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Pairwise sequence scores | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Consensus score | 712 | Hmu0915 | NP2366A | pNG5119 | VNG0258 | Hut1905 | HVO_0730 | Hbo0804 | HQ1230A | hla0235 | rrnAC3322 | Hmu0798 | rrnB0112 | pNG4042 | pNG5140 | HVO_A0598 | Hbo3671 | Hbo3624 | rrnB0157 | VNG0751 | pNG2006 | rrnB0161 | pNG6058 | pNG6092 | HVO_A0118 | HVO_A0416 | VNG5050 | VNG5247 | VNG6048 | VNG6478 | VNG1426 | Hbo2845 | VNG5130 | VNG6126 | VNG5144 | HQ2407A | rrnAC0992 | NP3002A | Hmu1653 | Hut0596 | HVO_2869 | Hbo2634 | hla1071 | Hmu1110 | rrnAC0435 |
272 | Hmu0915 | 850 | 192 | 185 | 192 | 161 | 236 | 202 | 227 | 210 | 207 | 201 | 206 | 212 | 191 | 214 | 235 | 208 | 212 | 226 | 223 | 208 | 245 | 219 | 222 | 222 | 258 | 258 | 258 | 258 | 252 | 250 | 266 | 266 | 261 | 225 | 232 | 240 | 237 | 238 | 236 | 237 | 242 | 254 | 254 |
284 | NP2366A | 192 | 873 | 236 | 327 | 285 | 342 | 307 | 325 | 344 | 317 | 288 | 193 | 215 | 191 | 257 | 256 | 280 | 254 | 255 | 267 | 245 | 256 | 282 | 267 | 267 | 291 | 291 | 291 | 291 | 285 | 273 | 275 | 275 | 283 | 267 | 265 | 272 | 272 | 271 | 274 | 273 | 286 | 302 | 300 |
357 | pNG5119 | 185 | 236 | 787 | 276 | 206 | 229 | 205 | 217 | 218 | 226 | 216 | 207 | 176 | 163 | 261 | 291 | 308 | 337 | 345 | 333 | 308 | 382 | 364 | 333 | 333 | 343 | 343 | 343 | 343 | 367 | 335 | 365 | 365 | 353 | 309 | 351 | 339 | 341 | 343 | 335 | 324 | 352 | 358 | 355 |
378 | VNG0258 | 192 | 327 | 276 | 864 | 483 | 553 | 527 | 577 | 552 | 554 | 502 | 210 | 244 | 238 | 245 | 265 | 315 | 299 | 298 | 308 | 296 | 377 | 351 | 312 | 312 | 385 | 385 | 385 | 385 | 356 | 321 | 350 | 350 | 349 | 328 | 342 | 334 | 341 | 342 | 334 | 327 | 343 | 348 | 340 |
346 | Hut1905 | 161 | 285 | 206 | 483 | 817 | 512 | 551 | 514 | 542 | 598 | 556 | 203 | 227 | 209 | 238 | 249 | 288 | 263 | 283 | 283 | 266 | 310 | 292 | 287 | 287 | 345 | 345 | 345 | 345 | 319 | 294 | 306 | 306 | 323 | 309 | 301 | 305 | 299 | 311 | 308 | 294 | 305 | 323 | 331 |
401 | HVO_0730 | 236 | 342 | 229 | 553 | 512 | 887 | 710 | 669 | 605 | 623 | 569 | 214 | 249 | 230 | 260 | 294 | 319 | 286 | 303 | 291 | 288 | 355 | 328 | 326 | 326 | 385 | 385 | 385 | 385 | 341 | 322 | 352 | 352 | 358 | 341 | 332 | 341 | 336 | 342 | 357 | 320 | 343 | 354 | 346 |
