| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 3088 | VNG1782 | hla1083 | HVO_2319 | Hbo2005 | HQ3330A | NP4542A | Hut0880 | Hmu2325 | rrnAC1718 |
| 1415 | VNG1782 | 2321 | 1263 | 1102 | 1269 | 1154 | 1144 | 1201 | 1094 | 1092 |
| 1941 | hla1083 | 1263 | 3168 | 1521 | 1598 | 1493 | 1474 | 1466 | 1428 | 1287 |
| 2074 | HVO_2319 | 1102 | 1521 | 3115 | 1832 | 1808 | 1473 | 1534 | 1590 | 1267 |
| 2227 | Hbo2005 | 1269 | 1598 | 1832 | 3115 | 2084 | 1534 | 1663 | 1687 | 1415 |
| 2141 | HQ3330A | 1154 | 1493 | 1808 | 2084 | 3172 | 1497 | 1626 | 1679 | 1464 |
| 1963 | NP4542A | 1144 | 1474 | 1473 | 1534 | 1497 | 3132 | 1644 | 1632 | 1437 |
| 2177 | Hut0880 | 1201 | 1466 | 1534 | 1663 | 1626 | 1644 | 3198 | 1918 | 1596 |
| 2196 | Hmu2325 | 1094 | 1428 | 1590 | 1687 | 1679 | 1632 | 1918 | 3119 | 1738 |
| 1868 | rrnAC1718 | 1092 | 1287 | 1267 | 1415 | 1464 | 1437 | 1596 | 1738 | 2537 |
473 symbols consensus -------VTSTLRRAGGFALVGTLALLAPVLD---------AAAAAPFAAVAGLAAFVVD #oth 111111123342111332232243334214333333233124323221434352243435 VNG1782 :::::::-------------------------:::::::::------------------- hla1083 ::::::::IRR::::SI::A:AAV:V:::A:G:::::::::D:::V::L:A::::F:G:R HVO_2319 :::::::::::V:::::::V::::::A::S:G::::::::::::F:::::::L::::::: Hbo2005 ::::::::Q::::::::::V::::::A::::K:::::::::::TF:::V:I:L::::::T HQ3330A MSPIAAY:QP::::::::::I::::VT::::G:::::::::Q::F::::::GIM:::LIT NP4542A :::::::M:RD::::VAYL:::S:VF:::A::AHYGSSTAA::T::V:GL::V-:G:KTS Hut0880 ::::::::::A::::VA:::::FASVI:::A:RLFAPDIATLV::V::LLLT:-GLH::E Hmu2325 :::::::----------------V:::V:LV:GVEPPWLAT:L:I:::VGI:A::LT::: rrnAC1718 :::::::-------------------------:::::::::------------------- consensus DGPLFELFARPGDRQDGRLYGLAGFALAAAGLALLATA--VDLPVEVFVAAVLILAYGNL #oth 213311321222124232121333132232224434551145216542233233243122 VNG1782 ---------------------MC::VV::::A:FA---::-------------------- hla1083 ::RW::TL:LR:::EEE::::FVA::::::::::F:SLPRAP::Y:A:A::T:AVGG:R: HVO_2319 :::::::::::::::::::N:::::::::T:::::::VPR:TM:LS::A::::::::::: Hbo2005 ::::::V::::::H:::::N:::::::::::::I:VV:::::M::SL::::::V:S:::: HQ3330A :::I:::::::::::::::N:::::::::::::I:S:E::LG::::L:::S::::::::: NP4542A ::::::::::RR::AEE::::::S::::V:A:GV:LV::::E::AV:P:V::FV:TV::V Hut0880 S:VI::::::::::R::::::::::S:SI:A:I:::IQ::F:M:TA:P:::T:::SV::V Hmu2325 ::::::::::::::E:HT:::::::::SI:::S:::LQ::FG::MW::::S:FV::G::: rrnAC1718 --------------------------------------::------M::GV:V:V::::: consensus GQRLVAAVAADPFVATAGFVAAGFLAGTAGQVASASI---TGRPAA---LPLLVFLAASG #oth .4422455553354432222552321163233564641125555652334143312.421 VNG1782 ::AV:::S:----------------GAPV::------:::------:::-:QF::::V:: hla1083 :RTV::GR:T:E:PLV::Y::G:T:GAL::::GVLLQ::::D:AGLVDG::E::::::VA HVO_2319 :A:::DSRTS:ESLRA::::::AV:::::::A:I::L:::::EAML::::ARFTL:::V: Hbo2005 :KQC::::SD:::LG:S:::VG:::G:VL:::GV:TA::::TL:T::::Y::F::::SA: HQ3330A :K::I:ETSDE:::G:::::IT:T:::I:::FTT:T::::IESQVV:::I:RY::::TA: NP4542A ::::A:GYV:S:A:GASA:A:F:TVG:SVAA::AGWL:::GAAV:S::::::V::V:::: Hut0880 :AHV:R:QGGE:I:::::::V::::::FGSF:L:G::::SG::::-:::F:V:::::::: Hmu2325 :T:::ER:T::AVA::::::T:::::A:::SAV::ML:::A:::LTSQF:A::A:Y:I:: rrnAC1718 ::::AYT:RS:EV:::::::LV::V::V::::LGTR:QAAV:EG::VVD:::VL:::::: consensus ALLAALLRSMLFERDDPLVMLSVGLLLWLFTALAP-SVTASRVA------VALAVTVALG #oth 1221124.332231.121133332221.3275.4415433753311111141.12.331. VNG1782 ::::GIM:TLFAL::A:::LG::VVV::VV::::::LAGVPT::AWERVL::::::T:F: hla1083 ::T:::V::LV:D::AHITVIL:AFAV:G:V::D::A::::L::::::::FG::::G::: HVO_2319 G:VG:V::TA:Y::::::::::I::V::GVEV::G:P:SPTQTG::::::::::L::::: Hbo2005 :IV:::F:E:::::::::::::T:::::S:D::SG:AIGTVEI:::::::A:::L:::F: HQ3330A ::V:::::E::::::::::::AS:::::::AY:GS:G:E:IELS::::::::::::A::: NP4542A :::GG:I::V:YVQ::S::V:A:A::V::LLS:GL::P:PE::::::::::G:::::G:: Hut0880 :::::::::::::::::::II::::::::::D:SI::LST:GI:::::::I:::I::::: Hmu2325 ::::::::AV:::::::::LF:I:::::::SD:PLHD:::G:I:::::::L::G:::V:: rrnAC1718 :FV::::::V:::::::::::T::::::::FE:D::::::R::V::::::I::::::L:: consensus YVSYALGTASVPGMLTGVLLSLLAIVLGGFGWFAVLISFFGLGGLATKFRYDEKLDRGIA #oth 33121.311.23..11..1131122.2.121.123122.123.2.11.11112.33..1. VNG1782 W::R:::AT:IA::::::F:G:::V::::Y:::V::VA::AV:S:::::K:EL:A:::V: hla1083 :::F:::::::::::::::SA:::V::::V::::T:M::YAI::::S:Y:F:::A:::V: HVO_2319 :AA::::::::A::I:::::L:F:V:F:D:::AL::V::::V:A::::::::S:AE::V: Hbo2005 L:::V:KA:::S:::S:::::::VT:F:::::::::M:::AI:A:S::::::::::::V: HQ3330A FI:::::::::A:::S:::::::V:::::::::::V::::S::A:S::Y:::::KQ:::: NP4542A :IA:::D::::T::::::::A:F:V::::Y:::VL:VT::::::::S:Y::::::::::: Hut0880 ::::::E:::L::::::::::::T::I:DY::::M::T:::G::::S:::::::VI:::: Hmu2325 ::::::D:::L:::::::F:G::T::::D:R:::M::T:::::::::::::::::::::: rrnAC1718 :L::::D:::L::::::::::F:T::::::::::M::T:::::::S::Y::::::::::: consensus EENEGARGTGNVLANSAVALVAVVGYAAS-AHTGVD--PDLFLFAFAGSVAAAMSDTLSS #oth 12.1....22..11.1321.321232..315332331145215211..14.1.12..1.. VNG1782 :P:D:::::A:::G:::A::I:L:L:::H:::VPFA::DTA::::Y:::::T:LA::::: hla1083 Q:::::::::::::::::::::::::::T:::V::P::GA::G:::::AT:T::A::::: HVO_2319 :D:D:::::::::G::G:S:::::::::A:QTL:YPFVS::LVL:::::A:::::::::: Hbo2005 :D:D:::::R::FG:A::::AS:I:F:::::::A::::GM::QY:::::M:::L:::::: HQ3330A :::::::::::::G:A::::IC:ICF::::ESIPI::::V::QY:::::I:::L:::::: NP4542A Q:::::::G:::::::::::::::::::::G:V:I:::ATV:K:::::A::::LA::F:: Hut0880 Q::D::::S:::::::LI::F::LAA:::PRL:::H::::::::V::::::::::::::: Hmu2325 ::::::::S:::::::I::::::LAA:::PS:::I::::M:L:Y::::A::::::::F:: rrnAC1718 ::::::::S:::::::I:::F:::AA:::PS:IA:::::L::FY::::A:::::T::F:: consensus EFGGLYDNPRLITTLERVEPGTDGGVTWQGELAGAVGAGIIAGIAAALFPDIDAI-GAGV #oth .3...1.4...1.1141.21....1.....231.33.23211322633355444521333 VNG1782 :V:::F:T:::V::F:::D:::::A:::::::::V:::T:::VLSV:V:-GVTLR::G:: hla1083 :I:::::G:::V:::S::::::::A:::::::::LA::LLV::L::FGM:IG:::A:G:I HVO_2319 :I:::F:Q:::::S:KP:PA::::A::::::V::::::AFV::VSVLVL:IPAQT:A:IA Hbo2005 :I::::::::::::::::D:::::::::::::::L::SA:V:A:::F:LSGVTGLL:GA: HQ3330A :L::::::::::::FTP:P::::::::::::IF:IL:GL::GIV:F::::SV::T::SIA NP4542A :::::F:A::::::::::D:::::::::::AV:::T:S:::::LGW:F:-EF:T::ATAT Hut0880 :::::::A::::::F:::::::::::::::::::IA::::::A::LL::ET:TLG::::: Hmu2325 :::::::::::::::R::::::::::::::AV::L::S::V::::GG::A::G:V:::L: rrnAC1718 :::::::::::::::RP:::::::::::::VA:::A:::::::::-::TQ::STV::S:: consensus ILAAGLAGMTVDSLLGATIEGARVGNQAVNFLATLAGAIAGAGLAVALG---- #oth 1233.23..22..21..12..5521.13..22..1411452433235453421 VNG1782 VV:::V::::A:::A::::::RVLT::G:::::::T::AV:GA::L:V:VA:: hla1083 VVL::V:::::::::::L:::E:I:::::::::::S:::V:VAA:::::VGL: HVO_2319 :::G::V:::::::::::V:::GL::::::::::F:::LGAVIVWIP:-:::: Hbo2005 V:LG:::::::::F::::V::::I::E::::S:::V::AIST:A:FV:F:::: HQ3330A :GI::FL:::A::I:::::::DK:::ET::LA::FI:::LSV:S:IT:L:::: NP4542A V:G::VL::V:::I::::L::G:L:::S::L::::SAGT:A:VV::LI-:::: Hut0880 :V:S:FI:::T::::::::::RW::::G:::::::SAG::::V::::TNIVAL Hmu2325 ::G::FL::L:::F::::V::ET::::S::L:::::A:V::-:::FQ:VL::: rrnAC1718 ::LC::V:::::::::::V::SV::::G::M:::::A:LT:::VVLTA:LL::