351 ::::V:::::A::D::A:I::::AG:::P:E:::::E::QQ::G::N:L:Y:::::::R: rrnAC3318 :::E::::::G:::::::L::::DT::A::G:::::D::Q:::G:E::L:::::MV:::Q Hmu0670 :::E::::::G::D::::::::MAS::::E::::::Q::RD::G::::L:::::M::::: Hut2679 :::E::::::G:::::S::::::ADEG:PTD:::::Q::AN::G:E::L:::::::::Q: HQ1226A VS::::::T::::H:::::::::::ND:VS::I::DT::N:DI::S:::E::AS:::::T hla0230 VS::::::::::::::::L:::::REER::R:E::A::::::V::A:::D:::S:::::: HVO_0734 VS::::::::::::::::I:::::::E:::S:E::A::::::V::::::::::S::::N: Hbo0800 VS::::::Q:::::::::I::::::ED:::K:E::AG:::::V::N:::::::S::::N: consensus GANVD------------VHDVWD--GFVGTQREVAIADRPVDVEIGLDGTP--DF-DVNL #oth 535.4322221111111.413.111.11.1...1.2..2..21.2..233.531311555 NP5182A RS::::::::::::::::Y::::::::::::::::L::D:::I:L:::DR:GF:L::GP: VNG0351 A:::N::::::::::::::::::::::::::::::M:::::::::::SDA:TF:REEYTS rrnAC3318 TTS::SVSAGGGRGTSG:::::N::::::V::::::::H:::::V::::::::EM::::F Hmu0670 S:::::::::::::::::S:::::::::::::::::::H:::::V:::::::::L:::RF Hut2679 S:K:::::::::::::::N::::::::::::::::::::::::::::::::::::::LTT HQ1226A TRP:TN::::::::::::AET::GD::L:::::I::::H::T:::::VNR:NI::::::P hla0230 ::D:ADAGRDGG::::G:::A:N:::WL:V:::::::::::::::::::::DL::::IGT HVO_0734 :TK:TN::::::::::::A:S::::::L:::::::::::::T:::::::K:SL:L::ASA Hbo0800 PTE:QN::::::::::::N:A::::::L:V:::::::::::S::::::SR:DI:::::S: consensus DDVATPTGPRARAESADLAENPHVPRPVEKTLEDDDWRAEGAMTYLYRRGFDVYDINTIL #oth 31241.3..1.5.33.313...1..1312..12....3.1..12....111.1.21.21. NP5182A E:I:A:R::::F::::RVT:::S:::AI::::S:::::::::I::::::::::::::NV: VNG0351 PAANA:S::N:S::::A:G:::::::Y:::::A::::A::::::::::::L:::Q::RV: rrnAC3318 :::G:::::::H:TG:::::::::::::::::S::::::::::A:::::::::::::::: Hmu0670 :::G:::::::N:TT:::::::::::A::::::::::Q:::::N::::::::::EV:::: Hut2679 ::IS:::::::::TE:T:::::::::::::::::::::::::::::::K::::::V:::: HQ1226A A::S::V:::::::::T:S:::::::A::::IS::::N::::I::::::D::I::::::: hla0230 E:IK:::::::A:RT:::G:::::::::K::::::::::::::::::::::::::::::: HVO_0734 ::::::V::::::R:::::::::::KL:K::::::::N:::::::::::::::::::::: Hbo0800 ::::::V::::::Q::::::::::::::Q::::::::N:Q:::N:::::::::::::::: consensus SAGALGQGDNRRLVPTRWSITAVDDTVGQYLRGTIRNAPTIDRVEVHRNEYMGNAYWVIL #oth .1....2363.2.............12.1111.3223243116332232112..21.122 NP5182A :V::::EAE::::::::::::::::::::::::::::::P:::TL:WHTS::::D:::VA VNG0351 :V::::::HH::::::::::::::::::::::::::D::SV:E:T::V::::::R:::V: rrnAC3318 :::::::ASE:S::::::::::::::::::V:::L:::D:::KP:LWY::::::R:::V: Hmu0670 :::::::RRQ:T:::::::::::::::::::::::Q:RN:::QT::WY::::::R:::LM Hut2679 ::::::::A::::::::::::::::::::::H:Q::::N:::ETQ:WY::::::R::I:: HQ1226A ::::::RT:Q:::::::::::::::VI:R::::R::TNQD:NS::I::ESFL:::F:::: hla0230 ::::::R:K::::::::::::::::::::F:::S::DN::VN:I:::::::L:::F:::: HVO_0734 :::::::TEQ::::::::::::::::L::::::QVKH:ESV:G::IY:::FI:::F:::: Hbo0800 :::::::::::::::::::::::::::::F:::R:QTN:S:NT::I::::FL:::F:::: consensus APGRWEFELVEMKAPGSVWNPDPEAGHYLAAASEGYEGRTGYVEETAGAYYAARLGVLEH #oth 21.4..2..2.1.1.2.1...322435222214..21..13..3..1...1.1.1....2 NP5182A :::D:::::L:L:::::I:::::DGQL:M::DN:::D::S::::::S::::::::::::A VNG0351 ::::::H::::::::::I:::::GGDLWM::::::::::::::D:::::::::::::::: rrnAC3318 :::::::::::::::Q:::::R::T:Y:MSS:H:::::::A::::::::::::::::::: Hmu0670 TL:Q:::::::::::E:::::-TGQT::::S:N:::::::::::::::::::S::::::: Hut2679 T::D:::::::::::E:::::-LGET::::S:H:::::::S:::::::::::S::::::: HQ1226A :::E::Y::::::::::I:::K::::TAITTDW::R::::K::S::::::H::::::::: hla0230 V::Q::Y::::::S:::I:::::G::V::S:::::R::::::::::::::::::M::::: HVO_0734 :::::::::I:L::::::::::::::M::::DR::::::::::N::::::H:S::::::: Hbo0800 :::N::::::::::::::::::::::MW:SSD:::F::::::::::::::H:S::::::Y consensus LQDRGRQAKALVLREVSDDYWAPVGVWQVRESVRNAFD---G--------EPAE------ #oth .422111..2112.22121..1.1....1..31.21.12221111111113325111111 NP5182A :A::D::::VF:V:YATEA:::::::::I:::::D::::::::::::::::::V:::::: VNG0351 :S:I::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::Q:G::::::: rrnAC3318 ::E:DK:::C:::::IT::::::::::::::G::::::::::::::::::::GT:::::: Hmu0670 ::E:D::::C::::::T::::::::::::::G::::::EGA:DANHRYHDQ::V:::::: Hut2679 :V:ID::::C::::::T::::::::::::::G:::::EDPE:::::::::L:DALSGRYG HQ1226A :AQ:::R::::I::HI:A:::::::::::::T::DT:::::D::::::::T::I:::::: hla0230 :D::::::::::::H::::::G:::::::::A:::::E:::::::::::::HGT:::::: HVO_0734 ::E:::::::::I:H::::::G::::::I:::I:H::E:::::::::::::M:D:::::: Hbo0800 :DQQ:::::::I::H::::::G:A:::::::::::::::::::::::::::R:::::::: consensus -AETFRDAVRAVTEQLPVSLAALRRKSTMAAGLQATLSDF---------- #oth 112113312352422..11224.1.1.2211.2.34253.5221111111 NP5182A :::::H::::QLVP:::::M::::::::::::V::D::A:GAGGDSSRSR VNG0351 :::::HG::AEISDH::::::::::::D:V::V:SA::E:A::::::::: rrnAC3318 ::QS::ETLT:IAD::::::GQ:::::ELV::::SQ:::::::::::::: Hmu0670 :::S:::::T::::::::::GT:::::D:V::::S::A:::::::::::: Hut2679 E:GS:::::TS:::::::::T::::::E:V:::::::::::::::::::: HQ1226A :S::MHE:IDG:C:H::I:S:R:H:A::I:::R:::FDT:T::::::::: hla0230 :::::GE:::G:ADH:::P:GR:::::::::::::N:G::VDAG:::::: HVO_0734 :::::G::::D:::Y::::::D::::::::::::TDIF::A::::::::: Hbo0800 :::::AA:::Q:::Y:::::GD::::::::S:::MN:R::S:::::::::