380 | Hbo0804 | 202 | 307 | 205 | 527 | 551 | 710 | 883 | 657 | 649 | 653 | 563 | 213 | 231 | 212 | 258 | 272 | 302 | 274 | 289 | 301 | 295 | 356 | 330 | 331 | 331 | 375 | 375 | 375 | 375 | 335 | 321 | 335 | 335 | 341 | 335 | 326 | 345 | 336 | 338 | 339 | 332 | 344 | 342 | 347 |
366 | HQ1230A | 227 | 325 | 217 | 577 | 514 | 669 | 657 | 879 | 645 | 644 | 590 | 198 | 253 | 226 | 253 | 267 | 328 | 267 | 300 | 285 | 280 | 339 | 306 | 308 | 308 | 363 | 363 | 363 | 363 | 335 | 307 | 323 | 323 | 328 | 328 | 318 | 326 | 317 | 319 | 333 | 316 | 322 | 337 | 326 |
383 | hla0235 | 210 | 344 | 218 | 552 | 542 | 605 | 649 | 645 | 873 | 632 | 587 | 222 | 258 | 238 | 259 | 286 | 322 | 277 | 304 | 309 | 309 | 351 | 322 | 319 | 319 | 385 | 385 | 385 | 385 | 344 | 332 | 354 | 354 | 352 | 347 | 350 | 353 | 344 | 335 | 349 | 332 | 341 | 349 | 348 |
380 | rrnAC3322 | 207 | 317 | 226 | 554 | 598 | 623 | 653 | 644 | 632 | 886 | 661 | 206 | 241 | 233 | 264 | 296 | 325 | 285 | 286 | 290 | 281 | 340 | 310 | 303 | 303 | 359 | 359 | 359 | 359 | 334 | 317 | 330 | 330 | 332 | 348 | 325 | 334 | 332 | 345 | 342 | 327 | 335 | 338 | 334 |
373 | Hmu0798 | 201 | 288 | 216 | 502 | 556 | 569 | 563 | 590 | 587 | 661 | 766 | 214 | 236 | 228 | 251 | 281 | 313 | 279 | 295 | 292 | 288 | 329 | 328 | 307 | 307 | 360 | 360 | 360 | 360 | 326 | 308 | 333 | 333 | 335 | 347 | 325 | 334 | 327 | 339 | 343 | 327 | 333 | 345 | 333 |
327 | rrnB0112 | 206 | 193 | 207 | 210 | 203 | 214 | 213 | 198 | 222 | 206 | 214 | 817 | 627 | 613 | 218 | 237 | 249 | 239 | 267 | 278 | 216 | 309 | 282 | 274 | 274 | 301 | 301 | 301 | 301 | 316 | 296 | 297 | 297 | 309 | 293 | 294 | 287 | 277 | 284 | 284 | 289 | 306 | 290 | 311 |
342 | pNG4042 | 212 | 215 | 176 | 244 | 227 | 249 | 231 | 253 | 258 | 241 | 236 | 627 | 794 | 713 | 231 | 258 | 253 | 251 | 283 | 288 | 244 | 307 | 316 | 275 | 275 | 328 | 328 | 328 | 328 | 323 | 299 | 312 | 312 | 335 | 301 | 303 | 282 | 283 | 292 | 280 | 280 | 303 | 305 | 314 |
305 | pNG5140 | 191 | 191 | 163 | 238 | 209 | 230 | 212 | 226 | 238 | 233 | 228 | 613 | 713 | 799 | 193 | 215 | 221 | 221 | 250 | 249 | 203 | 276 | 271 | 234 | 234 | 298 | 298 | 298 | 298 | 287 | 261 | 293 | 293 | 302 | 266 | 271 | 250 | 252 | 261 | 251 | 249 | 272 | 266 | 281 |
394 | HVO_A0598 | 214 | 257 | 261 | 245 | 238 | 260 | 258 | 253 | 259 | 264 | 251 | 218 | 231 | 193 | 707 | 541 | 379 | 313 | 327 | 324 | 328 | 336 | 355 | 370 | 370 | 350 | 350 | 350 | 350 | 371 | 348 | 354 | 354 | 352 | 374 | 405 | 418 | 411 | 413 | 383 | 383 | 389 | 413 | 387 |
