| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pairwise sequence scores | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Consensus score | 2938 | NP5000A | hla0362 | HQ2545A | HVO_1705 | Hbo3131 | VNG0924 | Hut2582 | rrnAC0906 | Hmu1586 |
| 1347 | NP5000A | 3181 | 938 | 990 | 1028 | 1016 | 899 | 795 | 849 | 823 |
| 1860 | hla0362 | 938 | 2919 | 1552 | 1754 | 1708 | 1269 | 1257 | 1306 | 1381 |
| 1988 | HQ2545A | 990 | 1552 | 2988 | 1867 | 2121 | 1115 | 1227 | 1354 | 1277 |
| 2191 | HVO_1705 | 1028 | 1754 | 1867 | 2937 | 2123 | 1320 | 1278 | 1458 | 1495 |
| 2167 | Hbo3131 | 1016 | 1708 | 2121 | 2123 | 2976 | 1211 | 1307 | 1457 | 1411 |
| 1619 | VNG0924 | 899 | 1269 | 1115 | 1320 | 1211 | 2896 | 1468 | 1466 | 1508 |
| 1631 | Hut2582 | 795 | 1257 | 1227 | 1278 | 1307 | 1468 | 2911 | 1563 | 1590 |
| 1896 | rrnAC0906 | 849 | 1306 | 1354 | 1458 | 1457 | 1466 | 1563 | 3001 | 1974 |
| 1883 | Hmu1586 | 823 | 1381 | 1277 | 1495 | 1411 | 1508 | 1590 | 1974 | 2966 |
423 symbols consensus ---------RRTDENRGR--SRRRFLAAAAAAGVGALAGCTGM--G---GSGTETGEGDG #oth 122234346555646425224..4.1334223235231..43611433235554435564 NP5000A :::::MSQQ:Q::G:D::FTG::A:IVG:::T::A:F::::DN:::NGD:N::GN:T:N: hla0362 :::::::::MTNYLPD:V::D::Q::::TG:L::AG::::::D::DTDG:::NSSDG::: HQ2545A MGDISRTDE:A:VGTHS:::T:::::Q:::V::IVSA:::GSA:::DN:ET::T:EAEVS HVO_1705 :::::::MHE:DR:P::H:::::::I:TT::L::::::::::-::-:::::DE::ETTTE Hbo3131 :::::::MDQQDG:H:::::::::::Q::::::IIGV:::N:L::SND::TA::::N:GN VNG0924 :::::::::--MS:ES:F::R::T::::TG::TLSG::::S::::L:::::NSS:DDRP: Hut2582 :::::::::---MTR:SA:::::Q::G:VG:GAL:G::::AN-::-:::PFES::T::S: rrnAC0906 ::::MSDSNDM:GR:ATQ:::::::::LGS:TAAT::T::S:ILS:DDG:D:GSD::AGT Hmu1586 MMEHNADDAD:S:RD:S:PS:::G::::SGTLAA:::::::D:::-:::----LP:GS:: consensus TSGGDGSLG-QIRGGRSPVGQRDAPGGVSIADLPDLEGELTLYSGRGEA-LYGELIELIE #oth 46655635311222124333315223.3134111..2.1123.2.112413244234422 NP5000A :GN:::NG:ADSVA:A::L::PVE:A:::WD::G:::::I:V::::TPD:QIDLVF:QL: hla0362 GD:::::I::::GS::---EG:G::::IPM:EM::::::::V::::::F::V:::V:Y:: HQ2545A SPI:TSDSE:::GS::::F:E::ISD:::MSEM:::A::::V:::::::::V:::LSF:: HVO_1705 S:TN-::V::::GS::::F:D::IT::::VTEM:::S::::::::::Q:::V::::TFFK Hbo3131 ETTTEQ:P::::GS::::F:D::IS::::M:EM::::::::::::::::::V::::SY:: VNG0924 -------I::DF::SGAI:QE:P::::E::::::::::::SI:L:G::GGR:VA::D::N Hut2582 EELSVP::A::F::SGTL:EG:P::::T::E:::::S:S:NI:M:G::GGI:ERF::ML: rrnAC0906 :T:QQI::S:DF::SGPL:A::E::::T::E:::::S::::::L:G::GG::LD::N:L: Hmu1586 ::ASEL::::DF::SGPL:E::S::E:T::D:::::S::::M:L:G::SG::LD:VD:L: consensus DRYPDFTIRPRYNSASELVNQIATEGQN--SPADVFYSVDAGSLGAVADNGATQSLPSEV #oth 35.221244634452351114153133324211...3121111.2311642234512423 NP5000A NE:SGL::NRD:DDNDAQ:::LMQ::EA::T:::::::Q:P:A:Q::::::L::V::ED: hla0362 :Q:D::DLTV::AGSTD:::::LN::DG:::::::::::N:::::TL:GE:RS:A:S::I HQ2545A ::::EL::::L:::::::::::I:::::::::G::::::N::::::L:TRER::::SD:T HVO_1705 EY:D:::::::::::A::::::Q:::::::::::::F::N::::::LK:A:R::D::::: Hbo3131 :L:::::V::L::::A:::::::::::::::::::::::N::A:::LKQRER:::::Q:: VNG0924 QY:D::SATQQTQRS:Q:A:N:V::YE:DTMQ::::W:I:::::AY::S::::RT:S:GT Hut2582 EI::E::GFTDDAPS:SQAQS:VEAV:SGG:Q::::W:I::A:::Y::E:D:YEP:AA:A rrnAC0906 Q::::::ANH:LEAS:D:A:T:IE:NEAGA::::::M:I:::::::::NAD::A:::D:A Hmu1586 