466 | Hbo3671 | 235 | 256 | 291 | 265 | 249 | 294 | 272 | 267 | 286 | 296 | 281 | 237 | 258 | 215 | 541 | 698 | 389 | 342 | 371 | 353 | 372 | 379 | 391 | 399 | 399 | 396 | 396 | 396 | 396 | 421 | 384 | 416 | 416 | 414 | 410 | 450 | 451 | 443 | 452 | 450 | 439 | 435 | 430 | 429 |
460 | Hbo3624 | 208 | 280 | 308 | 315 | 288 | 319 | 302 | 328 | 322 | 325 | 313 | 249 | 253 | 221 | 379 | 389 | 720 | 333 | 344 | 373 | 354 | 389 | 394 | 410 | 410 | 397 | 397 | 397 | 397 | 412 | 385 | 397 | 397 | 412 | 415 | 449 | 437 | 428 | 425 | 405 | 419 | 414 | 420 | 414 |
456 | rrnB0157 | 212 | 254 | 337 | 299 | 263 | 286 | 274 | 267 | 277 | 285 | 279 | 239 | 251 | 221 | 313 | 342 | 333 | 697 | 411 | 446 | 420 | 405 | 429 | 456 | 456 | 430 | 430 | 430 | 430 | 445 | 458 | 442 | 442 | 464 | 453 | 482 | 479 | 487 | 479 | 447 | 457 | 463 | 452 | 424 |
466 | VNG0751 | 226 | 255 | 345 | 298 | 283 | 303 | 289 | 300 | 304 | 286 | 295 | 267 | 283 | 250 | 327 | 371 | 344 | 411 | 812 | 413 | 415 | 426 | 448 | 437 | 437 | 443 | 443 | 443 | 443 | 486 | 451 | 489 | 489 | 474 | 429 | 472 | 452 | 462 | 456 | 454 | 440 | 458 | 472 | 467 |
516 | pNG2006 | 223 | 267 | 333 | 308 | 283 | 291 | 301 | 285 | 309 | 290 | 292 | 278 | 288 | 249 | 324 | 353 | 373 | 446 | 413 | 734 | 494 | 494 | 519 | 503 | 503 | 480 | 480 | 480 | 480 | 506 | 495 | 503 | 503 | 521 | 481 | 504 | 496 | 489 | 494 | 495 | 502 | 514 | 514 | 510 |
497 | rrnB0161 | 208 | 245 | 308 | 296 | 266 | 288 | 295 | 280 | 309 | 281 | 288 | 216 | 244 | 203 | 328 | 372 | 354 | 420 | 415 | 494 | 727 | 446 | 483 | 518 | 518 | 438 | 438 | 438 | 438 | 481 | 490 | 515 | 515 | 499 | 496 | 509 | 510 | 512 | 513 | 516 | 531 | 528 | 508 | 508 |
554 | pNG6058 | 245 | 256 | 382 | 377 | 310 | 355 | 356 | 339 | 351 | 340 | 329 | 309 | 307 | 276 | 336 | 379 | 389 | 405 | 426 | 494 | 446 | 749 | 638 | 524 | 524 | 556 | 556 | 556 | 556 | 540 | 504 | 518 | 518 | 521 | 504 | 536 | 530 | 528 | 533 | 508 | 514 | 537 | 511 | 531 |
573 | pNG6092 | 219 | 282 | 364 | 351 | 292 | 328 | 330 | 306 | 322 | 310 | 328 | 282 | 316 | 271 | 355 | 391 | 394 | 429 | 448 | 519 | 483 | 638 | 828 | 555 | 555 | 574 | 574 | 574 | 574 | 566 | 515 | 513 | 513 | 539 | 530 | 547 | 536 | 541 | 544 | 511 | 536 | 541 | 529 | 549 |
540 | HVO_A0118 | 222 | 267 | 333 | 312 | 287 | 326 | 331 | 308 | 319 | 303 | 307 | 274 | 275 | 234 | 370 | 399 | 410 | 456 | 437 | 503 | 518 | 524 | 555 | 727 | 727 | 499 | 499 | 499 | 499 | 556 | 545 | 516 | 516 | 547 | 548 | 539 | 565 | 563 | 567 | 571 | 558 | 581 | 577 | 559 |
540 | HVO_A0416 | 222 | 267 | 333 | 312 | 287 | 326 | 331 | 308 | 319 | 303 | 307 | 274 | 275 | 234 | 370 | 399 | 410 | 456 | 437 | 503 | 518 | 524 | 555 | 727 | 727 | 499 | 499 | 499 | 499 | 556 | 545 | 516 | 516 | 547 | 548 | 539 | 565 | 563 | 567 | 571 | 558 | 581 | 577 | 559 |
585 | VNG5050 | 258 | 291 | 343 | 385 | 345 | 385 | 375 | 363 | 385 | 359 | 360 | 301 | 328 | 298 | 350 | 396 | 397 | 430 | 443 | 480 | 438 | 556 | 574 | 499 | 499 | 722 | 722 | 722 | 722 | 542 | 501 | 548 | 548 | 579 | 534 | 568 | 547 | 550 | 555 | 513 | 523 | 528 | 527 | 521 |
585 | VNG5247 | 258 | 291 | 343 | 385 | 345 | 385 | 375 | 363 | 385 | 359 | 360 | 301 | 328 | 298 | 350 | 396 | 397 | 430 | 443 | 480 | 438 | 556 | 574 | 499 | 499 | 722 | 722 | 722 | 722 | 542 | 501 | 548 | 548 | 579 | 534 | 568 | 547 | 550 | 555 | 513 | 523 | 528 | 527 | 521 |
585 | VNG6048 | 258 | 291 | 343 | 385 | 345 | 385 | 375 | 363 | 385 | 359 | 360 | 301 | 328 | 298 | 350 | 396 | 397 | 430 | 443 | 480 | 438 | 556 | 574 | 499 | 499 | 722 | 722 | 722 | 722 | 542 | 501 | 548 | 548 | 579 | 534 | 568 | 547 | 550 | 555 | 513 | 523 | 528 | 527 | 521 |
585 | VNG6478 | 258 | 291 | 343 | 385 | 345 | 385 | 375 | 363 | 385 | 359 | 360 | 301 | 328 | 298 | 350 | 396 | 397 | 430 | 443 | 480 | 438 | 556 | 574 | 499 | 499 | 722 | 722 | 722 | 722 | 542 | 501 | 548 | 548 | 579 | 534 | 568 | 547 | 550 | 555 | 513 | 523 | 528 | 527 | 521 |
593 | VNG1426 | 252 | 285 | 367 | 356 | 319 | 341 | 335 | 335 | 344 | 334 | 326 | 316 | 323 | 287 | 371 | 421 | 412 | 445 | 486 | 506 | 481 | 540 | 566 | 556 | 556 | 542 | 542 | 542 | 542 | 716 | 561 | 574 | 574 | 587 | 574 | 563 | 555 | 553 | 556 | 573 | 568 | 579 | 566 | 574 |
568 | Hbo2845 | 250 | 273 | 335 | 321 | 294 | 322 | 321 | 307 | 332 | 317 | 308 | 296 | 299 | 261 | 348 | 384 | 385 | 458 | 451 | 495 | 490 | 504 | 515 | 545 | 545 | 501 | 501 | 501 | 501 | 561 | 703 | 541 | 541 | 565 | 554 | 549 | 556 | 553 | 547 | 560 | 580 | 581 | 561 | 552 |