QI::::SVSAQQE:::N:A:R::E:NRAGST:::::MA:::::::S::ED::AV:MSA:: consensus LDPVPDAFQDPDGRWVGTSGRARAVPYNTNQFSES------DIPDDIMAFPETAAFEGSL #oth 324.2432354224.2.51..2.2111.134242211111132.4314312246315253 NP5000A I:T::GSYRH:::H:T:V:::V:S:L::SDRLD:TPFDSWDEL::::FSYA:DPR:::II hla0362 T:M:RSE:R--TEQ:I:::::::T:::::GE::DD:::::::L::::::Y::--E:A::: HQ2545A :SL::E:::S:::S::::::::::I::::DILT::::::::S::TN::S::D:TE:D:Q: HVO_1705 ::L:R:E:H::::Q:T:::::::T::F::D::D::::::::G:::::::::D:E::RDNI Hbo3131 :EF::KS:R:S::M:::S:::::S::::::T:K:::::::::::::::S::DQSN:::E: VNG0924 R:::LSE-:FTTEH:::LA::S::::::::::::::::::::::NSVD::TTADR:Q:T: Hut2582 :E:::ED::GA::S:::VA::::S:::::ETIE::::::::E::ETVAQ::::::LQ:TM rrnAC0906 :ST::::Y::SE:::::IA:::::I::::::I::::::::::::STVQE:::A::L:N:M Hmu1586 T:::R:::K:SED::::FA:::::I:::::EL:A::::::::V:STVA:::::S::GD:F consensus GWAPTYGAFQAFITAMRLLEGEEATRQWLQSMQDLGVTRYDDEFQ-VSQAVADG---EIA #oth 111.2112122.111.14221223.24.1533323343516212513333222.111135 NP5000A ATR:NS:T:RG::QS:VE:::::T::::VSDFM:QDPQLFTSGSS:HAE:INR:GDDDPI hla0362 ::::S::SC:::::::::I::::::LA::E:VVEA:ISS:P:::A:AC::I::::::::D HQ2545A ::::::SS::::::::::::::SD:::::RG::E:NAQS:A:::::IAR::::::::::: HVO_1705 ::::::SS:::::::::V::::D:::E:::G:::::::E:N:::L::::::::::::::: Hbo3131 ::::::SS:::::::::I::::D:::K::KGI:::::SQ:G::::::AR::::::::::S VNG0924 ::::::::::G:V::::Q:R:D::::E::T::R:QAP:::RN:Y:A::EGITN:::::VG Hut2582 :::::::::K::V:::::QK:A:T:::::E::RNA:TE::PN:YV::T::::::::::LT rrnAC0906 ::::S:::::S:V:::::IR:DDE:MS:::A:::H:I:T:::::R:::NSC:::::::L: Hmu1586 ::::S:S:::S:V::::VI:DD:T::::::::::::::T::N::A:::NR:::::::::S consensus AGFANHYYIQRVLARRP-DAPLRLAFTQGDAGALFNVAGAAVLDGADDTELASNFVRHLL #oth 2112.1..53114351422211321..42.11121111.35434223244.33312..11 NP5000A I:LG:S::GA:IVNEN:::::::V::::D:P::::S:::V:ATANV::P::VAE:::::V hla0362 :A:T:::::::::DGN::::SIGT:::S:::::V::::::::V:T:S:AT::E::I:::: HQ2545A V::T::::::::::::TT:::::TT:::N::::I::::::CM::T:S::T:S:::::::: HVO_1705 :::::::::::I::G:::N:::ST:::A::::SI::::::L:::T::::::::::::::: Hbo3131 :::T::::::::::::GLST:::TT::K:::::V::::::C:::T:K::S:::::::::: VNG0924 ::LT::::PML:F:D:::::::D:::::N::SS:V:T:::S::K::::P:::ELYI:::: Hut2582 ::::::::AM::KNQ:::::::D::::S::::::V::::ILQIE:TEKDA:ITD:::::: rrnAC0906 ::::::::TL::QSA:E:NS:IG::::E::::::V::S:LEIIN:T:NAD::::::::V: Hmu1586 ::::::::SL::QSD:S:S::ID::::E::::::V::S::QI:::TENKA::E::L::V: consensus SAEAQEFFARRTFEYPLIPGVEPVGDLPTIDELNPPE-IDLTELS-DLEGTVDLLREAGV #oth 11.1.1121253211.21221211.4..3211.22.3321.43121213213411313.2 NP5000A AV:G:::MMEDNG:F:V:D::DY::P::GP::::S:T:F::S:FDME:Q:ARE::EDE:M hla0362 :::::DY:::S::::::::D:::I:::::::::DV:D::::::::::::P:I::M::::: HQ2545A :::::DY:::K::::::V:EI::I:R::S::S:::::S:N::::::N::R:IT::::T:: HVO_1705 :::::DY:::T::::::VS::D:I:E::S::::S:::GL:::Q:::::::::E::::V:: Hbo3131 :::::DY:::T::::::V:EI::I:R::::::::::QEL::AQ::::::::IR::::T:: VNG0924 :::::::L:T:G:AF:M:D::D:::P::S:A::S:::::::QS::::VQP::K::KDV:I Hut2582 :::::::::TVSYA::M::::::::G:::V:::::::::::AD::::::P:LE:MS:::: rrnAC0906 :::::::::T:::A::M::::A::::::R::::::::::N::::A::VA:::::::D::: Hmu1586 :::::::::T::YA::M:S:::::::::::::::::D::::G::::::G::::M:::V:: consensus L-- #oth 241 NP5000A :PV hla0362 EV: HQ2545A ::: HVO_1705 ::: Hbo3131 ::: VNG0924 :S: Hut2582 SG: rrnAC0906 ::: Hmu1586 :::