597 | VNG5130 | 266 | 275 | 365 | 350 | 306 | 352 | 335 | 323 | 354 | 330 | 333 | 297 | 312 | 293 | 354 | 416 | 397 | 442 | 489 | 503 | 515 | 518 | 513 | 516 | 516 | 548 | 548 | 548 | 548 | 574 | 541 | 780 | 780 | 645 | 533 | 564 | 547 | 551 | 562 | 540 | 553 | 554 | 546 | 543 |
597 | VNG6126 | 266 | 275 | 365 | 350 | 306 | 352 | 335 | 323 | 354 | 330 | 333 | 297 | 312 | 293 | 354 | 416 | 397 | 442 | 489 | 503 | 515 | 518 | 513 | 516 | 516 | 548 | 548 | 548 | 548 | 574 | 541 | 780 | 780 | 645 | 533 | 564 | 547 | 551 | 562 | 540 | 553 | 554 | 546 | 543 |
622 | VNG5144 | 261 | 283 | 353 | 349 | 323 | 358 | 341 | 328 | 352 | 332 | 335 | 309 | 335 | 302 | 352 | 414 | 412 | 464 | 474 | 521 | 499 | 521 | 539 | 547 | 547 | 579 | 579 | 579 | 579 | 587 | 565 | 645 | 645 | 720 | 548 | 585 | 563 | 567 | 578 | 555 | 569 | 571 | 574 | 567 |
590 | HQ2407A | 225 | 267 | 309 | 328 | 309 | 341 | 335 | 328 | 347 | 348 | 347 | 293 | 301 | 266 | 374 | 410 | 415 | 453 | 429 | 481 | 496 | 504 | 530 | 548 | 548 | 534 | 534 | 534 | 534 | 574 | 554 | 533 | 533 | 548 | 747 | 582 | 596 | 600 | 606 | 612 | 619 | 599 | 565 | 571 |
612 | rrnAC0992 | 232 | 265 | 351 | 342 | 301 | 332 | 326 | 318 | 350 | 325 | 325 | 294 | 303 | 271 | 405 | 450 | 449 | 482 | 472 | 504 | 509 | 536 | 547 | 539 | 539 | 568 | 568 | 568 | 568 | 563 | 549 | 564 | 564 | 585 | 582 | 710 | 665 | 656 | 652 | 616 | 623 | 633 | 573 | 587 |
601 | NP3002A | 240 | 272 | 339 | 334 | 305 | 341 | 345 | 326 | 353 | 334 | 334 | 287 | 282 | 250 | 418 | 451 | 437 | 479 | 452 | 496 | 510 | 530 | 536 | 565 | 565 | 547 | 547 | 547 | 547 | 555 | 556 | 547 | 547 | 563 | 596 | 665 | 716 | 686 | 667 | 621 | 657 | 639 | 585 | 586 |
591 | Hmu1653 | 237 | 272 | 341 | 341 | 299 | 336 | 336 | 317 | 344 | 332 | 327 | 277 | 283 | 252 | 411 | 443 | 428 | 487 | 462 | 489 | 512 | 528 | 541 | 563 | 563 | 550 | 550 | 550 | 550 | 553 | 553 | 551 | 551 | 567 | 600 | 656 | 686 | 717 | 684 | 613 | 642 | 634 | 578 | 572 |
606 | Hut0596 | 238 | 271 | 343 | 342 | 311 | 342 | 338 | 319 | 335 | 345 | 339 | 284 | 292 | 261 | 413 | 452 | 425 | 479 | 456 | 494 | 513 | 533 | 544 | 567 | 567 | 555 | 555 | 555 | 555 | 556 | 547 | 562 | 562 | 578 | 606 | 652 | 667 | 684 | 710 | 614 | 649 | 643 | 581 | 578 |
608 | HVO_2869 | 236 | 274 | 335 | 334 | 308 | 357 | 339 | 333 | 349 | 342 | 343 | 284 | 280 | 251 | 383 | 450 | 405 | 447 | 454 | 495 | 516 | 508 | 511 | 571 | 571 | 513 | 513 | 513 | 513 | 573 | 560 | 540 | 540 | 555 | 612 | 616 | 621 | 613 | 614 | 737 | 638 | 642 | 579 | 588 |
604 | Hbo2634 | 237 | 273 | 324 | 327 | 294 | 320 | 332 | 316 | 332 | 327 | 327 | 289 | 280 | 249 | 383 | 439 | 419 | 457 | 440 | 502 | 531 | 514 | 536 | 558 | 558 | 523 | 523 | 523 | 523 | 568 | 580 | 553 | 553 | 569 | 619 | 623 | 657 | 642 | 649 | 638 | 761 | 660 | 583 | 603 |
611 | hla1071 | 242 | 286 | 352 | 343 | 305 | 343 | 344 | 322 | 341 | 335 | 333 | 306 | 303 | 272 | 389 | 435 | 414 | 463 | 458 | 514 | 528 | 537 | 541 | 581 | 581 | 528 | 528 | 528 | 528 | 579 | 581 | 554 | 554 | 571 | 599 | 633 | 639 | 634 | 643 | 642 | 660 | 712 | 596 | 619 |
586 | Hmu1110 | 254 | 302 | 358 | 348 | 323 | 354 | 342 | 337 | 349 | 338 | 345 | 290 | 305 | 266 | 413 | 430 | 420 | 452 | 472 | 514 | 508 | 511 | 529 | 577 | 577 | 527 | 527 | 527 | 527 | 566 | 561 | 546 | 546 | 574 | 565 | 573 | 585 | 578 | 581 | 579 | 583 | 596 | 700 | 621 |
590 | rrnAC0435 | 254 | 300 | 355 | 340 | 331 | 346 | 347 | 326 | 348 | 334 | 333 | 311 | 314 | 281 | 387 | 429 | 414 | 424 | 467 | 510 | 508 | 531 | 549 | 559 | 559 | 521 | 521 | 521 | 521 | 574 | 552 | 543 | 543 | 567 | 571 | 587 | 586 | 572 | 578 | 588 | 603 | 619 | 621 | 694 |
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::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::D::::::::::E:::D:::: hla1071 ::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::D::::::::::E:::D:::: Hmu1110 ::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::D::::::::::::::K:::S rrnAC0435 ::::::::::::::::::::::Y:::::::::::::::::D::::::::::E:::N:::S consensus EINHGRLYPNLDTLVEKGLVEKGELDRRTNYYTLTRRGRREILARREWE-AQYVTLDE-- #oth 5135111.12.1514373326265615..19.7429719553:95;6144:7778=;=87 Hmu0915 :::RS:V:Q:::K:Q:Q:F:TTYPI:G::KG:S::DH:ENAM::Y:R:M:LSCLSN:HAD NP2366A DV:P:Q:::::NE:::T:F:A::QK:K:::A:EI:ND:QQALTSEVK:LA:RTAGVA:EA pNG5119 ::TA::V::Q::D:::::::K::KKNG:::E:R:AG:SV:DLQDH:::::N::LAPIDEL VNG0258 :V::::::::::D::N::::::S:::K:::E:A::NE:FDAVVDDL::TLSKF:ADADRR Hut1905 DV::::::::::D:::ME::::S:::K:::E:S::EN:YDVL:EQLA::FGKIT:EEGRV HVO_0730 :V::::::::::D:::M:::::S:::K:::Q:E::DD:LQAV:D:FD:ML:KF::D::RA Hbo0804 :V::::::::::D:::MD::::S:::K:::Q:E::EK:HDAV:N:FA:MLSKF::DETRA HQ1230A :V::::::::::D:::S:::T:S:::K:::Q:E::DE:YDAV:D:LG:VFSKF::DESRA hla0235 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